{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.9103706102892, 1274.065762029953, 0, 0, 0.3142722666628307, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001924844221020151],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.9980739879285, 1273.978058652314, 0, 1, 0.314319470378798, 0, 0.0007849428749643118, 0.003463159948280399, 0.685680529621202, 1, 0.0003316142887781082],
[584.0857773655677, 1274.007674765041, 0, 0, 0.3143468250726666, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001924338669424199],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0857773655677, 1273.949015019858, 0, 1, 0.3143567492703907, 0, 0.0007849607701799686, 0.003463238901789126, 0.6856432507296093, 1, 0.0003316142887781082],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 0, 0.3143666740947653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001928475790401494],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0003312827657137013],
[583.9712369440588, 1273.896683133179, 0, 1, 0.3143233330170108, 0, 0.0007849930164983839, 0.003463381172216666, 0.6856766669829892, 1, 0.0005241626619116041],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005242652227963367],
[584.0478798243412, 1273.946227036813, 1, 0, 0.3143432358948738, 0.00171218839164481, 0, -0.007554157698577154, 1, 0.3143432358948738, 0.0005242534519899786],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0099822831146, 1273.966150357128, 0, 0, 0.3143258796619837, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001929537714087616],
[584.0478798243411, 1273.928252815901, 1, 0, 0.3143462768783745, 0.00171218839164481, 0, -0.007554157698577155, 1, 0.3143462768783745, 0.0003311687478978901],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.000524286311351465],
[584.2013316941734, 1273.675189273243, 0, 1, 0.3144457261292981, 0, 0.0007851295278591381, 0.00346398345894622, 0.6855542738707019, 1, 0.0005244726942689776],
[584.1174391208631, 1273.759081846554, 0, 1, 0.3144005710437132, 0, 0.0007850778175024365, 0.003463755313380534, 0.6855994289562868, 1, 0.0005243195174488173],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.1174391208631, 1273.731061035382, 0, 1, 0.3144053129583703, 0, 0.0007850950884303056, 0.003463831512537916, 0.6855946870416296, 1, 0.0005243223270020875],
[584.2051424985023, 1273.671378468915, 0, 1, 0.314447777290549, 0, 0.0007851318769540882, 0.003463993823129151, 0.685552222709451, 1, 0.0005243328134404642],
[584.1672449572757, 1273.709276010141, 1, 0, 0.3144273789805435, 0.001711838533625995, 0, -0.007552614128570992, 1, 0.3144273789805435, 0.0005243572215031267],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.1672449572758, 1273.727250231053, 1, 0, 0.3144243370493762, 0.001711838533625994, 0, -0.00755261412857099, 1, 0.3144243370493762, 0.0005245024861874355],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.2051424985023, 1273.671378468915, 1, 0, 0.314447777290549, 0.001711727486210144, 0, -0.007552124188506306, 1, 0.314447777290549, 0.0005246372749451569],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.2051424985023, 1273.730038214098, 0, 1, 0.3144378493734286, 0, 0.0007850957188715626, 0.003463834294038304, 0.6855621506265714, 1, 0.0005243886831973269],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.8888696873042, 1273.987651280113, 1, 0, 0.3142775437967572, 0.001712654670974529, 0, -0.007556214918218098, 1, 0.3142775437967571, 0.0005248392632374798],
[583.257341861034, 1271.567357400607, 0, 1.5, 0.3144541595188019, 0, 0.001179646513627374, 0.00520458837123488, 0.5676161585371419, 1, 0.0005242891639292718],
[584.1492707363637, 1273.727250231053, 1, 0, 0.3144177043758488, 0.001711891206744854, 0, -0.007552846521833485, 1, 0.3144177043758487, 0.0005243377698759568],
[584.2051424985023, 1273.671378468915, 0, 1, 0.314447777290549, 0, 0.0007851318769540882, 0.003463993823129151, 0.685552222709451, 1, 0.0005243375086261768],
[584.2796343030152, 1273.646439482224, 0, 1, 0.3144794847044884, 0, 0.0007851472504461527, 0.00346406165081914, 0.6855205152955115, 1, 0.0005243121710621514],
[584.1672449572758, 1273.709276010141, 1, 0, 0.3144273789805435, 0.001711838533625994, 0, -0.00755261412857099, 1, 0.3144273789805435, 0.000524360858436039],
[584.2051424985023, 1273.779591031919, 1, 0, 0.3144294632542183, 0.001711727486210144, 0, -0.007552124188506306, 1, 0.3144294632542183, 0.0005242259192945486],
[584.145459932035, 1273.731061035382, 0, 1, 0.3144156532145979, 0, 0.0007850950884303054, 0.003463831512537915, 0.6855843467854021, 1, 0.0005243100132672722],
[584.4933944985285, 1273.345228927662, 0, 1, 0.3146093461124287, 0, 0.0007853329774849374, 0.003464881076617561, 0.6853906538875714, 1, 0.0005244215738424829],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[585.2939375038787, 1273.482971790713, 0, 1, 0.3148812181694244, 0, 0.0007852480340540765, 0.003464506307068069, 0.6851187818305755, 1, 0.0005242046155743482],
[584.7793812844242, 1273.54733384658, 0, 1, 0.3146806083790275, 0, 0.0007852083494844539, 0.003464331219152164, 0.6853193916209726, 1, 0.0005247555810267923],
[583.3825582469838, 1271.442242942744, 0, 1.5, 0.3145216507094301, 0, 0.00117976259505761, 0.005205100521319622, 0.567532338874304, 1, 0.0005243263491714132],
[583.8291871208369, 1274.04733384658, 0, 1, 0.3142454197208061, 0, 0.0007849001943913799, 0.00346297164202849, 0.685754580279194, 1, 0.0005243377698759568],
[584.2051424985023, 1273.671378468915, 1, 0, 0.314447777290549, 0.001711727486210144, 0, -0.007552124188506306, 1, 0.314447777290549, 0.00052422811314846],
[584.145459932035, 1273.731061035382, 0, 1, 0.3144156532145979, 0, 0.0007850950884303054, 0.003463831512537915, 0.6855843467854021, 1, 0.0005243452352187758],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0857773655677, 1273.790743601849, 0, 0, 0.3143835291386468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002163855217480276],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0857773655677, 1273.840549438262, 0, 1, 0.3143751013907876, 0, 0.0007850276083933578, 0.003463533791304028, 0.6856248986092124, 1, 0.0003077783947341951],
[584.0061714787857, 1273.969961161457, 0, 1, 0.3143238286107016, 0, 0.0007849478641461193, 0.003463181960499583, 0.6856761713892985, 1, 0.0005244630346700715],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0099822831146, 1273.966150357128, 0, 0, 0.3143258796619836, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002368602350135799],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0478798243412, 1273.928252815901, 1, 0, 0.3143462768783745, 0.00171218839164481, 0, -0.007554157698577154, 1, 0.3143462768783745, 0.0002873054426112922],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0629581595873, 1273.913174480655, 0, 1, 0.3143543923406678, 0, 0.0007849828544301513, 0.003463336337275402, 0.6856456076593322, 1, 0.000524372165775583],
[584.0762731647419, 1273.899859475501, 1, 0, 0.3143615587433576, 0.001712105158084284, 0, -0.007553790472958119, 1, 0.3143615587433576, 0.0005243605847878896],
[584.1126144094374, 1273.97173079381, 0, 1, 0.3143628091573765, 0, 0.0007849467738007825, 0.003463177149907092, 0.6856371908426235, 1, 0.000524232131931839],
[584.0819665612388, 1273.894166079004, 0, 1, 0.3143646230434834, 0, 0.0007849945675455607, 0.00346338801542097, 0.6856353769565167, 1, 0.0005245338369261955],
[584.1236749067942, 1273.852457733448, 1, 0, 0.3143870713111562, 0.0017119662204405, 0, -0.007553177481492615, 1, 0.3143870713111563, 0.0005243645009972511],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005240708480288059],
[583.9103706102892, 1274.009720407609, 1, 0, 0.31428174625658, 0.001712591607090012, 0, -0.007555936681003636, 1, 0.31428174625658, 0.0005245110592432784],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.9980739879285, 1273.950037841142, 0, 1, 0.3143242108160961, 0, 0.0007849601399554237, 0.00346323612124487, 0.6856757891839038, 1, 0.0005243876127180319],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.9200243976777, 1274.085724355292, 1, 1, 0.3142724530263618, 0.001712563293289205, 0.0007848765439280128, -0.004092944464377983, 0.9012328252687931, 0.5297777313215168, 0.001049528637409927],
[584.0857773655677, 1273.949015019858, 0, 1, 0.3143567492703907, 0, 0.0007849607701799686, 0.003463238901789126, 0.6856432507296093, 1, 0.0005243182199180256],
[583.259627824315, 1274.716504815927, 0, 1, 0.3139220238504812, 0, 0.0007844881557757838, 0.003461153731864337, 0.6860779761495188, 1, 0.0005244819673634806],
[584.0819665612388, 1273.894166079004, 0, 1, 0.3143646230434834, 0, 0.0007849945675455607, 0.00346338801542097, 0.6856353769565167, 1, 0.0005244594751645945],
[583.7098219879023, 1274.26631065234, 0, 1, 0.3141643273740186, 0, 0.0007847653129023445, 0.003462376546276315, 0.6858356726259813, 1, 0.0005243609281302411],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005243039681924125],
[584.0857773655677, 1273.78214271167, 1, 0, 0.3143849845586899, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143849845586899, 0.0005245010738844706],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0061714787857, 1273.969961161457, 0, 1, 0.3143238286107016, 0, 0.0007849478641461193, 0.003463181960499583, 0.6856761713892985, 1, 0.0005242986946680871],
[584.0478798243412, 1273.928252815901, 1, 0, 0.3143462768783745, 0.00171218839164481, 0, -0.007554157698577154, 1, 0.3143462768783745, 0.0005243129174454481],
[583.330055805908, 1274.646076834334, 0, 1, 0.31395992960199, 0, 0.0007845315010764121, 0.003461344970888054, 0.6860400703980101, 1, 0.0005246015310382662],
[583.1963573961849, 1274.634168539148, 0, 3, 0.3139125712785735, 0, 0.002353616491732906, 0.0103841319257178, 0.3229523025513354, 1, 0.001574518234482715],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.3338666102369, 1274.592460193593, 0, 1, 0.3139703971005889, 0, 0.000784564502953449, 0.003461490574832517, 0.6860296028994111, 1, 0.0005246140548943546],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.3338666102369, 1274.642266030006, 0, 1, 0.313961980653272, 0, 0.0007845338465941467, 0.003461355319288346, 0.686038019346728, 1, 0.0005241870537504774],
[583.2843137924151, 1274.75047859301, 0, 1, 0.3139253991275209, 0, 0.0007844672481345035, 0.003461061487564523, 0.6860746008724791, 1, 0.000524298180301959],
[583.3338666102369, 1274.642266030006, 0, 1, 0.313961980653272, 0, 0.0007845338465941467, 0.003461355319288346, 0.686038019346728, 1, 0.0005243210040147313],
[583.2959690690103, 1274.680163571232, 1, 0, 0.3139415834368811, 0.001714395526504468, 0, -0.007563895555038072, 1, 0.3139415834368811, 0.000524320998329008],
[583.7098219879023, 1274.26631065234, 0, 1, 0.3141643273740186, 0, 0.0007847653129023445, 0.003462376546276315, 0.6858356726259813, 1, 0.0005245367749393845],
[583.120562313732, 1274.799528704167, 1, 0, 0.3138566427764166, 0.001714911228703984, 0, -0.007566170827875834, 1, 0.3138566427764166, 0.0005244522757789788],
[582.2799336038117, 1272.647105259732, 1, 0.5, 0.3139098850812788, 0.001717387020038387, 0.0003928818899862708, -0.005843703107563034, 0.9583122214872599, 0.4317077372742075, 0.0005249215569082468],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.1584598549584, 1274.76163116294, 1, 0, 0.3138770406080616, 0.00171479978229025, 0, -0.007565679127436563, 1, 0.3138770406080615, 0.0005247393178422044],
[583.1584598549584, 1274.76163116294, 0, 1, 0.3138770406080616, 0, 0.0007844603850272145, 0.003461031207605252, 0.6861229593919385, 1, 0.0005246515376366671],
[583.2326986408805, 1274.795604940023, 0, 1, 0.3138987159220554, 0, 0.0007844394788661421, 0.003460938969836101, 0.6861012840779446, 1, 0.000524351340163265],
[583.1584598549584, 1274.76163116294, 1, 0, 0.3138770406080616, 0.00171479978229025, 0, -0.007565679127436563, 1, 0.3138770406080615, 0.0005245768468465768],
[583.1584598549584, 1274.76163116294, 1, 0, 0.3138770406080616, 0.00171479978229025, 0, -0.007565679127436563, 1, 0.3138770406080615, 0.0005245768468448794],
[583.5344152326239, 1274.385675785275, 0, 1, 0.3140793934323208, 0, 0.000784691807983326, 0.003462052243324258, 0.6859206065676792, 1, 0.0005243920712599153],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.9980739879285, 1273.950037841142, 0, 1, 0.3143242108160961, 0, 0.0007849601399554235, 0.003463236121244869, 0.6856757891839038, 1, 0.0005240925224663404],
[583.9702230369619, 1274.005909603281, 0, 1, 0.3143044804386814, 0, 0.000784925715384943, 0.003463084240391463, 0.6856955195613186, 1, 0.0005245547050482187],
[583.5980784636254, 1274.378054176617, 0, 1, 0.3141041847692167, 0, 0.0007846965009501091, 0.003462072948645779, 0.6858958152307832, 1, 0.0005244584550718605],
[583.8863304636516, 1274.089802176591, 0, 1, 0.3142593277739961, 0, 0.0007848740318709484, 0.003462856213255526, 0.685740672226004, 1, 0.0005243924107721558],
[584.0008708851605, 1274.024814572904, 0, 1, 0.3143125929075545, 0, 0.0007849140680475944, 0.003463032852458027, 0.6856874070924455, 1, 0.0005243174631266425],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0299056034293, 1273.946227036813, 1, 0, 0.3143366027923644, 0.001712241086296401, 0, -0.007554390186841839, 1, 0.3143366027923644, 0.0005243838798316211],
[583.9065598059603, 1274.069572834282, 0, 1, 0.3142702156115487, 0, 0.000784886493894843, 0.003462911195577683, 0.6857297843884513, 1, 0.0005245115064049516],
[583.8544988481508, 1274.121633792092, 1, 0, 0.3142421953604297, 0.001712755492974424, 0, -0.007556659743852012, 1, 0.3142421953604297, 0.0005245227681422719],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.9980739879285, 1273.978058652314, 0, 1, 0.314319470378798, 0, 0.0007849428749643118, 0.003463159948280399, 0.685680529621202, 1, 0.0005243845886086328],
[583.9626014283042, 1274.013531211938, 0, 1, 0.3143003783361173, 0, 0.0007849210196760816, 0.00346306352297192, 0.6856996216638827, 1, 0.0005242692793970815],
[583.9285146914065, 1274.009720407609, 1, 0, 0.314288442780385, 0.00171253839269774, 0, -0.007555701899648371, 1, 0.3142884427803849, 0.0005243916474607108],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0260947991004, 1273.950037841142, 0, 1, 0.3143345517410823, 0, 0.0007849601399554235, 0.003463236121244869, 0.6856654482589177, 1, 0.0005244220389903919],
[584.0819665612388, 1273.894166079004, 0, 1, 0.3143646230434834, 0, 0.0007849945675455607, 0.00346338801542097, 0.6856353769565167, 1, 0.0005242087413276723],
[583.0880921740395, 1271.894984891618, 0, 1.5, 0.3143360709772129, 0, 0.001179342648424562, 0.005203247721063232, 0.5677628267396551, 1, 0.000524663152727117],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005243351947137312],
[584.9823548884134, 1272.993777751829, 0, 1, 0.3148492300905583, 0, 0.0007855497940972265, 0.003465837669296787, 0.6851507699094417, 1, 0.0005242694469129654],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.5359715291549, 1273.440161111087, 0, 1, 0.3146089776183029, 0, 0.0007852744326262581, 0.003464622777298944, 0.6853910223816971, 1, 0.000524061590647584],
[584.9626014283042, 1273.013531211938, 0, 1, 0.3148385983823452, 0, 0.0007855376046537203, 0.003465783889596519, 0.6851614016176548, 1, 0.0005242046731088475],
[584.6287269254231, 1273.375426525991, 1, 4, 0.3146541550186641, 0.001710487278411762, 0.003141257414486752, 0.006312543228927181, 0.4982894086286788, 0.848800999352168, 0.002633138963783266],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.5260947991003, 1273.450037841142, 0, 1, 0.3146036617641962, 0, 0.0007852683421292936, 0.003464595906088535, 0.6853963382358037, 1, 0.000524315701396172],
[583.9363598563297, 1274.039772783913, 0, 1, 0.314286254596036, 0, 0.0007849048525501627, 0.00346299219377747, 0.685713745403964, 1, 0.000524460890568752],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0359715291549, 1273.940161111087, 0, 1, 0.3143398675951889, 0, 0.0007849662256725103, 0.003463262971366507, 0.6856601324048111, 1, 0.0002982057026106413],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 0, 0.3143666740947653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002259596316665637],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.9861656927424, 1273.9899669475, 0, 1, 0.3143130610956125, 0, 0.0007849355379116648, 0.003463127577279049, 0.6856869389043875, 1, 0.0005245910223864301],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.8984623151031, 1274.077670325139, 0, 1, 0.3142658573796452, 0, 0.0007848815054931496, 0.003462889186800355, 0.6857341426203548, 1, 0.0005243520437768837],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.9861656927424, 1273.9899669475, 1, 0, 0.3143130610956125, 0.001712369331238813, 0, -0.007554956002218089, 1, 0.3143130610956125, 0.0005270024532033154],
[583.9861656927424, 1273.9899669475, 1, 0, 0.3143130610956125, 0.001712369331238813, 0, -0.007554956002218089, 1, 0.3143130610956125, 0.000524320998329008],
[583.8984623151031, 1274.049649513968, 0, 1, 0.314270597008374, 0, 0.000784898767784667, 0.003462965347854242, 0.6857294029916261, 1, 0.0005243209368415875],
[584.2744176927685, 1273.663817406248, 0, 1, 0.314474618507235, 0, 0.0007851365378632251, 0.003464014387012664, 0.6855253814927651, 1, 0.0005243210040147313],
[583.9823548884135, 1273.993777751829, 0, 1, 0.3143110100443305, 0, 0.0007849331899914488, 0.003463117218279034, 0.6856889899556695, 1, 0.0005243098311668615],
[584.0359715291551, 1273.940161111087, 0, 1, 0.3143398675951889, 0, 0.0007849662256725103, 0.003463262971366507, 0.6856601324048111, 1, 0.0005243652293121624],
[584.0359715291551, 1273.940161111087, 0, 1, 0.3143398675951889, 0, 0.0007849662256725103, 0.003463262971366507, 0.6856601324048111, 1, 0.0005244560603153422],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005241242369723615],
[583.9702230369619, 1274.005909603281, 0, 1, 0.3143044804386814, 0, 0.000784925715384943, 0.003463084240391463, 0.6856955195613186, 1, 0.0005245254038898697],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0299056034293, 1273.946227036813, 1, 0, 0.3143366027923644, 0.001712241086296401, 0, -0.007554390186841839, 1, 0.3143366027923644, 0.0005241059608443623],
[583.330055805908, 1274.646076834334, 0, 1, 0.31395992960199, 0, 0.0007845315010764121, 0.003461344970888054, 0.6860400703980101, 1, 0.0005244389769137036],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.7098219879023, 1274.26631065234, 0, 1, 0.3141643273740186, 0, 0.0007847653129023445, 0.003462376546276315, 0.6858356726259813, 1, 0.0005241059608266612],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0819665612388, 1273.794554406178, 0, 1, 0.3143814779773959, 0, 0.0007850559546992123, 0.003463658854915978, 0.6856185220226041, 1, 0.0005245221346867553],
[584.0857773655677, 1273.840549438262, 0, 1, 0.3143751013907876, 0, 0.000785027608393358, 0.003463533791304029, 0.6856248986092124, 1, 0.0005241059637657426],
[584.0478798243412, 1273.928252815901, 1, 0, 0.3143462768783745, 0.00171218839164481, 0, -0.007554157698577154, 1, 0.3143462768783745, 0.0005245619119218029],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005243736688731634],
[584.0478798243412, 1273.928252815901, 1, 0, 0.3143462768783745, 0.00171218839164481, 0, -0.007554157698577154, 1, 0.3143462768783745, 0.0005243350389140393],
[583.9065598059603, 1274.069572834282, 0, 1, 0.3142702156115487, 0, 0.000784886493894843, 0.003462911195577683, 0.6857297843884513, 1, 0.0005242314703402475],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.9980739879285, 1273.978058652314, 0, 1, 0.314319470378798, 0, 0.0007849428749643118, 0.003463159948280399, 0.685680529621202, 1, 0.0005240985646385628],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.6622813656199, 1273.138444519344, 0, 0, 0.3147066707529226, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000200268530414216],
[584.3740293655939, 1273.51439989701, 0, 1, 0.3145366643989123, 0, 0.0007852286555070528, 0.0034644208091165, 0.6854633356010877, 1, 0.0003237424440569208],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0099822831146, 1273.890355274675, 1, 0, 0.314338702931071, 0.001712299498872646, 0, -0.007554647902531708, 1, 0.314338702931071, 0.0005243997344465805],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0478798243411, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143526887981909, 0.00171218839164481, 0, -0.007554157698577155, 1, 0.3143526887981909, 0.0002756197440338464],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 0, 0.3143666740947653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002485470581638628],
[583.7098219879023, 1274.26631065234, 0, 1, 0.3141643273740186, 0, 0.0007847653129023445, 0.003462376546276315, 0.6858356726259813, 1, 0.0005244206295268544],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.9626014283042, 1274.013531211938, 0, 1, 0.3143003783361173, 0, 0.0007849210196760816, 0.00346306352297192, 0.6856996216638827, 1, 0.0005245079244180706],
[584.0260947991004, 1273.950037841142, 0, 1, 0.3143345517410824, 0, 0.0007849601399554237, 0.00346323612124487, 0.6856654482589176, 1, 0.000524091167124018],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0819665612388, 1273.894166079004, 0, 1, 0.3143646230434834, 0, 0.0007849945675455607, 0.00346338801542097, 0.6856353769565167, 1, 0.0005244852889321726],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005240837777006364],
[584.1602691700806, 1273.815863470162, 0, 1, 0.3144067670772339, 0, 0.0007850428218689115, 0.003463600913002807, 0.6855932329227661, 1, 0.0005241489660026847],
[583.9980739879285, 1273.978058652314, 0, 1, 0.314319470378798, 0, 0.0007849428749643118, 0.003463159948280399, 0.685680529621202, 1, 0.0005241626004105743],
[584.0819665612388, 1273.894166079004, 0, 1, 0.3143646230434834, 0, 0.0007849945675455607, 0.00346338801542097, 0.6856353769565167, 1, 0.0005242064118595325],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005240148255863728],
[584.145459932035, 1273.830672708207, 0, 1, 0.3143987964484484, 0, 0.0007850336951566459, 0.003463560646041496, 0.6856012035515515, 1, 0.0005241490349698095],
[584.0857773655677, 1273.840549438262, 0, 1, 0.3143751013907876, 0, 0.000785027608393358, 0.003463533791304029, 0.6856248986092124, 1, 0.000524242009067954],
[584.0359715291549, 1273.940161111087, 0, 2, 0.3143398675951889, 0, 0.001569932451345021, 0.006926525942733014, 0.470129817169383, 1, 0.001049171366270037],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005241112774369625],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.9065598059603, 1274.069572834282, 0, 1, 0.3142702156115487, 0, 0.000784886493894843, 0.003462911195577683, 0.6857297843884513, 1, 0.0005244194357216579],
[583.9980739879285, 1273.978058652314, 0, 1, 0.314319470378798, 0, 0.0007849428749643118, 0.003463159948280399, 0.685680529621202, 1, 0.0005243253729504782],
[583.9980739879285, 1273.978058652314, 0, 1, 0.314319470378798, 0, 0.0007849428749643118, 0.003463159948280399, 0.685680529621202, 1, 0.0005241625936077926],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005242420770835485],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005242420155667044],
[584.0359715291551, 1273.894166079004, 0, 1, 0.3143476494121705, 0, 0.0007849945675455607, 0.00346338801542097, 0.6856523505878296, 1, 0.0005242420770835485],
[584.0895881698965, 1273.886544470346, 0, 1, 0.3143687251460474, 0, 0.0007849992641344508, 0.003463408736723191, 0.6856312748539526, 1, 0.0005242652227963367],
[584.0260947991004, 1273.950037841142, 0, 1, 0.3143345517410823, 0, 0.0007849601399554235, 0.003463236121244869, 0.6856654482589177, 1, 0.0005241625937047837],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0819665612388, 1274.01148556937, 0, 1, 0.3143447741508874, 0, 0.000784922280000552, 0.003463069083510613, 0.6856552258491126, 1, 0.0005243157739938325],
[584.0857773655677, 1273.949015019858, 0, 1, 0.3143567492703907, 0, 0.0007849607701799686, 0.003463238901789126, 0.6856432507296093, 1, 0.0005241965992325262],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.9626014283042, 1274.013531211938, 0, 1, 0.3143003783361173, 0, 0.0007849210196760816, 0.00346306352297192, 0.6856996216638827, 1, 0.0005246817927731175],
[584.0260947991004, 1273.950037841142, 0, 1, 0.3143345517410823, 0, 0.0007849601399554235, 0.003463236121244869, 0.6856654482589177, 1, 0.0005245285088191133],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005242651609069357],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005242420770835485],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005242534520220071],
[584.0857773655677, 1273.840549438262, 0, 1, 0.3143751013907876, 0, 0.000785027608393358, 0.003463533791304029, 0.6856248986092124, 1, 0.0005247508467443642],
[584.0260947991004, 1273.950037841142, 0, 1, 0.3143345517410823, 0, 0.0007849601399554235, 0.003463236121244869, 0.6856654482589177, 1, 0.0005242090885128793],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.145459932035, 1273.830672708207, 0, 1, 0.3143987964484484, 0, 0.0007850336951566459, 0.003463560646041496, 0.6856012035515515, 1, 0.0005242652227963367],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.000524242009067954],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.1355832019804, 1273.832927829604, 0, 1, 0.3143947702739351, 0, 0.0007850323053776218, 0.003463554514350634, 0.6856052297260649, 1, 0.0005241516486270177],
[584.0857773655677, 1273.886544470346, 0, 1, 0.3143673188782578, 0, 0.0007849992641344509, 0.003463408736723191, 0.6856326811217421, 1, 0.000524354778756899],
[584.2098219879023, 1273.874523215345, 0, 1, 0.3144151251777531, 0, 0.0007850066719883312, 0.00346344142009886, 0.6855848748222469, 1, 0.0005242206319748872],
[583.5267936239661, 1274.537042393915, 0, 1, 0.3140509934656252, 0, 0.000784598616389946, 0.003461641082965965, 0.6859490065343748, 1, 0.0005249122727070616],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.9065598059603, 1274.069572834282, 0, 1, 0.3142702156115487, 0, 0.000784886493894843, 0.003462911195577683, 0.6857297843884513, 1, 0.0005245113806429141],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.9980739879285, 1273.978058652314, 0, 1, 0.314319470378798, 0, 0.0007849428749643118, 0.003463159948280399, 0.685680529621202, 1, 0.0005243887982941375],
[584.1356406489781, 1273.939597626908, 0, 1, 0.3143767424568875, 0, 0.000784966572875824, 0.003463264503223982, 0.6856232575431125, 1, 0.0005242593200567094],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.1126144094374, 1273.913071048627, 0, 1, 0.3143727339083767, 0, 0.0007849829181647737, 0.003463336618471905, 0.6856272660916233, 1, 0.00052426810593466],
[583.9980739879285, 1273.978058652314, 0, 1, 0.314319470378798, 0, 0.0007849428749643118, 0.003463159948280399, 0.685680529621202, 1, 0.0005242420770835485],
[584.1236749067942, 1273.852457733448, 1, 0, 0.3143870713111563, 0.0017119662204405, 0, -0.007553177481492615, 1, 0.3143870713111563, 0.0005242651609377455],
[584.2098219879023, 1273.76631065234, 0, 1, 0.3144334373971326, 0, 0.0007850733620736641, 0.00346373565607429, 0.6855665626028674, 1, 0.0005241605486187556],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005243736792511821],
[584.0857773655677, 1273.949015019858, 0, 1, 0.3143567492703907, 0, 0.0007849607701799686, 0.003463238901789126, 0.6856432507296093, 1, 0.0005242091567346302],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005241489660026847],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.1009749628903, 1273.875157677352, 0, 1, 0.3143748537462989, 0, 0.0007850062810105294, 0.003463439695108791, 0.6856251462537011, 1, 0.000524349024675905],
[584.0952815663934, 1273.880851073849, 1, 0, 0.3143717894461732, 0.001712049440492409, 0, -0.007553544647511771, 1, 0.3143717894461732, 0.0005241920269842729],
[584.0952815663934, 1273.880851073849, 1, 0, 0.3143717894461732, 0.001712049440492409, 0, -0.007553544647511771, 1, 0.3143717894461732, 0.0005241489660026847],
[584.06173721893, 1273.914395421313, 0, 1, 0.3143537352059307, 0, 0.0007849821020895813, 0.00346333301795649, 0.6856462647940693, 1, 0.0005243645008928068],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0299056034293, 1273.946227036813, 1, 0, 0.3143366027923644, 0.001712241086296401, 0, -0.007554390186841839, 1, 0.3143366027923644, 0.0005243663683823687],
[584.461732743233, 1273.42669651937, 0, 1, 0.3145838703431757, 0, 0.0007852827357344389, 0.003464659410527444, 0.6854161296568243, 1, 0.0005248036438761385],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.6584705612911, 1273.241866996498, 0, 1, 0.3146877465611664, 0, 0.0007853967309125173, 0.003465162356088975, 0.6853122534388336, 1, 0.0005242603390168543],
[584.3740293655939, 1273.564205733422, 0, 1, 0.3145282325999662, 0, 0.0007851979472241201, 0.003464285324485802, 0.6854717674000339, 1, 0.0005241299878074256],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.000524242009067954],
[584.145459932035, 1273.830672708207, 0, 1, 0.3143987964484484, 0, 0.0007850336951566459, 0.003463560646041496, 0.6856012035515515, 1, 0.0005240762589387314],
[583.6355832019804, 1274.340549438262, 1, 0, 0.3141243705712279, 0.001713397929772776, 0, -0.00755949416844559, 1, 0.3141243705712279, 0.0005243356662137109],
[584.2839218935942, 1273.71018496756, 0, 1, 0.31447027723929, 0, 0.0007851079561128491, 0.00346388828462189, 0.68552972276071, 1, 0.0005243494311651121],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0359715291551, 1273.940161111087, 0, 1, 0.3143398675951889, 0, 0.0007849662256725103, 0.003463262971366507, 0.6856601324048111, 1, 0.0005243316713640615],
[584.3835335664196, 1273.610573294735, 0, 1, 0.3145238897197912, 0, 0.0007851693610026141, 0.003464159202368449, 0.6854761102802088, 1, 0.000524334311994827],
[583.9626014283042, 1274.013531211938, 0, 1, 0.3143003783361173, 0, 0.0007849210196760816, 0.00346306352297192, 0.6856996216638827, 1, 0.0005245076896744868],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0260947991004, 1273.950037841142, 0, 1, 0.3143345517410823, 0, 0.0007849601399554235, 0.003463236121244869, 0.6856654482589177, 1, 0.0005242664347177477],
[584.0478798243412, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143526887981909, 0.00171218839164481, 0, -0.007554157698577154, 1, 0.3143526887981909, 0.0005242420770835485],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005241741878012327],
[584.0359715291549, 1273.940161111087, 0, 1, 0.3143398675951889, 0, 0.0007849662256725103, 0.003463262971366507, 0.6856601324048111, 1, 0.0005243123477493828],
[584.0857773655677, 1273.840549438262, 0, 1, 0.3143751013907876, 0, 0.000785027608393358, 0.003463533791304029, 0.6856248986092124, 1, 0.0005242885719067953],
[583.9065598059603, 1274.069572834282, 0, 1, 0.3142702156115487, 0, 0.000784886493894843, 0.003462911195577683, 0.6857297843884513, 1, 0.000524424515712317],
[583.9482681515158, 1274.027864488727, 1, 0, 0.3142926638792216, 0.001712480461951695, 0, -0.007555446309788424, 1, 0.3142926638792216, 0.000525031945297354],
[583.9601764467019, 1274.033930414452, 1, 1, 0.3142960326355548, 0.001712445540524406, 0.0007849084519081001, -0.004092284162699923, 0.9012180038695503, 0.52981006914066, 0.001049210958971815],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.9980739879285, 1273.978058652314, 0, 1, 0.314319470378798, 0, 0.0007849428749643118, 0.003463159948280399, 0.685680529621202, 1, 0.0005242065811860374],
[584.3740293655939, 1273.564205733422, 0, 1, 0.3145282325999662, 0, 0.0007851979472241201, 0.003464285324485802, 0.6854717674000339, 1, 0.0005242420154670771],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005242652307534491],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005242536681329184],
[584.0115385796457, 1273.915041242775, 0, 1, 0.3143351007096659, 0, 0.0007849817041365995, 0.003463331262191998, 0.685664899290334, 1, 0.0005243617180716112],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005242885659369826],
[583.9257177941746, 1274.022394034896, 1, 0, 0.3142852666748183, 0.001712546595442959, 0, -0.007555738090076509, 1, 0.3142852666748184, 0.0005245152739851701],
[584.07815575691, 1273.897976883333, 1, 0, 0.3143625719922012, 0.001712099639651982, 0, -0.00755376612569116, 1, 0.3143625719922012, 0.00052439908140672],
[584.1523945428319, 1273.873290915232, 0, 1, 0.3143941438026026, 0, 0.0007850074313761112, 0.00346344477050999, 0.6856058561973974, 1, 0.000607984058089383],
[584.07815575691, 1273.947782719745, 0, 1, 0.3143541452579396, 0, 0.0007849615294789435, 0.003463242251808449, 0.6856458547420604, 1, 0.0005095876618147753],
[584.07815575691, 1273.897976883333, 0, 0, 0.3143625719922012, 0, 0, 0, 1, 1, 1.456200610257394e-05],
[584.07815575691, 1273.956636628516, 0, 1, 0.3143526472973335, 0, 0.0007849560740516783, 0.003463218182519068, 0.6856473527026665, 1, 0.000524347228786397],
[584.0402582156835, 1273.935874424559, 1, 0, 0.3143421747758104, 0.001712210735361165, 0, -0.007554256278825531, 1, 0.3143421747758104, 0.0005244291797315795],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.07815575691, 1273.897976883333, 1, 0, 0.3143625719922012, 0.001712099639651982, 0, -0.00755376612569116, 1, 0.3143625719922012, 0.0005244758395685126],
[584.0283499204972, 1273.901787687661, 0, 1, 0.3143435472080544, 0, 0.0007849898710128685, 0.003463367294366695, 0.6856564527919455, 1, 0.0005244132634381629],
[584.1279615933227, 1273.84817104692, 0, 1, 0.3143893784917778, 0, 0.0007850229114652996, 0.003463513068505402, 0.6856106215082223, 1, 0.0005242539164962667],
[584.5283499204972, 1273.447782719745, 0, 1, 0.3146048755157388, 0, 0.0007852697327441777, 0.003464602041467202, 0.6853951244842612, 1, 0.000524425406682201],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.9785440840845, 1273.997588556158, 0, 1, 0.3143089589930484, 0, 0.0007849308420852792, 0.003463106859340991, 0.6856910410069517, 1, 0.0005246493089310289],
[584.0283499204972, 1273.947782719745, 0, 1, 0.3143357654926248, 0, 0.0007849615294789435, 0.003463242251808449, 0.6856642345073751, 1, 0.0005244264650775216],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.07815575691, 1273.84817104692, 0, 1, 0.3143709991782576, 0, 0.0007850229114652996, 0.003463513068505402, 0.6856290008217424, 1, 0.0005244716482275088],
[584.4296781850661, 1273.447095800942, 1, 1, 0.3145685905374623, 0.001711069846941173, 0.0007852701563318923, -0.004084618780435734, 0.9010466018472745, 0.530183782922199, 0.001050308930983183],
[583.0923777843219, 1271.890667243256, 0, 1.75, 0.3143383867293801, 0, 0.001375904427220161, 0.006070476281764057, 0.5166449793206975, 1, 0.0005244192160719607],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.1279615933227, 1273.84817104692, 0, 1, 0.3143893784917778, 0, 0.0007850229114652996, 0.003463513068505402, 0.6856106215082223, 1, 0.0005243663550597556],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.1658591345491, 1273.810273505693, 0, 1, 0.3144097757081685, 0, 0.0007850462669357097, 0.003463616112602339, 0.6855902242918315, 1, 0.0005243807041327584],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0305009962667, 1273.945631643976, 0, 1, 0.3143369232447249, 0, 0.0007849628548979285, 0.003463248099543476, 0.6856630767552752, 1, 0.0005244377287020051],
[584.07815575691, 1273.897976883333, 1, 0, 0.3143625719922012, 0.001712099639651982, 0, -0.00755376612569116, 1, 0.3143625719922012, 0.0005244608660199671],
[584.07815575691, 1273.897976883333, 0, 1, 0.3143625719922012, 0, 0.0007849922192721898, 0.003463377654862839, 0.6856374280077988, 1, 0.0005245336199863624],
[584.07815575691, 1273.897976883333, 1, 0, 0.3143625719922012, 0.001712099639651982, 0, -0.00755376612569116, 1, 0.3143625719922012, 0.0005244955088069347],
[584.1279615933227, 1273.894166079004, 0, 1, 0.3143815958344374, 0, 0.0007849945675455607, 0.00346338801542097, 0.6856184041655626, 1, 0.0005245681909708622],
[583.9904523792708, 1273.985680260972, 0, 1, 0.314315368276234, 0, 0.0007849381790501392, 0.003463139229955026, 0.685684631723766, 1, 0.0005243873053796913],
[584.0036639523971, 1273.922915870024, 0, 1, 0.3143308623143847, 0, 0.0007849768518506093, 0.003463309853955762, 0.6856691376856152, 1, 0.000524342940468699],
[584.1049928007795, 1273.920692657284, 0, 1, 0.3143686319152141, 0, 0.0007849782217714743, 0.003463315898032629, 0.6856313680847859, 1, 0.0005243849147926894],
[584.07815575691, 1273.897976883333, 0, 1, 0.3143625719922012, 0, 0.0007849922192721898, 0.003463377654862839, 0.6856374280077988, 1, 0.000524410701718764],
[584.07815575691, 1273.839317138149, 0, 1, 0.3143724973137709, 0, 0.0007850283678216448, 0.003463537141893875, 0.6856275026862291, 1, 0.0005243266024489358],
[584.07815575691, 1273.947782719745, 0, 1, 0.3143541452579396, 0, 0.0007849615294789435, 0.003463242251808449, 0.6856458547420604, 1, 0.0005242418106759466],
[584.07815575691, 1273.897976883333, 0, 1, 0.3143625719922012, 0, 0.0007849922192721898, 0.003463377654862839, 0.6856374280077988, 1, 0.0005242420154382628],
[584.0686515560842, 1273.847798517691, 1, 0, 0.3143675548665774, 0.001712127499628315, 0, -0.007553889043622225, 1, 0.3143675548665774, 0.0005244052970097334],
[584.1160532981365, 1273.860079342106, 1, 0, 0.3143829692085922, 0.001711988558358614, 0, -0.007553276036159212, 1, 0.3143829692085922, 0.0005242420770835485],
[584.07815575691, 1273.897976883333, 1, 0, 0.3143625719922012, 0.001712099639651982, 0, -0.00755376612569116, 1, 0.3143625719922012, 0.000524484455227562],
[584.07815575691, 1273.897976883333, 0, 1, 0.3143625719922012, 0, 0.0007849922192721898, 0.003463377654862839, 0.6856374280077988, 1, 0.0005244050487744191],
[583.9904523792707, 1273.985680260972, 0, 1, 0.3143153682762339, 0, 0.0007849381790501392, 0.003463139229955026, 0.6856846317237661, 1, 0.0005244052300113695],
[584.07815575691, 1273.897976883333, 1, 0, 0.3143625719922012, 0.001712099639651982, 0, -0.00755376612569116, 1, 0.3143625719922012, 0.0005244052356441214],
[584.07815575691, 1273.897976883333, 1, 0, 0.3143625719922012, 0.001712099639651982, 0, -0.00755376612569116, 1, 0.3143625719922012, 0.000524484455227562],
[584.07815575691, 1273.897976883333, 1, 0, 0.3143625719922012, 0.001712099639651982, 0, -0.00755376612569116, 1, 0.3143625719922012, 0.0005242420770835485],
[584.0876599577357, 1273.948155248974, 1, 0, 0.3143575894379382, 0.001712071780582318, 0, -0.007553643211760305, 1, 0.3143575894379382, 0.0005243266024489358],
[584.0819665612388, 1273.894166079004, 0, 1, 0.3143646230434834, 0, 0.0007849945675455607, 0.00346338801542097, 0.6856353769565167, 1, 0.0005243266024206501],
[584.07815575691, 1273.897976883333, 0, 1, 0.3143625719922012, 0, 0.0007849922192721898, 0.003463377654862839, 0.6856374280077988, 1, 0.0005244052356187067],
[584.0876599577357, 1273.888472682507, 1, 0, 0.3143676873436091, 0.001712071780582318, 0, -0.007553643211760305, 1, 0.3143676873436091, 0.0005243266024489358],
[584.0184731904426, 1273.9576594498, 0, 1, 0.3143304496385183, 0, 0.0007849554438346739, 0.00346321540200808, 0.6856695503614818, 1, 0.000524484455227562],
[584.1160532981364, 1273.860079342106, 1, 0, 0.3143829692085922, 0.001711988558358614, 0, -0.007553276036159213, 1, 0.3143829692085922, 0.0005242420770835485],
[584.3664077569362, 1273.57182734208, 0, 1, 0.3145241304137289, 0, 0.0007851932482575254, 0.003464264592693174, 0.685475869586271, 1, 0.0005244845165360397],
[584.07815575691, 1273.947782719745, 0, 1, 0.3143541452579396, 0, 0.0007849615294789435, 0.003463242251808449, 0.6856458547420604, 1, 0.0005242536617203562],
[584.07815575691, 1273.897976883333, 0, 1, 0.3143625719922012, 0, 0.0007849922192721898, 0.003463377654862839, 0.6856374280077988, 1, 0.0005243499127184459],
[584.2400979204712, 1273.823738097411, 1, 0, 0.3144348900157209, 0.001711625072567552, 0, -0.007551672340561068, 1, 0.3144348900157209, 0.0005243002213795412],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.7022003792446, 1274.273932260998, 0, 1, 0.3141602252714545, 0, 0.0007847606191124524, 0.003462355837323245, 0.6858397747285454, 1, 0.0005245617826141539],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.9089847875626, 1274.021152820596, 0, 1, 0.3142793009102425, 0, 0.0007849163240234027, 0.003463042805800255, 0.6857206990897575, 1, 0.0005245474488241808],
[584.0184731904427, 1273.9576594498, 0, 1, 0.3143304496385183, 0, 0.0007849554438346739, 0.00346321540200808, 0.6856695503614818, 1, 0.0005244038033433961],
[584.07815575691, 1273.897976883333, 0, 1, 0.3143625719922012, 0, 0.0007849922192721898, 0.003463377654862839, 0.6856374280077988, 1, 0.0005242782846077792],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.7787043792969, 1274.197428260946, 0, 1, 0.3142014012578994, 0, 0.000784807736870748, 0.003462563720391665, 0.6857985987421007, 1, 0.0005245861100015616],
[583.9904523792707, 1273.985680260972, 0, 1, 0.3143153682762339, 0, 0.0007849381790501392, 0.003463139229955026, 0.6856846317237661, 1, 0.0005245033552174505],
[584.07815575691, 1273.925997694504, 1, 1, 0.3143578310478644, 0.001712099639651982, 0.0007849749528699127, -0.004090464650018838, 0.9011791540588825, 0.529894816154611, 0.001051370884841778],
[583.57815575691, 1274.397976883333, 0, 1, 0.3140934619690873, 0, 0.000784684233763145, 0.00346201882594217, 0.6859065380309127, 1, 0.0005244052356458454],
[584.07815575691, 1273.897976883333, 1, 0, 0.3143625719922012, 0.001712099639651982, 0, -0.00755376612569116, 1, 0.3143625719922012, 0.0005243263785061408],
[584.5781557569098, 1273.397976883333, 0, 1, 0.3146316820153152, 0, 0.0007853004466423924, 0.003464737550872466, 0.6853683179846848, 1, 0.0005243266024472148],
[584.07815575691, 1273.897976883333, 1, 0, 0.3143625719922012, 0.001712099639651982, 0, -0.00755376612569116, 1, 0.3143625719922012, 0.0005242420154382628],
[584.0184731904427, 1273.9576594498, 0, 1, 0.3143304496385183, 0, 0.0007849554438346739, 0.00346321540200808, 0.6856695503614818, 1, 0.0005244842397896949],
[583.57815575691, 1274.397976883333, 0, 1, 0.3140934619690873, 0, 0.000784684233763145, 0.00346201882594217, 0.6859065380309127, 1, 0.0005244844552025864],
[584.0819665612388, 1273.894166079004, 0, 1, 0.3143646230434834, 0, 0.0007849945675455607, 0.00346338801542097, 0.6856353769565167, 1, 0.000524071954079129],
[584.0819665612388, 1273.718759323725, 0, 1, 0.314394304202358, 0, 0.0007851026709624228, 0.003463864966592182, 0.685605695797642, 1, 0.000524494344337391],
[584.1236749067942, 1273.67705097817, 1, 0, 0.3144167545895143, 0.0017119662204405, 0, -0.007553177481492615, 1, 0.3144167545895142, 0.0005251940165280486],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0857773655677, 1273.802651897036, 0, 1, 0.3143815140704609, 0, 0.0007850509641432529, 0.00346363683663405, 0.6856184859295391, 1, 0.0005244189903795207],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005242420770818443],
[584.0895881698966, 1273.886544470346, 0, 1, 0.3143687251460475, 0, 0.0007849992641344509, 0.003463408736723191, 0.6856312748539526, 1, 0.0005241490349698095],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005242536000006772],
[584.2098219879023, 1273.815863470162, 0, 1, 0.3144250515804228, 0, 0.0007850428218689115, 0.003463600913002807, 0.6855749484195772, 1, 0.0005240418558160847],
[584.1602691700806, 1273.815863470162, 0, 1, 0.3144067670772339, 0, 0.0007850428218689115, 0.003463600913002807, 0.6855932329227661, 1, 0.0005241323228913056],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005242652229164081],
[584.0762731647419, 1273.899859475501, 1, 0, 0.3143615587433576, 0.001712105158084284, 0, -0.007553790472958119, 1, 0.3143615587433576, 0.0005241625935784312],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0359715291551, 1273.940161111087, 0, 1, 0.3143398675951889, 0, 0.0007849662256725103, 0.003463262971366507, 0.6856601324048111, 1, 0.0005245122721313293],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005243663683823687],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005244198848668132],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005241490349698095],
[584.145459932035, 1273.830672708207, 0, 1, 0.3143987964484484, 0, 0.0007850336951566459, 0.003463560646041496, 0.6856012035515515, 1, 0.0005241489734135644],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005240762668125478],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005243125261126128],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005242091567346302],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005242420770835485],
[584.0952815663934, 1273.880851073849, 1, 0, 0.3143717894461732, 0.001712049440492409, 0, -0.007553544647511771, 1, 0.3143717894461732, 0.0005241490349698095],
[583.9980739879285, 1273.950037841142, 0, 1, 0.3143242108160961, 0, 0.0007849601399554235, 0.003463236121244869, 0.6856757891839038, 1, 0.0005242536681329184],
[583.7003177870765, 1274.303835664338, 0, 1, 0.3141544741451731, 0, 0.0007847422035567098, 0.003462274588079374, 0.6858455258548269, 1, 0.0005243125922095364],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005242885719067953],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005242652227963367],
[584.0857773655677, 1273.840549438262, 0, 1, 0.3143751013907876, 0, 0.0007850276083933578, 0.003463533791304028, 0.6856248986092124, 1, 0.000524242009067954],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005240762668125478],
[584.1126144094374, 1274.313712394392, 0, 1, 0.3143049611302104, 0, 0.0007847361213127291, 0.003462247753281045, 0.6856950388697896, 1, 0.0005243125307004003],
[584.0819665612388, 1273.894166079004, 0, 1, 0.3143646230434834, 0, 0.0007849945675455607, 0.00346338801542097, 0.6856353769565167, 1, 0.0005242885658079619],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005241489041663772],
[583.7098219879023, 1274.26631065234, 0, 1, 0.3141643273740186, 0, 0.0007847653129023445, 0.003462376546276315, 0.6858356726259813, 1, 0.0005242420154653419],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005241742495942182],
[584.2003177870765, 1273.825367670988, 0, 1, 0.3144199363654395, 0, 0.0007850369645474723, 0.003463575070560434, 0.6855800636345606, 1, 0.0005242441045313429],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005241952432838804],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005242652307534491],
[583.9980739879284, 1273.978058652314, 0, 1, 0.314319470378798, 0, 0.0007849428749643118, 0.003463159948280399, 0.6856805296212021, 1, 0.0005241625936060553],
[584.4498244480469, 1273.488410650969, 0, 1, 0.3145690278648577, 0, 0.000785244680388438, 0.003464491510729521, 0.6854309721351423, 1, 0.0005243723532945099],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.1236749067942, 1273.852457733448, 1, 0, 0.3143870713111563, 0.0017119662204405, 0, -0.007553177481492615, 1, 0.3143870713111563, 0.0005243898885536395],
[583.9617327432331, 1273.564205733422, 0, 1, 0.3143760852255642, 0, 0.0007851979472241201, 0.003464285324485802, 0.6856239147744358, 1, 0.0005244082474979694],
[584.0857773655677, 1273.802651897036, 0, 1, 0.3143815140704609, 0, 0.0007850509641432529, 0.00346363683663405, 0.6856184859295391, 1, 0.0005242418106090697],
[584.0359715291549, 1273.940161111087, 0, 1, 0.3143398675951889, 0, 0.0007849662256725103, 0.003463262971366507, 0.6856601324048111, 1, 0.0005241625936077926],
[584.0112855610548, 1273.915294261366, 0, 1, 0.3143349645263561, 0, 0.000784981548227517, 0.003463330574322718, 0.6856650354736439, 1, 0.0005241742495924917],
[584.0359715291551, 1273.894166079004, 0, 1, 0.3143476494121705, 0, 0.0007849945675455607, 0.00346338801542097, 0.6856523505878296, 1, 0.0005243123477493828],
[584.0260947991004, 1273.950037841142, 0, 1, 0.3143345517410823, 0, 0.0007849601399554235, 0.003463236121244869, 0.6856654482589177, 1, 0.0005242885719067953],
[584.0359715291551, 1273.940161111087, 0, 1, 0.3143398675951889, 0, 0.0007849662256725103, 0.003463262971366507, 0.6856601324048111, 1, 0.0005241626618837616],
[584.0857773655677, 1273.802651897036, 0, 1, 0.3143815140704609, 0, 0.0007850509641432529, 0.00346363683663405, 0.6856184859295391, 1, 0.000524242009067954],
[584.0359715291549, 1273.940161111087, 0, 1, 0.3143398675951889, 0, 0.0007849662256725103, 0.003463262971366507, 0.6856601324048111, 1, 0.0005242536000006772],
[584.1355832019804, 1273.840549438262, 0, 1, 0.3143934805943419, 0, 0.000785027608393358, 0.003463533791304029, 0.6856065194056582, 1, 0.0005242441093173968],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005242883656884773],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005242420770835485],
[583.9980739879285, 1273.978058652314, 0, 1, 0.314319470378798, 0, 0.0007849428749643118, 0.003463159948280399, 0.685680529621202, 1, 0.0005242420770835485],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005242536000006772],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005243617180505276],
[584.2098219879023, 1273.76631065234, 0, 1, 0.3144334373971326, 0, 0.0007850733620736641, 0.00346373565607429, 0.6855665626028674, 1, 0.0005241951816511371],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005242652307534491],
[584.0478798243412, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143526887981909, 0.00171218839164481, 0, -0.007554157698577154, 1, 0.3143526887981909, 0.0005242420770835485],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005241741878012327],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005245993733921621],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005242885657814674],
[584.0952815663934, 1273.880851073849, 1, 0, 0.3143717894461732, 0.001712049440492409, 0, -0.007553544647511771, 1, 0.3143717894461732, 0.0005241489734135644],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005241626004105743],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005242536000024465],
[584.5457287485716, 1274.201323048653, 0, 1, 0.3144837422517355, 0, 0.0007848053379880354, 0.003462553136545635, 0.6855162577482645, 1, 0.0005247508495978532],
[584.2098219879023, 1273.76631065234, 0, 1, 0.3144334373971326, 0, 0.0007850733620736641, 0.00346373565607429, 0.6855665626028674, 1, 0.0005241951816511371],
[584.0857773655677, 1273.830672708207, 0, 1, 0.3143767726166451, 0, 0.0007850336951566459, 0.003463560646041496, 0.6856232273833549, 1, 0.0005241625936060553],
[584.0762731647419, 1273.899859475501, 1, 0, 0.3143615587433576, 0.001712105158084284, 0, -0.007553790472958119, 1, 0.3143615587433576, 0.0005241626004105743],
[583.7098219879023, 1274.26631065234, 0, 1, 0.3141643273740186, 0, 0.0007847653129023445, 0.003462376546276315, 0.6858356726259813, 1, 0.0005242534519959037],
[584.1126144094374, 1273.97173079381, 0, 1, 0.3143628091573766, 0, 0.0007849467738007826, 0.003463177149907092, 0.6856371908426234, 1, 0.0005243125922095364],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005241109664303169],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005242420770835485],
[584.0112855610547, 1273.964847079188, 0, 1, 0.3143265811122968, 0, 0.000784951015165524, 0.003463195862765017, 0.6856734188877032, 1, 0.0005241626004105743],
[584.0952815663934, 1273.880851073849, 1, 0, 0.3143717894461732, 0.001712049440492409, 0, -0.007553544647511771, 1, 0.3143717894461732, 0.0005241605558820034],
[584.1600161514896, 1273.924329051758, 0, 1, 0.3143883202393544, 0, 0.0007849759810650193, 0.003463306012058632, 0.6856116797606456, 1, 0.0005242441045296394],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005241951816528813],
[583.961732743233, 1274.01439989701, 0, 1, 0.3142999107923981, 0, 0.0007849204844786993, 0.003463061161686535, 0.6857000892076019, 1, 0.0005241625936077926],
[584.0478798243412, 1273.928252815901, 1, 0, 0.3143462768783745, 0.00171218839164481, 0, -0.007554157698577154, 1, 0.3143462768783745, 0.0005242420770835485],
[584.1236749067942, 1273.852457733448, 1, 0, 0.3143870713111562, 0.0017119662204405, 0, -0.007553177481492615, 1, 0.3143870713111563, 0.0005240762667835949],
[584.0115385796457, 1273.51439989701, 0, 1, 0.3144028982220242, 0, 0.0007852286555070528, 0.0034644208091165, 0.6855971017779758, 1, 0.0005243617801926529],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005242883656884773],
[584.1236749067942, 1273.834483512537, 1, 0, 0.3143901127481477, 0.0017119662204405, 0, -0.007553177481492615, 1, 0.3143901127481477, 0.0005242652307534491],
[584.1236749067942, 1273.852457733448, 1, 0, 0.3143870713111563, 0.0017119662204405, 0, -0.007553177481492615, 1, 0.3143870713111563, 0.0005242652307534491],
[584.0952815663934, 1273.880851073849, 1, 0, 0.3143717894461732, 0.001712049440492409, 0, -0.007553544647511771, 1, 0.3143717894461732, 0.0005241604868321114],
[584.0494361208723, 1273.818483956365, 0, 1, 0.3143654238330308, 0, 0.0007850412068869421, 0.003463593787718851, 0.6856345761669691, 1, 0.0005247508467426401],
[584.1602691700806, 1273.865416287984, 0, 1, 0.3143983819718111, 0, 0.0007850122840401606, 0.003463466180414219, 0.685601618028189, 1, 0.0005241951815562729],
[583.7098219879023, 1274.26631065234, 0, 1, 0.3141643273740186, 0, 0.0007847653129023445, 0.003462376546276315, 0.6858356726259813, 1, 0.000524242009067954],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005242536000006772],
[584.0857773655677, 1273.949015019858, 0, 1, 0.3143567492703907, 0, 0.0007849607701799686, 0.003463238901789126, 0.6856432507296093, 1, 0.0005241858429081053],
[583.7003177870765, 1274.362495409521, 1, 3, 0.3141445561697039, 0.001713207907426191, 0.002354118244068332, 0.002827689860104645, 0.6266773055480694, 0.7787260134010444, 0.002100163556247087],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005241489734135644],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005242536618494451],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005242104391959891],
[584.5359715291549, 1273.440161111087, 0, 1, 0.3146089776183029, 0, 0.0007852744326262581, 0.003464622777298944, 0.6853910223816971, 1, 0.0005242420770818443],
[583.9980739879285, 1273.978058652314, 0, 1, 0.314319470378798, 0, 0.0007849428749643118, 0.003463159948280399, 0.685680529621202, 1, 0.000524242009067954],
[583.9712369440588, 1273.896683133179, 0, 1, 0.3143233330170108, 0, 0.0007849930164983838, 0.003463381172216666, 0.6856766669829892, 1, 0.0005241625935784312],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.000524242009067954],
[584.0380030942865, 1273.862334463503, 0, 1, 0.3143537849086161, 0, 0.0007850141832014822, 0.003463474559494575, 0.6856462150913839, 1, 0.0005243173947787471],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0478798243412, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143526887981909, 0.00171218839164481, 0, -0.007554157698577154, 1, 0.3143526887981909, 0.0005242617170137744],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005242420089663696],
[584.0359715291549, 1273.940161111087, 0, 1, 0.3143398675951889, 0, 0.0007849662256725103, 0.003463262971366507, 0.6856601324048111, 1, 0.0005242420770835485],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005241626620095668],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005242420770835485],
[583.9980739879285, 1273.978058652314, 0, 1, 0.314319470378798, 0, 0.0007849428749643118, 0.003463159948280399, 0.685680529621202, 1, 0.0005242420770835485],
[584.0359715291549, 1273.940161111087, 0, 1, 0.3143398675951889, 0, 0.0007849662256725103, 0.003463262971366507, 0.6856601324048111, 1, 0.0005241626620095668],
[584.0359715291551, 1273.940161111087, 0, 1, 0.3143398675951889, 0, 0.0007849662256725103, 0.003463262971366507, 0.6856601324048111, 1, 0.000524242009067954],
[584.1236749067942, 1273.852457733448, 1, 0, 0.3143870713111563, 0.0017119662204405, 0, -0.007553177481492615, 1, 0.3143870713111563, 0.0005242652307534491],
[584.1602691700806, 1273.865416287984, 0, 1, 0.3143983819718111, 0, 0.0007850122840401606, 0.003463466180414219, 0.685601618028189, 1, 0.000524148966032984],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005242420154382628],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005241490349698095],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.000524242009067954],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005241489660044184],
[584.0478798243412, 1273.928252815901, 1, 1, 0.3143462768783745, 0.00171218839164481, 0.0007849735632988686, -0.004090862353678088, 0.9011864182127045, 0.5298789719694532, 0.001049101124946306],
[584.5359715291549, 1273.440161111087, 1, 0, 0.3146089776183029, 0.001710758702127407, 0, -0.007547849923026772, 1, 0.3146089776183029, 0.0005246819396350768],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005241489660026847],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005242652227963367],
[584.0857773655677, 1273.99856783768, 1, 0, 0.314348365763599, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.314348365763599, 0.0005241489660026847],
[583.9980739879285, 1273.978058652314, 0, 1, 0.314319470378798, 0, 0.0007849428749643118, 0.003463159948280399, 0.685680529621202, 1, 0.0005241625937047837],
[584.0478798243411, 1273.928252815901, 1, 0, 0.3143462768783745, 0.00171218839164481, 0, -0.007554157698577155, 1, 0.3143462768783745, 0.0005242420770835485],
[583.9333394028322, 1274.014772426238, 1, 0, 0.3142893688392486, 0.001712524242960103, 0, -0.007555639471150416, 1, 0.3142893688392486, 0.0005242420770835485],
[584.0260947991004, 1273.950037841142, 0, 1, 0.3143345517410823, 0, 0.0007849601399554235, 0.003463236121244869, 0.6856654482589177, 1, 0.0005242420155667044],
[583.9980739879285, 1273.978058652314, 0, 1, 0.314319470378798, 0, 0.0007849428749643118, 0.003463159948280399, 0.685680529621202, 1, 0.0005241625936060553],
[584.1236749067942, 1273.852457733448, 1, 0, 0.3143870713111563, 0.0017119662204405, 0, -0.007553177481492615, 1, 0.3143870713111563, 0.0005242652307534491],
[584.0359715291551, 1273.940161111087, 0, 1, 0.3143398675951889, 0, 0.0007849662256725103, 0.003463262971366507, 0.6856601324048111, 1, 0.0005242420770818443],
[584.7840607738242, 1273.192071866418, 1, 0, 0.3147425042230374, 0.001710032928525335, 0, -0.007544647817306239, 1, 0.3147425042230374, 0.0005271737195225745],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.2098219879023, 1273.76631065234, 0, 1, 0.3144334373971326, 0, 0.0007850733620736641, 0.00346373565607429, 0.6855665626028674, 1, 0.0005242367220324358],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.375724542355, 1273.708620660892, 0, 1, 0.3145044120580182, 0, 0.0007851089203440639, 0.003463892538800163, 0.6854955879419817, 1, 0.0005242243526465719],
[584.3488874984854, 1273.627245141757, 0, 1, 0.3145082852426674, 0, 0.0007851590830947545, 0.003464113856343933, 0.6854917147573325, 1, 0.0005241019042367743],
[584.1734807432069, 1273.802651897036, 0, 1, 0.3144138778107327, 0, 0.0007850509641432527, 0.003463636836634049, 0.6855861221892673, 1, 0.0005241489660026847],
[584.2706883216719, 1273.70544431857, 1, 0, 0.3144661968781078, 0.001711535457773037, 0, -0.00755127696100284, 1, 0.3144661968781078, 0.0005241134253684481],
[584.1734807432069, 1273.802651897036, 0, 1, 0.3144138778107327, 0, 0.0007850509641432529, 0.00346363683663405, 0.6855861221892673, 1, 0.0005243173596589222],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005242666651640043],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0857773655677, 1273.978058652314, 0, 1, 0.3143518355200077, 0, 0.0007849428749643118, 0.003463159948280399, 0.6856481644799923, 1, 0.0002737476220917076],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 0, 0.3143666740947653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002502802919128738],
[584.1322483589087, 1273.902544026517, 0, 4, 0.3143817601009368, 0, 0.003139957619801047, 0.01385346095241293, 0.2209680338668965, 1, 0.00212105125712817],
[584.0359715291551, 1273.894166079004, 0, 1, 0.3143476494121705, 0, 0.0007849945675455607, 0.00346338801542097, 0.6856523505878296, 1, 0.0002738235339937886],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 0, 0.3143666740947653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002505551969992758],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.9482681515158, 1274.027864488727, 1, 0, 0.3142926638792216, 0.001712480461951695, 0, -0.007555446309788424, 1, 0.3142926638792216, 0.0005251467270154115],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.9980739879285, 1273.978058652314, 0, 1, 0.314319470378798, 0, 0.0007849428749643118, 0.003463159948280399, 0.685680529621202, 1, 0.0005243692131102805],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0478798243412, 1273.928252815901, 1, 0, 0.3143462768783745, 0.00171218839164481, 0, -0.007554157698577154, 1, 0.3143462768783745, 0.0005251777005832795],
[584.0478798243412, 1273.928252815901, 1, 0, 0.3143462768783745, 0.00171218839164481, 0, -0.007554157698577154, 1, 0.3143462768783745, 0.0005241423572441715],
[583.2516799200204, 1271.664770153755, 1, 0, 0.3144355530928754, 0.001714525708930881, 0, -0.007564469918573942, 1, 0.3144355530928753, 0.0005249222159334543],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.1866923163333, 1271.739887506088, 0, 1, 0.314398800825941, 0, 0.0007863243182228278, 0.003469254861829277, 0.6856011991740589, 1, 0.0005250193187767686],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.2611841208461, 1271.714948519396, 0, 1, 0.314430559972043, 0, 0.0007863397384486653, 0.003469322895708196, 0.6855694400279571, 1, 0.0005249172162353576],
[583.3170558829846, 1271.659076757258, 1, 0, 0.3144606799079038, 0.001714333551393024, 0, -0.007563622121479287, 1, 0.3144606799079037, 0.0005248799862277114],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.1734807432069, 1271.802651897036, 0, 1, 0.3143832799148519, 0, 0.0007862855125426797, 0.003469083651564758, 0.6856167200851481, 1, 0.0005249583983763746],
[584.0589403216981, 1271.660090664355, 0, 1, 0.3147345748840831, 0, 0.0007863736601795601, 0.003469472558038486, 0.6852654251159169, 1, 0.0005249416734587613],
[582.875724542355, 1272.128428909059, 0, 1, 0.3142180158776779, 0, 0.0007860841541428101, 0.003468195260360863, 0.6857819841223221, 1, 0.0005249022169758127],
[583.2611841208461, 1271.714948519396, 0, 1, 0.314430559972043, 0, 0.0007863397384486653, 0.003469322895708196, 0.6855694400279571, 1, 0.0005248989240097727],
[583.2611841208461, 1271.714948519396, 0, 1, 0.314430559972043, 0, 0.0007863397384486653, 0.003469322895708196, 0.6855694400279571, 1, 0.0005249055149478508],
[583.2611841208461, 1271.714948519396, 0, 1, 0.314430559972043, 0, 0.0007863397384486653, 0.003469322895708196, 0.6855694400279571, 1, 0.000524984266302772],
[583.2611841208461, 1271.665142682984, 0, 1, 0.3144390026130292, 0, 0.0007863705361068407, 0.003469458774661551, 0.6855609973869707, 1, 0.0005249958560080587],
[583.2990816620727, 1271.67705097817, 1, 0, 0.3144509901762703, 0.001714386378169095, 0, -0.00756385519267583, 1, 0.3144509901762702, 0.000524808930388206],
[583.2015015543789, 1271.774631085864, 0, 1, 0.3143983856677934, 0, 0.0007863028366481743, 0.003469160085341281, 0.6856016143322066, 1, 0.000524962688951524],
[583.2053123587077, 1271.770820281535, 1, 0, 0.3144004400361822, 0.001714662021776882, 0, -0.007565071329458437, 1, 0.3144004400361822, 0.000524966900572163],
[583.3208666873135, 1271.655265952929, 0, 1, 0.3144627342762926, 0, 0.000786376643712979, 0.003469485721357461, 0.6855372657237074, 1, 0.0005248627580982825],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.3208666873135, 1271.655265952929, 0, 1, 0.3144627342762926, 0, 0.000786376643712979, 0.003469485721357461, 0.6855372657237074, 1, 0.0005250175494741349],
[583.2611841208461, 1271.714948519396, 0, 1, 0.314430559972043, 0, 0.0007863397384486653, 0.003469322895708196, 0.6855694400279571, 1, 0.0005248558220075917],
[584.1236749067942, 1273.852457733448, 1, 0, 0.3143870713111563, 0.0017119662204405, 0, -0.007553177481492615, 1, 0.3143870713111563, 0.0005249483538175898],
[584.1236749067942, 1273.852457733448, 1, 0, 0.3143870713111563, 0.0017119662204405, 0, -0.007553177481492615, 1, 0.3143870713111563, 0.0005250138812395679],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005243810255409334],
[583.2611841208461, 1271.714948519396, 0, 1, 0.314430559972043, 0, 0.0007863397384486653, 0.003469322895708196, 0.6855694400279571, 1, 0.0005250188144925991],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.1236749067942, 1273.852457733448, 1, 0, 0.3143870713111563, 0.0017119662204405, 0, -0.007553177481492615, 1, 0.3143870713111563, 0.0005251051818532151],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005244072835668172],
[584.0857773655677, 1273.714948519396, 1, 0, 0.3143963554472928, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143963554472928, 0.0005241717835759332],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0857773655677, 1273.802651897036, 0, 1, 0.3143815140704609, 0, 0.0007850509641432527, 0.003463636836634049, 0.6856184859295391, 1, 0.0005242987435042007],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0478798243412, 1273.946227036813, 1, 0, 0.3143432358948738, 0.00171218839164481, 0, -0.007554157698577154, 1, 0.3143432358948738, 0.0005242667354272869],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.979065586277, 1273.997067053966, 0, 1, 0.3143092396759825, 0, 0.000784931163391478, 0.003463108276940659, 0.6856907603240175, 1, 0.0005243350314341015],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0667689639162, 1273.909363676326, 0, 0, 0.3143564433919498, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001938235347169095],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0762731647419, 1273.899859475501, 1, 0, 0.3143615587433576, 0.001712105158084284, 0, -0.007553790472958119, 1, 0.3143615587433576, 0.0003303320934572156],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005243554446537256]
],
"NAMES": [
["epi_isl_414525_England_20200302_null_1"],
["epi_isl_422099_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_424019_England_20200319_null_1"],
["epi_isl_424002_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_423916_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_423782_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_423377_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_423129_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_423099_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_423091_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_423087_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_418259_Abruzzo_20200314_null_1"],
["epi_isl_422094_Wales_20200325_null_1"],
["epi_isl_421850_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_413485_Anhui_20200124_null_1"],
["epi_isl_423179_England_20200324_null_1"],
["Node975"],
["epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_4"],
["epi_isl_423378_England_20200328_null_1"],
["Node972"],
["epi_isl_414579_Santiago_20200303_null_1"],
["epi_isl_425759_Scotland_20200313_null_4"],
["Node966"],
["epi_isl_425421_England_20200314_null_3"],
["epi_isl_425794_Scotland_20200325_null_1"],
["epi_isl_422407_Taipei_20200304_null_1"],
["epi_isl_419961_Victoria_20200322_null_1"],
["epi_isl_418946_Illinois_20200312_null_2"],
["Node474"],
["epi_isl_424344_Rome_20200304_null_1"],
["epi_isl_423649_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_422667_Netherlands_20200316_null_5"],
["epi_isl_422006_England_20200403_null_1"],
["epi_isl_423228_England_20200325_null_6"],
["epi_isl_425950_Scotland_20200326_null_1"],
["epi_isl_423722_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_423665_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_425398_England_20200314_null_1"],
["epi_isl_423684_England_20200320_null_2"],
["epi_isl_423824_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_427805_New_South_Wales_20200320_null_439"],
["epi_isl_421934_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_422436_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_423745_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_423414_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_421898_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_423469_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_421892_England_20200327_null_3"],
["epi_isl_423266_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_417409_New_South_Wales_20200316_null_1"],
["epi_isl_425352_England_20200317_null_2"],
["epi_isl_423152_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_423213_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_425379_England_20200318_null_2"],
["epi_isl_423491_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_425402_England_20200313_null_1"],
["epi_isl_423970_England_20200320_null_3"],
["epi_isl_425412_England_20200317_null_1"],
["Node396"],
["epi_isl_423901_England_20200318_null_2"],
["epi_isl_422091_Wales_20200328_null_3"],
["epi_isl_427063_Victoria_20200331_null_1"],
["Node368"],
["epi_isl_427734_New_South_Wales_20200318_null_37"],
["Node367"],
["epi_isl_422154_Wales_20200325_null_1"],
["Node366"],
["epi_isl_422224_Wales_20200329_null_3"],
["epi_isl_427815_Saint_Petersburg_20200407_null_4"],
["Node353"],
["epi_isl_419587_Luxembourg_20200311_null_1"],
["Node352"],
["epi_isl_422634_Zuid_Holland_20200331_null_1"],
["epi_isl_424203_Washington_20200320_null_1"],
["Node348"],
["epi_isl_425518_England_20200320_null_4"],
["epi_isl_427629_New_York_20200330_null_3"],
["epi_isl_422670_Netherlands_20200317_null_1"],
["epi_isl_427105_Victoria_20200404_null_18"],
["Node358"],
["epi_isl_422703_Netherlands_20200316_null_2"],
["epi_isl_424429_Reykjavik_20200319_null_3"],
["Node363"],
["epi_isl_421711_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_427132_Victoria_20200405_null_1"],
["Node343"],
["epi_isl_422839_Netherlands_20200310_null_1"],
["epi_isl_426514_Arizona_20200311_null_1"],
["epi_isl_421666_India_20200310_null_1"],
["epi_isl_422562_New_York_20200322_null_1"],
["Node336"],
["epi_isl_417432_Cork_20200308_null_1"],
["epi_isl_423522_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_426884_Czech_Republic_20200327_null_1"],
["Node332"],
["epi_isl_417521_Taoyuan_20200310_null_6"],
["epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1"],
["epi_isl_427147_Victoria_20200406_null_26"],
["Node311"],
["epi_isl_427655_New_South_Wales_20200311_null_57"],
["epi_isl_424280_Washington_20200323_null_4"],
["epi_isl_416373_Shanghai_20200207_null_1"],
["epi_isl_416382_Shanghai_20200208_null_1"],
["epi_isl_427086_Victoria_20200402_null_2"],
["Node300"],
["epi_isl_421671_India_20200312_null_3"],
["epi_isl_416543_Dasman_20200302_null_1"],
["epi_isl_427644_New_South_Wales_20200302_null_25"],
["epi_isl_421665_India_20200310_null_1"],
["epi_isl_421663_India_20200310_null_1"],
["epi_isl_416541_Dasman_20200302_null_1"],
["epi_isl_415579_British_Columbia_20200302_null_1"],
["epi_isl_417444_Gilgit_20200304_null_1"],
["Node316"],
["epi_isl_417877_Kostoliste_20200306_null_1"],
["Node315"],
["epi_isl_428148_V_sterbotten_20200318_null_1"],
["epi_isl_427773_New_South_Wales_20200325_null_12"],
["epi_isl_422582_Netherlands_20200330_null_1"],
["epi_isl_418650_Li_ge_20200322_null_1"],
["epi_isl_427391_Istanbul_20200413_null_28"],
["Node282"],
["epi_isl_416748_ARA_20200304_null_1"],
["epi_isl_424645_Li_ge_20200404_null_1"],
["epi_isl_422387_Greater_Accra_20200325_null_1"],
["epi_isl_423571_England_20200402_null_1"],
["Node291"],
["epi_isl_421362_New_York_20200317_null_1"],
["epi_isl_419929_Victoria_20200321_null_1"],
["epi_isl_422194_Wales_20200324_null_4"],
["Node276"],
["epi_isl_422419_Taipei_20200319_null_1"],
["epi_isl_423813_England_20200323_null_1"],
["Node273"],
["epi_isl_418042_Minnesota_20200313_null_1"],
["epi_isl_421336_Wisconsin_20200324_null_1"],
["Node270"],
["epi_isl_421419_New_York_20200318_null_2"],
["epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1"],
["epi_isl_417363_Washington_20200314_null_1"],
["Node265"],
["epi_isl_420184_South_Yorkshire_20200327_null_1"],
["epi_isl_422088_Wales_20200330_null_1"],
["Node464"],
["epi_isl_414482_USA_20200218_null_1"],
["Node463"],
["epi_isl_422113_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_422215_Wales_20200329_null_1"],
["epi_isl_418691_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_422195_Wales_20200326_null_3"],
["epi_isl_421826_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_420488_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_421833_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_427665_New_South_Wales_20200311_null_193"],
["epi_isl_422087_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_420970_Wales_20200322_null_1"],
["epi_isl_419499_Wales_20200320_null_1"],
["epi_isl_427042_Victoria_20200318_null_1"],
["epi_isl_422056_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_427396_New_Taipei_City_20200323_null_1"],
["Node434"],
["epi_isl_418800_Gierle_20200310_null_1"],
["epi_isl_416700_Washington_20200313_null_1"],
["Node459"],
["epi_isl_417338_ARA_20200307_null_1"],
["epi_isl_425443_England_20200401_null_4"],
["Node262"],
["epi_isl_422384_Greater_Accra_20200324_null_2"],
["epi_isl_425596_England_20200324_null_1"],
["Node259"],
["epi_isl_413609_USA_20200221_null_1"],
["epi_isl_424591_Reykjavik_20200328_null_2"],
["Node256"],
["epi_isl_417448_Washington_20200314_null_1"],
["epi_isl_420729_England_20200328_null_1"],
["Node470"],
["epi_isl_424231_Washington_20200321_null_7"],
["epi_isl_424961_New_York_20200401_null_1"],
["epi_isl_425442_England_20200331_null_2"],
["Node253"],
["epi_isl_423258_England_20200323_null_5"],
["epi_isl_424352_Anhui_20200310_null_1"],
["Node491"],
["epi_isl_421895_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_423264_England_20200325_null_3"],
["epi_isl_424136_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_423399_England_20200329_null_2"],
["epi_isl_427123_Victoria_20200405_null_161"],
["Node480"],
["epi_isl_421775_England_20200325_null_1"],
["Node479"],
["epi_isl_418385_Finland_20200313_null_1"],
["epi_isl_421487_Portugal_20200322_null_2"],
["epi_isl_424256_Washington_20200322_null_1"],
["Node250"],
["epi_isl_424420_Reykjavik_20200319_null_1"],
["epi_isl_427768_New_South_Wales_20200323_null_1"],
["Node247"],
["epi_isl_423012_Washington_20200319_null_1"],
["epi_isl_423092_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_419818_Victoria_20200317_null_1"],
["epi_isl_424672_Puebla_20200311_null_1"],
["Node244"],
["epi_isl_425922_Scotland_20200323_null_4"],
["epi_isl_425967_Scotland_20200329_null_1"],
["epi_isl_419229_Hong_Kong_20200217_null_1"],
["epi_isl_422982_USA_20200316_null_2"],
["epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1"],
["epi_isl_427481_New_York_20200401_null_1"],
["Node241"],
["epi_isl_421969_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_422036_Wales_20200329_null_1"],
["epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1"],
["epi_isl_417346_Washington_20200312_null_6"],
["epi_isl_422257_Wales_20200324_null_1"],
["epi_isl_422260_Wales_20200327_null_1"],
["epi_isl_419946_Victoria_20200321_null_1"],
["epi_isl_426627_Louisiana_20200406_null_1"],
["Node238"],
["epi_isl_417030_New_South_Wales_20200124_null_1"],
["epi_isl_427569_New_York_20200315_null_1"],
["Node235"],
["epi_isl_418927_Washington_20200316_null_1"],
["epi_isl_420456_Western_Australia_20200222_null_3"],
["epi_isl_427208_Washington_20200327_null_2"],
["epi_isl_416408_Shanghai_20200212_null_1"],
["epi_isl_427443_Wisconsin_20200409_null_1"],
["epi_isl_427285_Minnesota_20200322_null_4"],
["epi_isl_413522_Kerala_20200127_null_1"],
["epi_isl_423858_England_20200318_null_4"],
["epi_isl_419920_Victoria_20200320_null_2"],
["epi_isl_427004_Victoria_20200327_null_6"],
["Node548"],
["epi_isl_426792_Victoria_20200324_null_1"],
["epi_isl_423564_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_425409_England_20200317_null_10"],
["Node230"],
["epi_isl_427478_New_York_20200401_null_3"],
["Node229"],
["epi_isl_421736_Luxembourg_20200317_null_1"],
["epi_isl_423393_England_20200330_null_1"],
["Node226"],
["epi_isl_420879_Queensland_20200325_null_1"],
["epi_isl_418412_ARA_20200315_null_1"],
["epi_isl_416480_Tbilisi_20200311_null_3"],
["epi_isl_419746_Victoria_20200310_null_1"],
["epi_isl_426898_Northern_territory_20200326_null_1"],
["epi_isl_416348_Shanghai_20200206_null_3"],
["epi_isl_420485_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_426783_Victoria_20200323_null_3"],
["Node223"],
["epi_isl_423040_Bangkok_20200320_null_1"],
["epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1"],
["epi_isl_422065_Wales_20200324_null_1"],
["Node572"],
["epi_isl_425763_Scotland_20200312_null_1"],
["epi_isl_422595_Netherlands_20200331_null_1"],
["epi_isl_425138_Duesseldorf_20200319_null_1"],
["Node220"],
["epi_isl_416907_Selangor_20200220_null_1"],
["epi_isl_427680_New_South_Wales_20200322_null_8"],
["epi_isl_425350_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_420319_Montigny_le_Tilleul_20200304_null_2"],
["epi_isl_424636_Li_ge_20200403_null_3"],
["Node588"],
["epi_isl_422623_Netherlands_20200402_null_4"],
["epi_isl_416691_Washington_20200313_null_1"],
["epi_isl_424673_CDMX_20200312_null_2"],
["Node217"],
["epi_isl_418809_Tokyo_20200201_null_4"],
["epi_isl_421465_Portugal_20200319_null_1"],
["epi_isl_427753_New_South_Wales_20200324_null_2"],
["epi_isl_427746_New_South_Wales_20200321_null_9"],
["epi_isl_421615_New_York_20200320_null_2"],
["epi_isl_422622_Netherlands_20200402_null_1"],
["epi_isl_424378_Reykjavik_20200319_null_2"],
["epi_isl_425439_England_20200101_null_5"],
["Node210"],
["epi_isl_424396_Reykjavik_20200319_null_6"],
["epi_isl_419556_Georgia_20200229_null_2"],
["epi_isl_427681_New_South_Wales_20200319_null_9"],
["epi_isl_416334_Shanghai_20200206_null_1"],
["epi_isl_426871_Victoria_20200326_null_7"],
["epi_isl_427636_New_York_20200405_null_1"],
["epi_isl_427631_New_York_20200406_null_2"],
["epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1"],
["epi_isl_421706_New_York_20200318_null_1"],
["Node199"],
["epi_isl_420057_Hauts_de_France_20200322_null_1"],
["epi_isl_425897_Scotland_20200322_null_1"],
["epi_isl_422394_Greater_Accra_20200327_null_1"],
["epi_isl_419922_Victoria_20200320_null_1"],
["epi_isl_420062_Ile_de_France_20200322_null_1"],
["epi_isl_426839_Victoria_20200325_null_1"],
["epi_isl_416509_Bretagne_20200306_null_1"],
["epi_isl_422932_Zuid_Holland_20200323_null_1"],
["epi_isl_414630_Hauts_de_France_20200303_null_1"],
["epi_isl_418237_Hauts_de_France_20200316_null_1"],
["Node186"],
["epi_isl_426678_Victoria_20200322_null_1"],
["epi_isl_426003_Scotland_20200330_null_6"],
["epi_isl_426059_Idaho_20200323_null_1"],
["epi_isl_424315_Idaho_20200320_null_1"],
["epi_isl_427622_Alaska_20200324_null_38"],
["Node178"],
["epi_isl_427808_New_South_Wales_20200324_null_1448"],
["epi_isl_424956_New_York_20200401_null_1"],
["epi_isl_417939_California_20200318_null_1"],
["epi_isl_417938_California_20200318_null_1"],
["epi_isl_419864_Victoria_20200318_null_1"],
["epi_isl_427550_New_York_20200314_null_1"],
["epi_isl_427554_New_York_20200315_null_1"],
["epi_isl_422430_Singapore_20200313_null_1"],
["epi_isl_426161_Wisconsin_20200406_null_1"],
["epi_isl_422124_Wales_20200329_null_1"],
["epi_isl_427640_New_York_20200405_null_1"],
["epi_isl_424501_Reykjavik_20200320_null_1"],
["epi_isl_426294_New_York_20200311_null_1"],
["epi_isl_426557_Arizona_20200401_null_1"],
["epi_isl_424934_New_York_20200401_null_1"],
["epi_isl_421726_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_420301_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_418964_Utah_20200314_null_2"],
["epi_isl_421409_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_421622_New_York_20200320_null_1"],
["epi_isl_427212_Washington_20200327_null_7"],
["epi_isl_427482_New_York_20200401_null_1"],
["epi_isl_423032_Washington_20200318_null_1"],
["epi_isl_424242_Washington_20200321_null_1"],
["epi_isl_417715_Reykjavik_20200304_null_1"],
["epi_isl_424496_Reykjavik_20200320_null_2"],
["epi_isl_418184_Wisconsin_20200318_null_1"],
["epi_isl_420417_Saint_Ghislain_20200324_null_1"],
["epi_isl_422620_Netherlands_20200402_null_1"],
["epi_isl_422656_Netherlands_20200318_null_2"],
["epi_isl_422408_Taipei_20200313_null_2"],
["epi_isl_422509_New_York_20200320_null_1"],
["epi_isl_427567_New_York_20200315_null_1"],
["epi_isl_427611_New_York_20200316_null_18"],
["epi_isl_420322_Elsene_20200305_null_4"],
["epi_isl_427160_Victoria_20200331_null_5"],
["epi_isl_421979_England_20200331_null_3"],
["epi_isl_426090_Washington_20200325_null_1"],
["epi_isl_426698_Victoria_20200324_null_1"],
["epi_isl_419822_Victoria_20200318_null_1"],
["epi_isl_426804_Victoria_20200323_null_7"],
["Node109"],
["epi_isl_424532_Reykjavik_20200320_null_5"],
["epi_isl_424622_Reykjavik_20200328_null_1"],
["Node112"],
["epi_isl_423948_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_427225_Washington_20200329_null_1"],
["epi_isl_427556_New_York_20200315_null_1"],
["Node117"],
["epi_isl_427240_Washington_20200331_null_1"],
["epi_isl_424304_Washington_20200324_null_1"],
["epi_isl_424413_Reykjavik_20200319_null_1"],
["epi_isl_427483_New_York_20200401_null_9"],
["epi_isl_427514_New_York_20200403_null_1"],
["epi_isl_426123_Washington_20200324_null_1"],
["epi_isl_427181_Washington_20200326_null_1"],
["Node62"],
["epi_isl_427018_Victoria_20200330_null_1"],
["epi_isl_423486_England_20200331_null_2"],
["epi_isl_427003_Victoria_20200328_null_4"],
["Node205"],
["epi_isl_417028_Utah_20200320_null_2"],
["epi_isl_419816_Victoria_20200311_null_2"],
["epi_isl_425216_Comunitat_Valenciana_20200316_null_1"],
["epi_isl_412869_Seoul_20200130_null_1"],
["epi_isl_423106_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1"],
["epi_isl_423089_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_420509_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_420510_England_20200323_null_1"],
["Node623"],
["epi_isl_425988_Scotland_20200330_null_1"],
["epi_isl_420610_ARA_20200323_null_1"],
["epi_isl_419932_Victoria_20200321_null_1"],
["epi_isl_425403_England_20200315_null_1"],
["epi_isl_420455_Hong_Kong_20200304_null_12"],
["epi_isl_427355_Liege_20200406_null_1"],
["epi_isl_420807_Utah_20200323_null_1"],
["epi_isl_419733_Victoria_20200131_null_1"],
["epi_isl_413021_Zurich_20200229_null_1"],
["epi_isl_420379_Tienen_20200325_null_1"],
["epi_isl_426888_Czech_Republic_20200331_null_2"],
["epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1"],
["epi_isl_420193_South_Yorkshire_20200328_null_1"],
["epi_isl_416350_Shanghai_20200129_null_5"],
["epi_isl_421993_England_20200331_null_9"],
["epi_isl_426719_Victoria_20200325_null_1"],
["epi_isl_417755_Reykjavik_20200313_null_2"],
["epi_isl_418751_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_420797_Texas_20200301_null_1"],
["epi_isl_419669_Austria_20200316_null_1"],
["epi_isl_427252_Washington_20200331_null_1"],
["epi_isl_416386_Shanghai_20200131_null_1"],
["epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1"],
["epi_isl_414532_Noord_Brabant_20200305_null_1"],
["epi_isl_426647_Victoria_20200320_null_14"],
["Node670"],
["epi_isl_423958_England_20200319_null_1"],
["epi_isl_418938_Washington_20200316_null_6"],
["epi_isl_417015_Li_ge_20200313_null_1"],
["epi_isl_420656_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_418389_Finland_20200313_null_1"],
["epi_isl_427717_New_South_Wales_20200317_null_2"],
["epi_isl_421239_Jiangxi_20200126_null_1"],
["epi_isl_419944_Victoria_20200321_null_1"],
["epi_isl_427341_Liege_20200330_null_1"],
["epi_isl_416409_Shanghai_20200202_null_1"],
["epi_isl_427632_New_York_20200406_null_16"],
["epi_isl_417149_Washington_20200228_null_2"],
["epi_isl_420115_Comunitat_Valenciana_20200309_null_1"],
["epi_isl_427712_New_South_Wales_20200320_null_3"],
["epi_isl_423417_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_426534_Arizona_20200327_null_2"],
["epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1"],
["epi_isl_408478_Chongqinq_20200121_null_1"],
["epi_isl_427135_Victoria_20200406_null_2"],
["epi_isl_410545_Rome_20200129_null_1"],
["epi_isl_426912_Victoria_20200329_null_1"],
["epi_isl_418331_Ontario_20200308_null_1"],
["epi_isl_406034_California_20200123_null_1"],
["epi_isl_427177_Washington_20200326_null_5"],
["epi_isl_415615_Washington_20200308_null_1"],
["epi_isl_427379_Liege_20200408_null_2"],
["epi_isl_425914_Scotland_20200323_null_1"],
["epi_isl_417076_Washington_20200302_null_2"],
["epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1"],
["epi_isl_425221_Comunitat_Valenciana_20200317_null_2"],
["epi_isl_426624_New_York_20200401_null_4"],
["epi_isl_417672_Reykjavik_20200316_null_1"],
["epi_isl_419685_Comunitat_Valenciana_20200310_null_1"],
["epi_isl_416342_Shanghai_20200204_null_1"],
["epi_isl_424592_Reykjavik_20200328_null_16"],
["epi_isl_426667_Victoria_20200322_null_1"],
["epi_isl_424326_Washington_20200320_null_4"],
["epi_isl_418710_England_20200316_null_2"],
["epi_isl_416605_unknown_20200216_null_1"],
["epi_isl_425747_Scotland_20200318_null_1"],
["epi_isl_427041_Victoria_20200329_null_1"],
["epi_isl_424346_Alaska_20200321_null_2"],
["epi_isl_420500_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_419923_Victoria_20200320_null_2"],
["epi_isl_427619_Alaska_20200402_null_1"],
["epi_isl_427810_South_Korea_20200218_null_1"],
["epi_isl_413016_Sao_Paulo_20200228_null_1"],
["epi_isl_424415_Reykjavik_20200319_null_3"],
["epi_isl_426757_Victoria_20200326_null_1"],
["epi_isl_424275_Washington_20200322_null_1"],
["epi_isl_427813_South_Korea_20200218_null_5464"],
["epi_isl_413018_South_Korea_20200206_null_1"],
["epi_isl_422784_Netherlands_20200329_null_1"],
["epi_isl_426784_Victoria_20200323_null_1"],
["epi_isl_426879_Victoria_20200323_null_1"],
["epi_isl_426853_Victoria_20200325_null_4"],
["epi_isl_426009_Scotland_20200331_null_1"],
["epi_isl_426094_Washington_20200324_null_2"],
["epi_isl_425231_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_425920_Scotland_20200323_null_2"],
["epi_isl_425708_Scotland_20200317_null_1"],
["epi_isl_426014_Scotland_20200401_null_15"],
["Node782"],
["epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1"],
["epi_isl_424602_Reykjavik_20200327_null_3"],
["epi_isl_425208_Comunitat_Valenciana_20200325_null_1"],
["epi_isl_425278_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_425975_Scotland_20200328_null_3"],
["epi_isl_421750_Luxembourg_20200317_null_1"],
["epi_isl_421869_England_20200327_null_4"],
["epi_isl_423739_England_20200323_null_2"],
["epi_isl_424046_England_20200311_null_1"],
["epi_isl_422678_Netherlands_20200311_null_1"],
["epi_isl_422737_Netherlands_20200325_null_1"],
["epi_isl_418899_Washington_20200316_null_1"],
["epi_isl_427190_Washington_20200326_null_1"],
["epi_isl_425203_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1"],
["epi_isl_427726_New_South_Wales_20200319_null_1"],
["epi_isl_424226_Washington_20200321_null_2"],
["epi_isl_424279_Washington_20200323_null_1"],
["epi_isl_422126_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_422161_Wales_20200329_null_1"],
["epi_isl_417443_Hong_Kong_20200122_null_2"],
["epi_isl_422615_Netherlands_20200401_null_2"],
["epi_isl_425451_England_20200401_null_6"],
["epi_isl_426096_Washington_20200325_null_1"],
["epi_isl_425248_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_426187_South_Korea_20200212_null_3"],
["epi_isl_425734_Scotland_20200318_null_2"],
["epi_isl_425776_Scotland_20200313_null_7"],
["Node963"],
["epi_isl_421844_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_420796_Texas_20200229_null_1"],
["epi_isl_420527_England_20200327_null_2"],
["epi_isl_418687_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_427723_New_South_Wales_20200319_null_53"],
["epi_isl_422156_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_424014_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_423881_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_427725_New_South_Wales_20200319_null_1"],
["epi_isl_425633_England_20200329_null_7"],
["epi_isl_416675_USA_20200311_null_1"],
["epi_isl_425539_England_20200322_null_1"],
["Node835"],
["epi_isl_417189_Minnesota_20200309_null_1"],
["epi_isl_422424_Dasman_20200315_null_1"],
["epi_isl_424345_Mexico_City_20200312_null_1"],
["epi_isl_425769_Scotland_20200313_null_1"],
["Node856"],
["epi_isl_424094_England_20200312_null_1"],
["epi_isl_423421_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_420769_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_419673_Austria_20200322_null_1"],
["epi_isl_424031_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_419453_Wales_20200319_null_1"],
["epi_isl_422127_Wales_20200327_null_1"],
["Node866"],
["epi_isl_416360_Shanghai_20200201_null_1"],
["epi_isl_425485_England_20200317_null_1"],
["Node869"],
["epi_isl_419589_Luxembourg_20200315_null_1"],
["epi_isl_426830_Victoria_20200325_null_1"],
["epi_isl_422240_Wales_20200325_null_3"],
["epi_isl_424644_Li_ge_20200404_null_1"],
["Node932"],
["epi_isl_421301_Wisconsin_20200319_null_1"],
["epi_isl_422638_Gelderland_20200320_null_1"],
["Node929"],
["epi_isl_415510_Noord_Brabant_20200309_null_1"],
["epi_isl_421952_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_420458_England_20200311_null_1"],
["epi_isl_418741_England_20200318_null_2"],
["epi_isl_421933_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_424069_England_20200321_null_1"],
["epi_isl_422172_Wales_20200323_null_2"],
["epi_isl_420640_England_20200323_null_2"],
["epi_isl_427801_New_South_Wales_20200326_null_305"],
["epi_isl_422017_Wales_20200329_null_1"],
["epi_isl_414553_Utrecht_20200309_null_5"],
["epi_isl_422174_Wales_20200329_null_1"],
["epi_isl_415509_Noord_Brabant_20200101_null_1"],
["epi_isl_422410_Taipei_20200313_null_1"],
["epi_isl_425610_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_422768_Netherlands_20200327_null_1"],
["epi_isl_422715_Netherlands_20200323_null_1"],
["epi_isl_425480_England_20200316_null_1"],
["epi_isl_425498_England_20200319_null_1"],
["epi_isl_422842_Netherlands_20200311_null_2"],
["epi_isl_425554_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_427149_Victoria_20200408_null_10"],
["Node902"],
["epi_isl_417666_Reykjavik_20200315_null_1"],
["Node881"],
["epi_isl_422800_Netherlands_20200314_null_1"],
["epi_isl_426918_Victoria_20200329_null_3"],
["Node926"],
["epi_isl_425493_England_20200318_null_3"],
["epi_isl_426829_Victoria_20200325_null_6"],
["Node937"],
["epi_isl_426693_Victoria_20200323_null_11"],
["Node936"],
["epi_isl_421251_Jiangxi_20200203_null_1"],
["epi_isl_424377_Reykjavik_20200318_null_1"],
["Node941"],
["epi_isl_413855_Guangdong_20200207_null_1"],
["epi_isl_418993_Singapore_20200129_null_2"],
["Node949"],
["epi_isl_414483_USA_20200217_null_1"],
["epi_isl_423488_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_424163_England_20200321_null_21"],
["Node955"],
["epi_isl_421836_England_20200326_null_1"],
["Node954"],
["epi_isl_419935_Victoria_20200321_null_1"],
["epi_isl_417483_Oslo_20200227_null_1"],
["epi_isl_425437_England_20200331_null_2"]
],
"RESOLVED": [
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.9103706102892, 1274.065762029953, 0, 0, 0.3142722666628307, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001924844221020151],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.9980739879285, 1273.978058652314, 0, 1, 0.314319470378798, 0, 0.0007849428749643118, 0.003463159948280399, 0.685680529621202, 1, 0.0003316142887781082],
[584.0857773655677, 1274.007674765041, 0, 0, 0.3143468250726666, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001924338669424199],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0857773655677, 1273.949015019858, 0, 1, 0.3143567492703907, 0, 0.0007849607701799686, 0.003463238901789126, 0.6856432507296093, 1, 0.0003316142887781082],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 0, 0.3143666740947653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001928475790401494],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0003312827657137013],
[583.9712369440588, 1273.896683133179, 0, 1, 0.3143233330170108, 0, 0.0007849930164983839, 0.003463381172216666, 0.6856766669829892, 1, 0.0005241626619116041],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005242652227963367],
[584.0478798243412, 1273.946227036813, 1, 0, 0.3143432358948738, 0.00171218839164481, 0, -0.007554157698577154, 1, 0.3143432358948738, 0.0005242534519899786],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0099822831146, 1273.966150357128, 0, 0, 0.3143258796619837, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001929537714087616],
[584.0478798243411, 1273.928252815901, 1, 0, 0.3143462768783745, 0.00171218839164481, 0, -0.007554157698577155, 1, 0.3143462768783745, 0.0003311687478978901],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.000524286311351465],
[584.2013316941734, 1273.675189273243, 0, 1, 0.3144457261292981, 0, 0.0007851295278591381, 0.00346398345894622, 0.6855542738707019, 1, 0.0005244726942689776],
[584.1174391208631, 1273.759081846554, 0, 1, 0.3144005710437132, 0, 0.0007850778175024365, 0.003463755313380534, 0.6855994289562868, 1, 0.0005243195174488173],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.1174391208631, 1273.731061035382, 0, 1, 0.3144053129583703, 0, 0.0007850950884303056, 0.003463831512537916, 0.6855946870416296, 1, 0.0005243223270020875],
[584.2051424985023, 1273.671378468915, 0, 1, 0.314447777290549, 0, 0.0007851318769540882, 0.003463993823129151, 0.685552222709451, 1, 0.0005243328134404642],
[584.1672449572757, 1273.709276010141, 1, 0, 0.3144273789805435, 0.001711838533625995, 0, -0.007552614128570992, 1, 0.3144273789805435, 0.0005243572215031267],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.1672449572758, 1273.727250231053, 1, 0, 0.3144243370493762, 0.001711838533625994, 0, -0.00755261412857099, 1, 0.3144243370493762, 0.0005245024861874355],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.2051424985023, 1273.671378468915, 1, 0, 0.314447777290549, 0.001711727486210144, 0, -0.007552124188506306, 1, 0.314447777290549, 0.0005246372749451569],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.2051424985023, 1273.730038214098, 0, 1, 0.3144378493734286, 0, 0.0007850957188715626, 0.003463834294038304, 0.6855621506265714, 1, 0.0005243886831973269],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.8888696873042, 1273.987651280113, 1, 0, 0.3142775437967572, 0.001712654670974529, 0, -0.007556214918218098, 1, 0.3142775437967571, 0.0005248392632374798],
[583.2570084747611, 1271.567792222784, 0, 1, 0.3144539625820267, 0, 0.0007864307401589137, 0.003469724394324476, 0.6855460374179733, 1, 0.0005242891639292718],
[584.1492707363637, 1273.727250231053, 1, 0, 0.3144177043758488, 0.001711891206744854, 0, -0.007552846521833485, 1, 0.3144177043758487, 0.0005243377698759568],
[584.2051424985023, 1273.671378468915, 0, 1, 0.314447777290549, 0, 0.0007851318769540882, 0.003463993823129151, 0.685552222709451, 1, 0.0005243375086261768],
[584.2796343030152, 1273.646439482224, 0, 1, 0.3144794847044884, 0, 0.0007851472504461527, 0.00346406165081914, 0.6855205152955115, 1, 0.0005243121710621514],
[584.1672449572758, 1273.709276010141, 1, 0, 0.3144273789805435, 0.001711838533625994, 0, -0.00755261412857099, 1, 0.3144273789805435, 0.000524360858436039],
[584.2051424985023, 1273.779591031919, 1, 0, 0.3144294632542183, 0.001711727486210144, 0, -0.007552124188506306, 1, 0.3144294632542183, 0.0005242259192945486],
[584.145459932035, 1273.731061035382, 0, 1, 0.3144156532145979, 0, 0.0007850950884303054, 0.003463831512537915, 0.6855843467854021, 1, 0.0005243100132672722],
[584.4933944985285, 1273.345228927662, 0, 1, 0.3146093461124287, 0, 0.0007853329774849374, 0.003464881076617561, 0.6853906538875714, 1, 0.0005244215738424829],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[585.2939375038787, 1273.482971790713, 0, 1, 0.3148812181694244, 0, 0.0007852480340540765, 0.003464506307068069, 0.6851187818305755, 1, 0.0005242046155743482],
[584.7793812844242, 1273.54733384658, 0, 1, 0.3146806083790275, 0, 0.0007852083494844539, 0.003464331219152164, 0.6853193916209726, 1, 0.0005247555810267923],
[583.3824568038855, 1271.442344385842, 0, 1, 0.3145215960179583, 0, 0.0007865083339528385, 0.003470066737350862, 0.6854784039820416, 1, 0.0005243263491714132],
[583.8291871208369, 1274.04733384658, 0, 1, 0.3142454197208061, 0, 0.0007849001943913799, 0.00346297164202849, 0.685754580279194, 1, 0.0005243377698759568],
[584.2051424985023, 1273.671378468915, 1, 0, 0.314447777290549, 0.001711727486210144, 0, -0.007552124188506306, 1, 0.314447777290549, 0.00052422811314846],
[584.145459932035, 1273.731061035382, 0, 1, 0.3144156532145979, 0, 0.0007850950884303054, 0.003463831512537915, 0.6855843467854021, 1, 0.0005243452352187758],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0857773655677, 1273.790743601849, 0, 0, 0.3143835291386468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002163855217480276],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0857773655677, 1273.840549438262, 0, 1, 0.3143751013907876, 0, 0.0007850276083933578, 0.003463533791304028, 0.6856248986092124, 1, 0.0003077783947341951],
[584.0061714787857, 1273.969961161457, 0, 1, 0.3143238286107016, 0, 0.0007849478641461193, 0.003463181960499583, 0.6856761713892985, 1, 0.0005244630346700715],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0099822831146, 1273.966150357128, 0, 0, 0.3143258796619836, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002368602350135799],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0478798243412, 1273.928252815901, 1, 0, 0.3143462768783745, 0.00171218839164481, 0, -0.007554157698577154, 1, 0.3143462768783745, 0.0002873054426112922],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0629581595873, 1273.913174480655, 0, 1, 0.3143543923406678, 0, 0.0007849828544301513, 0.003463336337275402, 0.6856456076593322, 1, 0.000524372165775583],
[584.0762731647419, 1273.899859475501, 1, 0, 0.3143615587433576, 0.001712105158084284, 0, -0.007553790472958119, 1, 0.3143615587433576, 0.0005243605847878896],
[584.1126144094374, 1273.97173079381, 0, 1, 0.3143628091573765, 0, 0.0007849467738007825, 0.003463177149907092, 0.6856371908426235, 1, 0.000524232131931839],
[584.0819665612388, 1273.894166079004, 0, 1, 0.3143646230434834, 0, 0.0007849945675455607, 0.00346338801542097, 0.6856353769565167, 1, 0.0005245338369261955],
[584.1236749067942, 1273.852457733448, 1, 0, 0.3143870713111562, 0.0017119662204405, 0, -0.007553177481492615, 1, 0.3143870713111563, 0.0005243645009972511],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005240708480288059],
[583.9103706102892, 1274.009720407609, 1, 0, 0.31428174625658, 0.001712591607090012, 0, -0.007555936681003636, 1, 0.31428174625658, 0.0005245110592432784],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.9980739879285, 1273.950037841142, 0, 1, 0.3143242108160961, 0, 0.0007849601399554237, 0.00346323612124487, 0.6856757891839038, 1, 0.0005243876127180319],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.9200243976777, 1274.085724355292, 1, 1, 0.3142724530263618, 0.001712563293289205, 0.0007848765439280128, -0.004092944464377983, 0.9012328252687931, 0.5297777313215168, 0.001049528637409927],
[584.0857773655677, 1273.949015019858, 0, 1, 0.3143567492703907, 0, 0.0007849607701799686, 0.003463238901789126, 0.6856432507296093, 1, 0.0005243182199180256],
[583.259627824315, 1274.716504815927, 0, 1, 0.3139220238504812, 0, 0.0007844881557757838, 0.003461153731864337, 0.6860779761495188, 1, 0.0005244819673634806],
[584.0819665612388, 1273.894166079004, 0, 1, 0.3143646230434834, 0, 0.0007849945675455607, 0.00346338801542097, 0.6856353769565167, 1, 0.0005244594751645945],
[583.7098219879023, 1274.26631065234, 0, 1, 0.3141643273740186, 0, 0.0007847653129023445, 0.003462376546276315, 0.6858356726259813, 1, 0.0005243609281302411],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005243039681924125],
[584.0857773655677, 1273.78214271167, 1, 0, 0.3143849845586899, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143849845586899, 0.0005245010738844706],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0061714787857, 1273.969961161457, 0, 1, 0.3143238286107016, 0, 0.0007849478641461193, 0.003463181960499583, 0.6856761713892985, 1, 0.0005242986946680871],
[584.0478798243412, 1273.928252815901, 1, 0, 0.3143462768783745, 0.00171218839164481, 0, -0.007554157698577154, 1, 0.3143462768783745, 0.0005243129174454481],
[583.330055805908, 1274.646076834334, 0, 1, 0.31395992960199, 0, 0.0007845315010764121, 0.003461344970888054, 0.6860400703980101, 1, 0.0005246015310382662],
[583.1963573961849, 1274.634168539148, 0, 3, 0.3139125712785735, 0, 0.002353616491732906, 0.0103841319257178, 0.3229523025513354, 1, 0.001574518234482715],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.3338666102369, 1274.592460193593, 0, 1, 0.3139703971005889, 0, 0.000784564502953449, 0.003461490574832517, 0.6860296028994111, 1, 0.0005246140548943546],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.3338666102369, 1274.642266030006, 0, 1, 0.313961980653272, 0, 0.0007845338465941467, 0.003461355319288346, 0.686038019346728, 1, 0.0005241870537504774],
[583.2843137924151, 1274.75047859301, 0, 1, 0.3139253991275209, 0, 0.0007844672481345035, 0.003461061487564523, 0.6860746008724791, 1, 0.000524298180301959],
[583.3338666102369, 1274.642266030006, 0, 1, 0.313961980653272, 0, 0.0007845338465941467, 0.003461355319288346, 0.686038019346728, 1, 0.0005243210040147313],
[583.2959690690103, 1274.680163571232, 1, 0, 0.3139415834368811, 0.001714395526504468, 0, -0.007563895555038072, 1, 0.3139415834368811, 0.000524320998329008],
[583.7098219879023, 1274.26631065234, 0, 1, 0.3141643273740186, 0, 0.0007847653129023445, 0.003462376546276315, 0.6858356726259813, 1, 0.0005245367749393845],
[583.120562313732, 1274.799528704167, 1, 0, 0.3138566427764166, 0.001714911228703984, 0, -0.007566170827875834, 1, 0.3138566427764166, 0.0005244522757789788],
[582.2798644929352, 1272.647174370609, 1, 0, 0.313909847823276, 0.001717387223875286, 0, -0.007577094893286048, 1, 0.313909847823276, 0.0005249215569082468],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.1584598549584, 1274.76163116294, 1, 0, 0.3138770406080616, 0.00171479978229025, 0, -0.007565679127436563, 1, 0.3138770406080615, 0.0005247393178422044],
[583.1584598549584, 1274.76163116294, 0, 1, 0.3138770406080616, 0, 0.0007844603850272145, 0.003461031207605252, 0.6861229593919385, 1, 0.0005246515376366671],
[583.2326986408805, 1274.795604940023, 0, 1, 0.3138987159220554, 0, 0.0007844394788661421, 0.003460938969836101, 0.6861012840779446, 1, 0.000524351340163265],
[583.1584598549584, 1274.76163116294, 1, 0, 0.3138770406080616, 0.00171479978229025, 0, -0.007565679127436563, 1, 0.3138770406080615, 0.0005245768468465768],
[583.1584598549584, 1274.76163116294, 1, 0, 0.3138770406080616, 0.00171479978229025, 0, -0.007565679127436563, 1, 0.3138770406080615, 0.0005245768468448794],
[583.5344152326239, 1274.385675785275, 0, 1, 0.3140793934323208, 0, 0.000784691807983326, 0.003462052243324258, 0.6859206065676792, 1, 0.0005243920712599153],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.9980739879285, 1273.950037841142, 0, 1, 0.3143242108160961, 0, 0.0007849601399554235, 0.003463236121244869, 0.6856757891839038, 1, 0.0005240925224663404],
[583.9702230369619, 1274.005909603281, 0, 1, 0.3143044804386814, 0, 0.000784925715384943, 0.003463084240391463, 0.6856955195613186, 1, 0.0005245547050482187],
[583.5980784636254, 1274.378054176617, 0, 1, 0.3141041847692167, 0, 0.0007846965009501091, 0.003462072948645779, 0.6858958152307832, 1, 0.0005244584550718605],
[583.8863304636516, 1274.089802176591, 0, 1, 0.3142593277739961, 0, 0.0007848740318709484, 0.003462856213255526, 0.685740672226004, 1, 0.0005243924107721558],
[584.0008708851605, 1274.024814572904, 0, 1, 0.3143125929075545, 0, 0.0007849140680475944, 0.003463032852458027, 0.6856874070924455, 1, 0.0005243174631266425],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0299056034293, 1273.946227036813, 1, 0, 0.3143366027923644, 0.001712241086296401, 0, -0.007554390186841839, 1, 0.3143366027923644, 0.0005243838798316211],
[583.9065598059603, 1274.069572834282, 0, 1, 0.3142702156115487, 0, 0.000784886493894843, 0.003462911195577683, 0.6857297843884513, 1, 0.0005245115064049516],
[583.8544988481508, 1274.121633792092, 1, 0, 0.3142421953604297, 0.001712755492974424, 0, -0.007556659743852012, 1, 0.3142421953604297, 0.0005245227681422719],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.9980739879285, 1273.978058652314, 0, 1, 0.314319470378798, 0, 0.0007849428749643118, 0.003463159948280399, 0.685680529621202, 1, 0.0005243845886086328],
[583.9626014283042, 1274.013531211938, 0, 1, 0.3143003783361173, 0, 0.0007849210196760816, 0.00346306352297192, 0.6856996216638827, 1, 0.0005242692793970815],
[583.9285146914065, 1274.009720407609, 1, 0, 0.314288442780385, 0.00171253839269774, 0, -0.007555701899648371, 1, 0.3142884427803849, 0.0005243916474607108],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0260947991004, 1273.950037841142, 0, 1, 0.3143345517410823, 0, 0.0007849601399554235, 0.003463236121244869, 0.6856654482589177, 1, 0.0005244220389903919],
[584.0819665612388, 1273.894166079004, 0, 1, 0.3143646230434834, 0, 0.0007849945675455607, 0.00346338801542097, 0.6856353769565167, 1, 0.0005242087413276723],
[583.0880921740395, 1271.894984891618, 0, 1, 0.3143360709772129, 0, 0.0007862284322830416, 0.003468831814042155, 0.6856639290227871, 1, 0.000524663152727117],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005243351947137312],
[584.9823548884134, 1272.993777751829, 0, 1, 0.3148492300905583, 0, 0.0007855497940972265, 0.003465837669296787, 0.6851507699094417, 1, 0.0005242694469129654],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.5359715291549, 1273.440161111087, 0, 1, 0.3146089776183029, 0, 0.0007852744326262581, 0.003464622777298944, 0.6853910223816971, 1, 0.000524061590647584],
[584.9626014283042, 1273.013531211938, 0, 1, 0.3148385983823452, 0, 0.0007855376046537203, 0.003465783889596519, 0.6851614016176548, 1, 0.0005242046731088475],
[584.6287269254231, 1273.375426525991, 1, 4, 0.3146541550186641, 0.001710487278411762, 0.003141257414486752, 0.006312543228927181, 0.4982894086286788, 0.848800999352168, 0.002633138963783266],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.5260947991003, 1273.450037841142, 0, 1, 0.3146036617641962, 0, 0.0007852683421292936, 0.003464595906088535, 0.6853963382358037, 1, 0.000524315701396172],
[583.9363598563297, 1274.039772783913, 0, 1, 0.314286254596036, 0, 0.0007849048525501627, 0.00346299219377747, 0.685713745403964, 1, 0.000524460890568752],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0359715291549, 1273.940161111087, 0, 1, 0.3143398675951889, 0, 0.0007849662256725103, 0.003463262971366507, 0.6856601324048111, 1, 0.0002982057026106413],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 0, 0.3143666740947653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002259596316665637],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.9861656927424, 1273.9899669475, 0, 1, 0.3143130610956125, 0, 0.0007849355379116648, 0.003463127577279049, 0.6856869389043875, 1, 0.0005245910223864301],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.8984623151031, 1274.077670325139, 0, 1, 0.3142658573796452, 0, 0.0007848815054931496, 0.003462889186800355, 0.6857341426203548, 1, 0.0005243520437768837],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.9861656927424, 1273.9899669475, 1, 0, 0.3143130610956125, 0.001712369331238813, 0, -0.007554956002218089, 1, 0.3143130610956125, 0.0005270024532033154],
[583.9861656927424, 1273.9899669475, 1, 0, 0.3143130610956125, 0.001712369331238813, 0, -0.007554956002218089, 1, 0.3143130610956125, 0.000524320998329008],
[583.8984623151031, 1274.049649513968, 0, 1, 0.314270597008374, 0, 0.000784898767784667, 0.003462965347854242, 0.6857294029916261, 1, 0.0005243209368415875],
[584.2744176927685, 1273.663817406248, 0, 1, 0.314474618507235, 0, 0.0007851365378632251, 0.003464014387012664, 0.6855253814927651, 1, 0.0005243210040147313],
[583.9823548884135, 1273.993777751829, 0, 1, 0.3143110100443305, 0, 0.0007849331899914488, 0.003463117218279034, 0.6856889899556695, 1, 0.0005243098311668615],
[584.0359715291551, 1273.940161111087, 0, 1, 0.3143398675951889, 0, 0.0007849662256725103, 0.003463262971366507, 0.6856601324048111, 1, 0.0005243652293121624],
[584.0359715291551, 1273.940161111087, 0, 1, 0.3143398675951889, 0, 0.0007849662256725103, 0.003463262971366507, 0.6856601324048111, 1, 0.0005244560603153422],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005241242369723615],
[583.9702230369619, 1274.005909603281, 0, 1, 0.3143044804386814, 0, 0.000784925715384943, 0.003463084240391463, 0.6856955195613186, 1, 0.0005245254038898697],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0299056034293, 1273.946227036813, 1, 0, 0.3143366027923644, 0.001712241086296401, 0, -0.007554390186841839, 1, 0.3143366027923644, 0.0005241059608443623],
[583.330055805908, 1274.646076834334, 0, 1, 0.31395992960199, 0, 0.0007845315010764121, 0.003461344970888054, 0.6860400703980101, 1, 0.0005244389769137036],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.7098219879023, 1274.26631065234, 0, 1, 0.3141643273740186, 0, 0.0007847653129023445, 0.003462376546276315, 0.6858356726259813, 1, 0.0005241059608266612],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0819665612388, 1273.794554406178, 0, 1, 0.3143814779773959, 0, 0.0007850559546992123, 0.003463658854915978, 0.6856185220226041, 1, 0.0005245221346867553],
[584.0857773655677, 1273.840549438262, 0, 1, 0.3143751013907876, 0, 0.000785027608393358, 0.003463533791304029, 0.6856248986092124, 1, 0.0005241059637657426],
[584.0478798243412, 1273.928252815901, 1, 0, 0.3143462768783745, 0.00171218839164481, 0, -0.007554157698577154, 1, 0.3143462768783745, 0.0005245619119218029],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005243736688731634],
[584.0478798243412, 1273.928252815901, 1, 0, 0.3143462768783745, 0.00171218839164481, 0, -0.007554157698577154, 1, 0.3143462768783745, 0.0005243350389140393],
[583.9065598059603, 1274.069572834282, 0, 1, 0.3142702156115487, 0, 0.000784886493894843, 0.003462911195577683, 0.6857297843884513, 1, 0.0005242314703402475],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.9980739879285, 1273.978058652314, 0, 1, 0.314319470378798, 0, 0.0007849428749643118, 0.003463159948280399, 0.685680529621202, 1, 0.0005240985646385628],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.6622813656199, 1273.138444519344, 0, 0, 0.3147066707529226, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000200268530414216],
[584.3740293655939, 1273.51439989701, 0, 1, 0.3145366643989123, 0, 0.0007852286555070528, 0.0034644208091165, 0.6854633356010877, 1, 0.0003237424440569208],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0099822831146, 1273.890355274675, 1, 0, 0.314338702931071, 0.001712299498872646, 0, -0.007554647902531708, 1, 0.314338702931071, 0.0005243997344465805],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0478798243411, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143526887981909, 0.00171218839164481, 0, -0.007554157698577155, 1, 0.3143526887981909, 0.0002756197440338464],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 0, 0.3143666740947653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002485470581638628],
[583.7098219879023, 1274.26631065234, 0, 1, 0.3141643273740186, 0, 0.0007847653129023445, 0.003462376546276315, 0.6858356726259813, 1, 0.0005244206295268544],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.9626014283042, 1274.013531211938, 0, 1, 0.3143003783361173, 0, 0.0007849210196760816, 0.00346306352297192, 0.6856996216638827, 1, 0.0005245079244180706],
[584.0260947991004, 1273.950037841142, 0, 1, 0.3143345517410824, 0, 0.0007849601399554237, 0.00346323612124487, 0.6856654482589176, 1, 0.000524091167124018],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0819665612388, 1273.894166079004, 0, 1, 0.3143646230434834, 0, 0.0007849945675455607, 0.00346338801542097, 0.6856353769565167, 1, 0.0005244852889321726],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005240837777006364],
[584.1602691700806, 1273.815863470162, 0, 1, 0.3144067670772339, 0, 0.0007850428218689115, 0.003463600913002807, 0.6855932329227661, 1, 0.0005241489660026847],
[583.9980739879285, 1273.978058652314, 0, 1, 0.314319470378798, 0, 0.0007849428749643118, 0.003463159948280399, 0.685680529621202, 1, 0.0005241626004105743],
[584.0819665612388, 1273.894166079004, 0, 1, 0.3143646230434834, 0, 0.0007849945675455607, 0.00346338801542097, 0.6856353769565167, 1, 0.0005242064118595325],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005240148255863728],
[584.145459932035, 1273.830672708207, 0, 1, 0.3143987964484484, 0, 0.0007850336951566459, 0.003463560646041496, 0.6856012035515515, 1, 0.0005241490349698095],
[584.0857773655677, 1273.840549438262, 0, 1, 0.3143751013907876, 0, 0.000785027608393358, 0.003463533791304029, 0.6856248986092124, 1, 0.000524242009067954],
[584.0359715291549, 1273.940161111087, 0, 2, 0.3143398675951889, 0, 0.001569932451345021, 0.006926525942733014, 0.470129817169383, 1, 0.001049171366270037],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005241112774369625],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.9065598059603, 1274.069572834282, 0, 1, 0.3142702156115487, 0, 0.000784886493894843, 0.003462911195577683, 0.6857297843884513, 1, 0.0005244194357216579],
[583.9980739879285, 1273.978058652314, 0, 1, 0.314319470378798, 0, 0.0007849428749643118, 0.003463159948280399, 0.685680529621202, 1, 0.0005243253729504782],
[583.9980739879285, 1273.978058652314, 0, 1, 0.314319470378798, 0, 0.0007849428749643118, 0.003463159948280399, 0.685680529621202, 1, 0.0005241625936077926],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005242420770835485],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005242420155667044],
[584.0359715291551, 1273.894166079004, 0, 1, 0.3143476494121705, 0, 0.0007849945675455607, 0.00346338801542097, 0.6856523505878296, 1, 0.0005242420770835485],
[584.0895881698965, 1273.886544470346, 0, 1, 0.3143687251460474, 0, 0.0007849992641344508, 0.003463408736723191, 0.6856312748539526, 1, 0.0005242652227963367],
[584.0260947991004, 1273.950037841142, 0, 1, 0.3143345517410823, 0, 0.0007849601399554235, 0.003463236121244869, 0.6856654482589177, 1, 0.0005241625937047837],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0819665612388, 1274.01148556937, 0, 1, 0.3143447741508874, 0, 0.000784922280000552, 0.003463069083510613, 0.6856552258491126, 1, 0.0005243157739938325],
[584.0857773655677, 1273.949015019858, 0, 1, 0.3143567492703907, 0, 0.0007849607701799686, 0.003463238901789126, 0.6856432507296093, 1, 0.0005241965992325262],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.9626014283042, 1274.013531211938, 0, 1, 0.3143003783361173, 0, 0.0007849210196760816, 0.00346306352297192, 0.6856996216638827, 1, 0.0005246817927731175],
[584.0260947991004, 1273.950037841142, 0, 1, 0.3143345517410823, 0, 0.0007849601399554235, 0.003463236121244869, 0.6856654482589177, 1, 0.0005245285088191133],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005242651609069357],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005242420770835485],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005242534520220071],
[584.0857773655677, 1273.840549438262, 0, 1, 0.3143751013907876, 0, 0.000785027608393358, 0.003463533791304029, 0.6856248986092124, 1, 0.0005247508467443642],
[584.0260947991004, 1273.950037841142, 0, 1, 0.3143345517410823, 0, 0.0007849601399554235, 0.003463236121244869, 0.6856654482589177, 1, 0.0005242090885128793],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.145459932035, 1273.830672708207, 0, 1, 0.3143987964484484, 0, 0.0007850336951566459, 0.003463560646041496, 0.6856012035515515, 1, 0.0005242652227963367],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.000524242009067954],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.1355832019804, 1273.832927829604, 0, 1, 0.3143947702739351, 0, 0.0007850323053776218, 0.003463554514350634, 0.6856052297260649, 1, 0.0005241516486270177],
[584.0857773655677, 1273.886544470346, 0, 1, 0.3143673188782578, 0, 0.0007849992641344509, 0.003463408736723191, 0.6856326811217421, 1, 0.000524354778756899],
[584.2098219879023, 1273.874523215345, 0, 1, 0.3144151251777531, 0, 0.0007850066719883312, 0.00346344142009886, 0.6855848748222469, 1, 0.0005242206319748872],
[583.5267936239661, 1274.537042393915, 0, 1, 0.3140509934656252, 0, 0.000784598616389946, 0.003461641082965965, 0.6859490065343748, 1, 0.0005249122727070616],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.9065598059603, 1274.069572834282, 0, 1, 0.3142702156115487, 0, 0.000784886493894843, 0.003462911195577683, 0.6857297843884513, 1, 0.0005245113806429141],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.9980739879285, 1273.978058652314, 0, 1, 0.314319470378798, 0, 0.0007849428749643118, 0.003463159948280399, 0.685680529621202, 1, 0.0005243887982941375],
[584.1356406489781, 1273.939597626908, 0, 1, 0.3143767424568875, 0, 0.000784966572875824, 0.003463264503223982, 0.6856232575431125, 1, 0.0005242593200567094],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.1126144094374, 1273.913071048627, 0, 1, 0.3143727339083767, 0, 0.0007849829181647737, 0.003463336618471905, 0.6856272660916233, 1, 0.00052426810593466],
[583.9980739879285, 1273.978058652314, 0, 1, 0.314319470378798, 0, 0.0007849428749643118, 0.003463159948280399, 0.685680529621202, 1, 0.0005242420770835485],
[584.1236749067942, 1273.852457733448, 1, 0, 0.3143870713111563, 0.0017119662204405, 0, -0.007553177481492615, 1, 0.3143870713111563, 0.0005242651609377455],
[584.2098219879023, 1273.76631065234, 0, 1, 0.3144334373971326, 0, 0.0007850733620736641, 0.00346373565607429, 0.6855665626028674, 1, 0.0005241605486187556],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005243736792511821],
[584.0857773655677, 1273.949015019858, 0, 1, 0.3143567492703907, 0, 0.0007849607701799686, 0.003463238901789126, 0.6856432507296093, 1, 0.0005242091567346302],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005241489660026847],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.1009749628903, 1273.875157677352, 0, 1, 0.3143748537462989, 0, 0.0007850062810105294, 0.003463439695108791, 0.6856251462537011, 1, 0.000524349024675905],
[584.0952815663934, 1273.880851073849, 1, 0, 0.3143717894461732, 0.001712049440492409, 0, -0.007553544647511771, 1, 0.3143717894461732, 0.0005241920269842729],
[584.0952815663934, 1273.880851073849, 1, 0, 0.3143717894461732, 0.001712049440492409, 0, -0.007553544647511771, 1, 0.3143717894461732, 0.0005241489660026847],
[584.06173721893, 1273.914395421313, 0, 1, 0.3143537352059307, 0, 0.0007849821020895813, 0.00346333301795649, 0.6856462647940693, 1, 0.0005243645008928068],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0299056034293, 1273.946227036813, 1, 0, 0.3143366027923644, 0.001712241086296401, 0, -0.007554390186841839, 1, 0.3143366027923644, 0.0005243663683823687],
[584.461732743233, 1273.42669651937, 0, 1, 0.3145838703431757, 0, 0.0007852827357344389, 0.003464659410527444, 0.6854161296568243, 1, 0.0005248036438761385],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.6584705612911, 1273.241866996498, 0, 1, 0.3146877465611664, 0, 0.0007853967309125173, 0.003465162356088975, 0.6853122534388336, 1, 0.0005242603390168543],
[584.3740293655939, 1273.564205733422, 0, 1, 0.3145282325999662, 0, 0.0007851979472241201, 0.003464285324485802, 0.6854717674000339, 1, 0.0005241299878074256],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.000524242009067954],
[584.145459932035, 1273.830672708207, 0, 1, 0.3143987964484484, 0, 0.0007850336951566459, 0.003463560646041496, 0.6856012035515515, 1, 0.0005240762589387314],
[583.6355832019804, 1274.340549438262, 1, 0, 0.3141243705712279, 0.001713397929772776, 0, -0.00755949416844559, 1, 0.3141243705712279, 0.0005243356662137109],
[584.2839218935942, 1273.71018496756, 0, 1, 0.31447027723929, 0, 0.0007851079561128491, 0.00346388828462189, 0.68552972276071, 1, 0.0005243494311651121],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0359715291551, 1273.940161111087, 0, 1, 0.3143398675951889, 0, 0.0007849662256725103, 0.003463262971366507, 0.6856601324048111, 1, 0.0005243316713640615],
[584.3835335664196, 1273.610573294735, 0, 1, 0.3145238897197912, 0, 0.0007851693610026141, 0.003464159202368449, 0.6854761102802088, 1, 0.000524334311994827],
[583.9626014283042, 1274.013531211938, 0, 1, 0.3143003783361173, 0, 0.0007849210196760816, 0.00346306352297192, 0.6856996216638827, 1, 0.0005245076896744868],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0260947991004, 1273.950037841142, 0, 1, 0.3143345517410823, 0, 0.0007849601399554235, 0.003463236121244869, 0.6856654482589177, 1, 0.0005242664347177477],
[584.0478798243412, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143526887981909, 0.00171218839164481, 0, -0.007554157698577154, 1, 0.3143526887981909, 0.0005242420770835485],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005241741878012327],
[584.0359715291549, 1273.940161111087, 0, 1, 0.3143398675951889, 0, 0.0007849662256725103, 0.003463262971366507, 0.6856601324048111, 1, 0.0005243123477493828],
[584.0857773655677, 1273.840549438262, 0, 1, 0.3143751013907876, 0, 0.000785027608393358, 0.003463533791304029, 0.6856248986092124, 1, 0.0005242885719067953],
[583.9065598059603, 1274.069572834282, 0, 1, 0.3142702156115487, 0, 0.000784886493894843, 0.003462911195577683, 0.6857297843884513, 1, 0.000524424515712317],
[583.9482681515158, 1274.027864488727, 1, 0, 0.3142926638792216, 0.001712480461951695, 0, -0.007555446309788424, 1, 0.3142926638792216, 0.000525031945297354],
[583.9601764467019, 1274.033930414452, 1, 1, 0.3142960326355548, 0.001712445540524406, 0.0007849084519081001, -0.004092284162699923, 0.9012180038695503, 0.52981006914066, 0.001049210958971815],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.9980739879285, 1273.978058652314, 0, 1, 0.314319470378798, 0, 0.0007849428749643118, 0.003463159948280399, 0.685680529621202, 1, 0.0005242065811860374],
[584.3740293655939, 1273.564205733422, 0, 1, 0.3145282325999662, 0, 0.0007851979472241201, 0.003464285324485802, 0.6854717674000339, 1, 0.0005242420154670771],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005242652307534491],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005242536681329184],
[584.0115385796457, 1273.915041242775, 0, 1, 0.3143351007096659, 0, 0.0007849817041365995, 0.003463331262191998, 0.685664899290334, 1, 0.0005243617180716112],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005242885659369826],
[583.9257177941746, 1274.022394034896, 1, 0, 0.3142852666748183, 0.001712546595442959, 0, -0.007555738090076509, 1, 0.3142852666748184, 0.0005245152739851701],
[584.07815575691, 1273.897976883333, 1, 0, 0.3143625719922012, 0.001712099639651982, 0, -0.00755376612569116, 1, 0.3143625719922012, 0.00052439908140672],
[584.1523945428319, 1273.873290915232, 0, 1, 0.3143941438026026, 0, 0.0007850074313761112, 0.00346344477050999, 0.6856058561973974, 1, 0.000607984058089383],
[584.07815575691, 1273.947782719745, 0, 1, 0.3143541452579396, 0, 0.0007849615294789435, 0.003463242251808449, 0.6856458547420604, 1, 0.0005095876618147753],
[584.07815575691, 1273.897976883333, 0, 0, 0.3143625719922012, 0, 0, 0, 1, 1, 1.456200610257394e-05],
[584.07815575691, 1273.956636628516, 0, 1, 0.3143526472973335, 0, 0.0007849560740516783, 0.003463218182519068, 0.6856473527026665, 1, 0.000524347228786397],
[584.0402582156835, 1273.935874424559, 1, 0, 0.3143421747758104, 0.001712210735361165, 0, -0.007554256278825531, 1, 0.3143421747758104, 0.0005244291797315795],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.07815575691, 1273.897976883333, 1, 0, 0.3143625719922012, 0.001712099639651982, 0, -0.00755376612569116, 1, 0.3143625719922012, 0.0005244758395685126],
[584.0283499204972, 1273.901787687661, 0, 1, 0.3143435472080544, 0, 0.0007849898710128685, 0.003463367294366695, 0.6856564527919455, 1, 0.0005244132634381629],
[584.1279615933227, 1273.84817104692, 0, 1, 0.3143893784917778, 0, 0.0007850229114652996, 0.003463513068505402, 0.6856106215082223, 1, 0.0005242539164962667],
[584.5283499204972, 1273.447782719745, 0, 1, 0.3146048755157388, 0, 0.0007852697327441777, 0.003464602041467202, 0.6853951244842612, 1, 0.000524425406682201],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.9785440840845, 1273.997588556158, 0, 1, 0.3143089589930484, 0, 0.0007849308420852792, 0.003463106859340991, 0.6856910410069517, 1, 0.0005246493089310289],
[584.0283499204972, 1273.947782719745, 0, 1, 0.3143357654926248, 0, 0.0007849615294789435, 0.003463242251808449, 0.6856642345073751, 1, 0.0005244264650775216],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.07815575691, 1273.84817104692, 0, 1, 0.3143709991782576, 0, 0.0007850229114652996, 0.003463513068505402, 0.6856290008217424, 1, 0.0005244716482275088],
[584.4296781850661, 1273.447095800942, 1, 1, 0.3145685905374623, 0.001711069846941173, 0.0007852701563318923, -0.004084618780435734, 0.9010466018472745, 0.530183782922199, 0.001050308930983183],
[583.0923777843219, 1271.890696052598, 0, 1, 0.3143383818474584, 0, 0.0007862310834598996, 0.003468843511007378, 0.6856616181525417, 1, 0.0005244192160719607],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.1279615933227, 1273.84817104692, 0, 1, 0.3143893784917778, 0, 0.0007850229114652996, 0.003463513068505402, 0.6856106215082223, 1, 0.0005243663550597556],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.1658591345491, 1273.810273505693, 0, 1, 0.3144097757081685, 0, 0.0007850462669357097, 0.003463616112602339, 0.6855902242918315, 1, 0.0005243807041327584],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0305009962667, 1273.945631643976, 0, 1, 0.3143369232447249, 0, 0.0007849628548979285, 0.003463248099543476, 0.6856630767552752, 1, 0.0005244377287020051],
[584.07815575691, 1273.897976883333, 1, 0, 0.3143625719922012, 0.001712099639651982, 0, -0.00755376612569116, 1, 0.3143625719922012, 0.0005244608660199671],
[584.07815575691, 1273.897976883333, 0, 1, 0.3143625719922012, 0, 0.0007849922192721898, 0.003463377654862839, 0.6856374280077988, 1, 0.0005245336199863624],
[584.07815575691, 1273.897976883333, 1, 0, 0.3143625719922012, 0.001712099639651982, 0, -0.00755376612569116, 1, 0.3143625719922012, 0.0005244955088069347],
[584.1279615933227, 1273.894166079004, 0, 1, 0.3143815958344374, 0, 0.0007849945675455607, 0.00346338801542097, 0.6856184041655626, 1, 0.0005245681909708622],
[583.9904523792708, 1273.985680260972, 0, 1, 0.314315368276234, 0, 0.0007849381790501392, 0.003463139229955026, 0.685684631723766, 1, 0.0005243873053796913],
[584.0036639523971, 1273.922915870024, 0, 1, 0.3143308623143847, 0, 0.0007849768518506093, 0.003463309853955762, 0.6856691376856152, 1, 0.000524342940468699],
[584.1049928007795, 1273.920692657284, 0, 1, 0.3143686319152141, 0, 0.0007849782217714743, 0.003463315898032629, 0.6856313680847859, 1, 0.0005243849147926894],
[584.07815575691, 1273.897976883333, 0, 1, 0.3143625719922012, 0, 0.0007849922192721898, 0.003463377654862839, 0.6856374280077988, 1, 0.000524410701718764],
[584.07815575691, 1273.839317138149, 0, 1, 0.3143724973137709, 0, 0.0007850283678216448, 0.003463537141893875, 0.6856275026862291, 1, 0.0005243266024489358],
[584.07815575691, 1273.947782719745, 0, 1, 0.3143541452579396, 0, 0.0007849615294789435, 0.003463242251808449, 0.6856458547420604, 1, 0.0005242418106759466],
[584.07815575691, 1273.897976883333, 0, 1, 0.3143625719922012, 0, 0.0007849922192721898, 0.003463377654862839, 0.6856374280077988, 1, 0.0005242420154382628],
[584.0686515560842, 1273.847798517691, 1, 0, 0.3143675548665774, 0.001712127499628315, 0, -0.007553889043622225, 1, 0.3143675548665774, 0.0005244052970097334],
[584.1160532981365, 1273.860079342106, 1, 0, 0.3143829692085922, 0.001711988558358614, 0, -0.007553276036159212, 1, 0.3143829692085922, 0.0005242420770835485],
[584.07815575691, 1273.897976883333, 1, 0, 0.3143625719922012, 0.001712099639651982, 0, -0.00755376612569116, 1, 0.3143625719922012, 0.000524484455227562],
[584.07815575691, 1273.897976883333, 0, 1, 0.3143625719922012, 0, 0.0007849922192721898, 0.003463377654862839, 0.6856374280077988, 1, 0.0005244050487744191],
[583.9904523792707, 1273.985680260972, 0, 1, 0.3143153682762339, 0, 0.0007849381790501392, 0.003463139229955026, 0.6856846317237661, 1, 0.0005244052300113695],
[584.07815575691, 1273.897976883333, 1, 0, 0.3143625719922012, 0.001712099639651982, 0, -0.00755376612569116, 1, 0.3143625719922012, 0.0005244052356441214],
[584.07815575691, 1273.897976883333, 1, 0, 0.3143625719922012, 0.001712099639651982, 0, -0.00755376612569116, 1, 0.3143625719922012, 0.000524484455227562],
[584.07815575691, 1273.897976883333, 1, 0, 0.3143625719922012, 0.001712099639651982, 0, -0.00755376612569116, 1, 0.3143625719922012, 0.0005242420770835485],
[584.0876599577357, 1273.948155248974, 1, 0, 0.3143575894379382, 0.001712071780582318, 0, -0.007553643211760305, 1, 0.3143575894379382, 0.0005243266024489358],
[584.0819665612388, 1273.894166079004, 0, 1, 0.3143646230434834, 0, 0.0007849945675455607, 0.00346338801542097, 0.6856353769565167, 1, 0.0005243266024206501],
[584.07815575691, 1273.897976883333, 0, 1, 0.3143625719922012, 0, 0.0007849922192721898, 0.003463377654862839, 0.6856374280077988, 1, 0.0005244052356187067],
[584.0876599577357, 1273.888472682507, 1, 0, 0.3143676873436091, 0.001712071780582318, 0, -0.007553643211760305, 1, 0.3143676873436091, 0.0005243266024489358],
[584.0184731904426, 1273.9576594498, 0, 1, 0.3143304496385183, 0, 0.0007849554438346739, 0.00346321540200808, 0.6856695503614818, 1, 0.000524484455227562],
[584.1160532981364, 1273.860079342106, 1, 0, 0.3143829692085922, 0.001711988558358614, 0, -0.007553276036159213, 1, 0.3143829692085922, 0.0005242420770835485],
[584.3664077569362, 1273.57182734208, 0, 1, 0.3145241304137289, 0, 0.0007851932482575254, 0.003464264592693174, 0.685475869586271, 1, 0.0005244845165360397],
[584.07815575691, 1273.947782719745, 0, 1, 0.3143541452579396, 0, 0.0007849615294789435, 0.003463242251808449, 0.6856458547420604, 1, 0.0005242536617203562],
[584.07815575691, 1273.897976883333, 0, 1, 0.3143625719922012, 0, 0.0007849922192721898, 0.003463377654862839, 0.6856374280077988, 1, 0.0005243499127184459],
[584.2400979204712, 1273.823738097411, 1, 0, 0.3144348900157209, 0.001711625072567552, 0, -0.007551672340561068, 1, 0.3144348900157209, 0.0005243002213795412],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.7022003792446, 1274.273932260998, 0, 1, 0.3141602252714545, 0, 0.0007847606191124524, 0.003462355837323245, 0.6858397747285454, 1, 0.0005245617826141539],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.9089847875626, 1274.021152820596, 0, 1, 0.3142793009102425, 0, 0.0007849163240234027, 0.003463042805800255, 0.6857206990897575, 1, 0.0005245474488241808],
[584.0184731904427, 1273.9576594498, 0, 1, 0.3143304496385183, 0, 0.0007849554438346739, 0.00346321540200808, 0.6856695503614818, 1, 0.0005244038033433961],
[584.07815575691, 1273.897976883333, 0, 1, 0.3143625719922012, 0, 0.0007849922192721898, 0.003463377654862839, 0.6856374280077988, 1, 0.0005242782846077792],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.7787043792969, 1274.197428260946, 0, 1, 0.3142014012578994, 0, 0.000784807736870748, 0.003462563720391665, 0.6857985987421007, 1, 0.0005245861100015616],
[583.9904523792707, 1273.985680260972, 0, 1, 0.3143153682762339, 0, 0.0007849381790501392, 0.003463139229955026, 0.6856846317237661, 1, 0.0005245033552174505],
[584.07815575691, 1273.925997694504, 1, 1, 0.3143578310478644, 0.001712099639651982, 0.0007849749528699127, -0.004090464650018838, 0.9011791540588825, 0.529894816154611, 0.001051370884841778],
[583.57815575691, 1274.397976883333, 0, 1, 0.3140934619690873, 0, 0.000784684233763145, 0.00346201882594217, 0.6859065380309127, 1, 0.0005244052356458454],
[584.07815575691, 1273.897976883333, 1, 0, 0.3143625719922012, 0.001712099639651982, 0, -0.00755376612569116, 1, 0.3143625719922012, 0.0005243263785061408],
[584.5781557569098, 1273.397976883333, 0, 1, 0.3146316820153152, 0, 0.0007853004466423924, 0.003464737550872466, 0.6853683179846848, 1, 0.0005243266024472148],
[584.07815575691, 1273.897976883333, 1, 0, 0.3143625719922012, 0.001712099639651982, 0, -0.00755376612569116, 1, 0.3143625719922012, 0.0005242420154382628],
[584.0184731904427, 1273.9576594498, 0, 1, 0.3143304496385183, 0, 0.0007849554438346739, 0.00346321540200808, 0.6856695503614818, 1, 0.0005244842397896949],
[583.57815575691, 1274.397976883333, 0, 1, 0.3140934619690873, 0, 0.000784684233763145, 0.00346201882594217, 0.6859065380309127, 1, 0.0005244844552025864],
[584.0819665612388, 1273.894166079004, 0, 1, 0.3143646230434834, 0, 0.0007849945675455607, 0.00346338801542097, 0.6856353769565167, 1, 0.000524071954079129],
[584.0819665612388, 1273.718759323725, 0, 1, 0.314394304202358, 0, 0.0007851026709624228, 0.003463864966592182, 0.685605695797642, 1, 0.000524494344337391],
[584.1236749067942, 1273.67705097817, 1, 0, 0.3144167545895143, 0.0017119662204405, 0, -0.007553177481492615, 1, 0.3144167545895142, 0.0005251940165280486],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0857773655677, 1273.802651897036, 0, 1, 0.3143815140704609, 0, 0.0007850509641432529, 0.00346363683663405, 0.6856184859295391, 1, 0.0005244189903795207],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005242420770818443],
[584.0895881698966, 1273.886544470346, 0, 1, 0.3143687251460475, 0, 0.0007849992641344509, 0.003463408736723191, 0.6856312748539526, 1, 0.0005241490349698095],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005242536000006772],
[584.2098219879023, 1273.815863470162, 0, 1, 0.3144250515804228, 0, 0.0007850428218689115, 0.003463600913002807, 0.6855749484195772, 1, 0.0005240418558160847],
[584.1602691700806, 1273.815863470162, 0, 1, 0.3144067670772339, 0, 0.0007850428218689115, 0.003463600913002807, 0.6855932329227661, 1, 0.0005241323228913056],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005242652229164081],
[584.0762731647419, 1273.899859475501, 1, 0, 0.3143615587433576, 0.001712105158084284, 0, -0.007553790472958119, 1, 0.3143615587433576, 0.0005241625935784312],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0359715291551, 1273.940161111087, 0, 1, 0.3143398675951889, 0, 0.0007849662256725103, 0.003463262971366507, 0.6856601324048111, 1, 0.0005245122721313293],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005243663683823687],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005244198848668132],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005241490349698095],
[584.145459932035, 1273.830672708207, 0, 1, 0.3143987964484484, 0, 0.0007850336951566459, 0.003463560646041496, 0.6856012035515515, 1, 0.0005241489734135644],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005240762668125478],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005243125261126128],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005242091567346302],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005242420770835485],
[584.0952815663934, 1273.880851073849, 1, 0, 0.3143717894461732, 0.001712049440492409, 0, -0.007553544647511771, 1, 0.3143717894461732, 0.0005241490349698095],
[583.9980739879285, 1273.950037841142, 0, 1, 0.3143242108160961, 0, 0.0007849601399554235, 0.003463236121244869, 0.6856757891839038, 1, 0.0005242536681329184],
[583.7003177870765, 1274.303835664338, 0, 1, 0.3141544741451731, 0, 0.0007847422035567098, 0.003462274588079374, 0.6858455258548269, 1, 0.0005243125922095364],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005242885719067953],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005242652227963367],
[584.0857773655677, 1273.840549438262, 0, 1, 0.3143751013907876, 0, 0.0007850276083933578, 0.003463533791304028, 0.6856248986092124, 1, 0.000524242009067954],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005240762668125478],
[584.1126144094374, 1274.313712394392, 0, 1, 0.3143049611302104, 0, 0.0007847361213127291, 0.003462247753281045, 0.6856950388697896, 1, 0.0005243125307004003],
[584.0819665612388, 1273.894166079004, 0, 1, 0.3143646230434834, 0, 0.0007849945675455607, 0.00346338801542097, 0.6856353769565167, 1, 0.0005242885658079619],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005241489041663772],
[583.7098219879023, 1274.26631065234, 0, 1, 0.3141643273740186, 0, 0.0007847653129023445, 0.003462376546276315, 0.6858356726259813, 1, 0.0005242420154653419],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005241742495942182],
[584.2003177870765, 1273.825367670988, 0, 1, 0.3144199363654395, 0, 0.0007850369645474723, 0.003463575070560434, 0.6855800636345606, 1, 0.0005242441045313429],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005241952432838804],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005242652307534491],
[583.9980739879284, 1273.978058652314, 0, 1, 0.314319470378798, 0, 0.0007849428749643118, 0.003463159948280399, 0.6856805296212021, 1, 0.0005241625936060553],
[584.4498244480469, 1273.488410650969, 0, 1, 0.3145690278648577, 0, 0.000785244680388438, 0.003464491510729521, 0.6854309721351423, 1, 0.0005243723532945099],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.1236749067942, 1273.852457733448, 1, 0, 0.3143870713111563, 0.0017119662204405, 0, -0.007553177481492615, 1, 0.3143870713111563, 0.0005243898885536395],
[583.9617327432331, 1273.564205733422, 0, 1, 0.3143760852255642, 0, 0.0007851979472241201, 0.003464285324485802, 0.6856239147744358, 1, 0.0005244082474979694],
[584.0857773655677, 1273.802651897036, 0, 1, 0.3143815140704609, 0, 0.0007850509641432529, 0.00346363683663405, 0.6856184859295391, 1, 0.0005242418106090697],
[584.0359715291549, 1273.940161111087, 0, 1, 0.3143398675951889, 0, 0.0007849662256725103, 0.003463262971366507, 0.6856601324048111, 1, 0.0005241625936077926],
[584.0112855610548, 1273.915294261366, 0, 1, 0.3143349645263561, 0, 0.000784981548227517, 0.003463330574322718, 0.6856650354736439, 1, 0.0005241742495924917],
[584.0359715291551, 1273.894166079004, 0, 1, 0.3143476494121705, 0, 0.0007849945675455607, 0.00346338801542097, 0.6856523505878296, 1, 0.0005243123477493828],
[584.0260947991004, 1273.950037841142, 0, 1, 0.3143345517410823, 0, 0.0007849601399554235, 0.003463236121244869, 0.6856654482589177, 1, 0.0005242885719067953],
[584.0359715291551, 1273.940161111087, 0, 1, 0.3143398675951889, 0, 0.0007849662256725103, 0.003463262971366507, 0.6856601324048111, 1, 0.0005241626618837616],
[584.0857773655677, 1273.802651897036, 0, 1, 0.3143815140704609, 0, 0.0007850509641432529, 0.00346363683663405, 0.6856184859295391, 1, 0.000524242009067954],
[584.0359715291549, 1273.940161111087, 0, 1, 0.3143398675951889, 0, 0.0007849662256725103, 0.003463262971366507, 0.6856601324048111, 1, 0.0005242536000006772],
[584.1355832019804, 1273.840549438262, 0, 1, 0.3143934805943419, 0, 0.000785027608393358, 0.003463533791304029, 0.6856065194056582, 1, 0.0005242441093173968],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005242883656884773],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005242420770835485],
[583.9980739879285, 1273.978058652314, 0, 1, 0.314319470378798, 0, 0.0007849428749643118, 0.003463159948280399, 0.685680529621202, 1, 0.0005242420770835485],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005242536000006772],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005243617180505276],
[584.2098219879023, 1273.76631065234, 0, 1, 0.3144334373971326, 0, 0.0007850733620736641, 0.00346373565607429, 0.6855665626028674, 1, 0.0005241951816511371],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005242652307534491],
[584.0478798243412, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143526887981909, 0.00171218839164481, 0, -0.007554157698577154, 1, 0.3143526887981909, 0.0005242420770835485],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005241741878012327],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005245993733921621],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005242885657814674],
[584.0952815663934, 1273.880851073849, 1, 0, 0.3143717894461732, 0.001712049440492409, 0, -0.007553544647511771, 1, 0.3143717894461732, 0.0005241489734135644],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005241626004105743],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005242536000024465],
[584.5457287485716, 1274.201323048653, 0, 1, 0.3144837422517355, 0, 0.0007848053379880354, 0.003462553136545635, 0.6855162577482645, 1, 0.0005247508495978532],
[584.2098219879023, 1273.76631065234, 0, 1, 0.3144334373971326, 0, 0.0007850733620736641, 0.00346373565607429, 0.6855665626028674, 1, 0.0005241951816511371],
[584.0857773655677, 1273.830672708207, 0, 1, 0.3143767726166451, 0, 0.0007850336951566459, 0.003463560646041496, 0.6856232273833549, 1, 0.0005241625936060553],
[584.0762731647419, 1273.899859475501, 1, 0, 0.3143615587433576, 0.001712105158084284, 0, -0.007553790472958119, 1, 0.3143615587433576, 0.0005241626004105743],
[583.7098219879023, 1274.26631065234, 0, 1, 0.3141643273740186, 0, 0.0007847653129023445, 0.003462376546276315, 0.6858356726259813, 1, 0.0005242534519959037],
[584.1126144094374, 1273.97173079381, 0, 1, 0.3143628091573766, 0, 0.0007849467738007826, 0.003463177149907092, 0.6856371908426234, 1, 0.0005243125922095364],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005241109664303169],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005242420770835485],
[584.0112855610547, 1273.964847079188, 0, 1, 0.3143265811122968, 0, 0.000784951015165524, 0.003463195862765017, 0.6856734188877032, 1, 0.0005241626004105743],
[584.0952815663934, 1273.880851073849, 1, 0, 0.3143717894461732, 0.001712049440492409, 0, -0.007553544647511771, 1, 0.3143717894461732, 0.0005241605558820034],
[584.1600161514896, 1273.924329051758, 0, 1, 0.3143883202393544, 0, 0.0007849759810650193, 0.003463306012058632, 0.6856116797606456, 1, 0.0005242441045296394],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005241951816528813],
[583.961732743233, 1274.01439989701, 0, 1, 0.3142999107923981, 0, 0.0007849204844786993, 0.003463061161686535, 0.6857000892076019, 1, 0.0005241625936077926],
[584.0478798243412, 1273.928252815901, 1, 0, 0.3143462768783745, 0.00171218839164481, 0, -0.007554157698577154, 1, 0.3143462768783745, 0.0005242420770835485],
[584.1236749067942, 1273.852457733448, 1, 0, 0.3143870713111562, 0.0017119662204405, 0, -0.007553177481492615, 1, 0.3143870713111563, 0.0005240762667835949],
[584.0115385796457, 1273.51439989701, 0, 1, 0.3144028982220242, 0, 0.0007852286555070528, 0.0034644208091165, 0.6855971017779758, 1, 0.0005243617801926529],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005242883656884773],
[584.1236749067942, 1273.834483512537, 1, 0, 0.3143901127481477, 0.0017119662204405, 0, -0.007553177481492615, 1, 0.3143901127481477, 0.0005242652307534491],
[584.1236749067942, 1273.852457733448, 1, 0, 0.3143870713111563, 0.0017119662204405, 0, -0.007553177481492615, 1, 0.3143870713111563, 0.0005242652307534491],
[584.0952815663934, 1273.880851073849, 1, 0, 0.3143717894461732, 0.001712049440492409, 0, -0.007553544647511771, 1, 0.3143717894461732, 0.0005241604868321114],
[584.0494361208723, 1273.818483956365, 0, 1, 0.3143654238330308, 0, 0.0007850412068869421, 0.003463593787718851, 0.6856345761669691, 1, 0.0005247508467426401],
[584.1602691700806, 1273.865416287984, 0, 1, 0.3143983819718111, 0, 0.0007850122840401606, 0.003463466180414219, 0.685601618028189, 1, 0.0005241951815562729],
[583.7098219879023, 1274.26631065234, 0, 1, 0.3141643273740186, 0, 0.0007847653129023445, 0.003462376546276315, 0.6858356726259813, 1, 0.000524242009067954],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005242536000006772],
[584.0857773655677, 1273.949015019858, 0, 1, 0.3143567492703907, 0, 0.0007849607701799686, 0.003463238901789126, 0.6856432507296093, 1, 0.0005241858429081053],
[583.7003177870765, 1274.362495409521, 1, 3, 0.3141445561697039, 0.001713207907426191, 0.002354118244068332, 0.002827689860104645, 0.6266773055480694, 0.7787260134010444, 0.002100163556247087],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005241489734135644],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005242536618494451],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005242104391959891],
[584.5359715291549, 1273.440161111087, 0, 1, 0.3146089776183029, 0, 0.0007852744326262581, 0.003464622777298944, 0.6853910223816971, 1, 0.0005242420770818443],
[583.9980739879285, 1273.978058652314, 0, 1, 0.314319470378798, 0, 0.0007849428749643118, 0.003463159948280399, 0.685680529621202, 1, 0.000524242009067954],
[583.9712369440588, 1273.896683133179, 0, 1, 0.3143233330170108, 0, 0.0007849930164983838, 0.003463381172216666, 0.6856766669829892, 1, 0.0005241625935784312],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.000524242009067954],
[584.0380030942865, 1273.862334463503, 0, 1, 0.3143537849086161, 0, 0.0007850141832014822, 0.003463474559494575, 0.6856462150913839, 1, 0.0005243173947787471],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0478798243412, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143526887981909, 0.00171218839164481, 0, -0.007554157698577154, 1, 0.3143526887981909, 0.0005242617170137744],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005242420089663696],
[584.0359715291549, 1273.940161111087, 0, 1, 0.3143398675951889, 0, 0.0007849662256725103, 0.003463262971366507, 0.6856601324048111, 1, 0.0005242420770835485],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005241626620095668],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005242420770835485],
[583.9980739879285, 1273.978058652314, 0, 1, 0.314319470378798, 0, 0.0007849428749643118, 0.003463159948280399, 0.685680529621202, 1, 0.0005242420770835485],
[584.0359715291549, 1273.940161111087, 0, 1, 0.3143398675951889, 0, 0.0007849662256725103, 0.003463262971366507, 0.6856601324048111, 1, 0.0005241626620095668],
[584.0359715291551, 1273.940161111087, 0, 1, 0.3143398675951889, 0, 0.0007849662256725103, 0.003463262971366507, 0.6856601324048111, 1, 0.000524242009067954],
[584.1236749067942, 1273.852457733448, 1, 0, 0.3143870713111563, 0.0017119662204405, 0, -0.007553177481492615, 1, 0.3143870713111563, 0.0005242652307534491],
[584.1602691700806, 1273.865416287984, 0, 1, 0.3143983819718111, 0, 0.0007850122840401606, 0.003463466180414219, 0.685601618028189, 1, 0.000524148966032984],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005242420154382628],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005241490349698095],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.000524242009067954],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005241489660044184],
[584.0478798243412, 1273.928252815901, 1, 1, 0.3143462768783745, 0.00171218839164481, 0.0007849735632988686, -0.004090862353678088, 0.9011864182127045, 0.5298789719694532, 0.001049101124946306],
[584.5359715291549, 1273.440161111087, 1, 0, 0.3146089776183029, 0.001710758702127407, 0, -0.007547849923026772, 1, 0.3146089776183029, 0.0005246819396350768],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005241489660026847],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005242652227963367],
[584.0857773655677, 1273.99856783768, 1, 0, 0.314348365763599, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.314348365763599, 0.0005241489660026847],
[583.9980739879285, 1273.978058652314, 0, 1, 0.314319470378798, 0, 0.0007849428749643118, 0.003463159948280399, 0.685680529621202, 1, 0.0005241625937047837],
[584.0478798243411, 1273.928252815901, 1, 0, 0.3143462768783745, 0.00171218839164481, 0, -0.007554157698577155, 1, 0.3143462768783745, 0.0005242420770835485],
[583.9333394028322, 1274.014772426238, 1, 0, 0.3142893688392486, 0.001712524242960103, 0, -0.007555639471150416, 1, 0.3142893688392486, 0.0005242420770835485],
[584.0260947991004, 1273.950037841142, 0, 1, 0.3143345517410823, 0, 0.0007849601399554235, 0.003463236121244869, 0.6856654482589177, 1, 0.0005242420155667044],
[583.9980739879285, 1273.978058652314, 0, 1, 0.314319470378798, 0, 0.0007849428749643118, 0.003463159948280399, 0.685680529621202, 1, 0.0005241625936060553],
[584.1236749067942, 1273.852457733448, 1, 0, 0.3143870713111563, 0.0017119662204405, 0, -0.007553177481492615, 1, 0.3143870713111563, 0.0005242652307534491],
[584.0359715291551, 1273.940161111087, 0, 1, 0.3143398675951889, 0, 0.0007849662256725103, 0.003463262971366507, 0.6856601324048111, 1, 0.0005242420770818443],
[584.7840607738242, 1273.192071866418, 1, 0, 0.3147425042230374, 0.001710032928525335, 0, -0.007544647817306239, 1, 0.3147425042230374, 0.0005271737195225745],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.2098219879023, 1273.76631065234, 0, 1, 0.3144334373971326, 0, 0.0007850733620736641, 0.00346373565607429, 0.6855665626028674, 1, 0.0005242367220324358],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.375724542355, 1273.708620660892, 0, 1, 0.3145044120580182, 0, 0.0007851089203440639, 0.003463892538800163, 0.6854955879419817, 1, 0.0005242243526465719],
[584.3488874984854, 1273.627245141757, 0, 1, 0.3145082852426674, 0, 0.0007851590830947545, 0.003464113856343933, 0.6854917147573325, 1, 0.0005241019042367743],
[584.1734807432069, 1273.802651897036, 0, 1, 0.3144138778107327, 0, 0.0007850509641432527, 0.003463636836634049, 0.6855861221892673, 1, 0.0005241489660026847],
[584.2706883216719, 1273.70544431857, 1, 0, 0.3144661968781078, 0.001711535457773037, 0, -0.00755127696100284, 1, 0.3144661968781078, 0.0005241134253684481],
[584.1734807432069, 1273.802651897036, 0, 1, 0.3144138778107327, 0, 0.0007850509641432529, 0.00346363683663405, 0.6855861221892673, 1, 0.0005243173596589222],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005242666651640043],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0857773655677, 1273.978058652314, 0, 1, 0.3143518355200077, 0, 0.0007849428749643118, 0.003463159948280399, 0.6856481644799923, 1, 0.0002737476220917076],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 0, 0.3143666740947653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002502802919128738],
[584.1322483589087, 1273.902544026517, 0, 4, 0.3143817601009368, 0, 0.003139957619801047, 0.01385346095241293, 0.2209680338668965, 1, 0.00212105125712817],
[584.0359715291551, 1273.894166079004, 0, 1, 0.3143476494121705, 0, 0.0007849945675455607, 0.00346338801542097, 0.6856523505878296, 1, 0.0002738235339937886],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 0, 0.3143666740947653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002505551969992758],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.9482681515158, 1274.027864488727, 1, 0, 0.3142926638792216, 0.001712480461951695, 0, -0.007555446309788424, 1, 0.3142926638792216, 0.0005251467270154115],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.9980739879285, 1273.978058652314, 0, 1, 0.314319470378798, 0, 0.0007849428749643118, 0.003463159948280399, 0.685680529621202, 1, 0.0005243692131102805],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0478798243412, 1273.928252815901, 1, 0, 0.3143462768783745, 0.00171218839164481, 0, -0.007554157698577154, 1, 0.3143462768783745, 0.0005251777005832795],
[584.0478798243412, 1273.928252815901, 1, 0, 0.3143462768783745, 0.00171218839164481, 0, -0.007554157698577154, 1, 0.3143462768783745, 0.0005241423572441715],
[583.2516799200204, 1271.664770153755, 1, 0, 0.3144355530928754, 0.001714525708930881, 0, -0.007564469918573942, 1, 0.3144355530928753, 0.0005249222159334543],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.1866923163333, 1271.739887506088, 0, 1, 0.314398800825941, 0, 0.0007863243182228278, 0.003469254861829277, 0.6856011991740589, 1, 0.0005250193187767686],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.2611841208461, 1271.714948519396, 0, 1, 0.314430559972043, 0, 0.0007863397384486653, 0.003469322895708196, 0.6855694400279571, 1, 0.0005249172162353576],
[583.3170558829846, 1271.659076757258, 1, 0, 0.3144606799079038, 0.001714333551393024, 0, -0.007563622121479287, 1, 0.3144606799079037, 0.0005248799862277114],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.1734807432069, 1271.802651897036, 0, 1, 0.3143832799148519, 0, 0.0007862855125426797, 0.003469083651564758, 0.6856167200851481, 1, 0.0005249583983763746],
[584.0589403216981, 1271.660090664355, 0, 1, 0.3147345748840831, 0, 0.0007863736601795601, 0.003469472558038486, 0.6852654251159169, 1, 0.0005249416734587613],
[582.875724542355, 1272.128428909059, 0, 1, 0.3142180158776779, 0, 0.0007860841541428101, 0.003468195260360863, 0.6857819841223221, 1, 0.0005249022169758127],
[583.2611841208461, 1271.714948519396, 0, 1, 0.314430559972043, 0, 0.0007863397384486653, 0.003469322895708196, 0.6855694400279571, 1, 0.0005248989240097727],
[583.2611841208461, 1271.714948519396, 0, 1, 0.314430559972043, 0, 0.0007863397384486653, 0.003469322895708196, 0.6855694400279571, 1, 0.0005249055149478508],
[583.2611841208461, 1271.714948519396, 0, 1, 0.314430559972043, 0, 0.0007863397384486653, 0.003469322895708196, 0.6855694400279571, 1, 0.000524984266302772],
[583.2611841208461, 1271.665142682984, 0, 1, 0.3144390026130292, 0, 0.0007863705361068407, 0.003469458774661551, 0.6855609973869707, 1, 0.0005249958560080587],
[583.2990816620727, 1271.67705097817, 1, 0, 0.3144509901762703, 0.001714386378169095, 0, -0.00756385519267583, 1, 0.3144509901762702, 0.000524808930388206],
[583.2015015543789, 1271.774631085864, 0, 1, 0.3143983856677934, 0, 0.0007863028366481743, 0.003469160085341281, 0.6856016143322066, 1, 0.000524962688951524],
[583.2053123587077, 1271.770820281535, 1, 0, 0.3144004400361822, 0.001714662021776882, 0, -0.007565071329458437, 1, 0.3144004400361822, 0.000524966900572163],
[583.3208666873135, 1271.655265952929, 0, 1, 0.3144627342762926, 0, 0.000786376643712979, 0.003469485721357461, 0.6855372657237074, 1, 0.0005248627580982825],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.3208666873135, 1271.655265952929, 0, 1, 0.3144627342762926, 0, 0.000786376643712979, 0.003469485721357461, 0.6855372657237074, 1, 0.0005250175494741349],
[583.2611841208461, 1271.714948519396, 0, 1, 0.314430559972043, 0, 0.0007863397384486653, 0.003469322895708196, 0.6855694400279571, 1, 0.0005248558220075917],
[584.1236749067942, 1273.852457733448, 1, 0, 0.3143870713111563, 0.0017119662204405, 0, -0.007553177481492615, 1, 0.3143870713111563, 0.0005249483538175898],
[584.1236749067942, 1273.852457733448, 1, 0, 0.3143870713111563, 0.0017119662204405, 0, -0.007553177481492615, 1, 0.3143870713111563, 0.0005250138812395679],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005243810255409334],
[583.2611841208461, 1271.714948519396, 0, 1, 0.314430559972043, 0, 0.0007863397384486653, 0.003469322895708196, 0.6855694400279571, 1, 0.0005250188144925991],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.1236749067942, 1273.852457733448, 1, 0, 0.3143870713111563, 0.0017119662204405, 0, -0.007553177481492615, 1, 0.3143870713111563, 0.0005251051818532151],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 1, 0, 0.3143666740947653, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143666740947653, 0.0005244072835668172],
[584.0857773655677, 1273.714948519396, 1, 0, 0.3143963554472928, 0.00171207729883503, 0, -0.007553667558234918, 1, 0.3143963554472928, 0.0005241717835759332],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0857773655677, 1273.802651897036, 0, 1, 0.3143815140704609, 0, 0.0007850509641432527, 0.003463636836634049, 0.6856184859295391, 1, 0.0005242987435042007],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0478798243412, 1273.946227036813, 1, 0, 0.3143432358948738, 0.00171218839164481, 0, -0.007554157698577154, 1, 0.3143432358948738, 0.0005242667354272869],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[583.979065586277, 1273.997067053966, 0, 1, 0.3143092396759825, 0, 0.000784931163391478, 0.003463108276940659, 0.6856907603240175, 1, 0.0005243350314341015],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0667689639162, 1273.909363676326, 0, 0, 0.3143564433919498, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001938235347169095],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0762731647419, 1273.899859475501, 1, 0, 0.3143615587433576, 0.001712105158084284, 0, -0.007553790472958119, 1, 0.3143615587433576, 0.0003303320934572156],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[584.0857773655677, 1273.890355274675, 0, 1, 0.3143666740947653, 0, 0.0007849969158329808, 0.003463398376041086, 0.6856333259052347, 1, 0.0005243554446537256]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[1.012187215819916, 2.024345271191977, 0, 0.75, 0.3333365344020941, 0, 0.3704901583109804, 1.654520003208727, 0.7377852895415954, 1, 0.223926067737146],
[0.9113615540396469, 2.024374431639833, 0, 0, 0.3104371641337194, 0, 0, 0, 1, 1, 0.223926067737146],
[1.012187215819916, 2.024374431639833, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.223926067737146],
[1.012126311744398, 2.02437909160604, 0, 1, 0.3333194502560844, 0, 0.4939786249257546, 2.205989815824426, 0.6666805497439157, 1, 0.223926067737146],
[0.8346427405586053, 2.02448164823735, 0, 1, 0.2919225004093275, 0, 0.4939536008492186, 2.205878064312917, 0.7080774995906725, 1, 0.223926067737146],
[1.002689634182443, 2.005379268364885, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9973175805446164, 0, -4.411989787712707, 1, 0.3333333333333334, 0.2260471189942741],
[0.8268110988991531, 2.181257803648169, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.9025065980081133, 2.105562304539214, 1, 0, 0.3000285655836681, 1.108025140433389, 0, -4.901744137962033, 1, 0.3000285655836681, 0.2260471189942741],
[0.9026341913813299, 2.105434711165997, 2, 0, 0.3000709826217581, 2.215737027354721, 0, -9.802102487361699, 1, 0.09004259461158748, 0.2260471189942741],
[0.9032678802379195, 2.104801022309408, 2, 1, 0.3002816456341821, 2.214182573915064, 0.4751042922350876, -7.693432632176248, 0.9729238842645923, 0.2163549686435029, 0.2260471189942741],
[0.8268110988991531, 2.125065449841227, 0, 0, 0.2800967741188122, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[1.002574066363934, 2.005494836183393, 1, 1, 0.3332949140609522, 0.9974325424422061, 0.498630054766471, -2.20663059053794, 0.8889145002611023, 0.555504328383007, 0.2260471189942741],
[1.002689634182443, 2.005379268364885, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4986587902723082, 2.205994893856353, 0.6666666666666666, 1, 0.2260471189942741],
[0.8268110988991531, 2.180647638638872, 0, 1, 0.2749201804763579, 0, 0.4585793606821253, 2.028689251703055, 0.7250798195236421, 1, 0.2260471189942741],
[1.002227190718878, 2.005414651397873, 1, 2, 0.33322690776689, 0.9977777586364625, 0.9972999841234337, -0.002113605849764777, 0.7408826301671865, 0.7035617802944381, 0.2260471189942741],
[0.9028100423968772, 2.005379268364885, 0, 0, 0.3104371641337193, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[1.002689634182443, 2.005379268364885, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4986587902723082, 2.205994893856353, 0.6666666666666666, 1, 0.2260471189942741],
[1.002486192326975, 2.005582710220352, 0, 1, 0.3332657012869746, 0, 0.4986082074322084, 2.205771122634119, 0.6667342987130254, 1, 0.2260471189942741],
[0.7729926474987776, 2.018205104686755, 0, 1, 0.2769394059928278, 0, 0.4954897783568977, 2.191975640129475, 0.7230605940071722, 1, 0.2260471189942741],
[0.9027221473584093, 2.013150958665102, 1, 0, 0.3095889685643716, 1.107760569435734, 0, -4.900573713853854, 1, 0.3095889685643716, 0.2260471189942741],
[0.8830034527060979, 2.125065449841227, 0, 0, 0.2935449556884629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.7539551586462927, 2.154741550352296, 1, 0, 0.2592072099898878, 1.326338826032406, 0, -5.867532538939381, 1, 0.2592072099898878, 0.2260471189942741],
[0.9028100423968772, 2.10525886015045, 0, 0, 0.3001294423915454, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[1.002078685300789, 2.005990217246539, 0, 1, 0.3331302299798375, 0, 0.4985069176322403, 2.205323031101616, 0.6668697700201625, 1, 0.2260471189942741],
[1.902830925578738, 1.104830773342901, 1, 1, 0.6326612219256493, 0.5255327662366293, 0.905115990727057, 1.679221686961835, 0.5997397782715445, 0.8650622221228429, 0.2260471189942741],
[1.002689634182443, 2.005379268364885, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.9992297913140359, 2.007733707926033, 0, 1, 0.3323052612931833, 0, 0.4980740204999542, 2.203407956341043, 0.6676947387068166, 1, 0.2260471189942741],
[1.002689634182443, 2.005379268364885, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[1.002689634182443, 2.005379268364885, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.7539551581589937, 2.154741550839595, 1, 0, 0.2592072098223561, 1.32633882688965, 0, -5.867532542731706, 1, 0.2592072098223561, 0.2260471189942741],
[1.002689634182443, 2.005379268364885, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[1.004695055449425, 1.903230595267878, 0, 1, 0.3455023188786119, 0, 0.5254224067679254, 2.324393290680403, 0.6544976811213881, 1, 0.2260471189942741],
[0.9028100423968772, 2.013021376361779, 0, 0, 0.309623538791974, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[1.002689634182443, 2.005379268364885, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[1.599803746397932, 1.352072802342452, 0, 0, 0.5419616030624979, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[1.002689634182443, 2.005379268364885, 1, 1, 0.3333333333333334, 0.9973175805446164, 0.4986587902723082, -2.205994893856353, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.2260471189942741],
[0.7542207562366322, 2.036976985191386, 0, 2, 0.2702140178183011, 0, 0.9818471266684873, 4.343550720915659, 0.532587579788907, 1, 0.2260471189942741],
[0.753933120200458, 1.351325739949992, 0, 0, 0.3581189631694884, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[1.905145962538876, 1.102857921071182, 2, 0, 0.6333588772672774, 1.04978833082937, 0, -4.644112853550509, 1, 0.401143467413266, 0.2260471189942741],
[0.9028100423968772, 2.10525886015045, 0, 0, 0.3001294423915454, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.8268110988991531, 2.181257803648169, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.8831331865857963, 2.124935715961529, 1, 0, 0.2935880843148014, 1.132332036876581, 0, -5.009274357994641, 1, 0.2935880843148013, 0.2260471189942741],
[0.9028100423968772, 2.10525886015045, 0, 1, 0.3001294423915454, 0, 0.4750009696805342, 2.101336092200167, 0.6998705576084546, 1, 0.2260471189942741],
[1.002274245139408, 2.00579465740792, 0, 1, 0.3331952417348719, 0, 0.4985555207791289, 2.205538044445316, 0.6668047582651281, 1, 0.2260471189942741],
[0.7729926474987776, 2.135704061499808, 0, 0, 0.2657522336747531, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.922204231000428, 2.085749764923834, 0, 1, 0.3065885423281082, 0, 0.4794438991757562, 2.120990974399018, 0.6934114576718917, 1, 0.2260471189942741],
[1.002689634182443, 2.005379268364885, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9973175805446164, 0, -4.411989787712707, 1, 0.3333333333333334, 0.2260471189942741],
[1.002689634182443, 2.005379268364885, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.9028100423968772, 2.005379268364885, 0, 0, 0.3104371641337193, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.9028100423968772, 2.013021376361779, 0, 0, 0.309623538791974, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.9028100423968772, 2.012994863782319, 0, 1, 0.3096263541101928, 0, 0.4967722561005689, 2.197649137537348, 0.6903736458898072, 1, 0.2260471189942741],
[1.002486230495461, 2.005517685543273, 0, 1, 0.3332729140245413, 0, 0.4986243737507159, 2.205842640106138, 0.6667270859754586, 1, 0.2260471189942741],
[0.753933120200458, 2.037128551920573, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.8268110988991531, 2.181257803648169, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.7729706089672677, 2.018091063153764, 1, 0, 0.2769450122468481, 1.293710250297947, 0, -5.723188404496837, 1, 0.2769450122468482, 0.2260471189942741],
[0.826898962004928, 2.181169940542394, 1, 0, 0.2748936240472036, 1.209337592558304, 0, -5.349935880354825, 1, 0.2748936240472035, 0.2260471189942741],
[0.7542207892077105, 2.037091836158902, 0, 1, 0.2702029082495375, 0, 0.4908958851288605, 2.171652916051078, 0.7297970917504625, 1, 0.2260471189942741],
[0.8830034527060979, 2.125065449841227, 0, 0, 0.2935449556884629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[1.002689634182443, 2.005379268364885, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0, 1.462083607549771, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.902546341136414, 2.005491547786252, 1, 1, 0.3103626484972581, 1.107976349159956, 0.4986308723683444, -2.695656903316014, 0.9036750264177673, 0.5244003234122837, 0.2260471189942741],
[1.002689634182443, 2.005379268364885, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9973175805446164, 0, -4.411989787712707, 1, 0.3333333333333334, 0.2260471189942741],
[0.753933120200458, 2.037128551920573, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[1.002689634182443, 2.005379268364885, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[1.002689634182443, 2.005379268364885, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4986587902723082, 2.205994893856353, 0.6666666666666666, 1, 0.2260471189942741],
[0.753933120200458, 2.037128551920573, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.7729926474987776, 2.135704061499808, 0, 0, 0.2657522336747531, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.9028100423968772, 2.10525886015045, 0, 0, 0.3001294423915454, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.8268110988991531, 2.005379268364885, 0, 0, 0.2919334478557216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.7539551586433895, 2.037106513477641, 1, 0, 0.2701320311816797, 1.326338826037513, 0, -5.867532538961974, 1, 0.2701320311816797, 0.2260471189942741],
[1.599781675927933, 1.351956279119322, 1, 0, 0.5419795728114768, 0.6250852944793001, 0, -2.76528759694183, 1, 0.5419795728114768, 0.2260471189942741],
[0.7729926474987776, 1.332266212651669, 0, 0, 0.3671722571178433, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[1.001817710198565, 2.006251192348762, 0, 1, 0.3330434716273268, 0, 0.4984420713685798, 2.205036160541403, 0.6669565283726732, 1, 0.2260471189942741],
[1.002689634182443, 2.005379268364885, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.8268110988991531, 2.181257803648169, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.753933120200458, 2.037128551920573, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.8830034527060979, 2.125065449841227, 0, 0, 0.2935449556884629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.753933120200458, 2.154763588798131, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[1.599803746397932, 1.352072802342452, 0, 0, 0.5419616030624979, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[1.002689634182443, 2.005379268364885, 0, 1.5, 0.3333333333333334, 0, 0.7479881854084622, 3.308992340784529, 0.5443310539518172, 1, 0.2260471189942741],
[0.7729926474987776, 2.135704061499808, 0, 0, 0.2657522336747531, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.753933120200458, 2.154763588798131, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.8268110988991531, 2.181257803648169, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.9028100423968772, 2.10525886015045, 0, 0, 0.3001294423915454, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[1.001281001502649, 2.006787901044679, 0, 32, 0.3328650486213039, 0, 15.94588047064749, 70.54228579242101, 2.370490448219214e-06, 1, 0.2260471189942741],
[0.9028100423968772, 2.10525886015045, 0, 0, 0.3001294423915454, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9997351137855456, 2.00001463380755, 0, 1, 0.3332728387051958, 0, 0.4999963415748809, 2.205978752922091, 0.6667271612948042, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031664118659786, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2800967741188121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000754641003057, 1.997281244743577, 0, 4, 0.3338034230213452, 0, 2.002722456102342, 8.835991023946452, 0.196974309878126, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 1, 0.2748644149071801, 0, 0.4596841476076032, 2.028121764818168, 0.7251355850928198, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -4.411989787712707, 1, 0.3333333333333333, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 2.205994893856353, 0.6666666666666667, 1, 0.2266551030523635],
[1.576504000052315, 1.248089244669228, 0, 0, 0.5581348758793523, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8246809037370597, 2.175319096262939, 1, 1, 0.2748936345790201, 1.212590221828198, 0.4597026715381375, -3.321732183175786, 0.9244334896679363, 0.4742207588259763, 0.2266551030523635],
[0.9998848015562857, 1.999884400574643, 2, 1, 0.3333205770783976, 2.000230423431849, 0.5000289015268391, -6.618873794155973, 0.9629672148852216, 0.2592422510820711, 0.2266551030523635],
[0.249256587087603, 2.750513787519399, 0, 1, 0.08309188903175896, 0, 0.3635684374815907, 1.604060233303446, 0.9169081109682411, 1, 0.2266551030523635],
[0.9923783913422773, 2.007621608657725, 0, 0, 0.3307927971140922, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7709191569822593, 2.129975207374301, 0, 0, 0.2657522336747532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.88077288538275, 2.119227114617251, 0, 1, 0.2935909617942499, 0, 0.4718701422337208, 2.08188624866172, 0.7064090382057502, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 1.347700917494591, 0, 0, 0.3581189631694884, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -4.411989787712707, 1, 0.3333333333333333, 0.2266551030523635],
[0.9194476214235076, 2.08032296015105, 0, 3, 0.3065059798475976, 0, 1.442083780963593, 6.362458914637508, 0.3335248225653207, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031664118659786, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7709191569822593, 2.129975207374301, 0, 0, 0.2657522336747532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.771184084353838, 2.129824893670167, 0, 1, 0.265833056772931, 0, 0.4695221672786325, 2.071527007138066, 0.734166943227069, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 1, 0.2748644149071801, 0, 0.4596841476076032, 2.028121764818168, 0.7251355850928198, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0.4999999999999994, -2.205994893856353, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9008943643565601, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3105574527035163, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8806348670653892, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2935449556884629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.091990064167641, 1.007621608657724, 0, 0, 0.5200914427657914, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.99939150297653, 2.000608497023474, 0, 1, 0.3331305009921763, 0, 0.4998479220136326, 2.205323927333567, 0.6668694990078237, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2919334478557216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9997970902165744, 2.000202909783429, 0, 1, 0.3332656967388578, 0, 0.4999492777001682, 2.205771107587489, 0.6667343032611422, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -4.411989787712707, 1, 0.3333333333333333, 0.2266551030523635],
[1.000666878343175, 1.899633771904672, 0, 1, 0.3450217749865562, 0, 0.5264172572576175, 2.322547563096343, 0.6549782250134438, 1, 0.2266551030523635],
[1.003123580939633, 1.996761210399751, 0, 2, 0.3343873684201585, 0, 1.001622021493297, 4.419146129976587, 0.4430401753186418, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031664118659786, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9003883271746372, 2.007621608657725, 0, 0, 0.309623538791974, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9003883271746372, 2.099611672825366, 0, 0, 0.3001294423915454, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 1.347700917494591, 0, 0, 0.3581189631694884, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9003281654669034, 2.007871425395302, 1, 1, 0.3095826601089575, 1.110706116231971, 0.4980398582061218, -2.703077273686209, 0.9041585765598616, 0.5233238967777767, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -4.411989787712707, 1, 0.3333333333333333, 0.2266551030523635],
[1.000666712584104, 1.899633959456693, 0, 1, 0.3450217152416769, 0, 0.5264172052841202, 2.322547333789804, 0.6549782847583232, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7710914758898176, 2.129917517015337, 0, 1, 0.2658011325630618, 0, 0.4695017492514472, 2.071436923010639, 0.7341988674369382, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2800967741188121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8246809037370597, 2.175319096262939, 1, 0, 0.2748936345790201, 1.212590221828198, 0, -5.3499356753863, 1, 0.2748936345790201, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.17520390179371, 0, 1, 0.2748830018987912, 0, 0.4597270164766544, 2.028310901830633, 0.7251169981012088, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2800967741188121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9997971771653548, 2.000202822834649, 0, 1, 0.3332657257217845, 0, 0.4999492994329542, 2.205771203472318, 0.6667342742782154, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031664118659786, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -4.411989787712707, 1, 0.3333333333333333, 0.2266551030523635],
[1.00066694094014, 1.899633701077857, 0, 1, 0.3450217975485075, 0, 0.5264172768848002, 2.322547649691273, 0.6549782024514925, 1, 0.2266551030523635],
[0, 1.458161686035484, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7709191569822593, 1.328692515843103, 0, 0, 0.3671722571178433, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0.4999999999999994, -2.205994893856353, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.2266551030523635],
[0.999884819007207, 1.999864767016939, 2, 1, 0.3333227625618077, 2.000230388521965, 0.5000338105319149, -6.618851981653656, 0.9629664864417317, 0.2592451650089684, 0.2266551030523635],
[0.8246809037253863, 2.175319096274612, 1, 0, 0.2748936345751289, 1.212590221845362, 0, -5.34993567546203, 1, 0.2748936345751289, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 2.205994893856353, 0.6666666666666667, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9002129714430944, 2.007880132915639, 2, 0, 0.3095543846563336, 2.221696491213498, 0, -9.802102230631119, 1, 0.09582391705996129, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031664118659786, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2800967741188121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.999585668094196, 2.000414331905807, 0, 1, 0.333195222698065, 0, 0.4998964384779696, 2.205537981478757, 0.666804777301935, 1, 0.2266551030523635],
[0.7709191569822593, 2.012655717008302, 0, 0, 0.2769529083573964, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 1, 0.2748644149071801, 0, 0.4596841476076032, 2.028121764818168, 0.7251355850928198, 1, 0.2266551030523635],
[1.5955124017038, 1.348445975952355, 0, 0, 0.5419616030624979, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9998619571828854, 2.000138042817118, 0, 1, 0.3332873190609614, 0, 0.4999654916775336, 2.205842643490043, 0.6667126809390386, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7520824666459976, 2.031878367212971, 0, 2, 0.2701483646964615, 0, 0.9843108880298298, 4.342769585922039, 0.5326834095552494, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 2.205994893856353, 0.6666666666666667, 1, 0.2266551030523635],
[0.9998618934006759, 2.000138106599327, 0, 1, 0.3332872978002249, 0, 0.4999654757341827, 2.205842573148141, 0.6667127021997751, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0.4999999999999994, -2.205994893856353, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.119495111323094, 0, 1, 0.2800844081423481, 0, 0.4718104772488721, 2.081623007357885, 0.7199155918576519, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -4.411989787712707, 1, 0.3333333333333333, 0.2266551030523635],
[0.9003006720304935, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3104163236290238, 1.11074003504257, 0, -4.900573691411481, 1, 0.3104163236290238, 0.2266551030523635],
[1.576504000052315, 1.248089244669228, 0, 0, 0.5581348758793523, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0.4999999999999994, -2.205994893856353, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.2266551030523635],
[0.7558964244802143, 1.346839950181839, 0, 1, 0.3594822601581237, 0, 0.7424787183250603, 3.275808522844189, 0.6405177398418762, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8807728662356563, 2.119227133764345, 0, 1, 0.2935909554118853, 0, 0.4718701379704015, 2.081886229852, 0.7064090445881147, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2919334478557216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2800967741188121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.001041276901473, 1.998958723098531, 0, 1, 0.3336804256338239, 0, 0.5002604548281656, 2.207144017898383, 0.6663195743661761, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 2.205994893856353, 0.6666666666666667, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2800967741188121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9003883271746372, 2.099265984322839, 0, 1, 0.3001640301429097, 0, 0.4763569778522232, 2.101682121589699, 0.6998359698570904, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000667020988447, 1.899633610505307, 0, 1, 0.3450218264004822, 0, 0.5264173019838271, 2.322547760427923, 0.6549781735995178, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031664118659786, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9686768798243525, 2.031323120175652, 2, 4, 0.3228922932747837, 2.064671968182677, 1.96915988415182, -0.4213983393472984, 0.7008384507240681, 0.6278902669419932, 0.2266551030523635],
[0.9997131344051374, 1.783861739585425, 0, 1, 0.3591472044622741, 0, 0.5605815617932379, 2.473280125811808, 0.6408527955377259, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 2, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0.9999999999999989, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.2266551030523635],
[0.7709191569822593, 2.012655717008302, 0, 0, 0.2769529083573964, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8248837030855399, 2.175116296914458, 1, 1, 0.2749612343618468, 1.212292104037726, 0.4597455324198361, -3.320227788756343, 0.9243963195982094, 0.4743187883219032, 0.2266551030523635],
[0.9997971464121417, 2.000202853587862, 0, 1, 0.3332657154707135, 0, 0.4999492917462102, 2.205771169558483, 0.6667342845292865, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 2.205994893856353, 0.6666666666666667, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031799781204152, 0, 1, 0.2701109707573006, 0, 0.4921744796169568, 2.171468777842831, 0.7298890292426994, 1, 0.2266551030523635],
[0.9003883271746372, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3104371641337194, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175203901716917, 0, 1, 0.274883001905828, 0, 0.4597270164928845, 2.02831090190224, 0.725116998094172, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 1, 0.2748644149071801, 0, 0.4596841476076032, 2.028121764818168, 0.7251355850928198, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031664118659786, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9989849482157932, 2.00101505178421, 0, 1, 0.3329949827385974, 0, 0.4997463657798814, 2.204875862267378, 0.6670050172614026, 1, 0.2266551030523635],
[0.9979246901063271, 2.001968863683495, 0, 4, 0.3326533665988348, 0, 1.998033072622446, 8.815301511922481, 0.19833798448228, 1, 0.2266551030523635],
[1.5955124017038, 1.348445975952355, 0, 0, 0.5419616030624979, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9999911850158721, 2.000008814984131, 0, 1, 0.3333303950052904, 0, 0.4999977962636802, 2.205985170994218, 0.6666696049947096, 1, 0.2266551030523635],
[0.8806348670653892, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2935449556884629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 2.205994893856353, 0.6666666666666667, 1, 0.2266551030523635],
[0.9991882901182946, 2.000552372443016, 0, 2, 0.3330915577432429, 0, 0.9997238900362597, 4.410771593372404, 0.4447668703533342, 1, 0.2266551030523635],
[0.7710914222513292, 2.129917534972877, 0, 1, 0.2658011173426842, 0, 0.4695017452930328, 2.071436905546156, 0.7341988826573158, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9998848015562855, 2.000008814202506, 1, 1, 0.3333067533807779, 1.000115211715925, 0.4999977964590848, -2.206512928770456, 0.8889066081507655, 0.555520114912321, 0.2266551030523635],
[0.9995857712322574, 2.000414228767746, 0, 1, 0.3331952570774188, 0, 0.4998964642518062, 2.205538095192662, 0.6668047429225812, 1, 0.2266551030523635],
[0.8799025103393512, 2.12009748966065, 1, 0, 0.2933008367797836, 1.136489540885991, 0, -5.014180248231299, 1, 0.2933008367797836, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8254637424490411, 2.174333186666845, 0, 1, 0.2751732073718488, 0, 0.4599111148797553, 2.029123142105048, 0.7248267926281512, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 1.783574873990561, 0, 0, 0.3592502610021014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9996543378005703, 2.000345662199433, 1, 1, 0.3332181126001897, 1.000345781723101, 0.4999135993828553, -2.207901677927947, 0.8889656894351672, 0.5554019146355468, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2800967741188121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9003883271746372, 2.099611672825366, 0, 0, 0.3001294423915454, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2919334478557216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9997971771679871, 2.000202822832016, 0, 1, 0.333265725722662, 0, 0.4999492994336122, 2.205771203475221, 0.666734274277338, 1, 0.2266551030523635],
[0.9003883271746372, 2.007621608657725, 0, 0, 0.309623538791974, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8269124006606536, 2.172072331017175, 1, 3, 0.2757307804625017, 1.209317938878483, 1.381169474496786, 0.7582072201507002, 0.6941995890343926, 0.7248306140713173, 0.2266551030523635],
[0.9002129137266361, 2.099787086273367, 1, 0, 0.3000709712422118, 1.11084831682793, 0, -4.90105142954268, 1, 0.3000709712422118, 0.2266551030523635],
[0.7709191569822593, 2.129975207374301, 0, 0, 0.2657522336747532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2800967741188121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2919334478557216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0, 1.458161686035484, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9998619670310093, 2.000138032968994, 1, 1, 0.3332873223436694, 1.000138052024722, 0.4999654941392247, -2.206756217484958, 0.8889195607649871, 0.5554942054523258, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999989, 4.411989787712707, 0.4444444444444445, 1, 0.2266551030523635],
[0.900618706792689, 2.099381293207314, 0, 3, 0.3002062355975627, 0, 1.42899244158586, 6.304700058995468, 0.3426969229823666, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9002165773361852, 2.099668783282933, 0, 1, 0.3000836595803774, 0, 0.4762655938697398, 2.101278936392222, 0.6999163404196226, 1, 0.2266551030523635],
[0.2480892446692261, 2.751910755330774, 0, 0, 0.082696414889742, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2800967741188121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9005035260649218, 2.099496473935081, 0, 1, 0.3001678420216403, 0, 0.4763046818200663, 2.101451392029885, 0.6998321579783597, 1, 0.2266551030523635],
[0.8248562784338695, 2.175143721566129, 1, 0, 0.27495209281129, 1.212332410075936, 0, -5.348798212568167, 1, 0.2749520928112901, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -4.411989787712707, 1, 0.3333333333333333, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 1.783574873990561, 0, 0, 0.3592502610021014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7527746885643412, 2.03080018542622, 0, 1, 0.270434503342515, 0, 0.4924167366028294, 2.172537613190503, 0.7295654966574849, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 2, 1, 0.3333333333333333, 1.999999999999998, 0.4999999999999994, -6.61798468156906, 0.962962962962963, 0.2592592592592592, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031849548647073, 0, 1, 0.2701061417738926, 0, 0.4921624244599506, 2.171415590613231, 0.7298938582261074, 1, 0.2266551030523635],
[0.9997971771679878, 2.000202822832016, 0, 1, 0.3332657257226622, 0, 0.4999492994336123, 2.205771203475222, 0.6667342742773378, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.828367573580237, 2.171632426419762, 7, 1, 0.2761225245267458, 8.450354918826344, 0.4604830853666333, -35.25123293435768, 0.9999662079387936, 0.0007425009794325144, 0.2266551030523635],
[0.8769870820688714, 2.045339387939804, 1, 0, 0.3000989420823567, 1.140267650968054, 0, -5.11377829090383, 1, 0.3000989420823568, 0.222979485246029],
[0.9003006720304935, 2.09969932796951, 1, 0, 0.3001002240101642, 1.11074003504257, 0, -4.900573691411481, 1, 0.3001002240101642, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9997971464384602, 2.000202853561543, 0, 1, 0.3332657154794864, 0, 0.4999492917527884, 2.205771169587505, 0.6667342845205136, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031664118659786, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.2480892446692261, 2.751910755330774, 0, 0, 0.082696414889742, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9998848015712313, 2.000115198428772, 0, 1, 0.3332949338570767, 0, 0.4999712020515462, 2.205867837601871, 0.6667050661429232, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 1.347700917494591, 0, 0, 0.3581189631694884, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7709191569822593, 2.012655717008302, 0, 0, 0.2769529083573964, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9003883271746372, 2.099611672825366, 0, 0, 0.3001294423915454, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9919994270931829, 2.008000572906819, 1, 1, 0.3306664756977274, 1.008065098313878, 0.498007826039801, -2.250367476421829, 0.8906596818496444, 0.551992633245099, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8806348670653892, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2935449556884629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9003006720304935, 2.09969932796951, 1, 0, 0.3001002240101642, 1.11074003504257, 0, -4.900573691411481, 1, 0.3001002240101642, 0.2266551030523635],
[0.8246808998656836, 2.175319100134315, 1, 0, 0.2748936332885614, 1.212590227520573, 0, -5.349935700501001, 1, 0.2748936332885614, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9997971464121417, 2.000202853587862, 0, 2, 0.3332657154707135, 0, 0.9998985834924204, 4.411542339116965, 0.4445346061667796, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031664118659786, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7709191569822593, 2.012655717008302, 0, 0, 0.2769529083573964, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.991990599319952, 2.00800940068005, 1, 0, 0.3306635331066504, 1.008074069134868, 0, -4.447612498281034, 1, 0.3306635331066503, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8806348670653892, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2935449556884629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8807728853989589, 2.119227114601042, 0, 1, 0.2935909617996528, 0, 0.4718701422373299, 2.081886248677644, 0.7064090382003472, 1, 0.2266551030523635],
[1.5955124017038, 1.348445975952355, 0, 0, 0.5419616030624979, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 2.205994893856353, 0.6666666666666667, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9997971464121417, 2.000202853587862, 0, 1, 0.3332657154707135, 0, 0.4999492917462102, 2.205771169558483, 0.6667342845292865, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -4.411989787712707, 1, 0.3333333333333333, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 3, 0.3333333333333333, 0, 1.499999999999998, 6.617984681569061, 0.2962962962962963, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -4.411989787712707, 1, 0.3333333333333333, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.032343064494088, 0, 1, 0.2700582647950079, 0, 0.4920429121787716, 2.170888303649163, 0.7299417352049921, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9988431647278549, 2.001156835272148, 1, 1, 0.3329477215759513, 1.00115817508994, 0.49971095836874, -2.212379999250898, 0.8891458146973829, 0.5550412578492854, 0.2266551030523635],
[0.7523698146470081, 2.148639119160067, 0, 2, 0.2593476379473441, 0, 0.9308217383577322, 4.106776003815308, 0.5485659214141786, 1, 0.2266551030523635],
[0.9997970832807025, 2.000202916719301, 0, 1, 0.3332656944269005, 0, 0.499949275966552, 2.205771099938792, 0.6667343055730995, 1, 0.2266551030523635],
[1.5955124017038, 1.348445975952355, 0, 0, 0.5419616030624979, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2919334478557216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 2.205994893856353, 0.6666666666666667, 1, 0.2266551030523635],
[0.9003883271746372, 2.099611672825366, 0, 0, 0.3001294423915454, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 1.347700917494591, 0, 0, 0.3581189631694884, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8806348670653892, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2935449556884629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031664118659786, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9998848015562855, 2.000115198443718, 0, 1, 0.3332949338520947, 0, 0.4999712020478101, 2.205867837585387, 0.6667050661479053, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.119227111030797, 0, 1, 0.2801099065404087, 0, 0.4718701430322857, 2.081886252184981, 0.7198900934595913, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9998619780961607, 2.000138021903842, 0, 1, 0.3332873260320532, 0, 0.4999654969051308, 2.205842666554148, 0.6667126739679468, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9998853745101582, 1.784075436966416, 1, 1, 0.3591592849972025, 1.000114638630351, 0.5605144150744922, -1.939511697004674, 0.8710046080002982, 0.5893231779947032, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 2.205994893856353, 0.6666666666666667, 1, 0.2266551030523635],
[0.752083020599835, 2.148811343756729, 0, 1, 0.2592590167503916, 0, 0.4653735670678831, 2.053223425374937, 0.7407409832496084, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9977672108296985, 2.002232789170305, 0, 3, 0.3325890702765658, 0, 1.498327275542798, 6.610604638346234, 0.2972897553059161, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -4.411989787712707, 1, 0.3333333333333333, 0.2266551030523635],
[0, 1.458161686035484, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8806348670653892, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2935449556884629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031664118659786, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7709191569822593, 1.328692515843103, 0, 0, 0.3671722571178433, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000666813038965, 1.899633845794666, 0, 1, 0.3450217514488265, 0, 0.5264172367815831, 2.322547472756289, 0.6549782485511735, 1, 0.2266551030523635],
[0.2480892446692261, 2.751910755330774, 0, 0, 0.082696414889742, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.89934686438156, 1.100653135618439, 1, 0, 0.6331156214605203, 0.5264967756827327, 0, -2.322898397575887, 1, 0.6331156214605203, 0.2266551030523635],
[0.824860972016524, 2.175139027983474, 0, 2, 0.2749536573388415, 0, 0.9194814557918893, 4.056742792945033, 0.5256921990063221, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2919334478557216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 2.205994893856353, 0.6666666666666667, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 1.900503528163994, 0, 1, 0.3447677240485883, 0, 0.526176344942681, 2.321484660423109, 0.6552322759514118, 1, 0.2266551030523635],
[0.7709812380907323, 2.012843959888368, 0, 1, 0.2769503051593976, 0, 0.4968094993590363, 2.191918437610733, 0.7230496948406024, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 2.205994893856353, 0.6666666666666667, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 2.205994893856353, 0.6666666666666667, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.001254499510841, 1.998363807233479, 0, 2.5, 0.3337939688058402, 0, 1.251023457766173, 5.519502719853399, 0.362260848623879, 1, 0.2266551030523635],
[1.091990064167641, 1.007621608657724, 0, 0, 0.5200914427657914, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 1.900388327174637, 0, 0, 0.3447814179331404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8810495266359002, 2.118950473364101, 0, 1, 0.2936831755453, 0, 0.4719317476129464, 2.082158050965732, 0.7063168244547, 1, 0.2266551030523635],
[0.90030065883458, 2.099699341165423, 1, 0, 0.3001002196115263, 1.110740051322942, 0, -4.900573763240314, 1, 0.3001002196115263, 0.2266551030523635],
[0.9997039783786964, 2.000296021621307, 2, 1, 0.3332346594595651, 2.000592218552103, 0.4999260055466523, -6.620924006545558, 0.9629958445186464, 0.2591277038326898, 0.2266551030523635],
[0.9998848190071795, 2.000115180992824, 0, 1, 0.3332949396690594, 0, 0.4999712064100312, 2.205867856831462, 0.6667050603309406, 1, 0.2266551030523635],
[0.999861893343947, 2.000138106656057, 1, 1, 0.3332872977813153, 1.000138125732136, 0.4999654757200023, -2.206756623946738, 0.8889195771376288, 0.5554941727002595, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031664118659786, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9998619392778075, 2.000138060722196, 0, 1, 0.3332873130926021, 0, 0.4999654872018819, 2.205842623743513, 0.6667126869073978, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 2.205994893856353, 0.6666666666666667, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 1.347700917494591, 0, 0, 0.3581189631694884, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9995942983387803, 2.00034088115744, 0, 2, 0.3332052989580402, 0, 0.9998295884663202, 4.411237933766408, 0.4446151733376364, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.576504000052315, 1.248089244669228, 0, 0, 0.5581348758793523, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7709191569822593, 1.328692515843103, 0, 0, 0.3671722571178433, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.770981238667472, 2.130027755394669, 0, 1, 0.2657631328429302, 0, 0.4694774504544951, 2.071329716966633, 0.7342368671570698, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.2480892446692261, 2.751910755330774, 0, 0, 0.082696414889742, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9991301375827243, 2.000869862417279, 0, 1, 0.333043379194241, 0, 0.4997826289371393, 2.20503585494687, 0.6669566208057589, 1, 0.2266551030523635],
[0.2478021472907828, 2.752197852709218, 0, 1, 0.08260071576359423, 0, 0.3633459705724342, 1.603078711572143, 0.9173992842364058, 1, 0.2266551030523635],
[1.900388327174637, 1.099611672825362, 0, 0, 0.6334627757248792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245091076398294, 2.175240359134575, 0, 1, 0.2748593230108694, 0, 0.4597193113858242, 2.028276907048577, 0.7251406769891307, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 1.783825156598614, 1, 0, 0.3592179622451001, 0.9999999999999989, 0, -4.411989787712707, 1, 0.3592179622451001, 0.2266551030523635],
[0.8806348670653892, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2935449556884629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 1.900388327174637, 0, 0, 0.3447814179331404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7709191569822593, 1.328692515843103, 0, 0, 0.3671722571178433, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2919334478557216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 1.900388327174637, 0, 0, 0.3447814179331404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.900035745683488, 1.099899443561966, 1, 0, 0.6333589313845763, 0.5263058878085877, 0, -2.322056202224561, 1, 0.6333589313845763, 0.2266551030523635],
[0.9008367181250803, 1.999921956946996, 0, 2, 0.3105521068906902, 0, 1.000039023049241, 4.412161957007448, 0.4753383973128662, 1, 0.2266551030523635],
[0.9996541851783455, 2.000345814821658, 0, 1, 0.3332180617261148, 0, 0.4999135612404876, 2.205613526932125, 0.6667819382738852, 1, 0.2266551030523635],
[0.8806348670653892, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2935449556884629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.001156661807711607, 2.998843338192287, 0, 1, 0.0003855539359038692, 0, 0.3334619008816924, 1.471230501281295, 0.9996144460640961, 1, 0.2266551030523635],
[0.9003883271746372, 2.099611672825366, 0, 0, 0.3001294423915454, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.594620732784508, 1.349402464343803, 0, 1, 0.5416467962412624, 0, 0.7410687518540195, 3.26958776517294, 0.4583532037587376, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999989, 4.411989787712707, 0.4444444444444445, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -4.411989787712707, 1, 0.3333333333333333, 0.2266551030523635],
[0.9003883271746372, 2.099611672825366, 0, 0, 0.3001294423915454, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.900388327174637, 1.099611672825362, 0, 0, 0.6334627757248792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9998617674159814, 2.000138232584022, 0, 1, 0.3332872558053268, 0, 0.4999654442423603, 2.205842434206543, 0.6667127441946732, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9997694521026294, 2.000230547897374, 1, 2, 0.3332564840342094, 1.000230601061961, 0.9998847393378647, -0.00152593839467181, 0.7408432005661838, 0.703601226159455, 0.2266551030523635],
[0.9003883271746372, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3104371641337194, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8806348670653892, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2935449556884629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9991304338518842, 2.000869566148119, 0, 1, 0.3330434779506277, 0, 0.4997827029400539, 2.205036181446974, 0.6669565220493723, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9991884469167592, 2.000811553083244, 0, 2, 0.3330628156389194, 0, 0.9995943880461937, 4.410200231914744, 0.4448052078834861, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7709191569822593, 1.328692515843103, 0, 0, 0.3671722571178433, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.5955124017038, 1.348445975952355, 0, 0, 0.5419616030624979, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9993096453508913, 2.000690354649112, 0, 1, 0.3331032151169634, 0, 0.4998274708908583, 2.205233697188739, 0.6668967848830366, 1, 0.2266551030523635],
[1.001377653020177, 1.906715445613339, 0, 2, 0.3443416765064072, 0, 1.048924213941454, 4.627842919994277, 0.4298878371664289, 1, 0.2266551030523635],
[0.7709191569822593, 1.328692515843103, 0, 0, 0.3671722571178433, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.001847633119429705, 1.458034633196875, 0, 1, 0.001265604194296986, 0, 0.6858547645109142, 3.02598421687626, 0.998734395805703, 1, 0.2266551030523635],
[1.900388327174637, 1.099611672825362, 0, 0, 0.6334627757248792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9998619449237224, 2.000138055076281, 0, 1, 0.3332873149745738, 0, 0.4999654886131659, 2.205842629970084, 0.6667126850254262, 1, 0.2266551030523635],
[0.9001807550658441, 2.099819244934159, 2, 0, 0.3000602516886143, 2.221776003035867, 0, -9.802453035979413, 0.9999999999999999, 0.09003615464343473, 0.2266551030523635],
[0.991085628798778, 2.008914371201224, 2, 0, 0.3303618762662591, 2.017989103952655, 0, -8.903347318354641, 0.9999999999999999, 0.1091389692901632, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9998617937296611, 2.000138206270342, 0, 1, 0.3332872645765533, 0, 0.4999654508198711, 2.205842463226453, 0.6667127354234467, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2919334478557216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031664118659786, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 2.205994893856353, 0.6666666666666667, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 2, 1, 0.3333333333333333, 1.999999999999998, 0.4999999999999994, -6.61798468156906, 0.962962962962963, 0.2592592592592592, 0.2266551030523635],
[0.9998847861148096, 2.000115213885194, 0, 1, 0.3332949287049362, 0, 0.4999711981878859, 2.205867820555441, 0.6667050712950638, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.001064877321333937, 1.458881637192087, 0, 1, 0.0007293947488814996, 0, 0.6854565678986146, 3.024227377489292, 0.9992706052511185, 1, 0.2266551030523635],
[0.999391071891185, 2.000608928108818, 0, 1, 0.3331303572970613, 0, 0.4998478143078682, 2.205323452136835, 0.6668696427029387, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031664118659786, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7708450770749281, 2.012729796915633, 1, 0, 0.2769262951313527, 1.297277533112918, 0, -5.723575227923335, 1, 0.2769262951313527, 0.2266551030523635],
[0.7709191569822593, 2.129839508400495, 0, 1, 0.2657646657001494, 0, 0.4695189454678668, 2.07151279254187, 0.7342353342998506, 1, 0.2266551030523635],
[0.8247961456808524, 2.175203854319146, 0, 1, 0.2749320485602843, 0, 0.459727026510353, 2.028310946099209, 0.7250679514397157, 1, 0.2266551030523635],
[0.7709191569822593, 2.129975207374301, 0, 0, 0.2657522336747532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031664118659786, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -4.411989787712707, 1, 0.3333333333333333, 0.2266551030523635],
[0.7709191569822593, 2.012655717008302, 0, 0, 0.2769529083573964, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9997227207317408, 2.000277279268262, 0, 1, 0.3332409069105799, 0, 0.4999306897920763, 2.205689097926812, 0.6667590930894201, 1, 0.2266551030523635],
[0.9008943643565601, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3105574527035163, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9003883271746372, 2.099611672825366, 0, 0, 0.3001294423915454, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9995939574752516, 2.000406042524752, 0, 2, 0.3331979858250835, 0, 0.9997970199468906, 4.411094241791283, 0.4446249261077255, 1, 0.2266551030523635],
[0, 1.458161686035484, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031664118659786, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8806348670653892, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2935449556884629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7521758500084842, 2.148851435790674, 1, 1, 0.2592791366322083, 1.329476345177422, 0.4653648843955786, -3.812450940415005, 0.9327743293072568, 0.4513326025716732, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9923872069659245, 2.007612793034077, 0, 1, 0.330795735655308, 0, 0.4981040185984837, 2.197629843275173, 0.669204264344692, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 1.900503525559812, 0, 1, 0.3447677243581339, 0, 0.5261763456636789, 2.321484663604145, 0.6552322756418661, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -4.411989787712707, 1, 0.3333333333333333, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2800967741188121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 2.205994893856353, 0.6666666666666667, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2800967741188121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7523693851998047, 2.031455831278836, 0, 2, 0.2702645915936862, 0, 0.9845156213615367, 4.343672867290735, 0.5325137662819297, 1, 0.2266551030523635],
[0.8807039779419774, 2.119296022058024, 0, 0.5, 0.2935679926473257, 0, 0.2359273998516054, 1.040909278786896, 0.8404950965667047, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 2.205994893856353, 0.6666666666666667, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 1.783574873990561, 0, 0, 0.3592502610021014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519327416229912, 1.347678931202375, 1, 0, 0.3581294347688325, 1.329906179961753, 0, -5.867532484607278, 1, 0.3581294347688324, 0.2266551030523635],
[0.8803726467316682, 2.119627353268333, 0, 1, 0.2934575489105559, 0, 0.4717810413505291, 2.081493136475003, 0.706542451089444, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8246809037370597, 2.119235898596291, 1, 0, 0.2801305060942677, 1.212590221828198, 0, -5.3499356753863, 1, 0.2801305060942677, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0.4999999999999994, -2.205994893856353, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.2266551030523635],
[0.7709191569822593, 2.129975207374301, 0, 0, 0.2657522336747532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7530715719133254, 2.030503302077236, 0, 1, 0.2705411587631248, 0, 0.4924887336932596, 2.172855263618227, 0.7294588412368752, 1, 0.2266551030523635],
[0.8807729159934066, 2.119227084006595, 0, 1, 0.2935909719978021, 0, 0.4718701490495335, 2.081886278733017, 0.706409028002198, 1, 0.2266551030523635],
[0.7709812466540706, 2.130027762154794, 0, 1, 0.2657631342450159, 0, 0.4694774489645022, 2.0713297103928, 0.734236865754984, 1, 0.2266551030523635],
[0.7711840743721999, 2.012641081478445, 0, 1, 0.2770231717862868, 0, 0.4968595787905811, 2.192139387551283, 0.7229768282137132, 1, 0.2266551030523635],
[0.8246946878198604, 2.175305312180138, 0, 0.5, 0.274898229273287, 0, 0.2298527922496034, 1.014108172082502, 0.8515290780277048, 1, 0.2266551030523635],
[0.9998619658532001, 2.000138034146803, 0, 2, 0.3332873219510663, 0, 0.999930987689626, 4.411685306104115, 0.444505795071181, 1, 0.2266551030523635],
[0.7709812380834492, 1.32967185158203, 0, 1, 0.3670197815509961, 0, 0.7520652549049681, 3.318104224334276, 0.6329802184490039, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9003883271746372, 2.099611672825366, 0, 0, 0.3001294423915454, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7709191569822593, 2.129839508466044, 0, 1, 0.2657646656941439, 0, 0.4695189454534164, 2.071512792478115, 0.7342353343058561, 1, 0.2266551030523635],
[0.9987823616259613, 2.001217638374042, 0, 2, 0.3329274538753201, 0, 0.9993915512482533, 4.409305318033659, 0.4449857817932632, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 2.205994893856353, 0.6666666666666667, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.59461973004285, 1.349403539979316, 0, 1, 0.5416464422276268, 0, 0.7410681611338653, 3.269585158921652, 0.4583535577723732, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.5955124017038, 1.348445975952355, 0, 0, 0.5419616030624979, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2800967741188121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 2.205994893856353, 0.6666666666666667, 1, 0.2266551030523635],
[0.9003883271746372, 2.099611672825366, 0, 0, 0.3001294423915454, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9923783913422773, 2.007621608657725, 0, 0, 0.3307927971140922, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8806348670653892, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2935449556884629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8806348670653892, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2935449556884629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 1.783574873990561, 0, 0, 0.3592502610021014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 2, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0.9999999999999989, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.2266551030523635],
[1.5955124017038, 1.348445975952355, 0, 0, 0.5419616030624979, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.576525986344531, 1.24820532346745, 1, 0, 0.5581153792816731, 0.6343060683184082, 0, -2.798551895705018, 1, 0.5581153792816731, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031664118659786, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9991304338624954, 2.000869566137508, 0, 1, 0.3330434779541648, 0, 0.4997827029427044, 2.205036181458668, 0.6669565220458352, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9988429899699173, 2.001157010030086, 0, 1, 0.3329476633233054, 0, 0.4997109147297571, 2.204719452596266, 0.6670523366766946, 1, 0.2266551030523635],
[0.900216577315838, 2.098626709593374, 0, 2, 0.3001879362104498, 0, 0.953004167371679, 4.204644654091504, 0.4897369246253895, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 1.900388327174637, 0, 0, 0.3447814179331404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7710914374403881, 2.129917529887758, 0, 1, 0.265801121652709, 0, 0.4695017464139553, 2.071436910491654, 0.734198878347291, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 1.783574873990561, 0, 0, 0.3592502610021014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.5955124017038, 1.348445975952355, 0, 0, 0.5419616030624979, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9000791994080083, 2.000000000000002, 2, 0, 0.3103636616516336, 2.222026685335492, 0, -9.803559043725317, 1, 0.09632560247380972, 0.2266551030523635],
[0.9008943643565601, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3105574527035163, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7708971775670485, 2.129997186789512, 1, 0, 0.2657446569027477, 1.297189857609805, 0, -5.723188404498965, 1, 0.2657446569027477, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2800967741188121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9008943643565601, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3105574527035163, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031664118659786, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031664118659786, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.999585564506296, 2.000414435493707, 1, 1, 0.3331951881687649, 1.000414607321694, 0.4998964125917225, -2.208281163713038, 0.8889809665811812, 0.5553713429187113, 0.2266551030523635],
[0.9997695829615184, 2.000123998058492, 0, 3, 0.3332683496797847, 0, 1.499907007221593, 6.617574398380405, 0.2963829496137192, 1, 0.2266551030523635],
[1.900388327174637, 1.099611672825362, 0, 0, 0.6334627757248792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9998847990242069, 2.000115200975797, 1, 1, 0.3332949330080686, 1.000115214248587, 0.4999712014148634, -2.206630277008044, 0.888914487631147, 0.5555043536472842, 0.2266551030523635],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.900388327174637, 1.099611672825362, 0, 0, 0.6334627757248792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 2, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0.9999999999999989, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 1.999884801571232, 0, 1, 0.3333461336502777, 0, 0.5000288012661221, 2.20612196474836, 0.6666538663497223, 1, 0.2266551030523635],
[0.751932734177154, 2.14896163017941, 1, 0, 0.259207209823353, 1.329906193130836, 0, -5.867532542709139, 1, 0.259207209823353, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031664118659786, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8868485564688207, 2.11315144353118, 0, 1, 0.2956161854896068, 0, 0.4732268494343929, 2.087872026976003, 0.7043838145103932, 1, 0.2266551030523635],
[0.9922577986300432, 2.007742201369959, 1, 1, 0.3307525995433475, 1.007802610753623, 0.4980719134745795, -2.248926630878819, 0.8906027178953179, 0.5521079169820131, 0.2266551030523635],
[0.9003883271746372, 2.099496362583159, 0, 1, 0.3001409788345339, 0, 0.4763047070820495, 2.101451503485497, 0.6998590211654661, 1, 0.2266551030523635],
[1.576504000052315, 1.248089244669228, 0, 0, 0.5581348758793523, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7709191569822593, 2.012655717008302, 0, 0, 0.2769529083573964, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9995362819318018, 1.784587533267618, 0, 1, 0.3590128702161213, 0, 0.5603535726650396, 2.472274240106488, 0.6409871297838787, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519327341745727, 2.031642139815988, 1, 0, 0.2701320310082388, 1.329906193135402, 0, -5.867532542729282, 1, 0.2701320310082389, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 2.205994893856353, 0.6666666666666667, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999989, 4.411989787712707, 0.4444444444444445, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031664118659786, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -4.411989787712707, 1, 0.3333333333333333, 0.2266551030523635],
[1.576504000052315, 1.248089244669228, 0, 0, 0.5581348758793523, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9991299034505051, 2.000870096549498, 0, 2, 0.333043301150168, 0, 0.9995651409099479, 4.410071193848307, 0.4448312381406655, 1, 0.2266551030523635],
[0.7709152644410792, 2.012909895123651, 1, 1, 0.2769266100611063, 1.297159423513308, 0.4967932257785294, -3.531207490836297, 0.923311652640064, 0.4771648727622766, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.032071176330626, 0, 1, 0.2700846391205047, 0, 0.4921087468037074, 2.171178765342058, 0.7299153608794953, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9999911846583328, 2.00000881534167, 1, 1, 0.3333303948861106, 1.000008815419378, 0.4999977961742961, -2.206043510653126, 0.8888908478450697, 0.5555516376172908, 0.2266551030523635],
[1.5955124017038, 1.348445975952355, 0, 0, 0.5419616030624979, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 2.205994893856353, 0.6666666666666667, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8246808998656836, 2.175319100134315, 1, 1, 0.2748936332885614, 1.212590227520573, 0.4597026707200131, -3.321732211900044, 0.924433490377414, 0.4742207569545367, 0.2266551030523635],
[1.576504000052315, 1.248089244669228, 0, 0, 0.5581348758793523, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519327326839567, 1.347678940141409, 1, 0, 0.3581294305113621, 1.329906195771781, 0, -5.867532554360958, 1, 0.358129430511362, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 1.994536648152082, 0, 1, 0.3339414799338313, 0, 0.5013695792085295, 2.212037463337852, 0.6660585200661687, 1, 0.2266551030523635],
[1.57600792792331, 1.248991305802466, 1, 1, 0.5578790638625335, 0.6345145746301478, 0.8006460856486979, 0.7329705300311247, 0.6887709501038632, 0.8045290778289302, 0.2266551030523635],
[0.7521976387605407, 2.03137723523002, 0, 1, 0.2702271980498885, 0, 0.4922768566355261, 2.171920464203255, 0.7297728019501115, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 1.347700917494591, 0, 0, 0.3581189631694884, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 2.205994893856353, 0.6666666666666667, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031664118659786, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9993907458272117, 2.000609254172792, 0, 1, 0.3331302486090702, 0, 0.499847732841503, 2.205323092708063, 0.6668697513909299, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.03220765400222, 0, 1, 0.270071399553338, 0, 0.4920756980865634, 2.171032954739522, 0.7299286004466621, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 2.205994893856353, 0.6666666666666667, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0.4999999999999994, -2.205994893856353, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.2266551030523635],
[1.591940771732749, 1.352277243962202, 0, 1, 0.5407007100854888, 0, 0.73949332835771, 3.262637012795899, 0.4592992899145112, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 2.205994893856353, 0.6666666666666667, 1, 0.2266551030523635],
[0.9991302750229624, 2.000869724977041, 0, 1, 0.3330434250076538, 0, 0.4997826632673322, 2.205036006411331, 0.6669565749923463, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 1.999884635918764, 0, 1, 0.3333461520575222, 0, 0.5000288426840139, 2.206122147483676, 0.6666538479424778, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2800967741188121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8806348670653892, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2935449556884629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9003883271746372, 2.099611672825366, 0, 0, 0.3001294423915454, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.999735113820078, 2.000014633805642, 0, 1, 0.333272838713083, 0, 0.4999963415753579, 2.205978752924196, 0.666727161286917, 1, 0.2266551030523635],
[1.005230077670636, 1.994769922329368, 1, 0, 0.3350766925568782, 0.9947971337240969, 0, -4.389034794836593, 1, 0.3350766925568782, 0.2266551030523635],
[0.01296043860782447, 2.987039561392174, 0, 2, 0.004320146202608161, 0, 0.669559260563612, 2.954088619875131, 0.9913783712579957, 1, 0.2266551030523635],
[1.586222573409781, 1.357923246907611, 1, 1, 0.5387717423720471, 0.6304285519341569, 0.7364186468397924, 0.4676272163223649, 0.7097250096213886, 0.7872684943654826, 0.2266551030523635],
[1.000463537141087, 1.999536462858917, 2, 1, 0.3334878457136952, 1.999073355252084, 0.5001159111498323, -6.613384935595082, 0.962911434958411, 0.2594652996331065, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031664118659786, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.992249139122653, 2.007750860877349, 1, 0, 0.3307497130408841, 1.007811405998498, 0, -4.446453631205761, 1, 0.3307497130408841, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.900300652169828, 2.099699347830175, 1, 0, 0.3001002173899424, 1.110740059545536, 0, -4.900573799518315, 1, 0.3001002173899423, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 2.205994893856353, 0.6666666666666667, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031664118659786, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7711053824249379, 2.130132834834336, 0, 1, 0.2657849251528823, 0, 0.4694542911347459, 2.071227538284409, 0.7342150748471177, 1, 0.2266551030523635],
[0.9003006720304935, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3104163236290238, 1.11074003504257, 0, -4.900573691411481, 1, 0.3104163236290238, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2800967741188121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -4.411989787712707, 1, 0.3333333333333333, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999989, 4.411989787712707, 0.4444444444444445, 1, 0.2266551030523635],
[0.8256121283813704, 2.174387871618628, 0, 1, 0.2752040427937903, 0, 0.4598995483062521, 2.029072110500873, 0.7247959572062097, 1, 0.2266551030523635],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9001250655365497, 2.099874934463454, 1, 0, 0.3000416885121829, 1.110956730667106, 0, -4.901529750293974, 1, 0.3000416885121829, 0.2266551030523635],
[0.8246809203353984, 2.1753190796646, 1, 0, 0.2748936401117996, 1.212590197422415, 0, -5.349935567708237, 1, 0.2748936401117996, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9003883271746372, 2.099611672825366, 0, 0, 0.3001294423915454, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9973908738266598, 2.002609126173344, 1, 1, 0.3324636246088862, 1.002615951520922, 0.4993485682904258, -2.220410555301847, 0.8894679383119216, 0.554395187529694, 0.2266551030523635],
[1.001047099882287, 1.998952900117716, 1, 0, 0.3336823666274287, 0.9989539953890179, 0, -4.407374826051158, 1, 0.3336823666274287, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -4.411989787712707, 1, 0.3333333333333333, 0.2266551030523635],
[0.9997971771679878, 2.000202822832016, 0, 1, 0.3332657257226622, 0, 0.4999492994336123, 2.205771203475222, 0.6667342742773378, 1, 0.2266551030523635]
],
"RESOLVED": [
[1.012187215819916, 2.024374431639833, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.223926067737146],
[0.9113615540396469, 2.024374431639833, 0, 0, 0.3104371641337194, 0, 0, 0, 1, 1, 0.223926067737146],
[1.012187215819916, 2.024374431639833, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.223926067737146],
[1.012126311744398, 2.02437909160604, 0, 1, 0.3333194502560844, 0, 0.4939786249257546, 2.205989815824426, 0.6666805497439157, 1, 0.223926067737146],
[0.8346427405586053, 2.02448164823735, 0, 1, 0.2919225004093275, 0, 0.4939536008492186, 2.205878064312917, 0.7080774995906725, 1, 0.223926067737146],
[1.002689634182443, 2.005379268364885, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9973175805446164, 0, -4.411989787712707, 1, 0.3333333333333334, 0.2260471189942741],
[0.8268110988991531, 2.181257803648169, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.9025065980081133, 2.105562304539214, 1, 0, 0.3000285655836681, 1.108025140433389, 0, -4.901744137962033, 1, 0.3000285655836681, 0.2260471189942741],
[0.9026341913813299, 2.105434711165997, 2, 0, 0.3000709826217581, 2.215737027354721, 0, -9.802102487361699, 1, 0.09004259461158748, 0.2260471189942741],
[0.9032678802379195, 2.104801022309408, 2, 1, 0.3002816456341821, 2.214182573915064, 0.4751042922350876, -7.693432632176248, 0.9729238842645923, 0.2163549686435029, 0.2260471189942741],
[0.8268110988991531, 2.125065449841227, 0, 0, 0.2800967741188122, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[1.002574066363934, 2.005494836183393, 1, 1, 0.3332949140609522, 0.9974325424422061, 0.498630054766471, -2.20663059053794, 0.8889145002611023, 0.555504328383007, 0.2260471189942741],
[1.002689634182443, 2.005379268364885, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4986587902723082, 2.205994893856353, 0.6666666666666666, 1, 0.2260471189942741],
[0.8268110988991531, 2.180647638638872, 0, 1, 0.2749201804763579, 0, 0.4585793606821253, 2.028689251703055, 0.7250798195236421, 1, 0.2260471189942741],
[1.002227190718878, 2.005414651397873, 1, 2, 0.33322690776689, 0.9977777586364625, 0.9972999841234337, -0.002113605849764777, 0.7408826301671865, 0.7035617802944381, 0.2260471189942741],
[0.9028100423968772, 2.005379268364885, 0, 0, 0.3104371641337193, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[1.002689634182443, 2.005379268364885, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4986587902723082, 2.205994893856353, 0.6666666666666666, 1, 0.2260471189942741],
[1.002486192326975, 2.005582710220352, 0, 1, 0.3332657012869746, 0, 0.4986082074322084, 2.205771122634119, 0.6667342987130254, 1, 0.2260471189942741],
[0.7729926474987776, 2.018205104686755, 0, 1, 0.2769394059928278, 0, 0.4954897783568977, 2.191975640129475, 0.7230605940071722, 1, 0.2260471189942741],
[0.9027221473584093, 2.013150958665102, 1, 0, 0.3095889685643716, 1.107760569435734, 0, -4.900573713853854, 1, 0.3095889685643716, 0.2260471189942741],
[0.8830034527060979, 2.125065449841227, 0, 0, 0.2935449556884629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.7539551586462927, 2.154741550352296, 1, 0, 0.2592072099898878, 1.326338826032406, 0, -5.867532538939381, 1, 0.2592072099898878, 0.2260471189942741],
[0.9028100423968772, 2.10525886015045, 0, 0, 0.3001294423915454, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[1.002078685300789, 2.005990217246539, 0, 1, 0.3331302299798375, 0, 0.4985069176322403, 2.205323031101616, 0.6668697700201625, 1, 0.2260471189942741],
[1.902830925578738, 1.104830773342901, 1, 1, 0.6326612219256493, 0.5255327662366293, 0.905115990727057, 1.679221686961835, 0.5997397782715445, 0.8650622221228429, 0.2260471189942741],
[1.002689634182443, 2.005379268364885, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.9992297913140359, 2.007733707926033, 0, 1, 0.3323052612931833, 0, 0.4980740204999542, 2.203407956341043, 0.6676947387068166, 1, 0.2260471189942741],
[1.002689634182443, 2.005379268364885, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[1.002689634182443, 2.005379268364885, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.7539551581589937, 2.154741550839595, 1, 0, 0.2592072098223561, 1.32633882688965, 0, -5.867532542731706, 1, 0.2592072098223561, 0.2260471189942741],
[1.002689634182443, 2.005379268364885, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[1.004695055449425, 1.903230595267878, 0, 1, 0.3455023188786119, 0, 0.5254224067679254, 2.324393290680403, 0.6544976811213881, 1, 0.2260471189942741],
[0.9028100423968772, 2.013021376361779, 0, 0, 0.309623538791974, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[1.002689634182443, 2.005379268364885, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[1.599803746397932, 1.352072802342452, 0, 0, 0.5419616030624979, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[1.002689634182443, 2.005379268364885, 1, 1, 0.3333333333333334, 0.9973175805446164, 0.4986587902723082, -2.205994893856353, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.2260471189942741],
[0.7542207562366322, 2.036976985191386, 0, 2, 0.2702140178183011, 0, 0.9818471266684873, 4.343550720915659, 0.532587579788907, 1, 0.2260471189942741],
[0.753933120200458, 1.351325739949992, 0, 0, 0.3581189631694884, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[1.905145962538876, 1.102857921071182, 2, 0, 0.6333588772672774, 1.04978833082937, 0, -4.644112853550509, 1, 0.401143467413266, 0.2260471189942741],
[0.9028100423968772, 2.10525886015045, 0, 0, 0.3001294423915454, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.8268110988991531, 2.181257803648169, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.8831331865857963, 2.124935715961529, 1, 0, 0.2935880843148014, 1.132332036876581, 0, -5.009274357994641, 1, 0.2935880843148013, 0.2260471189942741],
[0.9028100423968772, 2.10525886015045, 0, 1, 0.3001294423915454, 0, 0.4750009696805342, 2.101336092200167, 0.6998705576084546, 1, 0.2260471189942741],
[1.002274245139408, 2.00579465740792, 0, 1, 0.3331952417348719, 0, 0.4985555207791289, 2.205538044445316, 0.6668047582651281, 1, 0.2260471189942741],
[0.7729926474987776, 2.135704061499808, 0, 0, 0.2657522336747531, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.922204231000428, 2.085749764923834, 0, 1, 0.3065885423281082, 0, 0.4794438991757562, 2.120990974399018, 0.6934114576718917, 1, 0.2260471189942741],
[1.002689634182443, 2.005379268364885, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9973175805446164, 0, -4.411989787712707, 1, 0.3333333333333334, 0.2260471189942741],
[1.002689634182443, 2.005379268364885, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.9028100423968772, 2.005379268364885, 0, 0, 0.3104371641337193, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.9028100423968772, 2.013021376361779, 0, 0, 0.309623538791974, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.9028100423968772, 2.012994863782319, 0, 1, 0.3096263541101928, 0, 0.4967722561005689, 2.197649137537348, 0.6903736458898072, 1, 0.2260471189942741],
[1.002486230495461, 2.005517685543273, 0, 1, 0.3332729140245413, 0, 0.4986243737507159, 2.205842640106138, 0.6667270859754586, 1, 0.2260471189942741],
[0.753933120200458, 2.037128551920573, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.8268110988991531, 2.181257803648169, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.7729706089672677, 2.018091063153764, 1, 0, 0.2769450122468481, 1.293710250297947, 0, -5.723188404496837, 1, 0.2769450122468482, 0.2260471189942741],
[0.826898962004928, 2.181169940542394, 1, 0, 0.2748936240472036, 1.209337592558304, 0, -5.349935880354825, 1, 0.2748936240472035, 0.2260471189942741],
[0.7542207892077105, 2.037091836158902, 0, 1, 0.2702029082495375, 0, 0.4908958851288605, 2.171652916051078, 0.7297970917504625, 1, 0.2260471189942741],
[0.8830034527060979, 2.125065449841227, 0, 0, 0.2935449556884629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[1.002689634182443, 2.005379268364885, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0, 1.462083607549771, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.902546341136414, 2.005491547786252, 1, 1, 0.3103626484972581, 1.107976349159956, 0.4986308723683444, -2.695656903316014, 0.9036750264177673, 0.5244003234122837, 0.2260471189942741],
[1.002689634182443, 2.005379268364885, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9973175805446164, 0, -4.411989787712707, 1, 0.3333333333333334, 0.2260471189942741],
[0.753933120200458, 2.037128551920573, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[1.002689634182443, 2.005379268364885, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[1.002689634182443, 2.005379268364885, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4986587902723082, 2.205994893856353, 0.6666666666666666, 1, 0.2260471189942741],
[0.753933120200458, 2.037128551920573, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.7729926474987776, 2.135704061499808, 0, 0, 0.2657522336747531, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.9028100423968772, 2.10525886015045, 0, 0, 0.3001294423915454, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.8268110988991531, 2.005379268364885, 0, 0, 0.2919334478557216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.7539551586433895, 2.037106513477641, 1, 0, 0.2701320311816797, 1.326338826037513, 0, -5.867532538961974, 1, 0.2701320311816797, 0.2260471189942741],
[1.599781675927933, 1.351956279119322, 1, 0, 0.5419795728114768, 0.6250852944793001, 0, -2.76528759694183, 1, 0.5419795728114768, 0.2260471189942741],
[0.7729926474987776, 1.332266212651669, 0, 0, 0.3671722571178433, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[1.001817710198565, 2.006251192348762, 0, 1, 0.3330434716273268, 0, 0.4984420713685798, 2.205036160541403, 0.6669565283726732, 1, 0.2260471189942741],
[1.002689634182443, 2.005379268364885, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.8268110988991531, 2.181257803648169, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.753933120200458, 2.037128551920573, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.8830034527060979, 2.125065449841227, 0, 0, 0.2935449556884629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.753933120200458, 2.154763588798131, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[1.599803746397932, 1.352072802342452, 0, 0, 0.5419616030624979, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[1.002689634182443, 2.005379268364885, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4986587902723082, 2.205994893856353, 0.6666666666666666, 1, 0.2260471189942741],
[0.7729926474987776, 2.135704061499808, 0, 0, 0.2657522336747531, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.753933120200458, 2.154763588798131, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.8268110988991531, 2.181257803648169, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.9028100423968772, 2.10525886015045, 0, 0, 0.3001294423915454, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[1.001281001502649, 2.006787901044679, 0, 32, 0.3328650486213039, 0, 15.94588047064749, 70.54228579242101, 2.370490448219214e-06, 1, 0.2260471189942741],
[0.9028100423968772, 2.10525886015045, 0, 0, 0.3001294423915454, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2260471189942741],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9997351137855456, 2.00001463380755, 0, 1, 0.3332728387051958, 0, 0.4999963415748809, 2.205978752922091, 0.6667271612948042, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031664118659786, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2800967741188121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000754641003057, 1.997281244743577, 0, 4, 0.3338034230213452, 0, 2.002722456102342, 8.835991023946452, 0.196974309878126, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 1, 0.2748644149071801, 0, 0.4596841476076032, 2.028121764818168, 0.7251355850928198, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -4.411989787712707, 1, 0.3333333333333333, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 2.205994893856353, 0.6666666666666667, 1, 0.2266551030523635],
[1.576504000052315, 1.248089244669228, 0, 0, 0.5581348758793523, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8246809037370597, 2.175319096262939, 1, 1, 0.2748936345790201, 1.212590221828198, 0.4597026715381375, -3.321732183175786, 0.9244334896679363, 0.4742207588259763, 0.2266551030523635],
[0.9998848015562857, 1.999884400574643, 2, 1, 0.3333205770783976, 2.000230423431849, 0.5000289015268391, -6.618873794155973, 0.9629672148852216, 0.2592422510820711, 0.2266551030523635],
[0.249256587087603, 2.750513787519399, 0, 1, 0.08309188903175896, 0, 0.3635684374815907, 1.604060233303446, 0.9169081109682411, 1, 0.2266551030523635],
[0.9923783913422773, 2.007621608657725, 0, 0, 0.3307927971140922, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7709191569822593, 2.129975207374301, 0, 0, 0.2657522336747532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.88077288538275, 2.119227114617251, 0, 1, 0.2935909617942499, 0, 0.4718701422337208, 2.08188624866172, 0.7064090382057502, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 1.347700917494591, 0, 0, 0.3581189631694884, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -4.411989787712707, 1, 0.3333333333333333, 0.2266551030523635],
[0.9194476214235076, 2.08032296015105, 0, 3, 0.3065059798475976, 0, 1.442083780963593, 6.362458914637508, 0.3335248225653207, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031664118659786, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7709191569822593, 2.129975207374301, 0, 0, 0.2657522336747532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.771184084353838, 2.129824893670167, 0, 1, 0.265833056772931, 0, 0.4695221672786325, 2.071527007138066, 0.734166943227069, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 1, 0.2748644149071801, 0, 0.4596841476076032, 2.028121764818168, 0.7251355850928198, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0.4999999999999994, -2.205994893856353, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9008943643565601, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3105574527035163, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8806348670653892, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2935449556884629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.091990064167641, 1.007621608657724, 0, 0, 0.5200914427657914, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.99939150297653, 2.000608497023474, 0, 1, 0.3331305009921763, 0, 0.4998479220136326, 2.205323927333567, 0.6668694990078237, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2919334478557216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9997970902165744, 2.000202909783429, 0, 1, 0.3332656967388578, 0, 0.4999492777001682, 2.205771107587489, 0.6667343032611422, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -4.411989787712707, 1, 0.3333333333333333, 0.2266551030523635],
[1.000666878343175, 1.899633771904672, 0, 1, 0.3450217749865562, 0, 0.5264172572576175, 2.322547563096343, 0.6549782250134438, 1, 0.2266551030523635],
[1.003123580939633, 1.996761210399751, 0, 2, 0.3343873684201585, 0, 1.001622021493297, 4.419146129976587, 0.4430401753186418, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031664118659786, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9003883271746372, 2.007621608657725, 0, 0, 0.309623538791974, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9003883271746372, 2.099611672825366, 0, 0, 0.3001294423915454, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 1.347700917494591, 0, 0, 0.3581189631694884, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9003281654669034, 2.007871425395302, 1, 1, 0.3095826601089575, 1.110706116231971, 0.4980398582061218, -2.703077273686209, 0.9041585765598616, 0.5233238967777767, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -4.411989787712707, 1, 0.3333333333333333, 0.2266551030523635],
[1.000666712584104, 1.899633959456693, 0, 1, 0.3450217152416769, 0, 0.5264172052841202, 2.322547333789804, 0.6549782847583232, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7710914758898176, 2.129917517015337, 0, 1, 0.2658011325630618, 0, 0.4695017492514472, 2.071436923010639, 0.7341988674369382, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2800967741188121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8246809037370597, 2.175319096262939, 1, 0, 0.2748936345790201, 1.212590221828198, 0, -5.3499356753863, 1, 0.2748936345790201, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.17520390179371, 0, 1, 0.2748830018987912, 0, 0.4597270164766544, 2.028310901830633, 0.7251169981012088, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2800967741188121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9997971771653548, 2.000202822834649, 0, 1, 0.3332657257217845, 0, 0.4999492994329542, 2.205771203472318, 0.6667342742782154, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031664118659786, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -4.411989787712707, 1, 0.3333333333333333, 0.2266551030523635],
[1.00066694094014, 1.899633701077857, 0, 1, 0.3450217975485075, 0, 0.5264172768848002, 2.322547649691273, 0.6549782024514925, 1, 0.2266551030523635],
[0, 1.458161686035484, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7709191569822593, 1.328692515843103, 0, 0, 0.3671722571178433, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0.4999999999999994, -2.205994893856353, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.2266551030523635],
[0.999884819007207, 1.999864767016939, 2, 1, 0.3333227625618077, 2.000230388521965, 0.5000338105319149, -6.618851981653656, 0.9629664864417317, 0.2592451650089684, 0.2266551030523635],
[0.8246809037253863, 2.175319096274612, 1, 0, 0.2748936345751289, 1.212590221845362, 0, -5.34993567546203, 1, 0.2748936345751289, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 2.205994893856353, 0.6666666666666667, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9002129714430944, 2.007880132915639, 2, 0, 0.3095543846563336, 2.221696491213498, 0, -9.802102230631119, 1, 0.09582391705996129, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031664118659786, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2800967741188121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.999585668094196, 2.000414331905807, 0, 1, 0.333195222698065, 0, 0.4998964384779696, 2.205537981478757, 0.666804777301935, 1, 0.2266551030523635],
[0.7709191569822593, 2.012655717008302, 0, 0, 0.2769529083573964, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 1, 0.2748644149071801, 0, 0.4596841476076032, 2.028121764818168, 0.7251355850928198, 1, 0.2266551030523635],
[1.5955124017038, 1.348445975952355, 0, 0, 0.5419616030624979, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9998619571828854, 2.000138042817118, 0, 1, 0.3332873190609614, 0, 0.4999654916775336, 2.205842643490043, 0.6667126809390386, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7520824666459976, 2.031878367212971, 0, 2, 0.2701483646964615, 0, 0.9843108880298298, 4.342769585922039, 0.5326834095552494, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 2.205994893856353, 0.6666666666666667, 1, 0.2266551030523635],
[0.9998618934006759, 2.000138106599327, 0, 1, 0.3332872978002249, 0, 0.4999654757341827, 2.205842573148141, 0.6667127021997751, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0.4999999999999994, -2.205994893856353, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.119495111323094, 0, 1, 0.2800844081423481, 0, 0.4718104772488721, 2.081623007357885, 0.7199155918576519, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -4.411989787712707, 1, 0.3333333333333333, 0.2266551030523635],
[0.9003006720304935, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3104163236290238, 1.11074003504257, 0, -4.900573691411481, 1, 0.3104163236290238, 0.2266551030523635],
[1.576504000052315, 1.248089244669228, 0, 0, 0.5581348758793523, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0.4999999999999994, -2.205994893856353, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.2266551030523635],
[0.7558964244802143, 1.346839950181839, 0, 1, 0.3594822601581237, 0, 0.7424787183250603, 3.275808522844189, 0.6405177398418762, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8807728662356563, 2.119227133764345, 0, 1, 0.2935909554118853, 0, 0.4718701379704015, 2.081886229852, 0.7064090445881147, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2919334478557216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2800967741188121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.001041276901473, 1.998958723098531, 0, 1, 0.3336804256338239, 0, 0.5002604548281656, 2.207144017898383, 0.6663195743661761, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 2.205994893856353, 0.6666666666666667, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2800967741188121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9003883271746372, 2.099265984322839, 0, 1, 0.3001640301429097, 0, 0.4763569778522232, 2.101682121589699, 0.6998359698570904, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000667020988447, 1.899633610505307, 0, 1, 0.3450218264004822, 0, 0.5264173019838271, 2.322547760427923, 0.6549781735995178, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031664118659786, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9686768798243525, 2.031323120175652, 2, 4, 0.3228922932747837, 2.064671968182677, 1.96915988415182, -0.4213983393472984, 0.7008384507240681, 0.6278902669419932, 0.2266551030523635],
[0.9997131344051374, 1.783861739585425, 0, 1, 0.3591472044622741, 0, 0.5605815617932379, 2.473280125811808, 0.6408527955377259, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 2, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0.9999999999999989, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.2266551030523635],
[0.7709191569822593, 2.012655717008302, 0, 0, 0.2769529083573964, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8248837030855399, 2.175116296914458, 1, 1, 0.2749612343618468, 1.212292104037726, 0.4597455324198361, -3.320227788756343, 0.9243963195982094, 0.4743187883219032, 0.2266551030523635],
[0.9997971464121417, 2.000202853587862, 0, 1, 0.3332657154707135, 0, 0.4999492917462102, 2.205771169558483, 0.6667342845292865, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 2.205994893856353, 0.6666666666666667, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031799781204152, 0, 1, 0.2701109707573006, 0, 0.4921744796169568, 2.171468777842831, 0.7298890292426994, 1, 0.2266551030523635],
[0.9003883271746372, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3104371641337194, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175203901716917, 0, 1, 0.274883001905828, 0, 0.4597270164928845, 2.02831090190224, 0.725116998094172, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 1, 0.2748644149071801, 0, 0.4596841476076032, 2.028121764818168, 0.7251355850928198, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031664118659786, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9989849482157932, 2.00101505178421, 0, 1, 0.3329949827385974, 0, 0.4997463657798814, 2.204875862267378, 0.6670050172614026, 1, 0.2266551030523635],
[0.9979246901063271, 2.001968863683495, 0, 4, 0.3326533665988348, 0, 1.998033072622446, 8.815301511922481, 0.19833798448228, 1, 0.2266551030523635],
[1.5955124017038, 1.348445975952355, 0, 0, 0.5419616030624979, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9999911850158721, 2.000008814984131, 0, 1, 0.3333303950052904, 0, 0.4999977962636802, 2.205985170994218, 0.6666696049947096, 1, 0.2266551030523635],
[0.8806348670653892, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2935449556884629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 2.205994893856353, 0.6666666666666667, 1, 0.2266551030523635],
[0.9991882901182946, 2.000552372443016, 0, 2, 0.3330915577432429, 0, 0.9997238900362597, 4.410771593372404, 0.4447668703533342, 1, 0.2266551030523635],
[0.7710914222513292, 2.129917534972877, 0, 1, 0.2658011173426842, 0, 0.4695017452930328, 2.071436905546156, 0.7341988826573158, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9998848015562855, 2.000008814202506, 1, 1, 0.3333067533807779, 1.000115211715925, 0.4999977964590848, -2.206512928770456, 0.8889066081507655, 0.555520114912321, 0.2266551030523635],
[0.9995857712322574, 2.000414228767746, 0, 1, 0.3331952570774188, 0, 0.4998964642518062, 2.205538095192662, 0.6668047429225812, 1, 0.2266551030523635],
[0.8799025103393512, 2.12009748966065, 1, 0, 0.2933008367797836, 1.136489540885991, 0, -5.014180248231299, 1, 0.2933008367797836, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8254637424490411, 2.174333186666845, 0, 1, 0.2751732073718488, 0, 0.4599111148797553, 2.029123142105048, 0.7248267926281512, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 1.783574873990561, 0, 0, 0.3592502610021014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9996543378005703, 2.000345662199433, 1, 1, 0.3332181126001897, 1.000345781723101, 0.4999135993828553, -2.207901677927947, 0.8889656894351672, 0.5554019146355468, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2800967741188121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9003883271746372, 2.099611672825366, 0, 0, 0.3001294423915454, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2919334478557216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9997971771679871, 2.000202822832016, 0, 1, 0.333265725722662, 0, 0.4999492994336122, 2.205771203475221, 0.666734274277338, 1, 0.2266551030523635],
[0.9003883271746372, 2.007621608657725, 0, 0, 0.309623538791974, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8269124006606536, 2.172072331017175, 1, 3, 0.2757307804625017, 1.209317938878483, 1.381169474496786, 0.7582072201507002, 0.6941995890343926, 0.7248306140713173, 0.2266551030523635],
[0.9002129137266361, 2.099787086273367, 1, 0, 0.3000709712422118, 1.11084831682793, 0, -4.90105142954268, 1, 0.3000709712422118, 0.2266551030523635],
[0.7709191569822593, 2.129975207374301, 0, 0, 0.2657522336747532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2800967741188121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2919334478557216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0, 1.458161686035484, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9998619670310093, 2.000138032968994, 1, 1, 0.3332873223436694, 1.000138052024722, 0.4999654941392247, -2.206756217484958, 0.8889195607649871, 0.5554942054523258, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999989, 4.411989787712707, 0.4444444444444445, 1, 0.2266551030523635],
[0.900618706792689, 2.099381293207314, 0, 3, 0.3002062355975627, 0, 1.42899244158586, 6.304700058995468, 0.3426969229823666, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9002165773361852, 2.099668783282933, 0, 1, 0.3000836595803774, 0, 0.4762655938697398, 2.101278936392222, 0.6999163404196226, 1, 0.2266551030523635],
[0.2480892446692261, 2.751910755330774, 0, 0, 0.082696414889742, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2800967741188121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9005035260649218, 2.099496473935081, 0, 1, 0.3001678420216403, 0, 0.4763046818200663, 2.101451392029885, 0.6998321579783597, 1, 0.2266551030523635],
[0.8248562784338695, 2.175143721566129, 1, 0, 0.27495209281129, 1.212332410075936, 0, -5.348798212568167, 1, 0.2749520928112901, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -4.411989787712707, 1, 0.3333333333333333, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 1.783574873990561, 0, 0, 0.3592502610021014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7527746885643412, 2.03080018542622, 0, 1, 0.270434503342515, 0, 0.4924167366028294, 2.172537613190503, 0.7295654966574849, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 2, 1, 0.3333333333333333, 1.999999999999998, 0.4999999999999994, -6.61798468156906, 0.962962962962963, 0.2592592592592592, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031849548647073, 0, 1, 0.2701061417738926, 0, 0.4921624244599506, 2.171415590613231, 0.7298938582261074, 1, 0.2266551030523635],
[0.9997971771679878, 2.000202822832016, 0, 1, 0.3332657257226622, 0, 0.4999492994336123, 2.205771203475222, 0.6667342742773378, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.828367573580237, 2.171632426419762, 7, 1, 0.2761225245267458, 8.450354918826344, 0.4604830853666333, -35.25123293435768, 0.9999662079387936, 0.0007425009794325144, 0.2266551030523635],
[0.8769870820688714, 2.045339387939804, 1, 0, 0.3000989420823567, 1.140267650968054, 0, -5.11377829090383, 1, 0.3000989420823568, 0.222979485246029],
[0.9003006720304935, 2.09969932796951, 1, 0, 0.3001002240101642, 1.11074003504257, 0, -4.900573691411481, 1, 0.3001002240101642, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9997971464384602, 2.000202853561543, 0, 1, 0.3332657154794864, 0, 0.4999492917527884, 2.205771169587505, 0.6667342845205136, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031664118659786, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.2480892446692261, 2.751910755330774, 0, 0, 0.082696414889742, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9998848015712313, 2.000115198428772, 0, 1, 0.3332949338570767, 0, 0.4999712020515462, 2.205867837601871, 0.6667050661429232, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 1.347700917494591, 0, 0, 0.3581189631694884, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7709191569822593, 2.012655717008302, 0, 0, 0.2769529083573964, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9003883271746372, 2.099611672825366, 0, 0, 0.3001294423915454, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9919994270931829, 2.008000572906819, 1, 1, 0.3306664756977274, 1.008065098313878, 0.498007826039801, -2.250367476421829, 0.8906596818496444, 0.551992633245099, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8806348670653892, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2935449556884629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9003006720304935, 2.09969932796951, 1, 0, 0.3001002240101642, 1.11074003504257, 0, -4.900573691411481, 1, 0.3001002240101642, 0.2266551030523635],
[0.8246808998656836, 2.175319100134315, 1, 0, 0.2748936332885614, 1.212590227520573, 0, -5.349935700501001, 1, 0.2748936332885614, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9997971464121417, 2.000202853587862, 0, 2, 0.3332657154707135, 0, 0.9998985834924204, 4.411542339116965, 0.4445346061667796, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031664118659786, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7709191569822593, 2.012655717008302, 0, 0, 0.2769529083573964, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.991990599319952, 2.00800940068005, 1, 0, 0.3306635331066504, 1.008074069134868, 0, -4.447612498281034, 1, 0.3306635331066503, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8806348670653892, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2935449556884629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8807728853989589, 2.119227114601042, 0, 1, 0.2935909617996528, 0, 0.4718701422373299, 2.081886248677644, 0.7064090382003472, 1, 0.2266551030523635],
[1.5955124017038, 1.348445975952355, 0, 0, 0.5419616030624979, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 2.205994893856353, 0.6666666666666667, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9997971464121417, 2.000202853587862, 0, 1, 0.3332657154707135, 0, 0.4999492917462102, 2.205771169558483, 0.6667342845292865, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -4.411989787712707, 1, 0.3333333333333333, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 3, 0.3333333333333333, 0, 1.499999999999998, 6.617984681569061, 0.2962962962962963, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -4.411989787712707, 1, 0.3333333333333333, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.032343064494088, 0, 1, 0.2700582647950079, 0, 0.4920429121787716, 2.170888303649163, 0.7299417352049921, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9988431647278549, 2.001156835272148, 1, 1, 0.3329477215759513, 1.00115817508994, 0.49971095836874, -2.212379999250898, 0.8891458146973829, 0.5550412578492854, 0.2266551030523635],
[0.7523698146470081, 2.148639119160067, 0, 2, 0.2593476379473441, 0, 0.9308217383577322, 4.106776003815308, 0.5485659214141786, 1, 0.2266551030523635],
[0.9997970832807025, 2.000202916719301, 0, 1, 0.3332656944269005, 0, 0.499949275966552, 2.205771099938792, 0.6667343055730995, 1, 0.2266551030523635],
[1.5955124017038, 1.348445975952355, 0, 0, 0.5419616030624979, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2919334478557216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 2.205994893856353, 0.6666666666666667, 1, 0.2266551030523635],
[0.9003883271746372, 2.099611672825366, 0, 0, 0.3001294423915454, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 1.347700917494591, 0, 0, 0.3581189631694884, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8806348670653892, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2935449556884629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031664118659786, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9998848015562855, 2.000115198443718, 0, 1, 0.3332949338520947, 0, 0.4999712020478101, 2.205867837585387, 0.6667050661479053, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.119227111030797, 0, 1, 0.2801099065404087, 0, 0.4718701430322857, 2.081886252184981, 0.7198900934595913, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9998619780961607, 2.000138021903842, 0, 1, 0.3332873260320532, 0, 0.4999654969051308, 2.205842666554148, 0.6667126739679468, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9998853745101582, 1.784075436966416, 1, 1, 0.3591592849972025, 1.000114638630351, 0.5605144150744922, -1.939511697004674, 0.8710046080002982, 0.5893231779947032, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 2.205994893856353, 0.6666666666666667, 1, 0.2266551030523635],
[0.752083020599835, 2.148811343756729, 0, 1, 0.2592590167503916, 0, 0.4653735670678831, 2.053223425374937, 0.7407409832496084, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9977672108296985, 2.002232789170305, 0, 3, 0.3325890702765658, 0, 1.498327275542798, 6.610604638346234, 0.2972897553059161, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -4.411989787712707, 1, 0.3333333333333333, 0.2266551030523635],
[0, 1.458161686035484, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8806348670653892, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2935449556884629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031664118659786, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7709191569822593, 1.328692515843103, 0, 0, 0.3671722571178433, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000666813038965, 1.899633845794666, 0, 1, 0.3450217514488265, 0, 0.5264172367815831, 2.322547472756289, 0.6549782485511735, 1, 0.2266551030523635],
[0.2480892446692261, 2.751910755330774, 0, 0, 0.082696414889742, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.89934686438156, 1.100653135618439, 1, 0, 0.6331156214605203, 0.5264967756827327, 0, -2.322898397575887, 1, 0.6331156214605203, 0.2266551030523635],
[0.824860972016524, 2.175139027983474, 0, 2, 0.2749536573388415, 0, 0.9194814557918893, 4.056742792945033, 0.5256921990063221, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2919334478557216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 2.205994893856353, 0.6666666666666667, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 1.900503528163994, 0, 1, 0.3447677240485883, 0, 0.526176344942681, 2.321484660423109, 0.6552322759514118, 1, 0.2266551030523635],
[0.7709812380907323, 2.012843959888368, 0, 1, 0.2769503051593976, 0, 0.4968094993590363, 2.191918437610733, 0.7230496948406024, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 2.205994893856353, 0.6666666666666667, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 2.205994893856353, 0.6666666666666667, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.00092111323791, 1.998798629410382, 0, 2, 0.3336715423802393, 0, 1.000601046334504, 4.414641598002484, 0.4439936134339292, 1, 0.2266551030523635],
[1.091990064167641, 1.007621608657724, 0, 0, 0.5200914427657914, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 1.900388327174637, 0, 0, 0.3447814179331404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8810495266359002, 2.118950473364101, 0, 1, 0.2936831755453, 0, 0.4719317476129464, 2.082158050965732, 0.7063168244547, 1, 0.2266551030523635],
[0.90030065883458, 2.099699341165423, 1, 0, 0.3001002196115263, 1.110740051322942, 0, -4.900573763240314, 1, 0.3001002196115263, 0.2266551030523635],
[0.9997039783786964, 2.000296021621307, 2, 1, 0.3332346594595651, 2.000592218552103, 0.4999260055466523, -6.620924006545558, 0.9629958445186464, 0.2591277038326898, 0.2266551030523635],
[0.9998848190071795, 2.000115180992824, 0, 1, 0.3332949396690594, 0, 0.4999712064100312, 2.205867856831462, 0.6667050603309406, 1, 0.2266551030523635],
[0.999861893343947, 2.000138106656057, 1, 1, 0.3332872977813153, 1.000138125732136, 0.4999654757200023, -2.206756623946738, 0.8889195771376288, 0.5554941727002595, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031664118659786, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9998619392778075, 2.000138060722196, 0, 1, 0.3332873130926021, 0, 0.4999654872018819, 2.205842623743513, 0.6667126869073978, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 2.205994893856353, 0.6666666666666667, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 1.347700917494591, 0, 0, 0.3581189631694884, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9995942983387803, 2.00034088115744, 0, 2, 0.3332052989580402, 0, 0.9998295884663202, 4.411237933766408, 0.4446151733376364, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.576504000052315, 1.248089244669228, 0, 0, 0.5581348758793523, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7709191569822593, 1.328692515843103, 0, 0, 0.3671722571178433, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.770981238667472, 2.130027755394669, 0, 1, 0.2657631328429302, 0, 0.4694774504544951, 2.071329716966633, 0.7342368671570698, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.2480892446692261, 2.751910755330774, 0, 0, 0.082696414889742, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9991301375827243, 2.000869862417279, 0, 1, 0.333043379194241, 0, 0.4997826289371393, 2.20503585494687, 0.6669566208057589, 1, 0.2266551030523635],
[0.2478021472907828, 2.752197852709218, 0, 1, 0.08260071576359423, 0, 0.3633459705724342, 1.603078711572143, 0.9173992842364058, 1, 0.2266551030523635],
[1.900388327174637, 1.099611672825362, 0, 0, 0.6334627757248792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245091076398294, 2.175240359134575, 0, 1, 0.2748593230108694, 0, 0.4597193113858242, 2.028276907048577, 0.7251406769891307, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 1.783825156598614, 1, 0, 0.3592179622451001, 0.9999999999999989, 0, -4.411989787712707, 1, 0.3592179622451001, 0.2266551030523635],
[0.8806348670653892, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2935449556884629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 1.900388327174637, 0, 0, 0.3447814179331404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7709191569822593, 1.328692515843103, 0, 0, 0.3671722571178433, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2919334478557216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 1.900388327174637, 0, 0, 0.3447814179331404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.900035745683488, 1.099899443561966, 1, 0, 0.6333589313845763, 0.5263058878085877, 0, -2.322056202224561, 1, 0.6333589313845763, 0.2266551030523635],
[0.9008367181250803, 1.999921956946996, 0, 2, 0.3105521068906902, 0, 1.000039023049241, 4.412161957007448, 0.4753383973128662, 1, 0.2266551030523635],
[0.9996541851783455, 2.000345814821658, 0, 1, 0.3332180617261148, 0, 0.4999135612404876, 2.205613526932125, 0.6667819382738852, 1, 0.2266551030523635],
[0.8806348670653892, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2935449556884629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.001156661807711607, 2.998843338192287, 0, 1, 0.0003855539359038692, 0, 0.3334619008816924, 1.471230501281295, 0.9996144460640961, 1, 0.2266551030523635],
[0.9003883271746372, 2.099611672825366, 0, 0, 0.3001294423915454, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.594620732784508, 1.349402464343803, 0, 1, 0.5416467962412624, 0, 0.7410687518540195, 3.26958776517294, 0.4583532037587376, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999989, 4.411989787712707, 0.4444444444444445, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -4.411989787712707, 1, 0.3333333333333333, 0.2266551030523635],
[0.9003883271746372, 2.099611672825366, 0, 0, 0.3001294423915454, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.900388327174637, 1.099611672825362, 0, 0, 0.6334627757248792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9998617674159814, 2.000138232584022, 0, 1, 0.3332872558053268, 0, 0.4999654442423603, 2.205842434206543, 0.6667127441946732, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9997694521026294, 2.000230547897374, 1, 2, 0.3332564840342094, 1.000230601061961, 0.9998847393378647, -0.00152593839467181, 0.7408432005661838, 0.703601226159455, 0.2266551030523635],
[0.9003883271746372, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3104371641337194, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8806348670653892, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2935449556884629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9991304338518842, 2.000869566148119, 0, 1, 0.3330434779506277, 0, 0.4997827029400539, 2.205036181446974, 0.6669565220493723, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9991884469167592, 2.000811553083244, 0, 2, 0.3330628156389194, 0, 0.9995943880461937, 4.410200231914744, 0.4448052078834861, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7709191569822593, 1.328692515843103, 0, 0, 0.3671722571178433, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.5955124017038, 1.348445975952355, 0, 0, 0.5419616030624979, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9993096453508913, 2.000690354649112, 0, 1, 0.3331032151169634, 0, 0.4998274708908583, 2.205233697188739, 0.6668967848830366, 1, 0.2266551030523635],
[1.001377653020177, 1.906715445613339, 0, 2, 0.3443416765064072, 0, 1.048924213941454, 4.627842919994277, 0.4298878371664289, 1, 0.2266551030523635],
[0.7709191569822593, 1.328692515843103, 0, 0, 0.3671722571178433, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.001847633119429705, 1.458034633196875, 0, 1, 0.001265604194296986, 0, 0.6858547645109142, 3.02598421687626, 0.998734395805703, 1, 0.2266551030523635],
[1.900388327174637, 1.099611672825362, 0, 0, 0.6334627757248792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9998619449237224, 2.000138055076281, 0, 1, 0.3332873149745738, 0, 0.4999654886131659, 2.205842629970084, 0.6667126850254262, 1, 0.2266551030523635],
[0.9001807550658441, 2.099819244934159, 2, 0, 0.3000602516886143, 2.221776003035867, 0, -9.802453035979413, 0.9999999999999999, 0.09003615464343473, 0.2266551030523635],
[0.991085628798778, 2.008914371201224, 2, 0, 0.3303618762662591, 2.017989103952655, 0, -8.903347318354641, 0.9999999999999999, 0.1091389692901632, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9998617937296611, 2.000138206270342, 0, 1, 0.3332872645765533, 0, 0.4999654508198711, 2.205842463226453, 0.6667127354234467, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2919334478557216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031664118659786, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 2.205994893856353, 0.6666666666666667, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 2, 1, 0.3333333333333333, 1.999999999999998, 0.4999999999999994, -6.61798468156906, 0.962962962962963, 0.2592592592592592, 0.2266551030523635],
[0.9998847861148096, 2.000115213885194, 0, 1, 0.3332949287049362, 0, 0.4999711981878859, 2.205867820555441, 0.6667050712950638, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.001064877321333937, 1.458881637192087, 0, 1, 0.0007293947488814996, 0, 0.6854565678986146, 3.024227377489292, 0.9992706052511185, 1, 0.2266551030523635],
[0.999391071891185, 2.000608928108818, 0, 1, 0.3331303572970613, 0, 0.4998478143078682, 2.205323452136835, 0.6668696427029387, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031664118659786, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7708450770749281, 2.012729796915633, 1, 0, 0.2769262951313527, 1.297277533112918, 0, -5.723575227923335, 1, 0.2769262951313527, 0.2266551030523635],
[0.7709191569822593, 2.129839508400495, 0, 1, 0.2657646657001494, 0, 0.4695189454678668, 2.07151279254187, 0.7342353342998506, 1, 0.2266551030523635],
[0.8247961456808524, 2.175203854319146, 0, 1, 0.2749320485602843, 0, 0.459727026510353, 2.028310946099209, 0.7250679514397157, 1, 0.2266551030523635],
[0.7709191569822593, 2.129975207374301, 0, 0, 0.2657522336747532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031664118659786, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -4.411989787712707, 1, 0.3333333333333333, 0.2266551030523635],
[0.7709191569822593, 2.012655717008302, 0, 0, 0.2769529083573964, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9997227207317408, 2.000277279268262, 0, 1, 0.3332409069105799, 0, 0.4999306897920763, 2.205689097926812, 0.6667590930894201, 1, 0.2266551030523635],
[0.9008943643565601, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3105574527035163, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9003883271746372, 2.099611672825366, 0, 0, 0.3001294423915454, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9995939574752516, 2.000406042524752, 0, 2, 0.3331979858250835, 0, 0.9997970199468906, 4.411094241791283, 0.4446249261077255, 1, 0.2266551030523635],
[0, 1.458161686035484, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031664118659786, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8806348670653892, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2935449556884629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7521758500084842, 2.148851435790674, 1, 1, 0.2592791366322083, 1.329476345177422, 0.4653648843955786, -3.812450940415005, 0.9327743293072568, 0.4513326025716732, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9923872069659245, 2.007612793034077, 0, 1, 0.330795735655308, 0, 0.4981040185984837, 2.197629843275173, 0.669204264344692, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 1.900503525559812, 0, 1, 0.3447677243581339, 0, 0.5261763456636789, 2.321484663604145, 0.6552322756418661, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -4.411989787712707, 1, 0.3333333333333333, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2800967741188121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 2.205994893856353, 0.6666666666666667, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2800967741188121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7523693851998047, 2.031455831278836, 0, 2, 0.2702645915936862, 0, 0.9845156213615367, 4.343672867290735, 0.5325137662819297, 1, 0.2266551030523635],
[0.8806348670653892, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2935449556884629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 2.205994893856353, 0.6666666666666667, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 1.783574873990561, 0, 0, 0.3592502610021014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519327416229912, 1.347678931202375, 1, 0, 0.3581294347688325, 1.329906179961753, 0, -5.867532484607278, 1, 0.3581294347688324, 0.2266551030523635],
[0.8803726467316682, 2.119627353268333, 0, 1, 0.2934575489105559, 0, 0.4717810413505291, 2.081493136475003, 0.706542451089444, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8246809037370597, 2.119235898596291, 1, 0, 0.2801305060942677, 1.212590221828198, 0, -5.3499356753863, 1, 0.2801305060942677, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0.4999999999999994, -2.205994893856353, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.2266551030523635],
[0.7709191569822593, 2.129975207374301, 0, 0, 0.2657522336747532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7530715719133254, 2.030503302077236, 0, 1, 0.2705411587631248, 0, 0.4924887336932596, 2.172855263618227, 0.7294588412368752, 1, 0.2266551030523635],
[0.8807729159934066, 2.119227084006595, 0, 1, 0.2935909719978021, 0, 0.4718701490495335, 2.081886278733017, 0.706409028002198, 1, 0.2266551030523635],
[0.7709812466540706, 2.130027762154794, 0, 1, 0.2657631342450159, 0, 0.4694774489645022, 2.0713297103928, 0.734236865754984, 1, 0.2266551030523635],
[0.7711840743721999, 2.012641081478445, 0, 1, 0.2770231717862868, 0, 0.4968595787905811, 2.192139387551283, 0.7229768282137132, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9998619658532001, 2.000138034146803, 0, 2, 0.3332873219510663, 0, 0.999930987689626, 4.411685306104115, 0.444505795071181, 1, 0.2266551030523635],
[0.7709812380834492, 1.32967185158203, 0, 1, 0.3670197815509961, 0, 0.7520652549049681, 3.318104224334276, 0.6329802184490039, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9003883271746372, 2.099611672825366, 0, 0, 0.3001294423915454, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7709191569822593, 2.129839508466044, 0, 1, 0.2657646656941439, 0, 0.4695189454534164, 2.071512792478115, 0.7342353343058561, 1, 0.2266551030523635],
[0.9987823616259613, 2.001217638374042, 0, 2, 0.3329274538753201, 0, 0.9993915512482533, 4.409305318033659, 0.4449857817932632, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 2.205994893856353, 0.6666666666666667, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.59461973004285, 1.349403539979316, 0, 1, 0.5416464422276268, 0, 0.7410681611338653, 3.269585158921652, 0.4583535577723732, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.5955124017038, 1.348445975952355, 0, 0, 0.5419616030624979, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2800967741188121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 2.205994893856353, 0.6666666666666667, 1, 0.2266551030523635],
[0.9003883271746372, 2.099611672825366, 0, 0, 0.3001294423915454, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9923783913422773, 2.007621608657725, 0, 0, 0.3307927971140922, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8806348670653892, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2935449556884629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8806348670653892, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2935449556884629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 1.783574873990561, 0, 0, 0.3592502610021014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 2, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0.9999999999999989, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.2266551030523635],
[1.5955124017038, 1.348445975952355, 0, 0, 0.5419616030624979, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.576525986344531, 1.24820532346745, 1, 0, 0.5581153792816731, 0.6343060683184082, 0, -2.798551895705018, 1, 0.5581153792816731, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031664118659786, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9991304338624954, 2.000869566137508, 0, 1, 0.3330434779541648, 0, 0.4997827029427044, 2.205036181458668, 0.6669565220458352, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9988429899699173, 2.001157010030086, 0, 1, 0.3329476633233054, 0, 0.4997109147297571, 2.204719452596266, 0.6670523366766946, 1, 0.2266551030523635],
[0.900216577315838, 2.098626709593374, 0, 2, 0.3001879362104498, 0, 0.953004167371679, 4.204644654091504, 0.4897369246253895, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 1.900388327174637, 0, 0, 0.3447814179331404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7710914374403881, 2.129917529887758, 0, 1, 0.265801121652709, 0, 0.4695017464139553, 2.071436910491654, 0.734198878347291, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 1.783574873990561, 0, 0, 0.3592502610021014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.5955124017038, 1.348445975952355, 0, 0, 0.5419616030624979, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9000791994080083, 2.000000000000002, 2, 0, 0.3103636616516336, 2.222026685335492, 0, -9.803559043725317, 1, 0.09632560247380972, 0.2266551030523635],
[0.9008943643565601, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3105574527035163, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7708971775670485, 2.129997186789512, 1, 0, 0.2657446569027477, 1.297189857609805, 0, -5.723188404498965, 1, 0.2657446569027477, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2800967741188121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9008943643565601, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3105574527035163, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031664118659786, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031664118659786, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.999585564506296, 2.000414435493707, 1, 1, 0.3331951881687649, 1.000414607321694, 0.4998964125917225, -2.208281163713038, 0.8889809665811812, 0.5553713429187113, 0.2266551030523635],
[0.9997695829615184, 2.000123998058492, 0, 3, 0.3332683496797847, 0, 1.499907007221593, 6.617574398380405, 0.2963829496137192, 1, 0.2266551030523635],
[1.900388327174637, 1.099611672825362, 0, 0, 0.6334627757248792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9998847990242069, 2.000115200975797, 1, 1, 0.3332949330080686, 1.000115214248587, 0.4999712014148634, -2.206630277008044, 0.888914487631147, 0.5555043536472842, 0.2266551030523635],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.900388327174637, 1.099611672825362, 0, 0, 0.6334627757248792, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 2, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0.9999999999999989, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 1.999884801571232, 0, 1, 0.3333461336502777, 0, 0.5000288012661221, 2.20612196474836, 0.6666538663497223, 1, 0.2266551030523635],
[0.751932734177154, 2.14896163017941, 1, 0, 0.259207209823353, 1.329906193130836, 0, -5.867532542709139, 1, 0.259207209823353, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031664118659786, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8868485564688207, 2.11315144353118, 0, 1, 0.2956161854896068, 0, 0.4732268494343929, 2.087872026976003, 0.7043838145103932, 1, 0.2266551030523635],
[0.9922577986300432, 2.007742201369959, 1, 1, 0.3307525995433475, 1.007802610753623, 0.4980719134745795, -2.248926630878819, 0.8906027178953179, 0.5521079169820131, 0.2266551030523635],
[0.9003883271746372, 2.099496362583159, 0, 1, 0.3001409788345339, 0, 0.4763047070820495, 2.101451503485497, 0.6998590211654661, 1, 0.2266551030523635],
[1.576504000052315, 1.248089244669228, 0, 0, 0.5581348758793523, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7709191569822593, 2.012655717008302, 0, 0, 0.2769529083573964, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9995362819318018, 1.784587533267618, 0, 1, 0.3590128702161213, 0, 0.5603535726650396, 2.472274240106488, 0.6409871297838787, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519327341745727, 2.031642139815988, 1, 0, 0.2701320310082388, 1.329906193135402, 0, -5.867532542729282, 1, 0.2701320310082389, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 2.205994893856353, 0.6666666666666667, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999989, 4.411989787712707, 0.4444444444444445, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031664118659786, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -4.411989787712707, 1, 0.3333333333333333, 0.2266551030523635],
[1.576504000052315, 1.248089244669228, 0, 0, 0.5581348758793523, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9991299034505051, 2.000870096549498, 0, 2, 0.333043301150168, 0, 0.9995651409099479, 4.410071193848307, 0.4448312381406655, 1, 0.2266551030523635],
[0.7709152644410792, 2.012909895123651, 1, 1, 0.2769266100611063, 1.297159423513308, 0.4967932257785294, -3.531207490836297, 0.923311652640064, 0.4771648727622766, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.032071176330626, 0, 1, 0.2700846391205047, 0, 0.4921087468037074, 2.171178765342058, 0.7299153608794953, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9999911846583328, 2.00000881534167, 1, 1, 0.3333303948861106, 1.000008815419378, 0.4999977961742961, -2.206043510653126, 0.8888908478450697, 0.5555516376172908, 0.2266551030523635],
[1.5955124017038, 1.348445975952355, 0, 0, 0.5419616030624979, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 2.205994893856353, 0.6666666666666667, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8246808998656836, 2.175319100134315, 1, 1, 0.2748936332885614, 1.212590227520573, 0.4597026707200131, -3.321732211900044, 0.924433490377414, 0.4742207569545367, 0.2266551030523635],
[1.576504000052315, 1.248089244669228, 0, 0, 0.5581348758793523, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519327326839567, 1.347678940141409, 1, 0, 0.3581294305113621, 1.329906195771781, 0, -5.867532554360958, 1, 0.358129430511362, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 1.994536648152082, 0, 1, 0.3339414799338313, 0, 0.5013695792085295, 2.212037463337852, 0.6660585200661687, 1, 0.2266551030523635],
[1.57600792792331, 1.248991305802466, 1, 1, 0.5578790638625335, 0.6345145746301478, 0.8006460856486979, 0.7329705300311247, 0.6887709501038632, 0.8045290778289302, 0.2266551030523635],
[0.7521976387605407, 2.03137723523002, 0, 1, 0.2702271980498885, 0, 0.4922768566355261, 2.171920464203255, 0.7297728019501115, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 1.347700917494591, 0, 0, 0.3581189631694884, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 2.205994893856353, 0.6666666666666667, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.175406755278459, 0, 0, 0.2748644149071801, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031664118659786, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9993907458272117, 2.000609254172792, 0, 1, 0.3331302486090702, 0, 0.499847732841503, 2.205323092708063, 0.6668697513909299, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.03220765400222, 0, 1, 0.270071399553338, 0, 0.4920756980865634, 2.171032954739522, 0.7299286004466621, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 2.205994893856353, 0.6666666666666667, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0.4999999999999994, -2.205994893856353, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.2266551030523635],
[1.591940771732749, 1.352277243962202, 0, 1, 0.5407007100854888, 0, 0.73949332835771, 3.262637012795899, 0.4592992899145112, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 2.205994893856353, 0.6666666666666667, 1, 0.2266551030523635],
[0.9991302750229624, 2.000869724977041, 0, 1, 0.3330434250076538, 0, 0.4997826632673322, 2.205036006411331, 0.6669565749923463, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 1.999884635918764, 0, 1, 0.3333461520575222, 0, 0.5000288426840139, 2.206122147483676, 0.6666538479424778, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2800967741188121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.8806348670653892, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2935449556884629, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9003883271746372, 2.099611672825366, 0, 0, 0.3001294423915454, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.999735113820078, 2.000014633805642, 0, 1, 0.333272838713083, 0, 0.4999963415753579, 2.205978752924196, 0.666727161286917, 1, 0.2266551030523635],
[1.005230077670636, 1.994769922329368, 1, 0, 0.3350766925568782, 0.9947971337240969, 0, -4.389034794836593, 1, 0.3350766925568782, 0.2266551030523635],
[0.01296043860782447, 2.987039561392174, 0, 2, 0.004320146202608161, 0, 0.669559260563612, 2.954088619875131, 0.9913783712579957, 1, 0.2266551030523635],
[1.586222573409781, 1.357923246907611, 1, 1, 0.5387717423720471, 0.6304285519341569, 0.7364186468397924, 0.4676272163223649, 0.7097250096213886, 0.7872684943654826, 0.2266551030523635],
[1.000463537141087, 1.999536462858917, 2, 1, 0.3334878457136952, 1.999073355252084, 0.5001159111498323, -6.613384935595082, 0.962911434958411, 0.2594652996331065, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031664118659786, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.992249139122653, 2.007750860877349, 1, 0, 0.3307497130408841, 1.007811405998498, 0, -4.446453631205761, 1, 0.3307497130408841, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.900300652169828, 2.099699347830175, 1, 0, 0.3001002173899424, 1.110740059545536, 0, -4.900573799518315, 1, 0.3001002173899423, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 2.205994893856353, 0.6666666666666667, 1, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.031664118659786, 0, 0, 0.270124135102868, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.7711053824249379, 2.130132834834336, 0, 1, 0.2657849251528823, 0, 0.4694542911347459, 2.071227538284409, 0.7342150748471177, 1, 0.2266551030523635],
[0.9003006720304935, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3104163236290238, 1.11074003504257, 0, -4.900573691411481, 1, 0.3104163236290238, 0.2266551030523635],
[0.8245932447215398, 2.119365132934612, 0, 0, 0.2800967741188121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -4.411989787712707, 1, 0.3333333333333333, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999989, 4.411989787712707, 0.4444444444444445, 1, 0.2266551030523635],
[0.8256121283813704, 2.174387871618628, 0, 1, 0.2752040427937903, 0, 0.4598995483062521, 2.029072110500873, 0.7247959572062097, 1, 0.2266551030523635],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9001250655365497, 2.099874934463454, 1, 0, 0.3000416885121829, 1.110956730667106, 0, -4.901529750293974, 1, 0.3000416885121829, 0.2266551030523635],
[0.8246809203353984, 2.1753190796646, 1, 0, 0.2748936401117996, 1.212590197422415, 0, -5.349935567708237, 1, 0.2748936401117996, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9003883271746372, 2.099611672825366, 0, 0, 0.3001294423915454, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[0.9973908738266598, 2.002609126173344, 1, 1, 0.3324636246088862, 1.002615951520922, 0.4993485682904258, -2.220410555301847, 0.8894679383119216, 0.554395187529694, 0.2266551030523635],
[1.001047099882287, 1.998952900117716, 1, 0, 0.3336823666274287, 0.9989539953890179, 0, -4.407374826051158, 1, 0.3336823666274287, 0.2266551030523635],
[0.7519107553307751, 2.148983609025789, 0, 0, 0.2591996332474359, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2266551030523635],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -4.411989787712707, 1, 0.3333333333333333, 0.2266551030523635],
[0.9997971771679878, 2.000202822832016, 0, 1, 0.3332657257226622, 0, 0.4999492994336123, 2.205771203475222, 0.6667342742773378, 1, 0.2266551030523635]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node109":{
"Global MG94xREV":0.0005245617826141539,
"Nucleotide GTR":0.0005229119460715144,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "I", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ATA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node112":{
"Global MG94xREV":0.0005244038033433961,
"Nucleotide GTR":0.0005227544636725879,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "I", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ATT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node117":{
"Global MG94xREV":0.0005245033552174505,
"Nucleotide GTR":0.0005228537024389686,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "F", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "TTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node178":{
"Global MG94xREV":0.0005243663550597556,
"Nucleotide GTR":0.0005227171331702061,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "L", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "CTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node186":{
"Global MG94xREV":0.0005244264650775216,
"Nucleotide GTR":0.0005227770541316836,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "F", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "TTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node199":{
"Global MG94xREV":1.456200610257394e-05,
"Nucleotide GTR":1.45162061022719e-05,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node205":{
"Global MG94xREV":0.0005244189903795207,
"Nucleotide GTR":0.0005227696029428866,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "Y", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "TAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node210":{
"Global MG94xREV":0.0005242065811860374,
"Nucleotide GTR":0.0005225578618126537,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "S", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "AGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node217":{
"Global MG94xREV":0.0005242664347177477,
"Nucleotide GTR":0.0005226175270947668,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "I", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ATT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node220":{
"Global MG94xREV":0.0005241299878074256,
"Nucleotide GTR":0.0005224815093333203,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "L", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TTA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node223":{
"Global MG94xREV":0.0005241920269842729,
"Nucleotide GTR":0.0005225433533863427,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAG", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node226":{
"Global MG94xREV":0.00052426810593466,
"Nucleotide GTR":0.0005226191930554169,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "N", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAT", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node229":{
"Global MG94xREV":0.0005243887982941375,
"Nucleotide GTR":0.0005227395058167764,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "F", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TTT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node230":{
"Global MG94xREV":0.0005245113806429141,
"Nucleotide GTR":0.0005228617026230962,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "F", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TTT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node235":{
"Global MG94xREV":0.0005245285088191133,
"Nucleotide GTR":0.0005228787769282519,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "I", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ATT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node238":{
"Global MG94xREV":0.0005241965992325262,
"Nucleotide GTR":0.0005225479112540933,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "K", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "AAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node241":{
"Global MG94xREV":0.0005243253729504782,
"Nucleotide GTR":0.0005226762799566733,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "S", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "AGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node244":{
"Global MG94xREV":0.0005240148255863728,
"Nucleotide GTR":0.0005223667093171534,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "S", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AGT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node247":{
"Global MG94xREV":0.0005240837777006364,
"Nucleotide GTR":0.0005224354445652221,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "V", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GTT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node250":{
"Global MG94xREV":0.000524091167124018,
"Nucleotide GTR":0.0005224428107476024,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "I", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ATT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node253":{
"Global MG94xREV":0.0005240985646385628,
"Nucleotide GTR":0.0005224501849956994,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "F", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TTT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node256":{
"Global MG94xREV":0.0005241059637657426,
"Nucleotide GTR":0.0005224575608513576,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "Y", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "TAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node259":{
"Global MG94xREV":0.0005241059608266612,
"Nucleotide GTR":0.0005224575579215203,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "I", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ATA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node262":{
"Global MG94xREV":0.0005241059608443623,
"Nucleotide GTR":0.0005224575579391659,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATT", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node265":{
"Global MG94xREV":0.000524315701396172,
"Nucleotide GTR":0.0005226666388210604,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "I", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATT", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node270":{
"Global MG94xREV":0.000524061590647584,
"Nucleotide GTR":0.0005224133272942473,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "L", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CTA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node273":{
"Global MG94xREV":0.0005243351947137312,
"Nucleotide GTR":0.0005226860708288007,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCG", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node276":{
"Global MG94xREV":0.0005244220389903919,
"Nucleotide GTR":0.0005227726419653546,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "I", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ATT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node282":{
"Global MG94xREV":0.0005243838798316211,
"Nucleotide GTR":0.0005227346028236664,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATT", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node291":{
"Global MG94xREV":0.0005243845886086328,
"Nucleotide GTR":0.0005227353093714529,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "F", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "TTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node300":{
"Global MG94xREV":0.0005245367749393845,
"Nucleotide GTR":0.0005228870170501604,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node311":{
"Global MG94xREV":0.0005246140548943546,
"Nucleotide GTR":0.0005229640539464521,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "S", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "TCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node315":{
"Global MG94xREV":0.0005240925224663404,
"Nucleotide GTR":0.0005224441618271409,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "C", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "TGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node316":{
"Global MG94xREV":0.0005243920712599153,
"Nucleotide GTR":0.0005227427684885177,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "C", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "TGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node332":{
"Global MG94xREV":0.0005243129174454481,
"Nucleotide GTR":0.0005226638636263373,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTT", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node336":{
"Global MG94xREV":0.0005243039681924125,
"Nucleotide GTR":0.0005226549425202333,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGT", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node343":{
"Global MG94xREV":0.0005243182199180256,
"Nucleotide GTR":0.0005226691494217314,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "K", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "AAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node348":{
"Global MG94xREV":0.0005243605847878896,
"Nucleotide GTR":0.0005227113810468322,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAA", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node352":{
"Global MG94xREV":0.0002873054426112922,
"Nucleotide GTR":0.0002864018178451928,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAT", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node353":{
"Global MG94xREV":0.0002368602350135799,
"Nucleotide GTR":0.0002361152690549924,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAT", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node358":{
"Global MG94xREV":0.0005240708480288059,
"Nucleotide GTR":0.0005224225555594208,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCT", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node363":{
"Global MG94xREV":0.0005243876127180319,
"Nucleotide GTR":0.0005227383239695107,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "C", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "TGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node366":{
"Global MG94xREV":0.0003077783947341951,
"Nucleotide GTR":0.0003068103790313796,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node367":{
"Global MG94xREV":0.0002163855217480276,
"Nucleotide GTR":0.000215704952265251,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node368":{
"Global MG94xREV":0.0005243452352187758,
"Nucleotide GTR":0.0005226960797547396,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node396":{
"Global MG94xREV":0.0005247555810267923,
"Nucleotide GTR":0.0005231051349549917,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "L", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CTA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node434":{
"Global MG94xREV":0.0005243652293121624,
"Nucleotide GTR":0.0005227160109632819,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "D", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GAC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node459":{
"Global MG94xREV":0.0005241242369723615,
"Nucleotide GTR":0.0005224757765856153,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "V", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GTC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node463":{
"Global MG94xREV":0.0002259596316665637,
"Nucleotide GTR":0.0002252489499702589,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node464":{
"Global MG94xREV":0.0002982057026106413,
"Nucleotide GTR":0.0002972677946621465,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "F", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TTC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node470":{
"Global MG94xREV":0.0005243736688731634,
"Nucleotide GTR":0.0005227244239804195,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "V", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GTT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node474":{
"Global MG94xREV":0.0003311687478978901,
"Nucleotide GTR":0.0003301271655330079,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAT", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node479":{
"Global MG94xREV":0.0002485470581638628,
"Nucleotide GTR":0.0002477653351472131,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node480":{
"Global MG94xREV":0.0002756197440338464,
"Nucleotide GTR":0.0002747528727888357,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAT", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node491":{
"Global MG94xREV":0.0003237424440569208,
"Nucleotide GTR":0.0003227242186880296,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "L", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "TTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node548":{
"Global MG94xREV":0.000524354778756899,
"Nucleotide GTR":0.0005227055932768031,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "Y", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TAC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node572":{
"Global MG94xREV":0.0005243663683823687,
"Nucleotide GTR":0.0005227171464509171,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATT", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node578":{
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node588":{
"Global MG94xREV":0.0005243316713640615,
"Nucleotide GTR":0.0005226825585606684,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "S", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "AGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node62":{
"Global MG94xREV":0.000524071954079129,
"Nucleotide GTR":0.0005224236581310268,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node623":{
"Global MG94xREV":0.0005243663683823687,
"Nucleotide GTR":0.0005227171464509171,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "V", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GTC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node670":{
"Global MG94xREV":0.0005243898885536395,
"Nucleotide GTR":0.0005227405926472262,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAC", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node782":{
"Global MG94xREV":0.0005242617170137744,
"Nucleotide GTR":0.0005226128242287803,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAT", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node835":{
"Global MG94xREV":0.0005243173596589222,
"Nucleotide GTR":0.0005226682918682905,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "R", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CGT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node856":{
"Global MG94xREV":0.0005242666651640043,
"Nucleotide GTR":0.0005226177568162316,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTT", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node866":{
"Global MG94xREV":0.0002502802919128738,
"Nucleotide GTR":0.0002494931175795809,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node869":{
"Global MG94xREV":0.0002505551969992758,
"Nucleotide GTR":0.0002497671580424582,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node881":{
"Global MG94xREV":0.0005249483538175898,
"Nucleotide GTR":0.0005232973014423844,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node902":{
"Global MG94xREV":0.0005250175494741349,
"Nucleotide GTR":0.0005233662794667535,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "V", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "GTT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node926":{
"Global MG94xREV":0.0005243810255409334,
"Nucleotide GTR":0.000522731757510211,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGT", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node929":{
"Global MG94xREV":0.0005241423572441715,
"Nucleotide GTR":0.0005224938398660716,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAT", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node932":{
"Global MG94xREV":0.0005243692131102805,
"Nucleotide GTR":0.0005227199822316738,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "F", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "TTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node936":{
"Global MG94xREV":0.0005244072835668172,
"Nucleotide GTR":0.0005227579329501122,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCT", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node937":{
"Global MG94xREV":0.0005251051818532151,
"Nucleotide GTR":0.0005234536362270094,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCT", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node941":{
"Global MG94xREV":0.0005242987435042007,
"Nucleotide GTR":0.0005226497342645597,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "Y", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "TAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node949":{
"Global MG94xREV":0.0005242667354272869,
"Nucleotide GTR":0.0005226178268585231,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGT", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node954":{
"Global MG94xREV":0.0003303320934572156,
"Nucleotide GTR":0.000329293142513675,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAA", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node955":{
"Global MG94xREV":0.0001938235347169095,
"Nucleotide GTR":0.000193213926543005,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAA", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node963":{
"Global MG94xREV":0.0005242367220324358,
"Nucleotide GTR":0.0005225879078609327,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "G", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GGA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node966":{
"Global MG94xREV":0.0003312827657137013,
"Nucleotide GTR":0.0003302408247432838,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "V", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GTT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node972":{
"Global MG94xREV":0.0003316142887781082,
"Nucleotide GTR":0.0003305713051109391,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "K", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "AAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node975":{
"Global MG94xREV":0.0003316142887781082,
"Nucleotide GTR":0.0003305713051109391,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "F", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "TTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406034_California_20200123_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241626004105743,
"Nucleotide GTR":0.0005225140193642527,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "N", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AAC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406034_California_20200123_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243645008928068,
"Nucleotide GTR":0.0005227152848349301,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "S", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATT", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TCT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_408478_Chongqinq_20200121_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242420770835485,
"Nucleotide GTR":0.0005225932460694952,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAT", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_408478_Chongqinq_20200121_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242534519959037,
"Nucleotide GTR":0.0005226045852058041,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "I", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ATA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_410545_Rome_20200129_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005245993733921621,
"Nucleotide GTR":0.0005229494186200946,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCT", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_410545_Rome_20200129_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241625936060553,
"Nucleotide GTR":0.0005225140125811356,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "S"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "AGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
],
"original name":"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_412869_Seoul_20200130_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005240418558160847,
"Nucleotide GTR":0.0005223936545321687,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "T", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "ACA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_412869_Seoul_20200130_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000607984058089383,
"Nucleotide GTR":0.0006060718442193995,
"amino-acid": [
["-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "N", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAC", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413016_Sao_Paulo_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000524242009067954,
"Nucleotide GTR":0.0005225931782678213,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "I", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ATA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413016_Sao_Paulo_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413018_South_Korea_20200206_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241489734135644,
"Nucleotide GTR":0.0005225004352264796,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACG", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413018_South_Korea_20200206_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413021_Zurich_20200229_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242536681329184,
"Nucleotide GTR":0.0005226048006630312,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "C", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "TGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413021_Zurich_20200229_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413485_Anhui_20200124_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0001924844221020151,
"Nucleotide GTR":0.0001918790256663652,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "F", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "TTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413485_Anhui_20200124_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413522_Kerala_20200127_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242652227963367,
"Nucleotide GTR":0.0005226163189850562,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "T", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ACT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413522_Kerala_20200127_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413609_USA_20200221_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "Y", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "TAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413609_USA_20200221_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413855_Guangdong_20200207_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "HY", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGT", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "YAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413855_Guangdong_20200207_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414482_USA_20200218_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "SF", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TYC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414482_USA_20200218_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414483_USA_20200217_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTY", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414483_USA_20200217_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414525_England_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACW", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414525_England_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414532_Noord_Brabant_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243723532945099,
"Nucleotide GTR":0.0005227231125394866,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "L", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TTA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAC", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414532_Noord_Brabant_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414553_Utrecht_20200309_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0005249583983763746,
"Nucleotide GTR":0.000523307314409314,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "S", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "AGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414553_Utrecht_20200309_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242652229164081,
"Nucleotide GTR":0.0005226163191047503,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "P", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CCC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414579_Santiago_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "AV", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GYT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414579_Santiago_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414630_Hauts_de_France_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "F", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "TTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414630_Hauts_de_France_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415509_Noord_Brabant_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005249022169758127,
"Nucleotide GTR":0.0005232513097088676,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "F", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTT", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415509_Noord_Brabant_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415510_Noord_Brabant_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005249222159334543,
"Nucleotide GTR":0.0005232712457663665,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTA", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415510_Noord_Brabant_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415579_British_Columbia_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005245768468465768,
"Nucleotide GTR":0.0005229269629243494,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "C", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "TGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCT", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415579_British_Columbia_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415615_Washington_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005247508495978532,
"Nucleotide GTR":0.0005231004184072057,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "R", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "AGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415615_Washington_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416334_Shanghai_20200206_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243617180716112,
"Nucleotide GTR":0.0005227125107661825,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "K", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAA", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416334_Shanghai_20200206_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416342_Shanghai_20200204_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241605558820034,
"Nucleotide GTR":0.0005225119812660732,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAG", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416342_Shanghai_20200204_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416348_Shanghai_20200206_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005241489660026847,
"Nucleotide GTR":0.000522500427838908,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "D", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "GAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416348_Shanghai_20200206_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416350_Shanghai_20200129_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0005240762668125478,
"Nucleotide GTR":0.0005224279573001609,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGC", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416350_Shanghai_20200129_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416360_Shanghai_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00212105125712817,
"Nucleotide GTR":0.002114380188078151,
"amino-acid": [
["-", "-", "-", "-", "-", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "N", "V", "T", "C", "A", "K", "G", "I", "K", "E", "S", "G", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "R", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["---", "---", "---", "---", "---", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "AAT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GGA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GGT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "AGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416360_Shanghai_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416373_Shanghai_20200207_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000524298180301959,
"Nucleotide GTR":0.0005226491728336854,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "R", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "AGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416373_Shanghai_20200207_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416382_Shanghai_20200208_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243210040147313,
"Nucleotide GTR":0.0005226719247619774,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "S", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "TCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416382_Shanghai_20200208_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416386_Shanghai_20200131_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242652307534491,
"Nucleotide GTR":0.0005226163269171423,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTC", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416386_Shanghai_20200131_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416408_Shanghai_20200212_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005247508467443642,
"Nucleotide GTR":0.0005231004155626925,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "Y", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TAC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416408_Shanghai_20200212_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416409_Shanghai_20200202_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242441093173968,
"Nucleotide GTR":0.00052259527191162,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "T", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "ACC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416409_Shanghai_20200202_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242652227963367,
"Nucleotide GTR":0.0005226163189850562,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCC", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416480_Tbilisi_20200311_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005241605486187556,
"Nucleotide GTR":0.0005225119740256701,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "G", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GGA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416480_Tbilisi_20200311_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416509_Bretagne_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242539164962667,
"Nucleotide GTR":0.0005226050482452345,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "G", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "GGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416509_Bretagne_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416541_Dasman_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000524351340163265,
"Nucleotide GTR":0.0005227021654981339,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "C", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "D", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "TGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAC", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416541_Dasman_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416543_Dasman_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005249215569082468,
"Nucleotide GTR":0.000523270588813906,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "C", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "TI", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "TGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCA", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "AYT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416543_Dasman_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416605_unknown_20200216_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005240762667835949,
"Nucleotide GTR":0.0005224279572712996,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAC", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416605_unknown_20200216_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416675_USA_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241489660026847,
"Nucleotide GTR":0.000522500427838908,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "R", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "H", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CGT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CAT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416675_USA_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416691_Washington_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005245076896744868,
"Nucleotide GTR":0.0005228580232633972,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "I", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ATT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416691_Washington_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416700_Washington_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "V", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GTC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416700_Washington_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416748_ARA_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005245115064049516,
"Nucleotide GTR":0.0005228618279895905,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "F", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "TTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416748_ARA_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416907_Selangor_20200220_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000524242009067954,
"Nucleotide GTR":0.0005225931782678213,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "V", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GTA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416907_Selangor_20200220_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417015_Li_ge_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241625936077926,
"Nucleotide GTR":0.0005225140125828672,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "S", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "AGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417015_Li_ge_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417028_Utah_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005242420770818443,
"Nucleotide GTR":0.0005225932460677958,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCT", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417028_Utah_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417030_New_South_Wales_20200124_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "I", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ATT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417030_New_South_Wales_20200124_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417076_Washington_20200302_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005241626004105743,
"Nucleotide GTR":0.0005225140193642527,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAA", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417076_Washington_20200302_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417149_Washington_20200228_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005242420770835485,
"Nucleotide GTR":0.0005225932460694952,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "V", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GTC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417149_Washington_20200228_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242652307534491,
"Nucleotide GTR":0.0005226163269171423,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "A", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GCA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417189_Minnesota_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "SL", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TYA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417189_Minnesota_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417338_ARA_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005245254038898697,
"Nucleotide GTR":0.000522875681764541,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATT", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417338_ARA_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417346_Washington_20200312_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0005242420770835485,
"Nucleotide GTR":0.0005225932460694952,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "C", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "TGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417346_Washington_20200312_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417363_Washington_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "I", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATT", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417363_Washington_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417409_New_South_Wales_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243377698759568,
"Nucleotide GTR":0.0005226886378917012,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATT", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417409_New_South_Wales_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417432_Cork_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005245010738844706,
"Nucleotide GTR":0.000522851428281171,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGA", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417432_Cork_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417443_Hong_Kong_20200122_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005242420770835485,
"Nucleotide GTR":0.0005225932460694952,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAT", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417443_Hong_Kong_20200122_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417444_Gilgit_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005245768468448794,
"Nucleotide GTR":0.0005229269629226574,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "C", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "TGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCT", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417444_Gilgit_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417448_Washington_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005245619119218029,
"Nucleotide GTR":0.0005229120749724691,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "V", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAT", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GTT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417448_Washington_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417483_Oslo_20200227_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "TP", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "MCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417483_Oslo_20200227_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417521_Taoyuan_20200310_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0005246015310382662,
"Nucleotide GTR":0.0005229515694800341,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417521_Taoyuan_20200310_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417666_Reykjavik_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005248558220075917,
"Nucleotide GTR":0.0005232050606607582,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "D", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "GAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417666_Reykjavik_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417672_Reykjavik_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242420770835485,
"Nucleotide GTR":0.0005225932460694952,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCT", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417672_Reykjavik_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417715_Reykjavik_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244050487744191,
"Nucleotide GTR":0.0005227557051865182,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "T", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "ACA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417715_Reykjavik_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417755_Reykjavik_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005241489041663772,
"Nucleotide GTR":0.0005225003661970869,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "A", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "GCT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417755_Reykjavik_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417877_Kostoliste_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "C", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "TGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417877_Kostoliste_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002633138963783266,
"Nucleotide GTR":0.002624857291293429,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "F", "M", "F", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "T", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTA", "TTT", "ATG", "TTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "ACT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417938_California_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "AV", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GYC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417938_California_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417939_California_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "DY", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "KAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417939_California_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418042_Minnesota_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242694469129654,
"Nucleotide GTR":0.0005226205298161154,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "L", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CTA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418042_Minnesota_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418184_Wisconsin_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244052356441214,
"Nucleotide GTR":0.0005227558914684828,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTA", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418184_Wisconsin_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418237_Hauts_de_France_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005246493089310289,
"Nucleotide GTR":0.0005229991971031492,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "F", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "V", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "TTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GTC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418237_Hauts_de_France_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418259_Abruzzo_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "EA", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GMG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418259_Abruzzo_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418331_Ontario_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241489734135644,
"Nucleotide GTR":0.0005225004352264796,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAG", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418331_Ontario_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418385_Finland_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244206295268544,
"Nucleotide GTR":0.0005227712369348215,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "I", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ATA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418385_Finland_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418389_Finland_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243123477493828,
"Nucleotide GTR":0.0005226632957220632,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "C", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "TGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418389_Finland_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418412_ARA_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242651609377455,
"Nucleotide GTR":0.000522616257321021,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAC", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418412_ARA_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418650_Li_ge_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243174631266425,
"Nucleotide GTR":0.0005226683950105867,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "N", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAT", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATT", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418650_Li_ge_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418687_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "LF", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "YTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418687_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418691_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "PL", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "D", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CYA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GAC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418691_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418710_England_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005242420770835485,
"Nucleotide GTR":0.0005225932460694952,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAT", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418710_England_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418741_England_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005250193187767686,
"Nucleotide GTR":0.0005233680432046275,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "K", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AAG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418741_England_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418751_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242420154653419,
"Nucleotide GTR":0.0005225931846450883,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "I", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ATA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418751_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418800_Gierle_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244560603153422,
"Nucleotide GTR":0.0005228065562874188,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "D", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "V", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GAC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GTC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418800_Gierle_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418809_Tokyo_20200201_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005242420770835485,
"Nucleotide GTR":0.0005225932460694952,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAT", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418809_Tokyo_20200201_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418899_Washington_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000524242009067954,
"Nucleotide GTR":0.0005225931782678213,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "V", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GTT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418899_Washington_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418927_Washington_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242651609069357,
"Nucleotide GTR":0.000522616257290308,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACC", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418927_Washington_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418938_Washington_20200316_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0005242418106090697,
"Nucleotide GTR":0.0005225929804331236,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "Y", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "TAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418938_Washington_20200316_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418946_Illinois_20200312_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0001929537714087616,
"Nucleotide GTR":0.0001923468987892505,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAT", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418946_Illinois_20200312_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418964_Utah_20200314_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000524410701718764,
"Nucleotide GTR":0.0005227613403513856,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "V", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GTT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418964_Utah_20200314_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418993_Singapore_20200129_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGT", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418993_Singapore_20200129_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419229_Hong_Kong_20200217_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001049171366270037,
"Nucleotide GTR":0.001045871542842306,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "D", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "T", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GAC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "ACC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419229_Hong_Kong_20200217_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0001924338669424199,
"Nucleotide GTR":0.0001918286295113953,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "K", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "AAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419453_Wales_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "HY", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "YAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419453_Wales_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419499_Wales_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000524320998329008,
"Nucleotide GTR":0.000522671919094136,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "D", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GAC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCT", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419499_Wales_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419556_Georgia_20200229_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005242652307534491,
"Nucleotide GTR":0.0005226163269171423,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACC", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419556_Georgia_20200229_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419587_Luxembourg_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAY", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419587_Luxembourg_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419589_Luxembourg_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAY", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419589_Luxembourg_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419669_Austria_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242441045313429,
"Nucleotide GTR":0.0005225952671406184,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "T", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "ACG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419669_Austria_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419673_Austria_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "YTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419673_Austria_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419685_Comunitat_Valenciana_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241626004105743,
"Nucleotide GTR":0.0005225140193642527,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "K", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AAA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419685_Comunitat_Valenciana_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419733_Victoria_20200131_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241490349698095,
"Nucleotide GTR":0.0005225004965891191,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAG", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419733_Victoria_20200131_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419746_Victoria_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243736792511821,
"Nucleotide GTR":0.0005227244343257984,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "A", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "GCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419746_Victoria_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419816_Victoria_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005241490349698095,
"Nucleotide GTR":0.0005225004965891191,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "V", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "GTC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419816_Victoria_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419818_Victoria_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242064118595325,
"Nucleotide GTR":0.0005225576930187095,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "S", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AGT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419818_Victoria_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419822_Victoria_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "I", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATY", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ATA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419822_Victoria_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419864_Victoria_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "PL", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CYA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419864_Victoria_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419920_Victoria_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "Y", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TAC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419920_Victoria_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419922_Victoria_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "TI", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "AYT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419922_Victoria_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419923_Victoria_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005241604868321114,
"Nucleotide GTR":0.0005225119124333556,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAG", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419923_Victoria_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419929_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243916474607108,
"Nucleotide GTR":0.0005227423460222334,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "I", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ATT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAT", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419929_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419932_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241489734135644,
"Nucleotide GTR":0.0005225004352264796,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "V", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "GTT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419932_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419935_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "TI", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "AYA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419935_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419944_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000524242009067954,
"Nucleotide GTR":0.0005225931782678213,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "Y", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "TAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419944_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419946_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "K", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "AAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419946_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419961_Victoria_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAY", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419961_Victoria_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420057_Hauts_de_France_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000524347228786397,
"Nucleotide GTR":0.0005226980670522498,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "K", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "AAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420057_Hauts_de_France_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420062_Ile_de_France_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244758395685126,
"Nucleotide GTR":0.0005228262733314534,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCT", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420062_Ile_de_France_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420115_Comunitat_Valenciana_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242420770835485,
"Nucleotide GTR":0.0005225932460694952,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "F", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TTT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420115_Comunitat_Valenciana_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420184_South_Yorkshire_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000524460890568752,
"Nucleotide GTR":0.0005228113713488552,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "D", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "F", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GAC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TTC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420184_South_Yorkshire_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420193_South_Yorkshire_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000524242009067954,
"Nucleotide GTR":0.0005225931782678213,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "S", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "TCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420193_South_Yorkshire_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420301_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243849147926894,
"Nucleotide GTR":0.0005227356345296056,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "N", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAT", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420301_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420319_Montigny_le_Tilleul_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005243494311651121,
"Nucleotide GTR":0.0005227002625041073,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "S", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "L", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "AGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TTG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420319_Montigny_le_Tilleul_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420322_Elsene_20200305_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005242420770835485,
"Nucleotide GTR":0.0005225932460694952,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTC", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420322_Elsene_20200305_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420379_Tienen_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243125922095364,
"Nucleotide GTR":0.0005226635394133481,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "F", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTT", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420379_Tienen_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420417_Saint_Ghislain_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000524484455227562,
"Nucleotide GTR":0.0005228348618927812,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGT", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420417_Saint_Ghislain_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420455_Hong_Kong_20200304_null_12":{
"Global MG94xREV":0.0005243125261126128,
"Nucleotide GTR":0.0005226634735243106,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "V", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GTC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420455_Hong_Kong_20200304_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420456_Western_Australia_20200222_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005242420770835485,
"Nucleotide GTR":0.0005225932460694952,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCT", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420456_Western_Australia_20200222_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420458_England_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "TI", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "AYT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420458_England_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420485_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAG", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420485_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420488_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "D", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GAC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCY", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420488_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420500_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242652307534491,
"Nucleotide GTR":0.0005226163269171423,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAC", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420500_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420509_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "V", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GTC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420509_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420510_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005245122721313293,
"Nucleotide GTR":0.0005228625913076281,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "S", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "V", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "AGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GTC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420510_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420527_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGY", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420527_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420610_ARA_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241490349698095,
"Nucleotide GTR":0.0005225004965891191,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "A", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "GCA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420610_ARA_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420640_England_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005248799862277114,
"Nucleotide GTR":0.0005232291488802722,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATC", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420640_England_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420656_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241742495924917,
"Nucleotide GTR":0.0005225256319075002,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "K", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AAG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420656_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420729_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "V", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GTT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420729_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420769_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "IV", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "RTT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420769_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420796_Texas_20200229_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "GV", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GKT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420796_Texas_20200229_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420797_Texas_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241742495942182,
"Nucleotide GTR":0.0005225256319092209,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "N", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "AAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420797_Texas_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420807_Utah_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242420770835485,
"Nucleotide GTR":0.0005225932460694952,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "S", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "TCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420807_Utah_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420879_Queensland_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242420770835485,
"Nucleotide GTR":0.0005225932460694952,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "F", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "TTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420879_Queensland_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420970_Wales_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005270024532033154,
"Nucleotide GTR":0.0005253449403341492,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "D", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCC", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GAC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420970_Wales_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "S", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "AGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242420155667044,
"Nucleotide GTR":0.000522593184746131,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACT", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421239_Jiangxi_20200126_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241626618837616,
"Nucleotide GTR":0.0005225140806440974,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "S", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "AGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421239_Jiangxi_20200126_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421251_Jiangxi_20200203_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241717835759332,
"Nucleotide GTR":0.0005225231736469862,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "Y", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "TAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCT", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421251_Jiangxi_20200203_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421301_Wisconsin_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAT", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421301_Wisconsin_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421336_Wisconsin_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "L", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CTA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421336_Wisconsin_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421362_New_York_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242692793970815,
"Nucleotide GTR":0.0005226203628270981,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "I", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ATT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421362_New_York_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421409_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243266024489358,
"Nucleotide GTR":0.0005226775055881481,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "E", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "GAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421409_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421419_New_York_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005242046731088475,
"Nucleotide GTR":0.0005225559597366922,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "I", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATT", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421419_New_York_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421465_Portugal_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241741878012327,
"Nucleotide GTR":0.0005225255703105848,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTA", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421465_Portugal_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421487_Portugal_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "I", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ATT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421487_Portugal_20200322_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421615_New_York_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000524424515712317,
"Nucleotide GTR":0.0005227751108975663,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "S", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "AGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421615_New_York_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421622_New_York_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242418106759466,
"Nucleotide GTR":0.0005225929804997905,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "P", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "CCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421622_New_York_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421663_India_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005246515376366671,
"Nucleotide GTR":0.0005230014187991274,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "C", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "T", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "TGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "ACC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421663_India_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421665_India_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005247393178422044,
"Nucleotide GTR":0.000523088922920902,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "C", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "TGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTT", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421665_India_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421666_India_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243609281302411,
"Nucleotide GTR":0.0005227117233093141,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGT", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421666_India_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421671_India_20200312_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005244522757789788,
"Nucleotide GTR":0.0005228027836540689,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "C", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTT", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "TGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421671_India_20200312_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421706_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005095876618147753,
"Nucleotide GTR":0.0005079849214436594,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "H", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "CAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421706_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421711_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "K", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "AAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421711_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421726_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000524342940468699,
"Nucleotide GTR":0.0005226937922220442,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "K", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AAG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421726_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421736_Luxembourg_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242593200567094,
"Nucleotide GTR":0.0005226104348105547,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "N", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAT", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421736_Luxembourg_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421750_Luxembourg_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241626620095668,
"Nucleotide GTR":0.0005225140807695067,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "H", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CAC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421750_Luxembourg_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421775_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAY", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421775_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421826_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "D", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "AV", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GAC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GYT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421826_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421833_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243520437768837,
"Nucleotide GTR":0.0005227028668987677,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "F", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "D", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "TTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GAC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421833_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421836_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAR", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421836_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421844_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "NS", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "ART", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421844_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421850_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "TI", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "AYA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421850_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421869_England_20200327_null_4":{
"Global MG94xREV":0.000524242009067954,
"Nucleotide GTR":0.0005225931782678213,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "F", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "TTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421869_England_20200327_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421892_England_20200327_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005248392632374798,
"Nucleotide GTR":0.0005231885539708116,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATA", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421892_England_20200327_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421895_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "TI", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "AYA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAT", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421895_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421898_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCY", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421898_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421933_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAY", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421933_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421934_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243886831973269,
"Nucleotide GTR":0.0005227393910819656,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "K", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "AAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421934_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421952_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATY", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421952_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421969_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241625936077926,
"Nucleotide GTR":0.0005225140125828672,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "S", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "AGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421969_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421979_England_20200331_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005242536617203562,
"Nucleotide GTR":0.0005226047942706372,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "P", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "CCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421979_England_20200331_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421993_England_20200331_null_9":{
"Global MG94xREV":0.0005243125307004003,
"Nucleotide GTR":0.0005226634780976695,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "H", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAT", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421993_England_20200331_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422006_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAY", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422006_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422017_Wales_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "SG", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "RGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422017_Wales_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422036_Wales_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242420770835485,
"Nucleotide GTR":0.0005225932460694952,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "V", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GTC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422036_Wales_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422056_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243210040147313,
"Nucleotide GTR":0.0005226719247619774,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "D", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "L", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GAC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TTA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422056_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422065_Wales_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATT", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422065_Wales_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422087_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "TI", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "D", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "AYT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GAC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422087_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422088_Wales_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "F", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TTC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422088_Wales_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422091_Wales_20200328_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005243377698759568,
"Nucleotide GTR":0.0005226886378917012,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "I", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ATA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422091_Wales_20200328_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422094_Wales_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "NS", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "ART", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422094_Wales_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422099_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "SG", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "RGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422099_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422113_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "DG", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GRC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422113_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422124_Wales_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244377287020051,
"Nucleotide GTR":0.0005227882823301409,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "S", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGT", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422124_Wales_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422126_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241489660026847,
"Nucleotide GTR":0.000522500427838908,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGG", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422126_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422127_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002737476220917076,
"Nucleotide GTR":0.000272886638990467,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "H", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "CAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422127_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422154_Wales_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "PS", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "YCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422154_Wales_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422156_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "R", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACY", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CGT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422156_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422161_Wales_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241625937047837,
"Nucleotide GTR":0.0005225140126795527,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "D", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GAT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422161_Wales_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422172_Wales_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005249172162353576,
"Nucleotide GTR":0.0005232662617931758,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "S", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "TCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422172_Wales_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422174_Wales_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005249416734587613,
"Nucleotide GTR":0.0005232906420944283,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "L", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TTG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422174_Wales_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422194_Wales_20200324_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "I", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ATT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422194_Wales_20200324_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422195_Wales_20200326_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005245910223864301,
"Nucleotide GTR":0.0005229410938797048,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "D", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "V", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GAC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GTT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422195_Wales_20200326_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422215_Wales_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "TI", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "D", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "AYC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GAC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422215_Wales_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422224_Wales_20200329_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005244630346700715,
"Nucleotide GTR":0.0005228135087066094,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAT", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422224_Wales_20200329_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422240_Wales_20200325_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005251467270154115,
"Nucleotide GTR":0.0005234950507225633,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "F", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "TTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422240_Wales_20200325_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422257_Wales_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242652227963367,
"Nucleotide GTR":0.0005226163189850562,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "T", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ACC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422257_Wales_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422260_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241625937047837,
"Nucleotide GTR":0.0005225140126795527,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "I", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "ATT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422260_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422384_Greater_Accra_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005244389769137036,
"Nucleotide GTR":0.0005227895266160002,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "I", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ATA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422384_Greater_Accra_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422387_Greater_Accra_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "F", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "TTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422387_Greater_Accra_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422394_Greater_Accra_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "AV", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GYT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422394_Greater_Accra_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422407_Taipei_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242534519899786,
"Nucleotide GTR":0.0005226045851998972,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGT", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422407_Taipei_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422408_Taipei_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005243266024206501,
"Nucleotide GTR":0.0005226775055599513,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "V", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "GTC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422408_Taipei_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422410_Taipei_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005248989240097727,
"Nucleotide GTR":0.0005232480270997693,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "T", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "ACT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422410_Taipei_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422419_Taipei_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242087413276723,
"Nucleotide GTR":0.0005225600151602734,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCG", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422419_Taipei_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422424_Dasman_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCM", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422424_Dasman_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422430_Singapore_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCM", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422430_Singapore_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422436_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "HY", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "YAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422436_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422509_New_York_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244052356187067,
"Nucleotide GTR":0.000522755891443148,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "T", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "ACA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422509_New_York_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422562_New_York_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGT", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422562_New_York_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422582_Netherlands_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243924107721558,
"Nucleotide GTR":0.0005227431069329334,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "S", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATT", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "AGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422582_Netherlands_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422595_Netherlands_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "L", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TTA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422595_Netherlands_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422615_Netherlands_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005242420770835485,
"Nucleotide GTR":0.0005225932460694952,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "TTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422615_Netherlands_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422620_Netherlands_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242420770835485,
"Nucleotide GTR":0.0005225932460694952,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTC", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422620_Netherlands_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422622_Netherlands_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000525031945297354,
"Nucleotide GTR":0.0005233806300126456,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "S", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "AGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422622_Netherlands_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422623_Netherlands_20200402_null_4":{
"Global MG94xREV":0.000524334311994827,
"Nucleotide GTR":0.0005226851908861989,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "L", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TTG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422623_Netherlands_20200402_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422634_Zuid_Holland_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAA", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422634_Zuid_Holland_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422638_Gelderland_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005251777005832795,
"Nucleotide GTR":0.0005235259268732623,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAT", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422638_Gelderland_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422656_Netherlands_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005243266024489358,
"Nucleotide GTR":0.0005226775055881481,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTG", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422656_Netherlands_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422667_Netherlands_20200316_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0005243195174488173,
"Nucleotide GTR":0.0005226704428715675,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "S", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "AGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422667_Netherlands_20200316_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422670_Netherlands_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243645009972511,
"Nucleotide GTR":0.0005227152849390454,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCT", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAC", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422670_Netherlands_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422678_Netherlands_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242420154382628,
"Nucleotide GTR":0.0005225931846180942,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "V", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GTA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422678_Netherlands_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422703_Netherlands_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005245110592432784,
"Nucleotide GTR":0.0005228613822343187,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "C", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "TGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCT", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422703_Netherlands_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422715_Netherlands_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005249958560080587,
"Nucleotide GTR":0.0005233446542303383,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "S", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "TCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422715_Netherlands_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422737_Netherlands_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241490349698095,
"Nucleotide GTR":0.0005225004965891191,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "A", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "GCT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422737_Netherlands_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422768_Netherlands_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000524984266302772,
"Nucleotide GTR":0.0005233331009766579,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "V", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GTA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422768_Netherlands_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422784_Netherlands_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242536618494451,
"Nucleotide GTR":0.0005226047943993214,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "V", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GTA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422784_Netherlands_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422800_Netherlands_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005250138812395679,
"Nucleotide GTR":0.000523362622769412,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGT", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422800_Netherlands_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422839_Netherlands_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244819673634806,
"Nucleotide GTR":0.0005228323818534591,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "I", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "ATA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422839_Netherlands_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422842_Netherlands_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000524966900572163,
"Nucleotide GTR":0.0005233157898642436,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATT", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422842_Netherlands_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422932_Zuid_Holland_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000524425406682201,
"Nucleotide GTR":0.0005227759990651965,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "L", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CTA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422932_Zuid_Holland_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422982_USA_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005241112774369625,
"Nucleotide GTR":0.0005224628578101723,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "V", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GTC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422982_USA_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423012_Washington_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241489660026847,
"Nucleotide GTR":0.000522500427838908,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "R", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AGA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423012_Washington_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423032_Washington_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242420770835485,
"Nucleotide GTR":0.0005225932460694952,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAC", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423032_Washington_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423040_Bangkok_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241489660026847,
"Nucleotide GTR":0.000522500427838908,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAG", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423040_Bangkok_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423087_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "PL", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CYT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423087_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423089_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241625935784312,
"Nucleotide GTR":0.0005225140125535981,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAA", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423089_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423091_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "NS", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "ART", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423091_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423092_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241626004105743,
"Nucleotide GTR":0.0005225140193642527,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "D", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GAT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423092_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423099_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "EG", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GRA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423099_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423106_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241323228913056,
"Nucleotide GTR":0.000522483837072962,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "R", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AGA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423106_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423129_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "DG", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GRT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423129_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423152_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243121710621514,
"Nucleotide GTR":0.000522663119590544,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "R", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AGG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423152_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423179_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "LF", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "YTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423179_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423213_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000524360858436039,
"Nucleotide GTR":0.0005227116538343119,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAT", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423213_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423228_England_20200325_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0005243223270020875,
"Nucleotide GTR":0.0005226732435883114,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "C", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "TGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423228_England_20200325_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423258_England_20200323_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "VL", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "KTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423258_England_20200323_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423264_England_20200325_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "VL", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "KTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAT", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423264_England_20200325_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423266_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242891639292718,
"Nucleotide GTR":0.0005226401848190333,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "VL", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "G", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "KTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "GGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423266_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423377_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "KN", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAK", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423377_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423378_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "KE", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "RAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423378_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423393_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "N", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAT", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423393_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423399_England_20200329_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "TA", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "RCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAT", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423399_England_20200329_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423414_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "IV", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "RTT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423414_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423417_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243617180505276,
"Nucleotide GTR":0.0005227125107451655,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "T", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "ACT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423417_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423421_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCW", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423421_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423469_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATW", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423469_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423486_England_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005251940165280486,
"Nucleotide GTR":0.0005235421915015945,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "Y", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "TAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423486_England_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423488_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243350314341015,
"Nucleotide GTR":0.0005226859080627128,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "F", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAA", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "TTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423488_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423491_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243100132672722,
"Nucleotide GTR":0.0005226609685822981,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "I", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ATT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423491_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423522_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTT", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423522_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423564_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005249122727070616,
"Nucleotide GTR":0.0005232613338131219,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "F", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "F", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TTT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTT", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423564_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423571_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "LF", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "F", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "YTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "TTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423571_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423649_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244726942689776,
"Nucleotide GTR":0.0005228231379244241,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423649_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423665_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAY", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423665_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423684_England_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "VL", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "KTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423684_England_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423722_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243572215031267,
"Nucleotide GTR":0.0005227080283401759,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAT", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423722_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423739_England_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005242652307534491,
"Nucleotide GTR":0.0005226163269171423,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGC", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423739_England_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423745_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "TI", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "AYT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423745_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423782_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "ND", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "RAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423782_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423813_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000524663152727117,
"Nucleotide GTR":0.0005230129973581301,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "TA", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "V", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "RCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCG", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GTC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423813_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423824_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005246372749451569,
"Nucleotide GTR":0.0005229872009662219,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTT", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423824_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423858_England_20200318_null_4":{
"Global MG94xREV":0.000524242009067954,
"Nucleotide GTR":0.0005225931782678213,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "S", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "TCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423858_England_20200318_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423881_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "R", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "SF", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CGT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TYC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423881_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423901_England_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005243263491714132,
"Nucleotide GTR":0.0005226772531072258,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "SG", "V", "Q", "T", "F", "F", "E", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "RGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "GAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423901_England_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423916_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "SG", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "RGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423916_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423948_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242782846077792,
"Nucleotide GTR":0.0005226293397148673,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "P", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "CCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423948_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423958_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244082474979694,
"Nucleotide GTR":0.0005227588938495357,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "Q", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CAA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423958_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423970_England_20200320_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "L", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CTA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423970_England_20200320_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424002_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "KT", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "AMA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424002_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424014_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "R", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "KR", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CGT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "ARG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424014_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424019_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "KAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424019_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424031_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCM", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424031_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424046_England_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000524148966032984,
"Nucleotide GTR":0.0005225004278691136,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "R", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AGG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424046_England_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424069_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "SG", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "RGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424069_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424094_England_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "ND", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "RAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424094_England_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424136_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243997344465805,
"Nucleotide GTR":0.0005227504075731499,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGT", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAT", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424136_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424163_England_20200321_null_21":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAA", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424163_England_20200321_null_21",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424203_Washington_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000524372165775583,
"Nucleotide GTR":0.0005227229256103387,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAA", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424203_Washington_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424226_Washington_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005241489660026847,
"Nucleotide GTR":0.000522500427838908,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "S", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AGT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424226_Washington_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424231_Washington_20200321_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0005243350389140393,
"Nucleotide GTR":0.0005226859155191253,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAT", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424231_Washington_20200321_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424242_Washington_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000524484455227562,
"Nucleotide GTR":0.0005228348618927812,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGT", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424242_Washington_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
]
},
"epi_isl_424256_Washington_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005245079244180706,
"Nucleotide GTR":0.0005228582572686712,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "I", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ATT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424256_Washington_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424275_Washington_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002100163556247087,
"Nucleotide GTR":0.002093558182589578,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "K", "A", "T", "F", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "AAA", "GCT", "ACC", "TTT", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424275_Washington_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424279_Washington_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242652227963367,
"Nucleotide GTR":0.0005226163189850562,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "A", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GCA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424279_Washington_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424280_Washington_20200323_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005241870537504774,
"Nucleotide GTR":0.000522538395794219,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "H", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "CAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424280_Washington_20200323_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242420089663696,
"Nucleotide GTR":0.0005225931781665561,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "V", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GTT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424304_Washington_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244052356458454,
"Nucleotide GTR":0.0005227558914702018,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "M", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "ATG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424304_Washington_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424315_Idaho_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244192160719607,
"Nucleotide GTR":0.0005227698279254851,
"amino-acid": [
["TPAS", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "L", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "D", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["-CA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "CTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GAT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424315_Idaho_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424326_Washington_20200320_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005241625936077926,
"Nucleotide GTR":0.0005225140125828672,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "E", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GAA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424326_Washington_20200320_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424344_Rome_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000524286311351465,
"Nucleotide GTR":0.000522637341213071,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCT", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424344_Rome_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424345_Mexico_City_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "PA", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTT", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "SCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424345_Mexico_City_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424346_Alaska_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005242652307534491,
"Nucleotide GTR":0.0005226163269171423,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGC", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424346_Alaska_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424352_Anhui_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000200268530414216,
"Nucleotide GTR":0.0001996386516263037,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "L", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "TTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424352_Anhui_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424377_Reykjavik_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "Y", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "TAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424377_Reykjavik_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424378_Reykjavik_20200319_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001049210958971815,
"Nucleotide GTR":0.001045911011018261,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "R", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "S", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGT", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CGT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "AGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424378_Reykjavik_20200319_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424396_Reykjavik_20200319_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0005242420154670771,
"Nucleotide GTR":0.0005225931846468176,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "L", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TTA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424396_Reykjavik_20200319_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424413_Reykjavik_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243263785061408,
"Nucleotide GTR":0.0005226772823496915,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTG", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424413_Reykjavik_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424415_Reykjavik_20200319_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005242536000006772,
"Nucleotide GTR":0.0005226047327450779,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCT", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424415_Reykjavik_20200319_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424420_Reykjavik_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "V", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GTT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424420_Reykjavik_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424429_Reykjavik_20200319_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "C", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "TGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424429_Reykjavik_20200319_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424496_Reykjavik_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005244052300113695,
"Nucleotide GTR":0.0005227558858534475,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "D", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GAT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424496_Reykjavik_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424501_Reykjavik_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005245336199863624,
"Nucleotide GTR":0.0005228838720200058,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "V", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GTT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424501_Reykjavik_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424532_Reykjavik_20200320_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "I", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ATT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424532_Reykjavik_20200320_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424591_Reykjavik_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005245221346867553,
"Nucleotide GTR":0.0005228724228436294,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "Y", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "TAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424591_Reykjavik_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424592_Reykjavik_20200328_null_16":{
"Global MG94xREV":0.0005242441045296394,
"Nucleotide GTR":0.0005225952671389204,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "D", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAC", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424592_Reykjavik_20200328_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424602_Reykjavik_20200327_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005242420770835485,
"Nucleotide GTR":0.0005225932460694952,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "F", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TTC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424602_Reykjavik_20200327_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424622_Reykjavik_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005245474488241808,
"Nucleotide GTR":0.0005228976573637625,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "I", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "C", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ATT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "TGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424622_Reykjavik_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424636_Li_ge_20200403_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "S", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "AGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424636_Li_ge_20200403_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424644_Li_ge_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "F", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "TTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424644_Li_ge_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424645_Li_ge_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005245227681422719,
"Nucleotide GTR":0.0005228730543068211,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "F", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATT", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "TTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424645_Li_ge_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424672_Puebla_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "S", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AGT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424672_Puebla_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424673_CDMX_20200312_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "I", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ATT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424673_CDMX_20200312_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424934_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243873053796913,
"Nucleotide GTR":0.0005227380175978018,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "F", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "TTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424934_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424956_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243807041327584,
"Nucleotide GTR":0.0005227314371129197,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "R", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "CGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424956_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424961_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242314703402475,
"Nucleotide GTR":0.0005225826726862156,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "F", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TTT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424961_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425138_Duesseldorf_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242603390168543,
"Nucleotide GTR":0.0005226114505658964,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "L", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TTA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425138_Duesseldorf_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425203_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001049101124946306,
"Nucleotide GTR":0.001045801522439552,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "P", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAT", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CCT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425203_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425208_Comunitat_Valenciana_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241626620095668,
"Nucleotide GTR":0.0005225140807695067,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "N", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "AAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425208_Comunitat_Valenciana_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425216_Comunitat_Valenciana_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242536000006772,
"Nucleotide GTR":0.0005226047327450779,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGT", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425216_Comunitat_Valenciana_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425221_Comunitat_Valenciana_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005243125922095364,
"Nucleotide GTR":0.0005226635394133481,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "D", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAT", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425221_Comunitat_Valenciana_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425231_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241625935784312,
"Nucleotide GTR":0.0005225140125535981,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "E", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GAG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425231_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425248_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242652307534491,
"Nucleotide GTR":0.0005226163269171423,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAC", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425248_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425278_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242420770835485,
"Nucleotide GTR":0.0005225932460694952,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "L", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CTC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425278_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425350_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243356662137109,
"Nucleotide GTR":0.0005226865408458321,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTT", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425350_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425352_England_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005243375086261768,
"Nucleotide GTR":0.0005226883774635964,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "V", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GTC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425352_England_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425379_England_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005242259192945486,
"Nucleotide GTR":0.0005225771390995054,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGG", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425379_England_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425398_England_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005245024861874355,
"Nucleotide GTR":0.000522852836142202,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGT", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425398_England_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425402_England_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244215738424829,
"Nucleotide GTR":0.0005227721782804161,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "L", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TTA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425402_England_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425403_England_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005240762668125478,
"Nucleotide GTR":0.0005224279573001609,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "P", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "CCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425403_England_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425409_England_20200317_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "F", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TTT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425409_England_20200317_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425412_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242046155743482,
"Nucleotide GTR":0.0005225559023831492,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "L", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "I", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CTA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "ATT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425412_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425421_England_20200314_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005241626619116041,
"Nucleotide GTR":0.0005225140806718514,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "E", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GAG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425421_England_20200314_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425437_England_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005243554446537256,
"Nucleotide GTR":0.0005227062570792692,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "S", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "TCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425437_England_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425439_England_20200101_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "S", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "AGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425439_England_20200101_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425442_England_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "F", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TTT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425442_England_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425443_England_20200401_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATT", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425443_England_20200401_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425451_England_20200401_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0005242420155667044,
"Nucleotide GTR":0.000522593184746131,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "I", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ATT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425451_England_20200401_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425480_England_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000524808930388206,
"Nucleotide GTR":0.0005231583165235372,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAC", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425480_England_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425485_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002738235339937886,
"Nucleotide GTR":0.0002729623121366297,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "C", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "TGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425485_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425493_England_20200318_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005250188144925991,
"Nucleotide GTR":0.0005233675405065175,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "A", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCT", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "GCA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425493_England_20200318_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425498_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000524962688951524,
"Nucleotide GTR":0.0005233115914898706,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "I", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "ATT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425498_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425518_England_20200320_null_4":{
"Global MG94xREV":0.000524232131931839,
"Nucleotide GTR":0.0005225833321969886,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "D", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAT", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425518_England_20200320_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425539_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241134253684481,
"Nucleotide GTR":0.0005224649989860467,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "R", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CGT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAG", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425539_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425554_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005248627580982825,
"Nucleotide GTR":0.0005232119749362574,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "V", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "I", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "GTT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "ATT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425554_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425596_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "I", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ATA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425596_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425610_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005249055149478508,
"Nucleotide GTR":0.0005232545973082199,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "S", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "TCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425610_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425633_England_20200329_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0005241019042367743,
"Nucleotide GTR":0.0005224535140903037,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "G", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "R", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "GGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CGT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425633_England_20200329_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425708_Scotland_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243173947787471,
"Nucleotide GTR":0.000522668326877657,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "I", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAT", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "ATT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425708_Scotland_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425734_Scotland_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005271737195225745,
"Nucleotide GTR":0.0005255156679915363,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "G", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GGA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTG", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425734_Scotland_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425747_Scotland_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243617801926529,
"Nucleotide GTR":0.0005227125726918432,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "Q", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAA", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425747_Scotland_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425759_Scotland_20200313_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0001928475790401494,
"Nucleotide GTR":0.0001922410404138042,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "V", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GTT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425759_Scotland_20200313_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425763_Scotland_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005248036438761385,
"Nucleotide GTR":0.000523153046638455,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "L", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTA", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425763_Scotland_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425769_Scotland_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTT", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425769_Scotland_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425776_Scotland_20200313_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "G", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GGA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425776_Scotland_20200313_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425794_Scotland_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242652227963367,
"Nucleotide GTR":0.0005226163189850562,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "P", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CCT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425794_Scotland_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425897_Scotland_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244291797315795,
"Nucleotide GTR":0.0005227797602476902,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAT", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425897_Scotland_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425914_Scotland_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241625936060553,
"Nucleotide GTR":0.0005225140125811356,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "Y", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TAT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425914_Scotland_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425920_Scotland_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000524242009067954,
"Nucleotide GTR":0.0005225931782678213,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTT", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425920_Scotland_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425922_Scotland_20200323_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005241490349698095,
"Nucleotide GTR":0.0005225004965891191,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "V", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "GTT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425922_Scotland_20200323_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425950_Scotland_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243328134404642,
"Nucleotide GTR":0.0005226836970450448,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "V", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GTT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425950_Scotland_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425967_Scotland_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000524242009067954,
"Nucleotide GTR":0.0005225931782678213,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "Y", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "TAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425967_Scotland_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425975_Scotland_20200328_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005242420770835485,
"Nucleotide GTR":0.0005225932460694952,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "F", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "TTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425975_Scotland_20200328_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425988_Scotland_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244198848668132,
"Nucleotide GTR":0.0005227704946168629,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACG", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425988_Scotland_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426003_Scotland_20200330_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0005244716482275088,
"Nucleotide GTR":0.0005228220951729349,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "S", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "TCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426003_Scotland_20200330_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426009_Scotland_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242420770818443,
"Nucleotide GTR":0.0005225932460677958,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "L", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CTA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426009_Scotland_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426014_Scotland_20200401_null_15":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAT", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426014_Scotland_20200401_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426059_Idaho_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001050308930983183,
"Nucleotide GTR":0.001047005529719825,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "L", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "K", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "CTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCA", "AAA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426059_Idaho_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426090_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243499127184459,
"Nucleotide GTR":0.0005227007425428726,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "A", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "GCA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426090_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426094_Washington_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000524242009067954,
"Nucleotide GTR":0.0005225931782678213,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "F", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "TTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426094_Washington_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426096_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241625936060553,
"Nucleotide GTR":0.0005225140125811356,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "S", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "AGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426096_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426123_Washington_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244842397896949,
"Nucleotide GTR":0.000522834647132504,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "I", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ATT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426123_Washington_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426161_Wisconsin_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "GV", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GKG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426161_Wisconsin_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426187_South_Korea_20200212_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005242420770818443,
"Nucleotide GTR":0.0005225932460677958,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "F", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TTC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426187_South_Korea_20200212_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426294_New_York_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244955088069347,
"Nucleotide GTR":0.0005228458807067561,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426294_New_York_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426514_Arizona_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244594751645945,
"Nucleotide GTR":0.0005228099603963848,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGT", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426514_Arizona_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426534_Arizona_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005241951816511371,
"Nucleotide GTR":0.0005225464981312408,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "G", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GGA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426534_Arizona_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426557_Arizona_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005245681909708622,
"Nucleotide GTR":0.0005229183342728449,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "G", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "GGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426557_Arizona_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426624_New_York_20200401_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005241109664303169,
"Nucleotide GTR":0.0005224625477816962,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACC", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426624_New_York_20200401_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426627_Louisiana_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243157739938325,
"Nucleotide GTR":0.000522666711190388,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "K", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "AAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426627_Louisiana_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426647_Victoria_20200320_null_14":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAC", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426647_Victoria_20200320_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426667_Victoria_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241951816528813,
"Nucleotide GTR":0.0005225464981329785,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTG", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426667_Victoria_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426678_Victoria_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "LF", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTK", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426678_Victoria_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426693_Victoria_20200323_null_11":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCT", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426693_Victoria_20200323_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426698_Victoria_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243002213795412,
"Nucleotide GTR":0.0005226512074917299,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "CTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426698_Victoria_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426719_Victoria_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242885658079619,
"Nucleotide GTR":0.0005226395885789179,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "I", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ATC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426719_Victoria_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001574518234482715,
"Nucleotide GTR":0.001569566105283832,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "C", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "S", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "S", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "F", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "TGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "TCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "TCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "TTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426757_Victoria_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241858429081053,
"Nucleotide GTR":0.0005225371887601539,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "K", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "AAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426757_Victoria_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426783_Victoria_20200323_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000524349024675905,
"Nucleotide GTR":0.0005226998572933773,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAG", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426783_Victoria_20200323_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426784_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "GV", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GKT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426784_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426792_Victoria_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242206319748872,
"Nucleotide GTR":0.0005225718684093684,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "A", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GCA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426792_Victoria_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426804_Victoria_20200323_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "I", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ATA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426804_Victoria_20200323_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426829_Victoria_20200325_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCT", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426829_Victoria_20200325_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426830_Victoria_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "LF", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTK", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426830_Victoria_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426839_Victoria_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244132634381629,
"Nucleotide GTR":0.0005227638940137392,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "C", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "TGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426839_Victoria_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426853_Victoria_20200325_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005242104391959891,
"Nucleotide GTR":0.0005225617076885044,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "V", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GTT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426853_Victoria_20200325_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426871_Victoria_20200326_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0005242885659369826,
"Nucleotide GTR":0.0005226395887075316,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "S", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "TCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426871_Victoria_20200326_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426879_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "AG", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GST", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426879_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426884_Czech_Republic_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242986946680871,
"Nucleotide GTR":0.0005226496855820448,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTT", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426884_Czech_Republic_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426888_Czech_Republic_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005242885719067953,
"Nucleotide GTR":0.000522639594658568,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "L", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CTT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426888_Czech_Republic_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426898_Northern_territory_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242091567346302,
"Nucleotide GTR":0.0005225604292607055,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "K", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426898_Northern_territory_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426912_Victoria_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242885657814674,
"Nucleotide GTR":0.0005226395885525061,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGT", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426912_Victoria_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426918_Victoria_20200329_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGT", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426918_Victoria_20200329_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427003_Victoria_20200328_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "Y", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "TAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427003_Victoria_20200328_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427004_Victoria_20200327_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0005241516486270177,
"Nucleotide GTR":0.0005225031020259283,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "Y", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "G", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TAC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "GGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427004_Victoria_20200327_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427018_Victoria_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000524494344337391,
"Nucleotide GTR":0.0005228447198996684,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "Y", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "TAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427018_Victoria_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427041_Victoria_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242883656884773,
"Nucleotide GTR":0.000522639389088842,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "S", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "TCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427041_Victoria_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427042_Victoria_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243209368415875,
"Nucleotide GTR":0.0005226718578001032,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "D", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "C", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GAC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "TGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427042_Victoria_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427063_Victoria_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00052422811314846,
"Nucleotide GTR":0.0005225793260533707,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGC", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427063_Victoria_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427086_Victoria_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000524320998329008,
"Nucleotide GTR":0.000522671919094136,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTT", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427086_Victoria_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427105_Victoria_20200404_null_18":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCT", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427105_Victoria_20200404_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427123_Victoria_20200405_null_161":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAT", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427123_Victoria_20200405_null_161",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427132_Victoria_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001049528637409927,
"Nucleotide GTR":0.00104622769030334,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "K", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "TTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "AAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427132_Victoria_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427135_Victoria_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005241741878012327,
"Nucleotide GTR":0.0005225255703105848,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "N", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "AAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427135_Victoria_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427147_Victoria_20200406_null_26":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "S", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "TCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427147_Victoria_20200406_null_26",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427149_Victoria_20200408_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "V", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "GTT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427149_Victoria_20200408_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427160_Victoria_20200331_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0005244845165360397,
"Nucleotide GTR":0.0005228349230084341,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "L", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TTA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427160_Victoria_20200331_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427177_Washington_20200326_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0005242536000024465,
"Nucleotide GTR":0.0005226047327468413,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "V", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GTT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427177_Washington_20200326_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427181_Washington_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244844552025864,
"Nucleotide GTR":0.000522834861867884,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "M", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ATG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427181_Washington_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427190_Washington_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241489660044184,
"Nucleotide GTR":0.0005225004278406371,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTG", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427190_Washington_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427208_Washington_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005242534520220071,
"Nucleotide GTR":0.0005226045852318267,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "V", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GTT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427208_Washington_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427212_Washington_20200327_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0005242420154382628,
"Nucleotide GTR":0.0005225931846180942,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "A", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GCC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427212_Washington_20200327_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427225_Washington_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "F", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "TTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427225_Washington_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427240_Washington_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001051370884841778,
"Nucleotide GTR":0.001048064143551867,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "S", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACA", "AGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427240_Washington_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427252_Washington_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241952432838804,
"Nucleotide GTR":0.0005225465595701383,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "A", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "GCG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427252_Washington_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427285_Minnesota_20200322_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "TI", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "AYC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427285_Minnesota_20200322_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427341_Liege_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242536000006772,
"Nucleotide GTR":0.0005226047327450779,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "F", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "TTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427341_Liege_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427355_Liege_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242091567346302,
"Nucleotide GTR":0.0005225604292607055,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACA", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427355_Liege_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427379_Liege_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005241951816511371,
"Nucleotide GTR":0.0005225464981312408,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "G", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GGA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427379_Liege_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427391_Istanbul_20200413_null_28":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATT", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427391_Istanbul_20200413_null_28",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427396_New_Taipei_City_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243098311668615,
"Nucleotide GTR":0.0005226607870546243,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "D", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "I", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GAC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "ATC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427396_New_Taipei_City_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427443_Wisconsin_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242090885128793,
"Nucleotide GTR":0.0005225603612535239,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "I", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "ATT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427443_Wisconsin_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427478_New_York_20200401_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "F", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TTT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427478_New_York_20200401_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427481_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244194357216579,
"Nucleotide GTR":0.0005227700468843461,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "S", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "AGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427481_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427482_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244052970097334,
"Nucleotide GTR":0.0005227559526410894,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTA", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427482_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427483_New_York_20200401_null_9":{
"Global MG94xREV":0.0005243266024472148,
"Nucleotide GTR":0.0005226775055864326,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "V", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "GTG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427483_New_York_20200401_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427514_New_York_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242420154382628,
"Nucleotide GTR":0.0005225931846180942,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTC", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427514_New_York_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427550_New_York_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "MV", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "RTG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427550_New_York_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427554_New_York_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "SF", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TYT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427554_New_York_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427556_New_York_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005245861100015616,
"Nucleotide GTR":0.0005229361969451271,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "M", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "F", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATG", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "TTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427556_New_York_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427567_New_York_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243266024489358,
"Nucleotide GTR":0.0005226775055881481,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAG", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427567_New_York_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427569_New_York_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005246817927731175,
"Nucleotide GTR":0.0005230315787779979,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "I", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ATT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427569_New_York_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427611_New_York_20200316_null_18":{
"Global MG94xREV":0.000524484455227562,
"Nucleotide GTR":0.0005228348618927812,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "I", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ATT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427611_New_York_20200316_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427619_Alaska_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005247508467426401,
"Nucleotide GTR":0.0005231004155609743,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "E", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAA", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427619_Alaska_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427622_Alaska_20200324_null_38":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "L", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "CTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427622_Alaska_20200324_null_38",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427629_New_York_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005245338369261955,
"Nucleotide GTR":0.0005228840882775255,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCT", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427629_New_York_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427631_New_York_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00052439908140672,
"Nucleotide GTR":0.0005227497565872106,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACA", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427631_New_York_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427632_New_York_20200406_null_16":{
"Global MG94xREV":0.0005242883656884773,
"Nucleotide GTR":0.000522639389088842,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTT", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427632_New_York_20200406_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427636_New_York_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005245152739851701,
"Nucleotide GTR":0.0005228655837201256,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "TTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427636_New_York_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427640_New_York_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244608660199671,
"Nucleotide GTR":0.0005228113468772799,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427640_New_York_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427644_New_South_Wales_20200302_null_25":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "C", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "TGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427644_New_South_Wales_20200302_null_25",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427655_New_South_Wales_20200311_null_57":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427655_New_South_Wales_20200311_null_57",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427665_New_South_Wales_20200311_null_193":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "D", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GAC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427665_New_South_Wales_20200311_null_193",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427680_New_South_Wales_20200322_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0005240762589387314,
"Nucleotide GTR":0.0005224279494511093,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "T", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ACT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427680_New_South_Wales_20200322_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427681_New_South_Wales_20200319_null_9":{
"Global MG94xREV":0.0005242536681329184,
"Nucleotide GTR":0.0005226048006630312,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "L", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CTT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427681_New_South_Wales_20200319_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427712_New_South_Wales_20200320_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005242536000006772,
"Nucleotide GTR":0.0005226047327450779,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCT", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427712_New_South_Wales_20200320_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427717_New_South_Wales_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005242885719067953,
"Nucleotide GTR":0.000522639594658568,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "I", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ATT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427717_New_South_Wales_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427723_New_South_Wales_20200319_null_53":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "R", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CGT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427723_New_South_Wales_20200319_null_53",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427725_New_South_Wales_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242243526465719,
"Nucleotide GTR":0.0005225755773789043,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "R", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "A", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CGT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GCG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427725_New_South_Wales_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427726_New_South_Wales_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005246819396350768,
"Nucleotide GTR":0.0005230317251780513,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTA", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427726_New_South_Wales_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427734_New_South_Wales_20200318_null_37":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427734_New_South_Wales_20200318_null_37",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427746_New_South_Wales_20200321_null_9":{
"Global MG94xREV":0.0005242885719067953,
"Nucleotide GTR":0.000522639594658568,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "S", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "TCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427746_New_South_Wales_20200321_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427753_New_South_Wales_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005243123477493828,
"Nucleotide GTR":0.0005226632957220632,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "F", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "TTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427753_New_South_Wales_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427768_New_South_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244852889321726,
"Nucleotide GTR":0.0005228356929752484,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "V", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GTT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427768_New_South_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427773_New_South_Wales_20200325_null_12":{
"Global MG94xREV":0.0005244584550718605,
"Nucleotide GTR":0.0005228089435120174,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATT", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427773_New_South_Wales_20200325_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427801_New_South_Wales_20200326_null_305":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427801_New_South_Wales_20200326_null_305",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427805_New_South_Wales_20200320_null_439":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427805_New_South_Wales_20200320_null_439",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427808_New_South_Wales_20200324_null_1448":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427808_New_South_Wales_20200324_null_1448",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427810_South_Korea_20200218_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241951815562729,
"Nucleotide GTR":0.0005225464980366741,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "R", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AGG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427810_South_Korea_20200218_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427813_South_Korea_20200218_null_5464":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427813_South_Korea_20200218_null_5464",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427815_Saint_Petersburg_20200407_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAT", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427815_Saint_Petersburg_20200407_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428148_V_sterbotten_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005245547050482187,
"Nucleotide GTR":0.0005229048907657353,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATT", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428148_V_sterbotten_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, 312, 313, 314, 315, 316, 317, 318, 319, 320, 321, 322, 323, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 334, 335, 336, 337, 338, 339, 340, 341, 342, 343, 344, 345, 346, 347, 348, 349, 350, 351, 352, 353, 354, 355, 356, 357, 358, 359, 360, 361, 362, 363, 364, 365, 366, 367, 368, 369, 370, 371, 372, 373, 374, 375, 376, 377, 378, 379, 380, 381, 382, 383, 384, 385, 386, 387, 388, 389, 390, 391, 392, 393, 394, 395, 396, 397, 398, 399, 400, 401, 402, 403, 404, 405, 406, 407, 408, 409, 410, 411, 412, 413, 414, 415, 416, 417, 418, 419, 420, 421, 422, 423, 424, 425, 426, 427, 428, 429, 430, 431, 432, 433, 434, 435, 436, 437, 438, 439, 440, 441, 442, 443, 444, 445, 446, 447, 448, 449, 450, 451, 452, 453, 454, 455, 456, 457, 458, 459, 460, 461, 462, 463, 464, 465, 466, 467, 468, 469, 470, 471, 472, 473, 474, 475, 476, 477, 478, 479, 480, 481, 482, 483, 484, 485, 486, 487, 488, 489, 490, 491, 492, 493, 494, 495, 496, 497, 498, 499, 500, 501, 502, 503, 504, 505, 506, 507, 508, 509, 510, 511, 512, 513, 514, 515, 516, 517, 518, 519, 520, 521, 522, 523, 524, 525, 526, 527, 528, 529, 530, 531, 532, 533, 534, 535, 536, 537, 538, 539, 540, 541, 542, 543, 544, 545, 546, 547, 548, 549, 550, 551, 552, 553, 554, 555, 556, 557, 558, 559, 560, 561, 562, 563, 564, 565, 566, 567, 568, 569, 570, 571, 572, 573, 574, 575, 576, 577, 578, 579, 580, 581, 582, 583, 584, 585, 586, 587, 588, 589, 590, 591, 592, 593, 594, 595, 596, 597, 598, 599, 600, 601, 602, 603, 604, 605, 606, 607, 608, 609, 610, 611, 612, 613, 614, 615, 616, 617, 618, 619, 620, 621, 622, 623, 624, 625, 626, 627, 628, 629, 630, 631, 632, 633, 634, 635, 636, 637]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":13870.58477991338,
"Equilibrium frequencies": [
[0.03083976362284491],
[0.01739858552719252],
[0.01458200062910172],
[0.03909317951018933],
[0.01904573942716717],
[0.01074485947443272],
[0.009005418708946625],
[0.02414280859724218],
[0.01597762923923269],
[0.009013951995229919],
[0.007554720667361349],
[0.02025360296645989],
[0.02523829713332353],
[0.01423845774581589],
[0.01193345283629091],
[0.03199263432854734],
[0.01554814671087001],
[0.00877165479108994],
[0.007351647953336597],
[0.01970918123278178],
[0.009602082378194288],
[0.005417118416965033],
[0.004540163569081185],
[0.01217181605777001],
[0.008055266782896298],
[0.004544465702803126],
[0.003808780985881641],
[0.01021103774326468],
[0.0127241165451334],
[0.007178447690969908],
[0.006016358547198969],
[0.01612937693980884],
[0.03418546668032838],
[0.01928610002004342],
[0.01616395322399359],
[0.04333426811947762],
[0.02111194815083924],
[0.01191053342821134],
[0.009982386537783121],
[0.02676198134862464],
[0.0177109889254736],
[0.009991845571823678],
[0.008374307105971437],
[0.02245084877543053],
[0.02797631578084932],
[0.01578314051954303],
[0.01322807331811386],
[0.0354634084822987],
[0.01549607287990722],
[0.03481839129108454],
[0.01696311264808481],
[0.009569923097480577],
[0.008020687912233678],
[0.02150282394875144],
[0.008028288094785552],
[0.006728621810422726],
[0.01803889788387938],
[0.02247852224144814],
[0.01268150095200558],
[0.01062854532462323],
[0.02849428146906309]
],
"Log Likelihood":-6341.17943291512,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[1.164079606840254, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":593
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":14881.54184486731,
"Equilibrium frequencies": [
[0.2983476602018732],
[0.1840988585478508],
[0.214151629939825],
[0.303401851310451]
],
"Log Likelihood":-6440.71962899545,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.2304849019629826,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.0930326114954219,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.02660415428179359,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":2.218379411814487,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":0.2760598521180001
},
"display order":0,
"estimated parameters":999
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-04-20/sequences.nsp2.compressed.fas",
"number of sequences":497,
"number of sites":638,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_414525_England_20200302_null_1,epi_isl_422099_Wales_20200328_null_1,epi_isl_424019_England_20200319_null_1,epi_isl_424002_England_20200320_null_1,epi_isl_423916_England_20200318_null_1,epi_isl_423782_England_20200323_null_1,epi_isl_423377_England_20200328_null_1,epi_isl_423129_England_20200323_null_1,epi_isl_423099_England_20200323_null_1,epi_isl_423091_England_20200324_null_1,epi_isl_423087_England_20200323_null_1,epi_isl_418259_Abruzzo_20200314_null_1,epi_isl_422094_Wales_20200325_null_1,epi_isl_421850_England_20200327_null_1,(epi_isl_413485_Anhui_20200124_null_1,epi_isl_423179_England_20200324_null_1)Node975,(epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_4,epi_isl_423378_England_20200328_null_1)Node972,(epi_isl_414579_Santiago_20200303_null_1,epi_isl_425759_Scotland_20200313_null_4)Node966,epi_isl_425421_England_20200314_null_3,epi_isl_425794_Scotland_20200325_null_1,epi_isl_422407_Taipei_20200304_null_1,(epi_isl_419961_Victoria_20200322_null_1,epi_isl_418946_Illinois_20200312_null_2)Node474,epi_isl_424344_Rome_20200304_null_1,(((epi_isl_423649_England_20200322_null_1,epi_isl_422667_Netherlands_20200316_null_5,epi_isl_422006_England_20200403_null_1,epi_isl_423228_England_20200325_null_6,epi_isl_425950_Scotland_20200326_null_1,epi_isl_423722_England_20200323_null_1,epi_isl_423665_England_20200323_null_1,epi_isl_425398_England_20200314_null_1,epi_isl_423684_England_20200320_null_2,epi_isl_423824_England_20200322_null_1,epi_isl_427805_New_South_Wales_20200320_null_439,epi_isl_421934_England_20200331_null_1,epi_isl_422436_England_20200327_null_1,epi_isl_423745_England_20200323_null_1,epi_isl_423414_England_20200327_null_1,epi_isl_421898_England_20200320_null_1,epi_isl_423469_England_20200331_null_1,epi_isl_421892_England_20200327_null_3,epi_isl_423266_England_20200325_null_1,epi_isl_417409_New_South_Wales_20200316_null_1,epi_isl_425352_England_20200317_null_2,epi_isl_423152_England_20200324_null_1,epi_isl_423213_England_20200325_null_1,epi_isl_425379_England_20200318_null_2,epi_isl_423491_England_20200331_null_1,epi_isl_425402_England_20200313_null_1,(epi_isl_423970_England_20200320_null_3,epi_isl_425412_England_20200317_null_1)Node396,epi_isl_423901_England_20200318_null_2,epi_isl_422091_Wales_20200328_null_3,epi_isl_427063_Victoria_20200331_null_1)Node368,epi_isl_427734_New_South_Wales_20200318_null_37)Node367,epi_isl_422154_Wales_20200325_null_1)Node366,((epi_isl_422224_Wales_20200329_null_3,epi_isl_427815_Saint_Petersburg_20200407_null_4)Node353,epi_isl_419587_Luxembourg_20200311_null_1)Node352,(epi_isl_422634_Zuid_Holland_20200331_null_1,epi_isl_424203_Washington_20200320_null_1)Node348,epi_isl_425518_England_20200320_null_4,(epi_isl_427629_New_York_20200330_null_3,epi_isl_422670_Netherlands_20200317_null_1,epi_isl_427105_Victoria_20200404_null_18)Node358,(epi_isl_422703_Netherlands_20200316_null_2,epi_isl_424429_Reykjavik_20200319_null_3)Node363,(epi_isl_421711_New_York_20200318_null_1,epi_isl_427132_Victoria_20200405_null_1)Node343,epi_isl_422839_Netherlands_20200310_null_1,(epi_isl_426514_Arizona_20200311_null_1,epi_isl_421666_India_20200310_null_1,epi_isl_422562_New_York_20200322_null_1)Node336,epi_isl_417432_Cork_20200308_null_1,(epi_isl_423522_England_20200330_null_1,epi_isl_426884_Czech_Republic_20200327_null_1)Node332,(epi_isl_417521_Taoyuan_20200310_null_6,(epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1,epi_isl_427147_Victoria_20200406_null_26)Node311,epi_isl_427655_New_South_Wales_20200311_null_57,epi_isl_424280_Washington_20200323_null_4,epi_isl_416373_Shanghai_20200207_null_1,epi_isl_416382_Shanghai_20200208_null_1,epi_isl_427086_Victoria_20200402_null_2)Node300,((epi_isl_421671_India_20200312_null_3,epi_isl_416543_Dasman_20200302_null_1,epi_isl_427644_New_South_Wales_20200302_null_25,epi_isl_421665_India_20200310_null_1,epi_isl_421663_India_20200310_null_1,epi_isl_416541_Dasman_20200302_null_1,epi_isl_415579_British_Columbia_20200302_null_1,epi_isl_417444_Gilgit_20200304_null_1)Node316,epi_isl_417877_Kostoliste_20200306_null_1)Node315,(epi_isl_428148_V_sterbotten_20200318_null_1,epi_isl_427773_New_South_Wales_20200325_null_12,epi_isl_422582_Netherlands_20200330_null_1,epi_isl_418650_Li_ge_20200322_null_1,epi_isl_427391_Istanbul_20200413_null_28)Node282,(epi_isl_416748_ARA_20200304_null_1,epi_isl_424645_Li_ge_20200404_null_1,epi_isl_422387_Greater_Accra_20200325_null_1,epi_isl_423571_England_20200402_null_1)Node291,(epi_isl_421362_New_York_20200317_null_1,epi_isl_419929_Victoria_20200321_null_1,epi_isl_422194_Wales_20200324_null_4)Node276,(epi_isl_422419_Taipei_20200319_null_1,epi_isl_423813_England_20200323_null_1)Node273,(epi_isl_418042_Minnesota_20200313_null_1,epi_isl_421336_Wisconsin_20200324_null_1)Node270,(epi_isl_421419_New_York_20200318_null_2,epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1,epi_isl_417363_Washington_20200314_null_1)Node265,((epi_isl_420184_South_Yorkshire_20200327_null_1,epi_isl_422088_Wales_20200330_null_1)Node464,epi_isl_414482_USA_20200218_null_1)Node463,epi_isl_422113_Wales_20200328_null_1,(epi_isl_422215_Wales_20200329_null_1,epi_isl_418691_England_20200317_null_1,epi_isl_422195_Wales_20200326_null_3,epi_isl_421826_England_20200323_null_1,epi_isl_420488_England_20200320_null_1,epi_isl_421833_England_20200326_null_1,epi_isl_427665_New_South_Wales_20200311_null_193,epi_isl_422087_Wales_20200328_null_1,epi_isl_420970_Wales_20200322_null_1,epi_isl_419499_Wales_20200320_null_1,epi_isl_427042_Victoria_20200318_null_1,epi_isl_422056_Wales_20200328_null_1,epi_isl_427396_New_Taipei_City_20200323_null_1)Node434,(epi_isl_418800_Gierle_20200310_null_1,epi_isl_416700_Washington_20200313_null_1)Node459,(epi_isl_417338_ARA_20200307_null_1,epi_isl_425443_England_20200401_null_4)Node262,(epi_isl_422384_Greater_Accra_20200324_null_2,epi_isl_425596_England_20200324_null_1)Node259,(epi_isl_413609_USA_20200221_null_1,epi_isl_424591_Reykjavik_20200328_null_2)Node256,(epi_isl_417448_Washington_20200314_null_1,epi_isl_420729_England_20200328_null_1)Node470,epi_isl_424231_Washington_20200321_null_7,(epi_isl_424961_New_York_20200401_null_1,epi_isl_425442_England_20200331_null_2)Node253,(epi_isl_423258_England_20200323_null_5,epi_isl_424352_Anhui_20200310_null_1)Node491,((epi_isl_421895_England_20200327_null_1,epi_isl_423264_England_20200325_null_3,epi_isl_424136_England_20200320_null_1,epi_isl_423399_England_20200329_null_2,epi_isl_427123_Victoria_20200405_null_161)Node480,epi_isl_421775_England_20200325_null_1)Node479,epi_isl_418385_Finland_20200313_null_1,(epi_isl_421487_Portugal_20200322_null_2,epi_isl_424256_Washington_20200322_null_1)Node250,(epi_isl_424420_Reykjavik_20200319_null_1,epi_isl_427768_New_South_Wales_20200323_null_1)Node247,epi_isl_423012_Washington_20200319_null_1,epi_isl_423092_England_20200324_null_1,(epi_isl_419818_Victoria_20200317_null_1,epi_isl_424672_Puebla_20200311_null_1)Node244,epi_isl_425922_Scotland_20200323_null_4,epi_isl_425967_Scotland_20200329_null_1,epi_isl_419229_Hong_Kong_20200217_null_1,epi_isl_422982_USA_20200316_null_2,(epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1,epi_isl_427481_New_York_20200401_null_1)Node241,epi_isl_421969_England_20200401_null_1,epi_isl_422036_Wales_20200329_null_1,epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1,epi_isl_417346_Washington_20200312_null_6,epi_isl_422257_Wales_20200324_null_1,epi_isl_422260_Wales_20200327_null_1,(epi_isl_419946_Victoria_20200321_null_1,epi_isl_426627_Louisiana_20200406_null_1)Node238,(epi_isl_417030_New_South_Wales_20200124_null_1,epi_isl_427569_New_York_20200315_null_1)Node235,epi_isl_418927_Washington_20200316_null_1,epi_isl_420456_Western_Australia_20200222_null_3,epi_isl_427208_Washington_20200327_null_2,epi_isl_416408_Shanghai_20200212_null_1,epi_isl_427443_Wisconsin_20200409_null_1,epi_isl_427285_Minnesota_20200322_null_4,epi_isl_413522_Kerala_20200127_null_1,epi_isl_423858_England_20200318_null_4,(epi_isl_419920_Victoria_20200320_null_2,epi_isl_427004_Victoria_20200327_null_6)Node548,epi_isl_426792_Victoria_20200324_null_1,((epi_isl_423564_England_20200401_null_1,epi_isl_425409_England_20200317_null_10)Node230,epi_isl_427478_New_York_20200401_null_3)Node229,(epi_isl_421736_Luxembourg_20200317_null_1,epi_isl_423393_England_20200330_null_1)Node226,epi_isl_420879_Queensland_20200325_null_1,epi_isl_418412_ARA_20200315_null_1,epi_isl_416480_Tbilisi_20200311_null_3,epi_isl_419746_Victoria_20200310_null_1,epi_isl_426898_Northern_territory_20200326_null_1,epi_isl_416348_Shanghai_20200206_null_3,(epi_isl_420485_England_20200318_null_1,epi_isl_426783_Victoria_20200323_null_3)Node223,epi_isl_423040_Bangkok_20200320_null_1,(epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1,epi_isl_422065_Wales_20200324_null_1)Node572,epi_isl_425763_Scotland_20200312_null_1,(epi_isl_422595_Netherlands_20200331_null_1,epi_isl_425138_Duesseldorf_20200319_null_1)Node220,epi_isl_416907_Selangor_20200220_null_1,epi_isl_427680_New_South_Wales_20200322_null_8,epi_isl_425350_England_20200318_null_1,(epi_isl_420319_Montigny_le_Tilleul_20200304_null_2,epi_isl_424636_Li_ge_20200403_null_3)Node588,epi_isl_422623_Netherlands_20200402_null_4,(epi_isl_416691_Washington_20200313_null_1,epi_isl_424673_CDMX_20200312_null_2)Node217,epi_isl_418809_Tokyo_20200201_null_4,epi_isl_421465_Portugal_20200319_null_1,epi_isl_427753_New_South_Wales_20200324_null_2,epi_isl_427746_New_South_Wales_20200321_null_9,(epi_isl_421615_New_York_20200320_null_2,epi_isl_422622_Netherlands_20200402_null_1,epi_isl_424378_Reykjavik_20200319_null_2,epi_isl_425439_England_20200101_null_5)Node210,epi_isl_424396_Reykjavik_20200319_null_6,epi_isl_419556_Georgia_20200229_null_2,epi_isl_427681_New_South_Wales_20200319_null_9,epi_isl_416334_Shanghai_20200206_null_1,epi_isl_426871_Victoria_20200326_null_7,(epi_isl_427636_New_York_20200405_null_1,epi_isl_427631_New_York_20200406_null_2,(epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1,epi_isl_421706_New_York_20200318_null_1)Node199,epi_isl_420057_Hauts_de_France_20200322_null_1,epi_isl_425897_Scotland_20200322_null_1,epi_isl_422394_Greater_Accra_20200327_null_1,epi_isl_419922_Victoria_20200320_null_1,epi_isl_420062_Ile_de_France_20200322_null_1,epi_isl_426839_Victoria_20200325_null_1,epi_isl_416509_Bretagne_20200306_null_1,epi_isl_422932_Zuid_Holland_20200323_null_1,(epi_isl_414630_Hauts_de_France_20200303_null_1,epi_isl_418237_Hauts_de_France_20200316_null_1)Node186,epi_isl_426678_Victoria_20200322_null_1,epi_isl_426003_Scotland_20200330_null_6,(epi_isl_426059_Idaho_20200323_null_1,epi_isl_424315_Idaho_20200320_null_1,epi_isl_427622_Alaska_20200324_null_38)Node178,epi_isl_427808_New_South_Wales_20200324_null_1448,epi_isl_424956_New_York_20200401_null_1,epi_isl_417939_California_20200318_null_1,epi_isl_417938_California_20200318_null_1,epi_isl_419864_Victoria_20200318_null_1,epi_isl_427550_New_York_20200314_null_1,epi_isl_427554_New_York_20200315_null_1,epi_isl_422430_Singapore_20200313_null_1,epi_isl_426161_Wisconsin_20200406_null_1,epi_isl_422124_Wales_20200329_null_1,epi_isl_427640_New_York_20200405_null_1,epi_isl_424501_Reykjavik_20200320_null_1,epi_isl_426294_New_York_20200311_null_1,epi_isl_426557_Arizona_20200401_null_1,epi_isl_424934_New_York_20200401_null_1,epi_isl_421726_New_York_20200318_null_1,epi_isl_420301_New_York_20200318_null_1,epi_isl_418964_Utah_20200314_null_2,epi_isl_421409_New_York_20200318_null_1,epi_isl_421622_New_York_20200320_null_1,epi_isl_427212_Washington_20200327_null_7,epi_isl_427482_New_York_20200401_null_1,epi_isl_423032_Washington_20200318_null_1,epi_isl_424242_Washington_20200321_null_1,epi_isl_417715_Reykjavik_20200304_null_1,epi_isl_424496_Reykjavik_20200320_null_2,epi_isl_418184_Wisconsin_20200318_null_1,epi_isl_420417_Saint_Ghislain_20200324_null_1,epi_isl_422620_Netherlands_20200402_null_1,epi_isl_422656_Netherlands_20200318_null_2,epi_isl_422408_Taipei_20200313_null_2,epi_isl_422509_New_York_20200320_null_1,epi_isl_427567_New_York_20200315_null_1,epi_isl_427611_New_York_20200316_null_18,epi_isl_420322_Elsene_20200305_null_4,epi_isl_427160_Victoria_20200331_null_5,epi_isl_421979_England_20200331_null_3,epi_isl_426090_Washington_20200325_null_1,epi_isl_426698_Victoria_20200324_null_1,(epi_isl_419822_Victoria_20200318_null_1,epi_isl_426804_Victoria_20200323_null_7)Node109,(epi_isl_424532_Reykjavik_20200320_null_5,epi_isl_424622_Reykjavik_20200328_null_1)Node112,epi_isl_423948_England_20200318_null_1,(epi_isl_427225_Washington_20200329_null_1,epi_isl_427556_New_York_20200315_null_1)Node117,epi_isl_427240_Washington_20200331_null_1,epi_isl_424304_Washington_20200324_null_1,epi_isl_424413_Reykjavik_20200319_null_1,epi_isl_427483_New_York_20200401_null_9,epi_isl_427514_New_York_20200403_null_1,epi_isl_426123_Washington_20200324_null_1,epi_isl_427181_Washington_20200326_null_1)Node62,(epi_isl_427018_Victoria_20200330_null_1,epi_isl_423486_England_20200331_null_2,epi_isl_427003_Victoria_20200328_null_4)Node205,epi_isl_417028_Utah_20200320_null_2,epi_isl_419816_Victoria_20200311_null_2,epi_isl_425216_Comunitat_Valenciana_20200316_null_1,epi_isl_412869_Seoul_20200130_null_1,epi_isl_423106_England_20200323_null_1,epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1,epi_isl_423089_England_20200323_null_1,(epi_isl_420509_England_20200323_null_1,epi_isl_420510_England_20200323_null_1)Node623,epi_isl_425988_Scotland_20200330_null_1,epi_isl_420610_ARA_20200323_null_1,epi_isl_419932_Victoria_20200321_null_1,epi_isl_425403_England_20200315_null_1,epi_isl_420455_Hong_Kong_20200304_null_12,epi_isl_427355_Liege_20200406_null_1,epi_isl_420807_Utah_20200323_null_1,epi_isl_419733_Victoria_20200131_null_1,epi_isl_413021_Zurich_20200229_null_1,epi_isl_420379_Tienen_20200325_null_1,epi_isl_426888_Czech_Republic_20200331_null_2,epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1,epi_isl_420193_South_Yorkshire_20200328_null_1,epi_isl_416350_Shanghai_20200129_null_5,epi_isl_421993_England_20200331_null_9,epi_isl_426719_Victoria_20200325_null_1,epi_isl_417755_Reykjavik_20200313_null_2,epi_isl_418751_England_20200318_null_1,epi_isl_420797_Texas_20200301_null_1,epi_isl_419669_Austria_20200316_null_1,epi_isl_427252_Washington_20200331_null_1,epi_isl_416386_Shanghai_20200131_null_1,epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1,(epi_isl_414532_Noord_Brabant_20200305_null_1,epi_isl_426647_Victoria_20200320_null_14)Node670,epi_isl_423958_England_20200319_null_1,epi_isl_418938_Washington_20200316_null_6,epi_isl_417015_Li_ge_20200313_null_1,epi_isl_420656_England_20200325_null_1,epi_isl_418389_Finland_20200313_null_1,epi_isl_427717_New_South_Wales_20200317_null_2,epi_isl_421239_Jiangxi_20200126_null_1,epi_isl_419944_Victoria_20200321_null_1,epi_isl_427341_Liege_20200330_null_1,epi_isl_416409_Shanghai_20200202_null_1,epi_isl_427632_New_York_20200406_null_16,epi_isl_417149_Washington_20200228_null_2,epi_isl_420115_Comunitat_Valenciana_20200309_null_1,epi_isl_427712_New_South_Wales_20200320_null_3,epi_isl_423417_England_20200328_null_1,epi_isl_426534_Arizona_20200327_null_2,epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1,epi_isl_408478_Chongqinq_20200121_null_1,epi_isl_427135_Victoria_20200406_null_2,epi_isl_410545_Rome_20200129_null_1,epi_isl_426912_Victoria_20200329_null_1,epi_isl_418331_Ontario_20200308_null_1,epi_isl_406034_California_20200123_null_1,epi_isl_427177_Washington_20200326_null_5,epi_isl_415615_Washington_20200308_null_1,epi_isl_427379_Liege_20200408_null_2,epi_isl_425914_Scotland_20200323_null_1,epi_isl_417076_Washington_20200302_null_2,epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1,epi_isl_425221_Comunitat_Valenciana_20200317_null_2,epi_isl_426624_New_York_20200401_null_4,epi_isl_417672_Reykjavik_20200316_null_1,epi_isl_419685_Comunitat_Valenciana_20200310_null_1,epi_isl_416342_Shanghai_20200204_null_1,epi_isl_424592_Reykjavik_20200328_null_16,epi_isl_426667_Victoria_20200322_null_1,epi_isl_424326_Washington_20200320_null_4,epi_isl_418710_England_20200316_null_2,epi_isl_416605_unknown_20200216_null_1,epi_isl_425747_Scotland_20200318_null_1,epi_isl_427041_Victoria_20200329_null_1,epi_isl_424346_Alaska_20200321_null_2,epi_isl_420500_England_20200322_null_1,epi_isl_419923_Victoria_20200320_null_2,epi_isl_427619_Alaska_20200402_null_1,epi_isl_427810_South_Korea_20200218_null_1,epi_isl_413016_Sao_Paulo_20200228_null_1,epi_isl_424415_Reykjavik_20200319_null_3,epi_isl_426757_Victoria_20200326_null_1,epi_isl_424275_Washington_20200322_null_1,epi_isl_427813_South_Korea_20200218_null_5464,epi_isl_413018_South_Korea_20200206_null_1,epi_isl_422784_Netherlands_20200329_null_1,epi_isl_426784_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_426879_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_426853_Victoria_20200325_null_4,epi_isl_426009_Scotland_20200331_null_1,epi_isl_426094_Washington_20200324_null_2,epi_isl_425231_England_20200330_null_1,epi_isl_425920_Scotland_20200323_null_2,(epi_isl_425708_Scotland_20200317_null_1,epi_isl_426014_Scotland_20200401_null_15)Node782,epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1,epi_isl_424602_Reykjavik_20200327_null_3,epi_isl_425208_Comunitat_Valenciana_20200325_null_1,epi_isl_425278_England_20200331_null_1,epi_isl_425975_Scotland_20200328_null_3,epi_isl_421750_Luxembourg_20200317_null_1,epi_isl_421869_England_20200327_null_4,epi_isl_423739_England_20200323_null_2,epi_isl_424046_England_20200311_null_1,epi_isl_422678_Netherlands_20200311_null_1,epi_isl_422737_Netherlands_20200325_null_1,epi_isl_418899_Washington_20200316_null_1,epi_isl_427190_Washington_20200326_null_1,epi_isl_425203_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1,epi_isl_427726_New_South_Wales_20200319_null_1,epi_isl_424226_Washington_20200321_null_2,epi_isl_424279_Washington_20200323_null_1,epi_isl_422126_Wales_20200328_null_1,epi_isl_422161_Wales_20200329_null_1,epi_isl_417443_Hong_Kong_20200122_null_2,epi_isl_422615_Netherlands_20200401_null_2,epi_isl_425451_England_20200401_null_6,epi_isl_426096_Washington_20200325_null_1,epi_isl_425248_England_20200330_null_1,epi_isl_426187_South_Korea_20200212_null_3,(epi_isl_425734_Scotland_20200318_null_2,epi_isl_425776_Scotland_20200313_null_7)Node963,epi_isl_421844_England_20200324_null_1,epi_isl_420796_Texas_20200229_null_1,epi_isl_420527_England_20200327_null_2,epi_isl_418687_England_20200317_null_1,(epi_isl_427723_New_South_Wales_20200319_null_53,epi_isl_422156_Wales_20200328_null_1,epi_isl_424014_England_20200320_null_1,epi_isl_423881_England_20200318_null_1,epi_isl_427725_New_South_Wales_20200319_null_1,epi_isl_425633_England_20200329_null_7,epi_isl_416675_USA_20200311_null_1,epi_isl_425539_England_20200322_null_1)Node835,epi_isl_417189_Minnesota_20200309_null_1,epi_isl_422424_Dasman_20200315_null_1,(epi_isl_424345_Mexico_City_20200312_null_1,epi_isl_425769_Scotland_20200313_null_1)Node856,epi_isl_424094_England_20200312_null_1,epi_isl_423421_England_20200330_null_1,epi_isl_420769_England_20200331_null_1,epi_isl_419673_Austria_20200322_null_1,epi_isl_424031_England_20200320_null_1,(epi_isl_419453_Wales_20200319_null_1,epi_isl_422127_Wales_20200327_null_1)Node866,(epi_isl_416360_Shanghai_20200201_null_1,epi_isl_425485_England_20200317_null_1)Node869,epi_isl_419589_Luxembourg_20200315_null_1,epi_isl_426830_Victoria_20200325_null_1,(epi_isl_422240_Wales_20200325_null_3,epi_isl_424644_Li_ge_20200404_null_1)Node932,(epi_isl_421301_Wisconsin_20200319_null_1,epi_isl_422638_Gelderland_20200320_null_1)Node929,(epi_isl_415510_Noord_Brabant_20200309_null_1,epi_isl_421952_England_20200331_null_1,epi_isl_420458_England_20200311_null_1,epi_isl_418741_England_20200318_null_2,epi_isl_421933_England_20200331_null_1,epi_isl_424069_England_20200321_null_1,epi_isl_422172_Wales_20200323_null_2,epi_isl_420640_England_20200323_null_2,epi_isl_427801_New_South_Wales_20200326_null_305,epi_isl_422017_Wales_20200329_null_1,epi_isl_414553_Utrecht_20200309_null_5,epi_isl_422174_Wales_20200329_null_1,epi_isl_415509_Noord_Brabant_20200101_null_1,epi_isl_422410_Taipei_20200313_null_1,epi_isl_425610_England_20200329_null_1,epi_isl_422768_Netherlands_20200327_null_1,epi_isl_422715_Netherlands_20200323_null_1,epi_isl_425480_England_20200316_null_1,epi_isl_425498_England_20200319_null_1,epi_isl_422842_Netherlands_20200311_null_2,(epi_isl_425554_England_20200322_null_1,epi_isl_427149_Victoria_20200408_null_10)Node902,epi_isl_417666_Reykjavik_20200315_null_1)Node881,(epi_isl_422800_Netherlands_20200314_null_1,epi_isl_426918_Victoria_20200329_null_3)Node926,((epi_isl_425493_England_20200318_null_3,epi_isl_426829_Victoria_20200325_null_6)Node937,epi_isl_426693_Victoria_20200323_null_11)Node936,(epi_isl_421251_Jiangxi_20200203_null_1,epi_isl_424377_Reykjavik_20200318_null_1)Node941,(epi_isl_413855_Guangdong_20200207_null_1,epi_isl_418993_Singapore_20200129_null_2)Node949,epi_isl_414483_USA_20200217_null_1,((epi_isl_423488_England_20200331_null_1,epi_isl_424163_England_20200321_null_21)Node955,epi_isl_421836_England_20200326_null_1)Node954,epi_isl_419935_Victoria_20200321_null_1,epi_isl_417483_Oslo_20200227_null_1,epi_isl_425437_England_20200331_null_2)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node109":"test",
"Node112":"test",
"Node117":"test",
"Node178":"test",
"Node186":"test",
"Node199":"test",
"Node205":"test",
"Node210":"test",
"Node217":"test",
"Node220":"test",
"Node223":"test",
"Node226":"test",
"Node229":"test",
"Node230":"test",
"Node235":"test",
"Node238":"test",
"Node241":"test",
"Node244":"test",
"Node247":"test",
"Node250":"test",
"Node253":"test",
"Node256":"test",
"Node259":"test",
"Node262":"test",
"Node265":"test",
"Node270":"test",
"Node273":"test",
"Node276":"test",
"Node282":"test",
"Node291":"test",
"Node300":"test",
"Node311":"test",
"Node315":"test",
"Node316":"test",
"Node332":"test",
"Node336":"test",
"Node343":"test",
"Node348":"test",
"Node352":"test",
"Node353":"test",
"Node358":"test",
"Node363":"test",
"Node366":"test",
"Node367":"test",
"Node368":"test",
"Node396":"test",
"Node434":"test",
"Node459":"test",
"Node463":"test",
"Node464":"test",
"Node470":"test",
"Node474":"test",
"Node479":"test",
"Node480":"test",
"Node491":"test",
"Node548":"test",
"Node572":"test",
"Node588":"test",
"Node62":"test",
"Node623":"test",
"Node670":"test",
"Node782":"test",
"Node835":"test",
"Node856":"test",
"Node866":"test",
"Node869":"test",
"Node881":"test",
"Node902":"test",
"Node926":"test",
"Node929":"test",
"Node932":"test",
"Node936":"test",
"Node937":"test",
"Node941":"test",
"Node949":"test",
"Node954":"test",
"Node955":"test",
"Node963":"test",
"Node966":"test",
"Node972":"test",
"Node975":"test",
"epi_isl_406034_California_20200123_null_1":"test",
"epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1":"test",
"epi_isl_408478_Chongqinq_20200121_null_1":"test",
"epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1":"test",
"epi_isl_410545_Rome_20200129_null_1":"test",
"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1":"test",
"epi_isl_412869_Seoul_20200130_null_1":"test",
"epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1":"test",
"epi_isl_413016_Sao_Paulo_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_413018_South_Korea_20200206_null_1":"test",
"epi_isl_413021_Zurich_20200229_null_1":"test",
"epi_isl_413485_Anhui_20200124_null_1":"test",
"epi_isl_413522_Kerala_20200127_null_1":"test",
"epi_isl_413609_USA_20200221_null_1":"test",
"epi_isl_413855_Guangdong_20200207_null_1":"test",
"epi_isl_414482_USA_20200218_null_1":"test",
"epi_isl_414483_USA_20200217_null_1":"test",
"epi_isl_414525_England_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_414532_Noord_Brabant_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_414553_Utrecht_20200309_null_5":"test",
"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1":"test",
"epi_isl_414579_Santiago_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_414630_Hauts_de_France_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_415509_Noord_Brabant_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_415510_Noord_Brabant_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_415579_British_Columbia_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_415615_Washington_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_416334_Shanghai_20200206_null_1":"test",
"epi_isl_416342_Shanghai_20200204_null_1":"test",
"epi_isl_416348_Shanghai_20200206_null_3":"test",
"epi_isl_416350_Shanghai_20200129_null_5":"test",
"epi_isl_416360_Shanghai_20200201_null_1":"test",
"epi_isl_416373_Shanghai_20200207_null_1":"test",
"epi_isl_416382_Shanghai_20200208_null_1":"test",
"epi_isl_416386_Shanghai_20200131_null_1":"test",
"epi_isl_416408_Shanghai_20200212_null_1":"test",
"epi_isl_416409_Shanghai_20200202_null_1":"test",
"epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1":"test",
"epi_isl_416480_Tbilisi_20200311_null_3":"test",
"epi_isl_416509_Bretagne_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_416541_Dasman_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_416543_Dasman_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_416605_unknown_20200216_null_1":"test",
"epi_isl_416675_USA_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_416691_Washington_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_416700_Washington_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_416748_ARA_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_416907_Selangor_20200220_null_1":"test",
"epi_isl_417015_Li_ge_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_417028_Utah_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_417030_New_South_Wales_20200124_null_1":"test",
"epi_isl_417076_Washington_20200302_null_2":"test",
"epi_isl_417149_Washington_20200228_null_2":"test",
"epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1":"test",
"epi_isl_417189_Minnesota_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_417338_ARA_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_417346_Washington_20200312_null_6":"test",
"epi_isl_417363_Washington_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_417409_New_South_Wales_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_417432_Cork_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_417443_Hong_Kong_20200122_null_2":"test",
"epi_isl_417444_Gilgit_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_417448_Washington_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_417483_Oslo_20200227_null_1":"test",
"epi_isl_417521_Taoyuan_20200310_null_6":"test",
"epi_isl_417666_Reykjavik_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_417672_Reykjavik_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_417715_Reykjavik_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_417755_Reykjavik_20200313_null_2":"test",
"epi_isl_417877_Kostoliste_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_417938_California_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_417939_California_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418042_Minnesota_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_418184_Wisconsin_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418237_Hauts_de_France_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418259_Abruzzo_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_418331_Ontario_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_418385_Finland_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_418389_Finland_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_418412_ARA_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_418650_Li_ge_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_418687_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418691_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418710_England_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_418741_England_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_418751_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418800_Gierle_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_418809_Tokyo_20200201_null_4":"test",
"epi_isl_418899_Washington_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418927_Washington_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418938_Washington_20200316_null_6":"test",
"epi_isl_418946_Illinois_20200312_null_2":"test",
"epi_isl_418964_Utah_20200314_null_2":"test",
"epi_isl_418993_Singapore_20200129_null_2":"test",
"epi_isl_419229_Hong_Kong_20200217_null_1":"test",
"epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_4":"test",
"epi_isl_419453_Wales_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_419499_Wales_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_419556_Georgia_20200229_null_2":"test",
"epi_isl_419587_Luxembourg_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_419589_Luxembourg_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_419669_Austria_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_419673_Austria_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_419685_Comunitat_Valenciana_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_419733_Victoria_20200131_null_1":"test",
"epi_isl_419746_Victoria_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_419816_Victoria_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_419818_Victoria_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419822_Victoria_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419864_Victoria_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419920_Victoria_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_419922_Victoria_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_419923_Victoria_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_419929_Victoria_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_419932_Victoria_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_419935_Victoria_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_419944_Victoria_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_419946_Victoria_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_419961_Victoria_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_420057_Hauts_de_France_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_420062_Ile_de_France_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_420115_Comunitat_Valenciana_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_420184_South_Yorkshire_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_420193_South_Yorkshire_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420301_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_420319_Montigny_le_Tilleul_20200304_null_2":"test",
"epi_isl_420322_Elsene_20200305_null_4":"test",
"epi_isl_420379_Tienen_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_420417_Saint_Ghislain_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420455_Hong_Kong_20200304_null_12":"test",
"epi_isl_420456_Western_Australia_20200222_null_3":"test",
"epi_isl_420458_England_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_420485_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_420488_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_420500_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_420509_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420510_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420527_England_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_420610_ARA_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420640_England_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_420656_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_420729_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420769_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_420796_Texas_20200229_null_1":"test",
"epi_isl_420797_Texas_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_420807_Utah_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420879_Queensland_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_420970_Wales_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421239_Jiangxi_20200126_null_1":"test",
"epi_isl_421251_Jiangxi_20200203_null_1":"test",
"epi_isl_421301_Wisconsin_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_421336_Wisconsin_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_421362_New_York_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_421409_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_421419_New_York_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_421465_Portugal_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_421487_Portugal_20200322_null_2":"test",
"epi_isl_421615_New_York_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_421622_New_York_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_421663_India_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_421665_India_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_421666_India_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_421671_India_20200312_null_3":"test",
"epi_isl_421706_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_421711_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_421726_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_421736_Luxembourg_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_421750_Luxembourg_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_421775_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_421826_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_421833_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_421836_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_421844_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_421850_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421869_England_20200327_null_4":"test",
"epi_isl_421892_England_20200327_null_3":"test",
"epi_isl_421895_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421898_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_421933_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_421934_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_421952_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_421969_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_421979_England_20200331_null_3":"test",
"epi_isl_421993_England_20200331_null_9":"test",
"epi_isl_422006_England_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_422017_Wales_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_422036_Wales_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_422056_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422065_Wales_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_422087_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422088_Wales_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_422091_Wales_20200328_null_3":"test",
"epi_isl_422094_Wales_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_422099_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422113_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422124_Wales_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_422126_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422127_Wales_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422154_Wales_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_422156_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422161_Wales_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_422172_Wales_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_422174_Wales_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_422194_Wales_20200324_null_4":"test",
"epi_isl_422195_Wales_20200326_null_3":"test",
"epi_isl_422215_Wales_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_422224_Wales_20200329_null_3":"test",
"epi_isl_422240_Wales_20200325_null_3":"test",
"epi_isl_422257_Wales_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_422260_Wales_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422384_Greater_Accra_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_422387_Greater_Accra_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_422394_Greater_Accra_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422407_Taipei_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_422408_Taipei_20200313_null_2":"test",
"epi_isl_422410_Taipei_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_422419_Taipei_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_422424_Dasman_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_422430_Singapore_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_422436_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422509_New_York_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_422562_New_York_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_422582_Netherlands_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_422595_Netherlands_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_422615_Netherlands_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_422620_Netherlands_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_422622_Netherlands_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_422623_Netherlands_20200402_null_4":"test",
"epi_isl_422634_Zuid_Holland_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_422638_Gelderland_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_422656_Netherlands_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_422667_Netherlands_20200316_null_5":"test",
"epi_isl_422670_Netherlands_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_422678_Netherlands_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_422703_Netherlands_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_422715_Netherlands_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_422737_Netherlands_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_422768_Netherlands_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422784_Netherlands_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_422800_Netherlands_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_422839_Netherlands_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_422842_Netherlands_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_422932_Zuid_Holland_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_422982_USA_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_423012_Washington_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_423032_Washington_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_423040_Bangkok_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_423087_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423089_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423091_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423092_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423099_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423106_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423129_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423152_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423179_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423213_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_423228_England_20200325_null_6":"test",
"epi_isl_423258_England_20200323_null_5":"test",
"epi_isl_423264_England_20200325_null_3":"test",
"epi_isl_423266_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_423377_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_423378_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_423393_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_423399_England_20200329_null_2":"test",
"epi_isl_423414_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_423417_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_423421_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_423469_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_423486_England_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_423488_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_423491_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_423522_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_423564_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_423571_England_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_423649_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_423665_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423684_England_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_423722_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423739_England_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_423745_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423782_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423813_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423824_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_423858_England_20200318_null_4":"test",
"epi_isl_423881_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_423901_England_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_423916_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_423948_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_423958_England_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_423970_England_20200320_null_3":"test",
"epi_isl_424002_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424014_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424019_England_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_424031_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424046_England_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_424069_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_424094_England_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_424136_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424163_England_20200321_null_21":"test",
"epi_isl_424203_Washington_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424226_Washington_20200321_null_2":"test",
"epi_isl_424231_Washington_20200321_null_7":"test",
"epi_isl_424242_Washington_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_424256_Washington_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_424275_Washington_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_424279_Washington_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_424280_Washington_20200323_null_4":"test",
"epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_424304_Washington_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_424315_Idaho_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424326_Washington_20200320_null_4":"test",
"epi_isl_424344_Rome_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_424345_Mexico_City_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_424346_Alaska_20200321_null_2":"test",
"epi_isl_424352_Anhui_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_424377_Reykjavik_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_424378_Reykjavik_20200319_null_2":"test",
"epi_isl_424396_Reykjavik_20200319_null_6":"test",
"epi_isl_424413_Reykjavik_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_424415_Reykjavik_20200319_null_3":"test",
"epi_isl_424420_Reykjavik_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_424429_Reykjavik_20200319_null_3":"test",
"epi_isl_424496_Reykjavik_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_424501_Reykjavik_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424532_Reykjavik_20200320_null_5":"test",
"epi_isl_424591_Reykjavik_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_424592_Reykjavik_20200328_null_16":"test",
"epi_isl_424602_Reykjavik_20200327_null_3":"test",
"epi_isl_424622_Reykjavik_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_424636_Li_ge_20200403_null_3":"test",
"epi_isl_424644_Li_ge_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_424645_Li_ge_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_424672_Puebla_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_424673_CDMX_20200312_null_2":"test",
"epi_isl_424934_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_424956_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_424961_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_425138_Duesseldorf_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_425203_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_425208_Comunitat_Valenciana_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_425216_Comunitat_Valenciana_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_425221_Comunitat_Valenciana_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_425231_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_425248_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_425278_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_425350_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_425352_England_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_425379_England_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_425398_England_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_425402_England_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_425403_England_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_425409_England_20200317_null_10":"test",
"epi_isl_425412_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_425421_England_20200314_null_3":"test",
"epi_isl_425437_England_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_425439_England_20200101_null_5":"test",
"epi_isl_425442_England_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_425443_England_20200401_null_4":"test",
"epi_isl_425451_England_20200401_null_6":"test",
"epi_isl_425480_England_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_425485_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_425493_England_20200318_null_3":"test",
"epi_isl_425498_England_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_425518_England_20200320_null_4":"test",
"epi_isl_425539_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_425554_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_425596_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_425610_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_425633_England_20200329_null_7":"test",
"epi_isl_425708_Scotland_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_425734_Scotland_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_425747_Scotland_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_425759_Scotland_20200313_null_4":"test",
"epi_isl_425763_Scotland_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_425769_Scotland_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_425776_Scotland_20200313_null_7":"test",
"epi_isl_425794_Scotland_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_425897_Scotland_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_425914_Scotland_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_425920_Scotland_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_425922_Scotland_20200323_null_4":"test",
"epi_isl_425950_Scotland_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_425967_Scotland_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_425975_Scotland_20200328_null_3":"test",
"epi_isl_425988_Scotland_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_426003_Scotland_20200330_null_6":"test",
"epi_isl_426009_Scotland_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_426014_Scotland_20200401_null_15":"test",
"epi_isl_426059_Idaho_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_426090_Washington_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_426094_Washington_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_426096_Washington_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_426123_Washington_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_426161_Wisconsin_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_426187_South_Korea_20200212_null_3":"test",
"epi_isl_426294_New_York_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_426514_Arizona_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_426534_Arizona_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_426557_Arizona_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_426624_New_York_20200401_null_4":"test",
"epi_isl_426627_Louisiana_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_426647_Victoria_20200320_null_14":"test",
"epi_isl_426667_Victoria_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_426678_Victoria_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_426693_Victoria_20200323_null_11":"test",
"epi_isl_426698_Victoria_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_426719_Victoria_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_426757_Victoria_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_426783_Victoria_20200323_null_3":"test",
"epi_isl_426784_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_426792_Victoria_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_426804_Victoria_20200323_null_7":"test",
"epi_isl_426829_Victoria_20200325_null_6":"test",
"epi_isl_426830_Victoria_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_426839_Victoria_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_426853_Victoria_20200325_null_4":"test",
"epi_isl_426871_Victoria_20200326_null_7":"test",
"epi_isl_426879_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_426884_Czech_Republic_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_426888_Czech_Republic_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_426898_Northern_territory_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_426912_Victoria_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_426918_Victoria_20200329_null_3":"test",
"epi_isl_427003_Victoria_20200328_null_4":"test",
"epi_isl_427004_Victoria_20200327_null_6":"test",
"epi_isl_427018_Victoria_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_427041_Victoria_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_427042_Victoria_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_427063_Victoria_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_427086_Victoria_20200402_null_2":"test",
"epi_isl_427105_Victoria_20200404_null_18":"test",
"epi_isl_427123_Victoria_20200405_null_161":"test",
"epi_isl_427132_Victoria_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_427135_Victoria_20200406_null_2":"test",
"epi_isl_427147_Victoria_20200406_null_26":"test",
"epi_isl_427149_Victoria_20200408_null_10":"test",
"epi_isl_427160_Victoria_20200331_null_5":"test",
"epi_isl_427177_Washington_20200326_null_5":"test",
"epi_isl_427181_Washington_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_427190_Washington_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_427208_Washington_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_427212_Washington_20200327_null_7":"test",
"epi_isl_427225_Washington_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_427240_Washington_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_427252_Washington_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_427285_Minnesota_20200322_null_4":"test",
"epi_isl_427341_Liege_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_427355_Liege_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_427379_Liege_20200408_null_2":"test",
"epi_isl_427391_Istanbul_20200413_null_28":"test",
"epi_isl_427396_New_Taipei_City_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_427443_Wisconsin_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_427478_New_York_20200401_null_3":"test",
"epi_isl_427481_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_427482_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_427483_New_York_20200401_null_9":"test",
"epi_isl_427514_New_York_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_427550_New_York_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_427554_New_York_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_427556_New_York_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_427567_New_York_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_427569_New_York_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_427611_New_York_20200316_null_18":"test",
"epi_isl_427619_Alaska_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_427622_Alaska_20200324_null_38":"test",
"epi_isl_427629_New_York_20200330_null_3":"test",
"epi_isl_427631_New_York_20200406_null_2":"test",
"epi_isl_427632_New_York_20200406_null_16":"test",
"epi_isl_427636_New_York_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_427640_New_York_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_427644_New_South_Wales_20200302_null_25":"test",
"epi_isl_427655_New_South_Wales_20200311_null_57":"test",
"epi_isl_427665_New_South_Wales_20200311_null_193":"test",
"epi_isl_427680_New_South_Wales_20200322_null_8":"test",
"epi_isl_427681_New_South_Wales_20200319_null_9":"test",
"epi_isl_427712_New_South_Wales_20200320_null_3":"test",
"epi_isl_427717_New_South_Wales_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_427723_New_South_Wales_20200319_null_53":"test",
"epi_isl_427725_New_South_Wales_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_427726_New_South_Wales_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_427734_New_South_Wales_20200318_null_37":"test",
"epi_isl_427746_New_South_Wales_20200321_null_9":"test",
"epi_isl_427753_New_South_Wales_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_427768_New_South_Wales_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_427773_New_South_Wales_20200325_null_12":"test",
"epi_isl_427801_New_South_Wales_20200326_null_305":"test",
"epi_isl_427805_New_South_Wales_20200320_null_439":"test",
"epi_isl_427808_New_South_Wales_20200324_null_1448":"test",
"epi_isl_427810_South_Korea_20200218_null_1":"test",
"epi_isl_427813_South_Korea_20200218_null_5464":"test",
"epi_isl_427815_Saint_Petersburg_20200407_null_4":"test",
"epi_isl_428148_V_sterbotten_20200318_null_1":"test"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":22
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":23
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":46
}
}
}