{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2777246174717803, 0.00426451725853119, 0, -0.02302685245899454, 1, 0.2777246174717803, 0.001164829052097778],
[235.2106726219439, 609.5972888522975, 0, 1, 0.2784191003733995, 0, 0.001640427243176757, 0.008857714439490075, 0.7215808996266004, 1, 0.001165096798299227],
[234.3466574198849, 609.9901974113318, 1, 0, 0.2775511409681755, 0.00426718268999363, 0, -0.02304124482589196, 1, 0.2775511409681755, 0.001164185342877442],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2777246174717803, 0.00426451725853119, 0, -0.02302685245899454, 1, 0.2777246174717803, 0.001163650243677772],
[234.4931300253257, 609.8148314489158, 0, 1, 0.2777341215826966, 0, 0.00163984204454983, 0.0088545545783324, 0.7222658784173034, 1, 0.001164829052097778],
[234.6291754835991, 609.7076793476176, 0, 1, 0.2778857444645141, 0, 0.001640130235968148, 0.00885611070786999, 0.7221142555354858, 1, 0.001164403480097685],
[234.8322421635532, 609.5046126676634, 0, 1, 0.2781262488068181, 0, 0.001640676672852773, 0.008859061269623547, 0.7218737511931819, 1, 0.001165125123307371],
[234.7540440795624, 610.053917394679, 0, 1, 0.2778785887267235, 0, 0.001639199374820246, 0.008851084393984247, 0.7221214112732766, 1, 0.001163650243677685],
[234.4642366683507, 609.872618162866, 0, 1, 0.2776903972943597, 0, 0.001639686666065324, 0.008853715590653111, 0.7223096027056404, 1, 0.001164829052097804],
[234.5221579904999, 610.2858034837415, 0, 1, 0.2776041049391207, 0, 0.001638576539535449, 0.008847721308471907, 0.7223958950608793, 1, 0.001165121602054438],
[234.6035205206457, 609.7333343105709, 1, 0, 0.2778553597160496, 0.004262510629766946, 0, -0.02301601738864706, 1, 0.2778553597160496, 0.00116473319567649],
[234.6436535842425, 609.6932012469741, 0, 1, 0.2779028917684138, 0, 0.001640169183377396, 0.008856321009808531, 0.7220971082315862, 1, 0.001163650243677685],
[234.3322421635532, 610.0046126676634, 0, 1, 0.2775340680946544, 0, 0.001639331866076904, 0.008851799798902136, 0.7224659319053456, 1, 0.001164829052429292],
[234.2757220369067, 610.06113279431, 0, 1, 0.2774671278369562, 0, 0.001639179987454082, 0.008850979709211466, 0.7225328721630437, 1, 0.001164944957679513],
[234.0581794402886, 610.2221552642816, 1, 0, 0.2772280364935777, 0.004272442015875431, 0, -0.02306964328549996, 1, 0.2772280364935777, 0.001164185342888241],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2777246174717803, 0.00426451725853119, 0, -0.02302685245899454, 1, 0.2777246174717803, 0.001163650243628045],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 0, 1, 0.2777246174717803, 0, 0.001639764351626793, 0.008854135064617854, 0.7222753825282197, 1, 0.001163650243196344],
[234.6035205206457, 609.7333343105709, 1, 0, 0.2778553597160496, 0.004262510629766946, 0, -0.02301601738864706, 1, 0.2778553597160496, 0.001164907565861288],
[234.4931300253257, 609.8148314489158, 1, 0, 0.2777341215826966, 0.00426451725853119, 0, -0.02302685245899454, 1, 0.2777341215826966, 0.001167561511263963],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2777246174717803, 0.00426451725853119, 0, -0.02302685245899454, 1, 0.2777246174717803, 0.001164829052429292],
[234.3046153938818, 609.9901974113317, 1, 0, 0.2775151663142316, 0.004267948364222073, 0, -0.02304537919009338, 1, 0.2775151663142316, 0.001164829052097804],
[234.2757220369067, 610.06113279431, 0, 1, 0.2774671278369562, 0, 0.001639179987454082, 0.008850979709211466, 0.7225328721630437, 1, 0.001164378335051217],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 0, 1, 0.2777246174717803, 0, 0.001639764351626793, 0.008854135064617854, 0.7222753825282197, 1, 0.001164185342888241],
[234.4641020601515, 609.7548272584316, 0, 1, 0.2777290272908246, 0, 0.00164000341661284, 0.008855425929170178, 0.7222709727091754, 1, 0.00116412466621867],
[234.9931300253257, 609.3437248058908, 0, 1, 0.278316798183944, 0, 0.00164110986835641, 0.008861400368833006, 0.7216832018160559, 1, 0.001163650243677772],
[234.456973967338, 609.9219228898817, 0, 1, 0.2776679697230561, 0, 0.001639554117454711, 0.008852999876044586, 0.7223320302769438, 1, 0.001163890581832312],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2777246174717803, 0.00426451725853119, 0, -0.02302685245899454, 1, 0.2777246174717803, 0.001165629266314735],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 0, 1, 0.2777246174717803, 0, 0.001639764351626793, 0.008854135064617854, 0.7222753825282197, 1, 0.001163650243196344],
[234.346583472018, 610.1787859906424, 0, 1, 0.2774890985467067, 0, 0.001638863924737193, 0.008849273084731277, 0.7225109014532933, 1, 0.001163721129552711],
[234.7105380137448, 609.6263168174719, 0, 1, 0.2779821071066044, 0, 0.001640349132597256, 0.008857292670581515, 0.7220178928933956, 1, 0.001163721129552795],
[234.4931300253257, 609.6098580685714, 1, 0, 0.2778015637106606, 0.00426451725853119, 0, -0.02302685245899454, 1, 0.2778015637106606, 0.00116562926630808],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 0, 1, 0.2777246174717803, 0, 0.001639764351626793, 0.008854135064617854, 0.7222753825282197, 1, 0.001164742705563006],
[232.985732716114, 605.3511221151026, 1, 0, 0.2779142195329362, 0.004292108312136304, 0, -0.02317583418002807, 1, 0.2779142195329363, 0.001163959373679157],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2777246174717803, 0.00426451725853119, 0, -0.02302685245899454, 1, 0.2777246174717803, 0.001163952196114406],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2777246174717803, 0.00426451725853119, 0, -0.02302685245899454, 1, 0.2777246174717803, 0.001164181009274786],
[234.3046153938818, 610.0322394373347, 1, 0, 0.2775013480143769, 0.004267948364222073, 0, -0.02304537919009338, 1, 0.2775013480143769, 0.001164829052429292],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 0, 1, 0.2777246174717803, 0, 0.001639764351626793, 0.008854135064617854, 0.7222753825282197, 1, 0.001164544145474664],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2777246174717803, 0.00426451725853119, 0, -0.02302685245899454, 1, 0.2777246174717803, 0.001165096798305297],
[234.6816446567696, 609.6972522004501, 1, 0, 0.277934047771984, 0.004261091665104598, 0, -0.02300835549213133, 1, 0.277934047771984, 0.001163721129552711],
[234.3827395300058, 610.1150031629834, 1, 0, 0.2775409899647463, 0.004266525777475092, 0, -0.02303769773562927, 1, 0.2775409899647463, 0.001163650243677772],
[234.4931300253257, 609.7277835812047, 0, 1, 0.2777627588299914, 0, 0.001640076156816328, 0.008855818699988541, 0.7222372411700086, 1, 0.001163819703897904],
[234.5221579904999, 609.93262235335, 0, 1, 0.2777202088843714, 0, 0.001639525356328086, 0.008852844576351986, 0.7222797911156287, 1, 0.001164878946509701],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 0, 1, 0.2777246174717803, 0, 0.001639764351626793, 0.008854135064617854, 0.7222753825282197, 1, 0.001164829052429292],
[234.2757220369067, 610.0611327943099, 0, 1, 0.2774671278369563, 0, 0.001639179987454082, 0.008850979709211466, 0.7225328721630437, 1, 0.001164378335051217],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2777246174717803, 0.00426451725853119, 0, -0.02302685245899454, 1, 0.2777246174717803, 0.001163650243196344],
[234.2757220369067, 610.06113279431, 0, 1, 0.2774671278369562, 0, 0.001639179987454082, 0.008850979709211466, 0.7225328721630438, 1, 0.001164944957679513],
[234.4642366683506, 609.872618162866, 0, 1, 0.2776903972943596, 0, 0.001639686666065324, 0.008853715590653111, 0.7223096027056404, 1, 0.00116418534296718],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2777246174717803, 0.00426451725853119, 0, -0.02302685245899454, 1, 0.2777246174717803, 0.001163721129552711],
[234.6816446567696, 609.6552101744469, 1, 0, 0.2779478869291838, 0.004261091665104598, 0, -0.02300835549213133, 1, 0.2779478869291838, 0.001163721129552795],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2777246174717803, 0.00426451725853119, 0, -0.02302685245899454, 1, 0.2777246174717803, 0.001164742705425847],
[234.8322421635532, 609.5046126676634, 0, 1, 0.2781262488068181, 0, 0.001640676672852773, 0.008859061269623547, 0.7218737511931819, 1, 0.001164878946650231],
[234.2757220369067, 610.06113279431, 0, 1, 0.2774671278369562, 0, 0.001639179987454082, 0.008850979709211466, 0.7225328721630437, 1, 0.001164829052097804],
[234.6540178870982, 609.6828369441183, 0, 1, 0.2779151668489062, 0, 0.001640197065432001, 0.008856471562829827, 0.7220848331510938, 1, 0.001163721129552711],
[234.129175483599, 610.2076793476176, 0, 1, 0.2772935637523504, 0, 0.001638786324467623, 0.008848854071311975, 0.7227064362476496, 1, 0.001164742705563006],
[234.7105380137448, 609.6263168174719, 0, 1, 0.2779821071066044, 0, 0.001640349132597256, 0.008857292670581515, 0.7220178928933956, 1, 0.001164486610052446],
[234.6685699356085, 609.450876907189, 0, 1, 0.2780039848783527, 0, 0.001640821332598207, 0.008859842379984448, 0.7219960151216473, 1, 0.001167561511288431],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2777246174717803, 0.00426451725853119, 0, -0.02302685245899454, 1, 0.2777246174717803, 0.001164181009669053],
[234.8570845670525, 609.4797702641642, 0, 1, 0.2781556711912102, 0, 0.001640743546855664, 0.0088594223650781, 0.7218443288087899, 1, 0.001163650243196344],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2777246174717803, 0.00426451725853119, 0, -0.02302685245899454, 1, 0.2777246174717803, 0.001163721129552795],
[234.239565978919, 610.1538089789442, 0, 1, 0.2774057363851392, 0, 0.001638931012613754, 0.008849635335026376, 0.7225942636148608, 1, 0.001164944957679513],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2777246174717803, 0.00426451725853119, 0, -0.02302685245899454, 1, 0.2777246174717803, 0.001164185342888241],
[234.3046153938818, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2775633194261002, 0.004267948364222073, 0, -0.02304537919009338, 1, 0.2775633194261002, 0.001164829052097804],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 0, 1, 0.2777246174717803, 0, 0.001639764351626793, 0.008854135064617854, 0.7222753825282197, 1, 0.001164907565861288],
[234.41176749518, 610.0430128486699, 0, 2, 0.2775894848978543, 0, 0.003278457351164071, 0.01770248521502354, 0.5218769523301475, 1, 0.002333132351118612],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 0, 1, 0.2777246174717803, 0, 0.001639764351626793, 0.008854135064617854, 0.7222753825282197, 1, 0.0011643504915699],
[234.129175483599, 610.2076793476176, 0, 1, 0.2772935637523504, 0, 0.001638786324467623, 0.008848854071311975, 0.7227064362476496, 1, 0.001164829052429292],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2777246174717803, 0.00426451725853119, 0, -0.02302685245899454, 1, 0.2777246174717803, 0.001163721129552795],
[234.3322421635532, 610.0046126676634, 0, 1, 0.2775340680946544, 0, 0.001639331866076904, 0.008851799798902136, 0.7224659319053456, 1, 0.001164185342888241],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 0, 1, 0.2777246174717803, 0, 0.001639764351626793, 0.008854135064617854, 0.7222753825282197, 1, 0.001171296013838719],
[234.4642366683507, 609.872618162866, 0, 1, 0.2776903972943597, 0, 0.001639686666065324, 0.008853715590653111, 0.7223096027056404, 1, 0.001164829052429292],
[234.6540178870982, 609.6828369441184, 0, 1, 0.2779151668489062, 0, 0.001640197065432001, 0.008856471562829826, 0.7220848331510938, 1, 0.001163721129552795],
[234.5221579904999, 610.2858034837416, 0, 1, 0.2776041049391206, 0, 0.001638576539535449, 0.008847721308471907, 0.7223958950608793, 1, 0.001164878946651059],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 0, 2, 0.2777246174717803, 0, 0.003279528703253586, 0.01770827012923571, 0.521681728206286, 1, 0.002331902624486625],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 0, 1, 0.2777246174717803, 0, 0.001639764351626793, 0.008854135064617854, 0.7222753825282197, 1, 0.001164829052429292],
[234.3827395300058, 610.1150031629833, 1, 0, 0.2775409899647464, 0.004266525777475091, 0, -0.02303769773562926, 1, 0.2775409899647463, 0.00116381970431506],
[234.4366098986792, 609.9002449325374, 0, 1, 0.2776576772140821, 0, 0.00163961239286043, 0.00885331454218102, 0.7223423227859179, 1, 0.001165754004580854],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2777246174717803, 0.00426451725853119, 0, -0.02302685245899454, 1, 0.2777246174717803, 0.001164829052097804],
[234.5112499709657, 609.9435303728842, 0, 1, 0.2777072916509231, 0, 0.001639496035622606, 0.008852686255135736, 0.7222927083490769, 1, 0.001163650243677685],
[234.6035205206456, 609.7333343105709, 1, 0, 0.2778553597160496, 0.004262510629766947, 0, -0.02301601738864707, 1, 0.2778553597160496, 0.001164544145474664],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2777246174717803, 0.00426451725853119, 0, -0.02302685245899454, 1, 0.2777246174717803, 0.001164878946650231],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[232.2218154704065, 606.1715594874565, 0, 2, 0.2769843159627517, 0, 0.003299395969172628, 0.01781554618730915, 0.5227516793638499, 1, 0.002332969657348906],
[234.3466574198849, 609.9901974113317, 1, 0, 0.2775511409681755, 0.00426718268999363, 0, -0.02304124482589196, 1, 0.2775511409681755, 0.001165059898274166],
[234.2757220369067, 610.06113279431, 0, 1, 0.2774671278369562, 0, 0.001639179987454082, 0.008850979709211466, 0.7225328721630437, 1, 0.001164326530898234],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2777246174717803, 0.00426451725853119, 0, -0.02302685245899454, 1, 0.2777246174717803, 0.001163721129552711],
[234.6816446567697, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2778858435076837, 0.004261091665104597, 0, -0.02300835549213133, 1, 0.2778858435076837, 0.001163721130020807],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2777246174717803, 0.00426451725853119, 0, -0.02302685245899454, 1, 0.2777246174717803, 0.001164251918830229],
[234.4931300253257, 609.8148314489158, 1, 0, 0.2777341215826966, 0.00426451725853119, 0, -0.02302685245899454, 1, 0.2777341215826966, 0.001165418563210203],
[234.2757220369067, 610.06113279431, 0, 1, 0.2774671278369562, 0, 0.001639179987454082, 0.008850979709211466, 0.7225328721630438, 1, 0.00116482905235735],
[234.6816446567696, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2778858435076837, 0.004261091665104598, 0, -0.02300835549213133, 1, 0.2778858435076836, 0.001163721129552711],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[232.7902246000556, 606.0708838324465, 0, 1, 0.2775074708553935, 0, 0.001649972019240671, 0.008909252781781504, 0.7224925291446065, 1, 0.001164982809037904],
[234.5221579904999, 610.0485635780362, 0, 1, 0.2776820839289166, 0, 0.001639213760515776, 0.008851162071542665, 0.7223179160710833, 1, 0.00116431707969749],
[234.6035205206457, 609.733334310571, 1, 0, 0.2778553597160496, 0.004262510629766946, 0, -0.02301601738864706, 1, 0.2778553597160496, 0.001164284972124978],
[234.8322421635532, 609.5046126676634, 0, 1, 0.2781262488068181, 0, 0.001640676672852773, 0.008859061269623547, 0.7218737511931819, 1, 0.001164393795284309],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[234.5509167392759, 606.7859380919406, 0, 0, 0.2787835994493906, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004116547620542882],
[234.9931300253257, 609.3437248058908, 0, 1, 0.278316798183944, 0, 0.00164110986835641, 0.008861400368833006, 0.7216832018160559, 1, 0.0007518408867466438],
[234.7105380137448, 609.6263168174719, 0, 1, 0.2779821071066044, 0, 0.001640349132597256, 0.008857292670581515, 0.7220178928933956, 1, 0.001163956700483351],
[232.7684085609872, 605.6249663968759, 0, 1, 0.2776362689801621, 0, 0.001651186882121837, 0.008915812602419245, 0.7223637310198379, 1, 0.001164108230300042],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[234.5112499709657, 609.8256048602509, 0, 1, 0.2777460780364072, 0, 0.001639813074475878, 0.008854398150399723, 0.7222539219635928, 1, 0.001163546292689852],
[234.9280806103629, 609.4652943475003, 1, 0, 0.2782211319719156, 0.004256621845297999, 0, -0.022984220080087, 1, 0.2782211319719157, 0.001163721129552711],
[234.2757220369067, 610.06113279431, 0, 1, 0.2774671278369562, 0, 0.001639179987454082, 0.008850979709211466, 0.7225328721630437, 1, 0.001164829052097804],
[234.2757220369067, 610.06113279431, 0, 1, 0.2774671278369562, 0, 0.001639179987454082, 0.008850979709211466, 0.7225328721630437, 1, 0.001164944957536274],
[234.6540178870982, 609.6828369441183, 0, 1, 0.2779151668489062, 0, 0.001640197065432001, 0.008856471562829827, 0.7220848331510938, 1, 0.001164181009669053],
[234.3046153938818, 610.0322394373347, 1, 0, 0.2775013480143769, 0.004267948364222073, 0, -0.02304537919009338, 1, 0.2775013480143769, 0.001164829052097778],
[234.5744925554714, 609.6444367631118, 0, 1, 0.2778597877979468, 0, 0.001640300377888247, 0.008857029412767567, 0.7221402122020532, 1, 0.001165418563210203],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 0, 1, 0.2777246174717803, 0, 0.001639764351626793, 0.008854135064617854, 0.7222753825282197, 1, 0.001164251918830229],
[232.3551394068194, 605.6612062881559, 0, 1, 0.2772680277663617, 0, 0.001651088082937624, 0.008915279122519873, 0.7227319722336383, 1, 0.001165406133229597],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[234.3046153938818, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2775633194261002, 0.004267948364222073, 0, -0.02304537919009338, 1, 0.2775633194261002, 0.001164431079616309],
[234.3046153938818, 610.0322394373347, 1, 0, 0.2775013480143769, 0.004267948364222073, 0, -0.02304537919009338, 1, 0.2775013480143769, 0.001164829052097804],
[234.3827395300058, 609.9541153012108, 1, 0, 0.277593875227511, 0.004266525777475092, 0, -0.02303769773562927, 1, 0.277593875227511, 0.001163650243196344],
[234.4931300253257, 610.0046126676634, 0, 1, 0.2776717073009086, 0, 0.001639331866076904, 0.008851799798902136, 0.7223282926990914, 1, 0.001163819704257828],
[234.8322421635532, 609.5046126676634, 0, 1, 0.2781262488068181, 0, 0.001640676672852773, 0.008859061269623547, 0.7218737511931819, 1, 0.001164944957536274],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 0, 1, 0.2777246174717803, 0, 0.001639764351626793, 0.008854135064617854, 0.7222753825282197, 1, 0.001164829052429292],
[232.7321686697072, 605.6612062881559, 0, 1, 0.2775930435774306, 0, 0.001651088082937624, 0.008915279122519873, 0.7224069564225695, 1, 0.001165403711751609],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2777246174717803, 0.00426451725853119, 0, -0.02302685245899454, 1, 0.2777246174717803, 0.001164413563767595],
[234.2757220369067, 610.06113279431, 0, 1, 0.2774671278369562, 0, 0.001639179987454082, 0.008850979709211466, 0.7225328721630437, 1, 0.001164378334914994],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 0, 1, 0.2777246174717803, 0, 0.001639764351626793, 0.008854135064617854, 0.7222753825282197, 1, 0.001165096798305297],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2777246174717803, 0.00426451725853119, 0, -0.02302685245899454, 1, 0.2777246174717803, 0.001164181009669125],
[232.7321686697072, 605.6612062881559, 0, 1, 0.2775930435774306, 0, 0.001651088082937624, 0.008915279122519873, 0.7224069564225695, 1, 0.001165475776600092],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 0, 1, 0.2777246174717803, 0, 0.001639764351626793, 0.008854135064617854, 0.7222753825282197, 1, 0.001164718497787312],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[232.9529496603471, 605.118649573971, 0, 1, 0.2779630641023731, 0, 0.001652568468521078, 0.008923272669818674, 0.7220369358976269, 1, 0.001165576176407623],
[234.6035205206456, 609.5724464487985, 1, 0, 0.2779083149723657, 0.004262510629766947, 0, -0.02301601738864707, 1, 0.2779083149723657, 0.001164914373237138],
[232.7321686697072, 605.6612062881559, 0, 1, 0.2775930435774306, 0, 0.001651088082937624, 0.008915279122519873, 0.7224069564225695, 1, 0.001165166963927454],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 0, 1, 0.2777246174717803, 0, 0.001639764351626793, 0.008854135064617854, 0.7222753825282197, 1, 0.001164315173642105],
[233.109197932595, 605.284177025268, 0, 1, 0.2780427480647863, 0, 0.001652116539564282, 0.008920832416730409, 0.7219572519352138, 1, 0.001164033508292403],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[234.6816446567697, 609.6552101744469, 1, 0, 0.2779478869291838, 0.004261091665104597, 0, -0.02300835549213133, 1, 0.2779478869291838, 0.00116416948725796],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[233.4103929461622, 604.9829820117009, 0, 1, 0.2784020006812353, 0, 0.001652939057351301, 0.008925273715611004, 0.7215979993187647, 1, 0.001164745535447593],
[234.8322421635532, 609.5046126676634, 0, 1, 0.2781262488068181, 0, 0.001640676672852773, 0.008859061269623547, 0.7218737511931819, 1, 0.001165126289371205],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[232.674381955757, 605.7189930021061, 0, 1, 0.2775241180399964, 0, 0.00165093056607608, 0.008914428588377158, 0.7224758819600036, 1, 0.001165652587746514],
[234.4642366683507, 609.8726181628659, 0, 1, 0.2776903972943597, 0, 0.001639686666065324, 0.008853715590653111, 0.7223096027056403, 1, 0.001164405658599737],
[232.0830484902727, 605.8755104907523, 0, 1, 0.2769624416420909, 0, 0.001650504076637809, 0.008912125699497828, 0.7230375583579091, 1, 0.001164992506421468],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[234.1685699356085, 609.950876907189, 1, 0, 0.2774116516465215, 0.004270427924101766, 0, -0.02305876791759793, 1, 0.2774116516465215, 0.001164898475829738],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[232.7321686697072, 605.6612062881559, 0, 1, 0.2775930435774306, 0, 0.001651088082937624, 0.008915279122519873, 0.7224069564225695, 1, 0.001165381942122219],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 0, 1, 0.2777246174717803, 0, 0.001639764351626793, 0.008854135064617854, 0.7222753825282197, 1, 0.00116457462185361],
[232.2900899918565, 606.1598050926531, 1, 0, 0.277047073836706, 0.004304961955264891, 0, -0.02324523920900068, 1, 0.2770470738367059, 0.001165203652537842],
[232.6671192547443, 605.7827758297652, 1, 0, 0.2774967480093646, 0.004297985908808681, 0, -0.02320757107852872, 1, 0.2774967480093646, 0.001164758717736781],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[232.4786046233004, 605.9712904612092, 1, 0, 0.2772719109230353, 0.004301471103632794, 0, -0.02322638987140502, 1, 0.2772719109230353, 0.001164871852457486],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[232.2611966348814, 606.1886984496282, 0, 1, 0.2770126133911331, 0, 0.001649651342160573, 0.00890752124140712, 0.7229873866088669, 1, 0.001165034197644527],
[232.2900899918565, 606.1598050926531, 1, 0, 0.277047073836706, 0.004304961955264891, 0, -0.02324523920900068, 1, 0.2770470738367059, 0.001165117006208639],
[232.4786046233004, 605.9712904612092, 1, 0, 0.2772719109230353, 0.004301471103632794, 0, -0.02322638987140502, 1, 0.2772719109230353, 0.001164705960784122],
[232.2611966348814, 606.1886984496282, 0, 1, 0.2770126133911331, 0, 0.001649651342160573, 0.00890752124140712, 0.7229873866088669, 1, 0.001165999228162923],
[232.4641893669688, 605.9857057175409, 0, 1, 0.277254718176735, 0, 0.001650203941388207, 0.00891050507758652, 0.7227452818232649, 1, 0.001165131331872779],
[232.4786046233004, 605.9712904612092, 0, 1, 0.2772719109230353, 0, 0.001650243197559562, 0.008910717046728888, 0.7227280890769647, 1, 0.001165157232886941],
[232.4786046233004, 605.9712904612092, 0, 1, 0.2772719109230353, 0, 0.001650243197559562, 0.008910717046728888, 0.7227280890769647, 1, 0.00116489386293108],
[232.4786046233004, 606.0278105878557, 0, 1, 0.2772532212109036, 0, 0.001650089290506298, 0.008909886004246689, 0.7227467787890964, 1, 0.001165157233031903],
[232.4786046233004, 605.9712904612092, 1, 0, 0.2772719109230353, 0.004301471103632794, 0, -0.02322638987140502, 1, 0.2772719109230353, 0.00116489386293108],
[232.3791221475147, 606.1886984496282, 0, 1, 0.2771142851415856, 0, 0.001649651342160573, 0.00890752124140712, 0.7228857148584144, 1, 0.001165653784739988],
[232.6394924850729, 605.8104025994367, 0, 1, 0.2774637981934801, 0, 0.001650681460254162, 0.008913083506938809, 0.7225362018065199, 1, 0.001164508353628869],
[232.4786046233004, 606.0278105878556, 0, 1, 0.2772532212109036, 0, 0.001650089290506298, 0.00890988600424669, 0.7227467787890964, 1, 0.001165157233031903],
[232.4641893669688, 605.9857057175409, 0, 1, 0.277254718176735, 0, 0.001650203941388207, 0.00891050507758652, 0.7227452818232649, 1, 0.001165131331872779],
[231.8714525220022, 606.1073359194825, 0, 1, 0.2767032480061321, 0, 0.001649872787767815, 0.008908716967679642, 0.7232967519938679, 1, 0.001165999228162923],
[232.9786046233004, 605.4712904612092, 0, 1, 0.2778682494793775, 0, 0.001651605973320823, 0.008918075543479361, 0.7221317505206224, 1, 0.001164438153014098],
[232.4786046233004, 605.9712904612092, 1, 0, 0.2772719109230353, 0.004301471103632794, 0, -0.02322638987140502, 1, 0.2772719109230353, 0.001165131331737631],
[232.4786046233004, 605.7538824727901, 0, 1, 0.2773438254924738, 0, 0.001650835477798063, 0.008913915146030524, 0.7226561745075262, 1, 0.001165653784739988],
[234.239565978919, 610.1538089789442, 0, 1, 0.2774057363851392, 0, 0.001638931012613754, 0.008849635335026376, 0.7225942636148608, 1, 0.001164984968786785],
[232.9787392314995, 608.5276759796566, 0, 1, 0.276859136211147, 0, 0.001643310632322712, 0.008873283699132054, 0.723140863788853, 1, 0.00117222904951114],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[233.2973526928692, 608.096022264994, 0, 1, 0.2772750055282437, 0, 0.001644477127601113, 0.008879582352189705, 0.7227249944717562, 1, 0.001164993814548998],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[234.3046153938818, 610.0322394373347, 1, 0, 0.2775013480143769, 0.004267948364222073, 0, -0.02304537919009338, 1, 0.2775013480143769, 0.001164550003702594]
],
"NAMES": [
["epi_isl_427166_Idaho_20200325_null_8"],
["epi_isl_427178_Washington_20200327_null_1"],
["epi_isl_427671_New_South_Wales_20200321_null_1"],
["epi_isl_427188_Washington_20200326_null_1"],
["epi_isl_421435_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_421761_Luxembourg_20200317_null_1"],
["epi_isl_422414_Taipei_20200316_null_1"],
["epi_isl_427210_Washington_20200327_null_1"],
["epi_isl_421495_Portugal_20200323_null_2"],
["epi_isl_419662_Austria_20200314_null_1"],
["epi_isl_420310_Norway_20200316_null_3"],
["epi_isl_427333_Saint_Petersburg_20200407_null_1"],
["epi_isl_419688_Comunitat_Valenciana_20200309_null_1"],
["epi_isl_417797_Reykjavik_20200313_null_1"],
["epi_isl_424010_England_20200320_null_6"],
["epi_isl_427376_Liege_20200407_null_14"],
["epi_isl_419604_Luxembourg_20200315_null_1"],
["epi_isl_419235_Madrid_20200307_null_1"],
["epi_isl_419246_Hong_Kong_20200223_null_1"],
["epi_isl_424225_Washington_20200321_null_1"],
["epi_isl_425281_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_426772_Victoria_20200324_null_1"],
["epi_isl_417572_Reykjavik_20200317_null_1"],
["epi_isl_422564_Pichincha_20200330_null_2"],
["epi_isl_422184_Wales_20200327_null_2"],
["epi_isl_417177_Hong_Kong_20200123_null_1"],
["epi_isl_419941_Victoria_20200321_null_1"],
["epi_isl_422915_Zuid_Holland_20200319_null_19"],
["epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1"],
["epi_isl_419249_Hong_Kong_20200225_null_1"],
["epi_isl_417176_Hong_Kong_20200121_null_1"],
["epi_isl_423187_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_421375_New_York_20200316_null_1"],
["epi_isl_424532_Reykjavik_20200320_null_3"],
["Node151"],
["epi_isl_422171_Wales_20200330_null_1"],
["epi_isl_426171_South_Korea_20200205_null_8"],
["epi_isl_413902_Guangdong_20200228_null_1"],
["epi_isl_420051_Ile_de_France_20200319_null_1"],
["epi_isl_424904_South_Carolina_20200307_null_1"],
["epi_isl_421410_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_417296_England_20200306_null_1"],
["epi_isl_421980_England_20200331_null_6"],
["epi_isl_422328_Wales_20200325_null_1"],
["epi_isl_422356_Wales_20200327_null_25"],
["epi_isl_419187_ARA_20200322_null_1"],
["epi_isl_418062_Washington_20200314_null_1"],
["epi_isl_420061_Ile_de_France_20200323_null_1"],
["epi_isl_427743_New_South_Wales_20200321_null_15"],
["epi_isl_427152_Victoria_20200327_null_1"],
["epi_isl_417088_Washington_20200302_null_1"],
["epi_isl_423772_England_20200322_null_2"],
["epi_isl_425162_Wisconsin_20200330_null_2"],
["epi_isl_418082_Washington_20200315_null_1"],
["epi_isl_417427_Sint_Pieters_Woluwe_20200302_null_1"],
["epi_isl_422421_Taipei_20200319_null_2"],
["epi_isl_421256_Jiangxi_20200127_null_1"],
["epi_isl_423168_England_20200325_null_2"],
["epi_isl_425569_England_20200323_null_3"],
["epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1"],
["epi_isl_418017_Portugal_20200316_null_1"],
["epi_isl_420890_Japan_20200309_null_1"],
["epi_isl_426627_Louisiana_20200406_null_9"],
["epi_isl_421815_England_20200325_null_5"],
["epi_isl_417445_Lombardy_20200224_null_1"],
["epi_isl_422017_Wales_20200329_null_1"],
["epi_isl_425930_Scotland_20200325_null_6"],
["epi_isl_426513_Arizona_20200311_null_1"],
["epi_isl_413898_Guangdong_20200228_null_2"],
["epi_isl_420387_Sint_Agatha_Berchem_20200324_null_1"],
["epi_isl_426042_New_York_20200306_null_1"],
["epi_isl_426628_Louisiana_20200406_null_1"],
["epi_isl_422712_Netherlands_20200322_null_2"],
["epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1"],
["epi_isl_427779_New_South_Wales_20200324_null_8065"],
["epi_isl_427105_Victoria_20200404_null_25"],
["epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1"],
["epi_isl_426483_Arizona_20200322_null_1"],
["epi_isl_425146_Wisconsin_20200331_null_1"],
["epi_isl_421313_Wisconsin_20200323_null_1"],
["epi_isl_417351_Washington_20200312_null_1"],
["epi_isl_424931_New_York_20200401_null_2"],
["epi_isl_424860_Georgia_20200301_null_1"],
["epi_isl_427149_Victoria_20200408_null_3"],
["Node123"],
["epi_isl_421507_Ile_de_France_20200323_null_1"],
["epi_isl_422878_Noord_Brabant_20200311_null_1"],
["epi_isl_427179_Washington_20200326_null_28"],
["epi_isl_420241_South_Yorkshire_20200326_null_1"],
["epi_isl_420815_Utah_20200324_null_2"],
["epi_isl_426898_Northern_territory_20200326_null_15"],
["epi_isl_421460_Portugal_20200320_null_1"],
["epi_isl_424421_Reykjavik_20200319_null_2"],
["epi_isl_425950_Scotland_20200326_null_1"],
["Node118"],
["epi_isl_424351_USA_20200327_null_2"],
["epi_isl_421641_Taipei_20200319_null_1"],
["epi_isl_424413_Reykjavik_20200319_null_1"],
["epi_isl_425460_England_20200331_null_1"],
["Node252"],
["epi_isl_423094_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_418764_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_427519_New_York_20200318_null_2"],
["Node114"],
["epi_isl_425637_England_20200330_null_16"],
["epi_isl_426068_Idaho_20200327_null_2"],
["epi_isl_427459_Wisconsin_20200406_null_32"],
["epi_isl_427758_New_South_Wales_20200320_null_1"],
["epi_isl_422231_Wales_20200327_null_2"],
["epi_isl_406798_Hubei_20191226_null_1"],
["epi_isl_418251_Madrid_20200225_null_1"],
["epi_isl_423889_England_20200319_null_1"],
["epi_isl_418949_Washington_20200316_null_11"],
["Node111"],
["epi_isl_424570_Reykjavik_20200328_null_2"],
["epi_isl_426482_Montevideo_20200317_null_4"],
["epi_isl_416350_Shanghai_20200129_null_5"],
["epi_isl_419863_Victoria_20200318_null_1"],
["epi_isl_420432_Leuven_20200323_null_3"],
["epi_isl_418805_Deinze_20200306_null_1"],
["epi_isl_419599_Luxembourg_20200316_null_1"],
["Node108"],
["epi_isl_426979_Victoria_20200329_null_1"],
["epi_isl_417979_Madrid_20200303_null_1"],
["epi_isl_423589_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_423316_England_20200326_null_2"],
["epi_isl_426295_New_York_20200322_null_1"],
["Node105"],
["epi_isl_413612_USA_20200217_null_2"],
["epi_isl_419735_Victoria_20200224_null_6"],
["Node102"],
["epi_isl_422667_Netherlands_20200316_null_1"],
["epi_isl_425459_England_20200331_null_1"],
["Node99"],
["epi_isl_422072_Wales_20200328_null_2"],
["epi_isl_425139_Duesseldorf_20200319_null_1"],
["Node96"],
["epi_isl_420946_Wales_20200321_null_1"],
["epi_isl_424174_Connecticut_20200313_null_1"],
["Node93"],
["epi_isl_421258_Jiangxi_20200208_null_2"],
["epi_isl_425689_Scotland_20200314_null_2"],
["Node90"],
["epi_isl_421841_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_425994_Scotland_20200330_null_2"],
["Node87"],
["epi_isl_426853_Victoria_20200325_null_22"],
["epi_isl_426882_Victoria_20200324_null_3"],
["Node84"],
["epi_isl_425451_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_419832_Northern_Territory_20200221_null_1"],
["epi_isl_423274_England_20200320_null_2"],
["Node75"],
["epi_isl_427800_New_South_Wales_20200324_null_1498"],
["epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1"],
["epi_isl_427759_New_South_Wales_20200320_null_5"],
["epi_isl_416382_Shanghai_20200208_null_1"],
["epi_isl_412981_Hubei_20200118_null_1"],
["epi_isl_423293_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_419869_Victoria_20200318_null_2"],
["epi_isl_426810_Victoria_20200325_null_2"],
["epi_isl_416589_unknown_20200216_null_1"],
["epi_isl_417487_Oslo_20200301_null_2"],
["epi_isl_421929_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_422000_England_20200402_null_1"],
["epi_isl_417386_New_South_Wales_20200304_null_1"],
["epi_isl_423831_England_20200323_null_24"],
["epi_isl_423110_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_427805_New_South_Wales_20200320_null_3"],
["epi_isl_420495_England_20200319_null_1"],
["epi_isl_423231_England_20200324_null_3"],
["Node38"],
["epi_isl_417393_New_South_Wales_20200308_null_1"],
["epi_isl_427646_New_South_Wales_20200304_null_45"],
["Node80"],
["epi_isl_425284_England_20200318_null_2"],
["Node79"]
],
"RESOLVED": [
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2777246174717803, 0.00426451725853119, 0, -0.02302685245899454, 1, 0.2777246174717803, 0.001164829052097778],
[235.2106726219439, 609.5972888522975, 0, 1, 0.2784191003733995, 0, 0.001640427243176757, 0.008857714439490075, 0.7215808996266004, 1, 0.001165096798299227],
[234.3466574198849, 609.9901974113318, 1, 0, 0.2775511409681755, 0.00426718268999363, 0, -0.02304124482589196, 1, 0.2775511409681755, 0.001164185342877442],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2777246174717803, 0.00426451725853119, 0, -0.02302685245899454, 1, 0.2777246174717803, 0.001163650243677772],
[234.4931300253257, 609.8148314489158, 0, 1, 0.2777341215826966, 0, 0.00163984204454983, 0.0088545545783324, 0.7222658784173034, 1, 0.001164829052097778],
[234.6291754835991, 609.7076793476176, 0, 1, 0.2778857444645141, 0, 0.001640130235968148, 0.00885611070786999, 0.7221142555354858, 1, 0.001164403480097685],
[234.8322421635532, 609.5046126676634, 0, 1, 0.2781262488068181, 0, 0.001640676672852773, 0.008859061269623547, 0.7218737511931819, 1, 0.001165125123307371],
[234.7540440795624, 610.053917394679, 0, 1, 0.2778785887267235, 0, 0.001639199374820246, 0.008851084393984247, 0.7221214112732766, 1, 0.001163650243677685],
[234.4642366683507, 609.872618162866, 0, 1, 0.2776903972943597, 0, 0.001639686666065324, 0.008853715590653111, 0.7223096027056404, 1, 0.001164829052097804],
[234.5221579904999, 610.2858034837415, 0, 1, 0.2776041049391207, 0, 0.001638576539535449, 0.008847721308471907, 0.7223958950608793, 1, 0.001165121602054438],
[234.6035205206457, 609.7333343105709, 1, 0, 0.2778553597160496, 0.004262510629766946, 0, -0.02301601738864706, 1, 0.2778553597160496, 0.00116473319567649],
[234.6436535842425, 609.6932012469741, 0, 1, 0.2779028917684138, 0, 0.001640169183377396, 0.008856321009808531, 0.7220971082315862, 1, 0.001163650243677685],
[234.3322421635532, 610.0046126676634, 0, 1, 0.2775340680946544, 0, 0.001639331866076904, 0.008851799798902136, 0.7224659319053456, 1, 0.001164829052429292],
[234.2757220369067, 610.06113279431, 0, 1, 0.2774671278369562, 0, 0.001639179987454082, 0.008850979709211466, 0.7225328721630437, 1, 0.001164944957679513],
[234.0581794402886, 610.2221552642816, 1, 0, 0.2772280364935777, 0.004272442015875431, 0, -0.02306964328549996, 1, 0.2772280364935777, 0.001164185342888241],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2777246174717803, 0.00426451725853119, 0, -0.02302685245899454, 1, 0.2777246174717803, 0.001163650243628045],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 0, 1, 0.2777246174717803, 0, 0.001639764351626793, 0.008854135064617854, 0.7222753825282197, 1, 0.001163650243196344],
[234.6035205206457, 609.7333343105709, 1, 0, 0.2778553597160496, 0.004262510629766946, 0, -0.02301601738864706, 1, 0.2778553597160496, 0.001164907565861288],
[234.4931300253257, 609.8148314489158, 1, 0, 0.2777341215826966, 0.00426451725853119, 0, -0.02302685245899454, 1, 0.2777341215826966, 0.001167561511263963],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2777246174717803, 0.00426451725853119, 0, -0.02302685245899454, 1, 0.2777246174717803, 0.001164829052429292],
[234.3046153938818, 609.9901974113317, 1, 0, 0.2775151663142316, 0.004267948364222073, 0, -0.02304537919009338, 1, 0.2775151663142316, 0.001164829052097804],
[234.2757220369067, 610.06113279431, 0, 1, 0.2774671278369562, 0, 0.001639179987454082, 0.008850979709211466, 0.7225328721630437, 1, 0.001164378335051217],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 0, 1, 0.2777246174717803, 0, 0.001639764351626793, 0.008854135064617854, 0.7222753825282197, 1, 0.001164185342888241],
[234.4641020601515, 609.7548272584316, 0, 1, 0.2777290272908246, 0, 0.00164000341661284, 0.008855425929170178, 0.7222709727091754, 1, 0.00116412466621867],
[234.9931300253257, 609.3437248058908, 0, 1, 0.278316798183944, 0, 0.00164110986835641, 0.008861400368833006, 0.7216832018160559, 1, 0.001163650243677772],
[234.456973967338, 609.9219228898817, 0, 1, 0.2776679697230561, 0, 0.001639554117454711, 0.008852999876044586, 0.7223320302769438, 1, 0.001163890581832312],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2777246174717803, 0.00426451725853119, 0, -0.02302685245899454, 1, 0.2777246174717803, 0.001165629266314735],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 0, 1, 0.2777246174717803, 0, 0.001639764351626793, 0.008854135064617854, 0.7222753825282197, 1, 0.001163650243196344],
[234.346583472018, 610.1787859906424, 0, 1, 0.2774890985467067, 0, 0.001638863924737193, 0.008849273084731277, 0.7225109014532933, 1, 0.001163721129552711],
[234.7105380137448, 609.6263168174719, 0, 1, 0.2779821071066044, 0, 0.001640349132597256, 0.008857292670581515, 0.7220178928933956, 1, 0.001163721129552795],
[234.4931300253257, 609.6098580685714, 1, 0, 0.2778015637106606, 0.00426451725853119, 0, -0.02302685245899454, 1, 0.2778015637106606, 0.00116562926630808],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 0, 1, 0.2777246174717803, 0, 0.001639764351626793, 0.008854135064617854, 0.7222753825282197, 1, 0.001164742705563006],
[232.985732716114, 605.3511221151026, 1, 0, 0.2779142195329362, 0.004292108312136304, 0, -0.02317583418002807, 1, 0.2779142195329363, 0.001163959373679157],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2777246174717803, 0.00426451725853119, 0, -0.02302685245899454, 1, 0.2777246174717803, 0.001163952196114406],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2777246174717803, 0.00426451725853119, 0, -0.02302685245899454, 1, 0.2777246174717803, 0.001164181009274786],
[234.3046153938818, 610.0322394373347, 1, 0, 0.2775013480143769, 0.004267948364222073, 0, -0.02304537919009338, 1, 0.2775013480143769, 0.001164829052429292],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 0, 1, 0.2777246174717803, 0, 0.001639764351626793, 0.008854135064617854, 0.7222753825282197, 1, 0.001164544145474664],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2777246174717803, 0.00426451725853119, 0, -0.02302685245899454, 1, 0.2777246174717803, 0.001165096798305297],
[234.6816446567696, 609.6972522004501, 1, 0, 0.277934047771984, 0.004261091665104598, 0, -0.02300835549213133, 1, 0.277934047771984, 0.001163721129552711],
[234.3827395300058, 610.1150031629834, 1, 0, 0.2775409899647463, 0.004266525777475092, 0, -0.02303769773562927, 1, 0.2775409899647463, 0.001163650243677772],
[234.4931300253257, 609.7277835812047, 0, 1, 0.2777627588299914, 0, 0.001640076156816328, 0.008855818699988541, 0.7222372411700086, 1, 0.001163819703897904],
[234.5221579904999, 609.93262235335, 0, 1, 0.2777202088843714, 0, 0.001639525356328086, 0.008852844576351986, 0.7222797911156287, 1, 0.001164878946509701],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 0, 1, 0.2777246174717803, 0, 0.001639764351626793, 0.008854135064617854, 0.7222753825282197, 1, 0.001164829052429292],
[234.2757220369067, 610.0611327943099, 0, 1, 0.2774671278369563, 0, 0.001639179987454082, 0.008850979709211466, 0.7225328721630437, 1, 0.001164378335051217],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2777246174717803, 0.00426451725853119, 0, -0.02302685245899454, 1, 0.2777246174717803, 0.001163650243196344],
[234.2757220369067, 610.06113279431, 0, 1, 0.2774671278369562, 0, 0.001639179987454082, 0.008850979709211466, 0.7225328721630438, 1, 0.001164944957679513],
[234.4642366683506, 609.872618162866, 0, 1, 0.2776903972943596, 0, 0.001639686666065324, 0.008853715590653111, 0.7223096027056404, 1, 0.00116418534296718],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2777246174717803, 0.00426451725853119, 0, -0.02302685245899454, 1, 0.2777246174717803, 0.001163721129552711],
[234.6816446567696, 609.6552101744469, 1, 0, 0.2779478869291838, 0.004261091665104598, 0, -0.02300835549213133, 1, 0.2779478869291838, 0.001163721129552795],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2777246174717803, 0.00426451725853119, 0, -0.02302685245899454, 1, 0.2777246174717803, 0.001164742705425847],
[234.8322421635532, 609.5046126676634, 0, 1, 0.2781262488068181, 0, 0.001640676672852773, 0.008859061269623547, 0.7218737511931819, 1, 0.001164878946650231],
[234.2757220369067, 610.06113279431, 0, 1, 0.2774671278369562, 0, 0.001639179987454082, 0.008850979709211466, 0.7225328721630437, 1, 0.001164829052097804],
[234.6540178870982, 609.6828369441183, 0, 1, 0.2779151668489062, 0, 0.001640197065432001, 0.008856471562829827, 0.7220848331510938, 1, 0.001163721129552711],
[234.129175483599, 610.2076793476176, 0, 1, 0.2772935637523504, 0, 0.001638786324467623, 0.008848854071311975, 0.7227064362476496, 1, 0.001164742705563006],
[234.7105380137448, 609.6263168174719, 0, 1, 0.2779821071066044, 0, 0.001640349132597256, 0.008857292670581515, 0.7220178928933956, 1, 0.001164486610052446],
[234.6685699356085, 609.450876907189, 0, 1, 0.2780039848783527, 0, 0.001640821332598207, 0.008859842379984448, 0.7219960151216473, 1, 0.001167561511288431],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2777246174717803, 0.00426451725853119, 0, -0.02302685245899454, 1, 0.2777246174717803, 0.001164181009669053],
[234.8570845670525, 609.4797702641642, 0, 1, 0.2781556711912102, 0, 0.001640743546855664, 0.0088594223650781, 0.7218443288087899, 1, 0.001163650243196344],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2777246174717803, 0.00426451725853119, 0, -0.02302685245899454, 1, 0.2777246174717803, 0.001163721129552795],
[234.239565978919, 610.1538089789442, 0, 1, 0.2774057363851392, 0, 0.001638931012613754, 0.008849635335026376, 0.7225942636148608, 1, 0.001164944957679513],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2777246174717803, 0.00426451725853119, 0, -0.02302685245899454, 1, 0.2777246174717803, 0.001164185342888241],
[234.3046153938818, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2775633194261002, 0.004267948364222073, 0, -0.02304537919009338, 1, 0.2775633194261002, 0.001164829052097804],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 0, 1, 0.2777246174717803, 0, 0.001639764351626793, 0.008854135064617854, 0.7222753825282197, 1, 0.001164907565861288],
[234.41176749518, 610.0430128486699, 0, 2, 0.2775894848978543, 0, 0.003278457351164071, 0.01770248521502354, 0.5218769523301475, 1, 0.002333132351118612],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 0, 1, 0.2777246174717803, 0, 0.001639764351626793, 0.008854135064617854, 0.7222753825282197, 1, 0.0011643504915699],
[234.129175483599, 610.2076793476176, 0, 1, 0.2772935637523504, 0, 0.001638786324467623, 0.008848854071311975, 0.7227064362476496, 1, 0.001164829052429292],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2777246174717803, 0.00426451725853119, 0, -0.02302685245899454, 1, 0.2777246174717803, 0.001163721129552795],
[234.3322421635532, 610.0046126676634, 0, 1, 0.2775340680946544, 0, 0.001639331866076904, 0.008851799798902136, 0.7224659319053456, 1, 0.001164185342888241],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 0, 1, 0.2777246174717803, 0, 0.001639764351626793, 0.008854135064617854, 0.7222753825282197, 1, 0.001171296013838719],
[234.4642366683507, 609.872618162866, 0, 1, 0.2776903972943597, 0, 0.001639686666065324, 0.008853715590653111, 0.7223096027056404, 1, 0.001164829052429292],
[234.6540178870982, 609.6828369441184, 0, 1, 0.2779151668489062, 0, 0.001640197065432001, 0.008856471562829826, 0.7220848331510938, 1, 0.001163721129552795],
[234.5221579904999, 610.2858034837416, 0, 1, 0.2776041049391206, 0, 0.001638576539535449, 0.008847721308471907, 0.7223958950608793, 1, 0.001164878946651059],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 0, 2, 0.2777246174717803, 0, 0.003279528703253586, 0.01770827012923571, 0.521681728206286, 1, 0.002331902624486625],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 0, 1, 0.2777246174717803, 0, 0.001639764351626793, 0.008854135064617854, 0.7222753825282197, 1, 0.001164829052429292],
[234.3827395300058, 610.1150031629833, 1, 0, 0.2775409899647464, 0.004266525777475091, 0, -0.02303769773562926, 1, 0.2775409899647463, 0.00116381970431506],
[234.4366098986792, 609.9002449325374, 0, 1, 0.2776576772140821, 0, 0.00163961239286043, 0.00885331454218102, 0.7223423227859179, 1, 0.001165754004580854],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2777246174717803, 0.00426451725853119, 0, -0.02302685245899454, 1, 0.2777246174717803, 0.001164829052097804],
[234.5112499709657, 609.9435303728842, 0, 1, 0.2777072916509231, 0, 0.001639496035622606, 0.008852686255135736, 0.7222927083490769, 1, 0.001163650243677685],
[234.6035205206456, 609.7333343105709, 1, 0, 0.2778553597160496, 0.004262510629766947, 0, -0.02301601738864707, 1, 0.2778553597160496, 0.001164544145474664],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2777246174717803, 0.00426451725853119, 0, -0.02302685245899454, 1, 0.2777246174717803, 0.001164878946650231],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[232.2218154704065, 606.1715594874565, 0, 2, 0.2769843159627517, 0, 0.003299395969172628, 0.01781554618730915, 0.5227516793638499, 1, 0.002332969657348906],
[234.3466574198849, 609.9901974113317, 1, 0, 0.2775511409681755, 0.00426718268999363, 0, -0.02304124482589196, 1, 0.2775511409681755, 0.001165059898274166],
[234.2757220369067, 610.06113279431, 0, 1, 0.2774671278369562, 0, 0.001639179987454082, 0.008850979709211466, 0.7225328721630437, 1, 0.001164326530898234],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2777246174717803, 0.00426451725853119, 0, -0.02302685245899454, 1, 0.2777246174717803, 0.001163721129552711],
[234.6816446567697, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2778858435076837, 0.004261091665104597, 0, -0.02300835549213133, 1, 0.2778858435076837, 0.001163721130020807],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2777246174717803, 0.00426451725853119, 0, -0.02302685245899454, 1, 0.2777246174717803, 0.001164251918830229],
[234.4931300253257, 609.8148314489158, 1, 0, 0.2777341215826966, 0.00426451725853119, 0, -0.02302685245899454, 1, 0.2777341215826966, 0.001165418563210203],
[234.2757220369067, 610.06113279431, 0, 1, 0.2774671278369562, 0, 0.001639179987454082, 0.008850979709211466, 0.7225328721630438, 1, 0.00116482905235735],
[234.6816446567696, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2778858435076837, 0.004261091665104598, 0, -0.02300835549213133, 1, 0.2778858435076836, 0.001163721129552711],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[232.7902246000556, 606.0708838324465, 0, 1, 0.2775074708553935, 0, 0.001649972019240671, 0.008909252781781504, 0.7224925291446065, 1, 0.001164982809037904],
[234.5221579904999, 610.0485635780362, 0, 1, 0.2776820839289166, 0, 0.001639213760515776, 0.008851162071542665, 0.7223179160710833, 1, 0.00116431707969749],
[234.6035205206457, 609.733334310571, 1, 0, 0.2778553597160496, 0.004262510629766946, 0, -0.02301601738864706, 1, 0.2778553597160496, 0.001164284972124978],
[234.8322421635532, 609.5046126676634, 0, 1, 0.2781262488068181, 0, 0.001640676672852773, 0.008859061269623547, 0.7218737511931819, 1, 0.001164393795284309],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[234.5509167392759, 606.7859380919406, 0, 0, 0.2787835994493906, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004116547620542882],
[234.9931300253257, 609.3437248058908, 0, 1, 0.278316798183944, 0, 0.00164110986835641, 0.008861400368833006, 0.7216832018160559, 1, 0.0007518408867466438],
[234.7105380137448, 609.6263168174719, 0, 1, 0.2779821071066044, 0, 0.001640349132597256, 0.008857292670581515, 0.7220178928933956, 1, 0.001163956700483351],
[232.7684085609872, 605.6249663968759, 0, 1, 0.2776362689801621, 0, 0.001651186882121837, 0.008915812602419245, 0.7223637310198379, 1, 0.001164108230300042],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[234.5112499709657, 609.8256048602509, 0, 1, 0.2777460780364072, 0, 0.001639813074475878, 0.008854398150399723, 0.7222539219635928, 1, 0.001163546292689852],
[234.9280806103629, 609.4652943475003, 1, 0, 0.2782211319719156, 0.004256621845297999, 0, -0.022984220080087, 1, 0.2782211319719157, 0.001163721129552711],
[234.2757220369067, 610.06113279431, 0, 1, 0.2774671278369562, 0, 0.001639179987454082, 0.008850979709211466, 0.7225328721630437, 1, 0.001164829052097804],
[234.2757220369067, 610.06113279431, 0, 1, 0.2774671278369562, 0, 0.001639179987454082, 0.008850979709211466, 0.7225328721630437, 1, 0.001164944957536274],
[234.6540178870982, 609.6828369441183, 0, 1, 0.2779151668489062, 0, 0.001640197065432001, 0.008856471562829827, 0.7220848331510938, 1, 0.001164181009669053],
[234.3046153938818, 610.0322394373347, 1, 0, 0.2775013480143769, 0.004267948364222073, 0, -0.02304537919009338, 1, 0.2775013480143769, 0.001164829052097778],
[234.5744925554714, 609.6444367631118, 0, 1, 0.2778597877979468, 0, 0.001640300377888247, 0.008857029412767567, 0.7221402122020532, 1, 0.001165418563210203],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 0, 1, 0.2777246174717803, 0, 0.001639764351626793, 0.008854135064617854, 0.7222753825282197, 1, 0.001164251918830229],
[232.3551394068194, 605.6612062881559, 0, 1, 0.2772680277663617, 0, 0.001651088082937624, 0.008915279122519873, 0.7227319722336383, 1, 0.001165406133229597],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[234.3046153938818, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2775633194261002, 0.004267948364222073, 0, -0.02304537919009338, 1, 0.2775633194261002, 0.001164431079616309],
[234.3046153938818, 610.0322394373347, 1, 0, 0.2775013480143769, 0.004267948364222073, 0, -0.02304537919009338, 1, 0.2775013480143769, 0.001164829052097804],
[234.3827395300058, 609.9541153012108, 1, 0, 0.277593875227511, 0.004266525777475092, 0, -0.02303769773562927, 1, 0.277593875227511, 0.001163650243196344],
[234.4931300253257, 610.0046126676634, 0, 1, 0.2776717073009086, 0, 0.001639331866076904, 0.008851799798902136, 0.7223282926990914, 1, 0.001163819704257828],
[234.8322421635532, 609.5046126676634, 0, 1, 0.2781262488068181, 0, 0.001640676672852773, 0.008859061269623547, 0.7218737511931819, 1, 0.001164944957536274],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 0, 1, 0.2777246174717803, 0, 0.001639764351626793, 0.008854135064617854, 0.7222753825282197, 1, 0.001164829052429292],
[232.7321686697072, 605.6612062881559, 0, 1, 0.2775930435774306, 0, 0.001651088082937624, 0.008915279122519873, 0.7224069564225695, 1, 0.001165403711751609],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2777246174717803, 0.00426451725853119, 0, -0.02302685245899454, 1, 0.2777246174717803, 0.001164413563767595],
[234.2757220369067, 610.06113279431, 0, 1, 0.2774671278369562, 0, 0.001639179987454082, 0.008850979709211466, 0.7225328721630437, 1, 0.001164378334914994],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 0, 1, 0.2777246174717803, 0, 0.001639764351626793, 0.008854135064617854, 0.7222753825282197, 1, 0.001165096798305297],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 1, 0, 0.2777246174717803, 0.00426451725853119, 0, -0.02302685245899454, 1, 0.2777246174717803, 0.001164181009669125],
[232.7321686697072, 605.6612062881559, 0, 1, 0.2775930435774306, 0, 0.001651088082937624, 0.008915279122519873, 0.7224069564225695, 1, 0.001165475776600092],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 0, 1, 0.2777246174717803, 0, 0.001639764351626793, 0.008854135064617854, 0.7222753825282197, 1, 0.001164718497787312],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[232.9529496603471, 605.118649573971, 0, 1, 0.2779630641023731, 0, 0.001652568468521078, 0.008923272669818674, 0.7220369358976269, 1, 0.001165576176407623],
[234.6035205206456, 609.5724464487985, 1, 0, 0.2779083149723657, 0.004262510629766947, 0, -0.02301601738864707, 1, 0.2779083149723657, 0.001164914373237138],
[232.7321686697072, 605.6612062881559, 0, 1, 0.2775930435774306, 0, 0.001651088082937624, 0.008915279122519873, 0.7224069564225695, 1, 0.001165166963927454],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 0, 1, 0.2777246174717803, 0, 0.001639764351626793, 0.008854135064617854, 0.7222753825282197, 1, 0.001164315173642105],
[233.109197932595, 605.284177025268, 0, 1, 0.2780427480647863, 0, 0.001652116539564282, 0.008920832416730409, 0.7219572519352138, 1, 0.001164033508292403],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[234.6816446567697, 609.6552101744469, 1, 0, 0.2779478869291838, 0.004261091665104597, 0, -0.02300835549213133, 1, 0.2779478869291838, 0.00116416948725796],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[233.4103929461622, 604.9829820117009, 0, 1, 0.2784020006812353, 0, 0.001652939057351301, 0.008925273715611004, 0.7215979993187647, 1, 0.001164745535447593],
[234.8322421635532, 609.5046126676634, 0, 1, 0.2781262488068181, 0, 0.001640676672852773, 0.008859061269623547, 0.7218737511931819, 1, 0.001165126289371205],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[232.674381955757, 605.7189930021061, 0, 1, 0.2775241180399964, 0, 0.00165093056607608, 0.008914428588377158, 0.7224758819600036, 1, 0.001165652587746514],
[234.4642366683507, 609.8726181628659, 0, 1, 0.2776903972943597, 0, 0.001639686666065324, 0.008853715590653111, 0.7223096027056403, 1, 0.001164405658599737],
[232.0830484902727, 605.8755104907523, 0, 1, 0.2769624416420909, 0, 0.001650504076637809, 0.008912125699497828, 0.7230375583579091, 1, 0.001164992506421468],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[234.1685699356085, 609.950876907189, 1, 0, 0.2774116516465215, 0.004270427924101766, 0, -0.02305876791759793, 1, 0.2774116516465215, 0.001164898475829738],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[232.7321686697072, 605.6612062881559, 0, 1, 0.2775930435774306, 0, 0.001651088082937624, 0.008915279122519873, 0.7224069564225695, 1, 0.001165381942122219],
[234.4931300253257, 609.8437248058908, 0, 1, 0.2777246174717803, 0, 0.001639764351626793, 0.008854135064617854, 0.7222753825282197, 1, 0.00116457462185361],
[232.2900899918565, 606.1598050926531, 1, 0, 0.277047073836706, 0.004304961955264891, 0, -0.02324523920900068, 1, 0.2770470738367059, 0.001165203652537842],
[232.6671192547443, 605.7827758297652, 1, 0, 0.2774967480093646, 0.004297985908808681, 0, -0.02320757107852872, 1, 0.2774967480093646, 0.001164758717736781],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[232.4786046233004, 605.9712904612092, 1, 0, 0.2772719109230353, 0.004301471103632794, 0, -0.02322638987140502, 1, 0.2772719109230353, 0.001164871852457486],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[232.2611966348814, 606.1886984496282, 0, 1, 0.2770126133911331, 0, 0.001649651342160573, 0.00890752124140712, 0.7229873866088669, 1, 0.001165034197644527],
[232.2900899918565, 606.1598050926531, 1, 0, 0.277047073836706, 0.004304961955264891, 0, -0.02324523920900068, 1, 0.2770470738367059, 0.001165117006208639],
[232.4786046233004, 605.9712904612092, 1, 0, 0.2772719109230353, 0.004301471103632794, 0, -0.02322638987140502, 1, 0.2772719109230353, 0.001164705960784122],
[232.2611966348814, 606.1886984496282, 0, 1, 0.2770126133911331, 0, 0.001649651342160573, 0.00890752124140712, 0.7229873866088669, 1, 0.001165999228162923],
[232.4641893669688, 605.9857057175409, 0, 1, 0.277254718176735, 0, 0.001650203941388207, 0.00891050507758652, 0.7227452818232649, 1, 0.001165131331872779],
[232.4786046233004, 605.9712904612092, 0, 1, 0.2772719109230353, 0, 0.001650243197559562, 0.008910717046728888, 0.7227280890769647, 1, 0.001165157232886941],
[232.4786046233004, 605.9712904612092, 0, 1, 0.2772719109230353, 0, 0.001650243197559562, 0.008910717046728888, 0.7227280890769647, 1, 0.00116489386293108],
[232.4786046233004, 606.0278105878557, 0, 1, 0.2772532212109036, 0, 0.001650089290506298, 0.008909886004246689, 0.7227467787890964, 1, 0.001165157233031903],
[232.4786046233004, 605.9712904612092, 1, 0, 0.2772719109230353, 0.004301471103632794, 0, -0.02322638987140502, 1, 0.2772719109230353, 0.00116489386293108],
[232.3791221475147, 606.1886984496282, 0, 1, 0.2771142851415856, 0, 0.001649651342160573, 0.00890752124140712, 0.7228857148584144, 1, 0.001165653784739988],
[232.6394924850729, 605.8104025994367, 0, 1, 0.2774637981934801, 0, 0.001650681460254162, 0.008913083506938809, 0.7225362018065199, 1, 0.001164508353628869],
[232.4786046233004, 606.0278105878556, 0, 1, 0.2772532212109036, 0, 0.001650089290506298, 0.00890988600424669, 0.7227467787890964, 1, 0.001165157233031903],
[232.4641893669688, 605.9857057175409, 0, 1, 0.277254718176735, 0, 0.001650203941388207, 0.00891050507758652, 0.7227452818232649, 1, 0.001165131331872779],
[231.8714525220022, 606.1073359194825, 0, 1, 0.2767032480061321, 0, 0.001649872787767815, 0.008908716967679642, 0.7232967519938679, 1, 0.001165999228162923],
[232.9786046233004, 605.4712904612092, 0, 1, 0.2778682494793775, 0, 0.001651605973320823, 0.008918075543479361, 0.7221317505206224, 1, 0.001164438153014098],
[232.4786046233004, 605.9712904612092, 1, 0, 0.2772719109230353, 0.004301471103632794, 0, -0.02322638987140502, 1, 0.2772719109230353, 0.001165131331737631],
[232.4786046233004, 605.7538824727901, 0, 1, 0.2773438254924738, 0, 0.001650835477798063, 0.008913915146030524, 0.7226561745075262, 1, 0.001165653784739988],
[234.239565978919, 610.1538089789442, 0, 1, 0.2774057363851392, 0, 0.001638931012613754, 0.008849635335026376, 0.7225942636148608, 1, 0.001164984968786785],
[232.9787392314995, 608.5276759796566, 0, 1, 0.276859136211147, 0, 0.001643310632322712, 0.008873283699132054, 0.723140863788853, 1, 0.00117222904951114],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[233.2973526928692, 608.096022264994, 0, 1, 0.2772750055282437, 0, 0.001644477127601113, 0.008879582352189705, 0.7227249944717562, 1, 0.001164993814548998],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[234.3046153938818, 610.0322394373347, 1, 0, 0.2775013480143769, 0.004267948364222073, 0, -0.02304537919009338, 1, 0.2775013480143769, 0.001164550003702594]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.999999999999998, 0, -5.399638707740988, 1, 0.3333333333333333, 0.18519757600937],
[0.7279090834533908, 2.035511292749209, 0, 1, 0.2634087414719215, 0, 0.4912770582812029, 2.652718620120313, 0.7365912585280785, 1, 0.18519757600937],
[0.764148974733374, 2.000000000000004, 0, 0, 0.2764499966240356, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.999999999999998, 0, -5.399638707740988, 1, 0.3333333333333333, 0.18519757600937],
[0.9702487341385679, 2.029751265861437, 1, 0, 0.3234162447128555, 1.030663545145304, 0, -5.565210773024146, 1, 0.3234162447128555, 0.18519757600937],
[0.5072419457030567, 2.257647989330493, 0, 1, 0.183458277769347, 0, 0.4429388481844552, 2.391709749818998, 0.816541722230653, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 1.998528048156412, 1, 0, 0.3334969638235775, 0.999999999999998, 0, -5.399638707740988, 1, 0.3334969638235774, 0.18519757600937],
[0.9977108511185642, 2.002289148881442, 0, 1, 0.3325702837061874, 0, 0.4994283670560966, 2.696732742499978, 0.6674297162938126, 1, 0.18519757600937],
[0.9422132860498034, 2.057604984673054, 0, 1, 0.3140901218068657, 0, 0.486001933047852, 2.624234849722131, 0.6859098781931343, 1, 0.18519757600937],
[0.9410275938599646, 2.058972406140038, 1, 0, 0.3136758646199879, 1.062668094458462, 0, -5.738023776319278, 1, 0.313675864619988, 0.18519757600937],
[0, 1.985743814372916, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.072312115975508, 1.81464763073148, 0, 0, 0.371432998745009, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.292172255898936, 1.274196331686434, 0, 1, 0.5035022101461692, 0, 0.784808412276994, 4.237681881091613, 0.4964977898538308, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.999999999999998, 0, -5.399638707740988, 1, 0.3333333333333333, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.6782242764549814, 2.321775723545022, 0, 0, 0.2260747588183269, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.072312115975508, 1.81464763073148, 0, 0, 0.371432998745009, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.999999999999998, 0, -5.399638707740988, 1, 0.3333333333333333, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 1.942213286049806, 0, 0, 0.3398801863690154, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.293093106615355, 1.272090916546612, 0, 0, 0.5040937004673167, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.9986324424686055, 2.001367557531401, 0, 1, 0.3328774808228678, 0, 0.4996583442341077, 2.697974536172264, 0.6671225191771322, 1, 0.18519757600937],
[1.293093106615355, 1.272090916546612, 0, 0, 0.5040937004673167, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.507128092813544, 1.550658621136657, 0, 0, 0.2464434673309961, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.7279090834533908, 1.32987763049681, 0, 0, 0.3537339795804545, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0, 1.985743814372916, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.9986323377076163, 2.00136766229239, 0, 1, 0.3328774459025381, 0, 0.4996583180796417, 2.697974394947598, 0.6671225540974619, 1, 0.18519757600937],
[1.071900378330145, 1.815417118925014, 0, 1, 0.3712443745272737, 0, 0.5508375951594766, 2.974324000502075, 0.6287556254727262, 1, 0.18519757600937],
[3.117617635238448, 6.808853413505585, 0, 0, 0.3140710953499341, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04352165083273263],
[0.9362697086439548, 2.063730291356047, 1, 0, 0.312089902881318, 1.068068304215832, 0, -5.767182957955095, 1, 0.312089902881318, 0.18519757600937],
[0.5665501440114288, 2.433449855988575, 0, 1, 0.1888500480038093, 0, 0.4109392258644901, 2.218923350507022, 0.8111499519961907, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.9797661517571429, 1.927822346116933, 0, 15, 0.3369686434216922, 0, 7.780799942595007, 42.01350854722494, 0.002103831813458096, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.000000000000004, 0, 0, 0.2203288411508547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.7279090834533908, 1.804357441907519, 0, 0, 0.2874535820630674, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.433447587197128, 0, 1, 0.1884806460418397, 0, 0.4109396089980353, 2.218925419289743, 0.8115193539581603, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.999999999999998, 0, -5.399638707740988, 1, 0.3333333333333333, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.292399491020882, 1.273795437378565, 1, 0, 0.503624832516897, 0.7737545603721091, 0, -4.177995074476359, 1, 0.503624832516897, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.999999999999998, 0.499999999999999, -2.699819353870494, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.499999999999999, 2.699819353870494, 0.6666666666666667, 1, 0.18519757600937],
[0.002133110940110098, 2.997866889059893, 0, 1, 0.0007110369800366988, 0, 0.3335705143044533, 1.801160260799399, 0.9992889630199633, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.6778685020145305, 2.322131497985473, 0, 1, 0.2259561673381766, 0, 0.430638833704092, 2.325294115525054, 0.7740438326618234, 1, 0.18519757600937],
[0.6792352432735955, 2.320764756726408, 0, 1, 0.2264117477578649, 0, 0.4308924448725971, 2.32666352420723, 0.7735882522421351, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.499999999999999, 2.699819353870494, 0.6666666666666667, 1, 0.18519757600937],
[0, 3.000000000000003, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 1.999818178751056, 1, 0, 0.333353536918808, 0.999999999999998, 0, -5.399638707740988, 1, 0.333353536918808, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.499999999999999, 2.699819353870494, 0.6666666666666667, 1, 0.18519757600937],
[0, 3.000000000000003, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.18519757600937],
[0, 3.000000000000003, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.7279090834533908, 2.036239891279986, 0, 0, 0.2633393098950476, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.507822241234981, 2.256326733498395, 1, 0, 0.1837173921799799, 1.969192994714221, 0, -10.63293071727132, 1, 0.18371739217998, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.321775723545022, 0, 0, 0.1957713555953254, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.072312115975508, 1.81464763073148, 0, 0, 0.371432998745009, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5687388087678164, 2.431261191232188, 1, 0, 0.1895796029226052, 1.758276355655278, 0, -9.494057068902016, 1, 0.1895796029226052, 0.18519757600937],
[1.072312115975508, 1.81464763073148, 0, 0, 0.371432998745009, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.293093106615355, 1.272090916546612, 0, 0, 0.5040937004673167, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 2, 0, 0.3333333333333333, 1.999999999999996, 0, -10.79927741548198, 1, 0.1111111111111109, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.999999999999998, 0, -5.399638707740988, 1, 0.3333333333333333, 0.18519757600937],
[0.9986325785327134, 2.001367421467293, 1, 1, 0.3328775261775704, 1.001369293869118, 0.4996583782036658, -2.709057680323357, 0.8891925525659007, 0.5549476049210419, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.000000000000004, 0, 0, 0.2203288411508547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.002132990068697013, 2.997867009931305, 0, 1, 0.0007109966895656704, 0, 0.3335705008551779, 1.80116018817817, 0.9992890033104344, 1, 0.18519757600937],
[0.9999093094673777, 2.000090690532628, 1, 1, 0.3333031031557919, 1.000090698758141, 0.499977328394893, -2.700431512872204, 0.8889090414267194, 0.5555152477383034, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.000000000000004, 0, 0, 0.2203288411508547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0, 3.000000000000003, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.499999999999999, 2.699819353870494, 0.6666666666666667, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.499999999999999, 2.699819353870494, 0.6666666666666667, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0, 1.985743814372916, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.499999999999999, 2.699819353870494, 0.6666666666666667, 1, 0.18519757600937],
[0.00314377266189268, 2.99685622733811, 0, 1, 0.001047924220630892, 0, 0.3336830078392607, 1.801767685244315, 0.9989520757793691, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.6782242764549814, 2.321775723545022, 0, 0, 0.2260747588183269, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0, 3.000000000000003, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.999999999999998, 0, -5.399638707740988, 1, 0.3333333333333333, 0.18519757600937],
[0, 1.985743814372916, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.072312115975508, 1.81464763073148, 0, 0, 0.371432998745009, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5665504205539368, 2.433449579446067, 0, 1, 0.1888501401846454, 0, 0.4109392725645184, 2.218923602670302, 0.8111498598153546, 1, 0.18519757600937],
[0.006384723280748933, 2.993615276719254, 0, 2, 0.002128241093582976, 0, 0.6680885201093137, 3.607436633379651, 0.9957480472229864, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.830457623265638, 7.885621821222252, 0, 0, 0.1883946743873209, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04386951600323353],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.072312115975508, 1.81464763073148, 0, 0, 0.371432998745009, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.998632578533018, 2.001367421466988, 0, 1, 0.332877526177672, 0, 0.4996583782037419, 2.697974719596016, 0.667122473822328, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5073106765504377, 2.257580040865984, 0, 1, 0.1834830842878595, 0, 0.4429521797226779, 2.391781735308819, 0.8165169157121405, 1, 0.18519757600937],
[1.942213286049806, 1.0577867139502, 0, 0, 0.6474044286832675, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.7279090834533908, 2.036239891279986, 0, 0, 0.2633393098950476, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.9422132860498034, 2.057786713950199, 0, 0, 0.3140710953499342, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.3221313158578, 0, 1, 0.1957472450355361, 0, 0.430638867479636, 2.325294297900789, 0.8042527549644639, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.999999999999998, 0, -5.399638707740988, 1, 0.3333333333333333, 0.18519757600937],
[0, 3.000000000000003, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.566368587585843, 2.000000000000004, 1, 0, 0.2206887156917001, 1.765634644856487, 0, -9.533789172095618, 1, 0.2206887156917001, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.499999999999999, 2.699819353870494, 0.6666666666666667, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 1.942213286049806, 0, 0, 0.3398801863690154, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.293093106615355, 1.272090916546612, 0, 0, 0.5040937004673167, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.942213286049806, 1.0577867139502, 0, 0, 0.6474044286832675, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.9711694873366479, 2.028830512663357, 0, 0, 0.3237231624455488, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0, 3.000000000000003, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.999999999999998, 0.499999999999999, -2.699819353870494, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.18519757600937],
[0.764148974733374, 2.000000000000004, 0, 0, 0.2764499966240356, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.9989880706885386, 2.001011929311467, 0, 1, 0.3329960235628455, 0, 0.4997471456075188, 2.698454031505435, 0.6670039764371545, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.000000000000004, 0, 0, 0.2203288411508547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.9986331076410019, 2.001366892359004, 0, 2, 0.3328777025469999, 0, 0.9993170206001593, 5.395950865737029, 0.445052159758969, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5433679840935272, 2.456632015906477, 0, 0, 0.1811226613645088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.764148974733374, 2.000000000000004, 0, 0, 0.2764499966240356, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0, 1.985743814372916, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.499999999999999, 2.699819353870494, 0.6666666666666667, 1, 0.18519757600937],
[0.003141645449017372, 2.996858354550985, 0, 1, 0.001047215149672456, 0, 0.3336827709862946, 1.801766406323871, 0.9989527848503276, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.9999093094673777, 2.000090690532628, 0, 1, 0.3333031031557919, 0, 0.499977328394893, 2.699696935393996, 0.6666968968442081, 1, 0.18519757600937],
[1.074168786292699, 1.810018017090039, 1, 1, 0.3724338468759558, 0.9309523910588771, 0.5524806883456869, -2.043610455754786, 0.8612930297011769, 0.6061607234530888, 0.18519757600937],
[0.9977110208094144, 2.002288979190592, 0, 1, 0.3325703402698041, 0, 0.4994284093818673, 2.696732971043848, 0.6674296597301959, 1, 0.18519757600937],
[0.9998183711502927, 2.000181628849713, 0, 1, 0.3332727903834303, 0, 0.4999545969108271, 2.69957419359275, 0.6667272096165697, 1, 0.18519757600937],
[0.9986324424687737, 2.001367557531232, 0, 1, 0.3328774808229239, 0, 0.4996583442341497, 2.697974536172491, 0.6671225191770761, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.000000000000004, 0, 0, 0.2203288411508547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.7279090834533908, 2.036239891279986, 0, 0, 0.2633393098950476, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.001011052454045, 0, 1, 0.2202420340263075, 0, 0.4997473646003091, 2.698455213987383, 0.7797579659736925, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.000000000000004, 0, 0, 0.2203288411508547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 2, 0.188394674387321, 0, 0.8214173140909353, 4.43535672437406, 0.6587032045628626, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.293093106615355, 1.272090916546612, 0, 0, 0.5040937004673167, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 1, 0.188394674387321, 0, 0.4107086570454677, 2.21767836218703, 0.811605325612679, 1, 0.18519757600937],
[0.7288548667610719, 1.328931847189129, 0, 1, 0.3541935915029484, 0, 0.7524840360437864, 4.063141927979202, 0.6458064084970516, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.999999999999998, 0, -5.399638707740988, 1, 0.3333333333333333, 0.18519757600937],
[0.6782242764549814, 2.321775723545022, 0, 0, 0.2260747588183269, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 1.999817844421825, 1, 0, 0.3333535740710077, 0.999999999999998, 0, -5.399638707740988, 1, 0.3333535740710076, 0.18519757600937],
[0.002988807352987419, 2.997011192647015, 0, 2, 0.0009962691176624721, 0, 0.6673315084397677, 3.603349043866559, 0.9980084543168298, 1, 0.18519757600937],
[0, 1.985743814372916, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.9958944380073664, 2.00410556199264, 0, 2, 0.3319648126691215, 0, 0.9979514242809857, 5.38857713899287, 0.446271011512202, 1, 0.18519757600937],
[0.274377748804994, 2.725622251195009, 0, 1, 0.0914592496016646, 0, 0.3668886983739456, 1.981066417172668, 0.9085407503983354, 1, 0.18519757600937],
[0.9711694873366479, 2.028830512663357, 0, 0, 0.3237231624455488, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.9422132860498034, 2.057786713950199, 0, 0, 0.3140710953499342, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.9422132860498034, 2.000000000000004, 0, 0, 0.320239627261969, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 1.942213286049806, 0, 0, 0.3398801863690154, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.999999999999998, 0, -5.399638707740988, 1, 0.3333333333333333, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.9989886299024003, 2.001011370097606, 1, 1, 0.3329962099674662, 1.001012394002621, 0.4997472852696593, -2.7066504839545, 0.8891135241473032, 0.5551059440822355, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.006398934537171723, 2.993601065462831, 0, 1, 0.002132978179057239, 0, 0.3340458458333002, 1.80372687932157, 0.9978670218209428, 1, 0.18519757600937],
[0.5665510426278102, 2.433448957372194, 0, 1, 0.1888503475426032, 0, 0.4109393776148356, 2.218924169904061, 0.8111496524573969, 1, 0.18519757600937],
[1.070717126647487, 1.816598147588333, 0, 1, 0.3708348500081521, 0, 0.5504794779888843, 2.972390297165838, 0.6291651499918478, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.499999999999999, 2.699819353870494, 0.6666666666666667, 1, 0.18519757600937],
[0.764148974733374, 2.000000000000004, 0, 0, 0.2764499966240356, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.9986331076408419, 2.001366892359164, 0, 2, 0.3328777025469467, 0, 0.9993170206000797, 5.395950865736599, 0.4450521597590401, 1, 0.18519757600937],
[0.6802466096067721, 2.319753390393231, 0, 2, 0.2267488698689238, 0, 0.8621606108143123, 4.655355806442583, 0.5979173102489866, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0, 3.000000000000003, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.321775723545022, 0, 0, 0.1957713555953254, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.9986324424686055, 2.0013675575314, 0, 1, 0.3328774808228678, 0, 0.4996583442341078, 2.697974536172265, 0.6671225191771322, 1, 0.18519757600937],
[0.5083697824521524, 2.02830930872851, 1, 1, 0.2004076054474587, 1.967072069422458, 0.4930214517562272, -7.959340772320105, 0.9598367916788159, 0.360652002573733, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.000000000000004, 0, 0, 0.2203288411508547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.9410275938599646, 2.029751774970512, 1, 0, 0.3167611852072422, 1.062668094458462, 0, -5.738023776319278, 1, 0.3167611852072422, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.6782242764549814, 2.321775723545022, 0, 0, 0.2260747588183269, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.9410275938596272, 2.058972406140375, 1, 0, 0.3136758646198755, 1.062668094458843, 0, -5.738023776321336, 1, 0.3136758646198754, 0.18519757600937],
[0.942133257732778, 2.056496113099207, 1, 1, 0.3141879643069655, 1.061420973935765, 0.4862639873862769, -3.105639927600284, 0.9012859230846448, 0.529661851698576, 0.18519757600937],
[0.2720909165466105, 2.727909083453393, 0, 0, 0.09069697218220341, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.998632578533018, 2.001367421466988, 0, 1, 0.332877526177672, 0, 0.4996583782037419, 2.697974719596016, 0.667122473822328, 1, 0.18519757600937],
[0.5089500754526143, 1.554759964243415, 0, 2, 0.2466189850622519, 0, 1.286372202781315, 6.945945138700042, 0.5675829536686314, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.321775723545022, 0, 0, 0.1957713555953254, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.2720909165466105, 2.727909083453393, 0, 0, 0.09069697218220341, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0, 3.000000000000003, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.942213286049806, 1.0577867139502, 0, 0, 0.6474044286832675, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.000000000000004, 0, 0, 0.2203288411508547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.321775723545022, 0, 0, 0.1957713555953254, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.9410275938599646, 2.058972406140038, 1, 0, 0.3136758646199879, 1.062668094458462, 0, -5.738023776319278, 1, 0.313675864619988, 0.18519757600937],
[1.293093106615355, 1.272090916546612, 0, 0, 0.5040937004673167, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.000000000000004, 0, 0, 0.2203288411508547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5663685875853666, 2.321210929805644, 1, 1, 0.1961395640100303, 1.765634644857972, 0.4308096205990768, -7.207572869049648, 0.9615292714299553, 0.3538083994500159, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.999999999999998, 0.499999999999999, -2.699819353870494, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.321775723545022, 0, 0, 0.1957713555953254, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.9422132860498034, 2.000000000000004, 0, 0, 0.320239627261969, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.999818270722805, 2.000181729277201, 1, 1, 0.3332727569076011, 1.000181762308728, 0.499954571808516, -2.701046100489474, 0.8889292695032071, 0.5554747833184092, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.321775723545022, 0, 0, 0.1957713555953254, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.293093106615355, 1.272090916546612, 0, 0, 0.5040937004673167, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.9998182707228568, 2.000181729277149, 0, 1, 0.3332727569076183, 0, 0.4999545718085289, 2.699574058049409, 0.6667272430923817, 1, 0.18519757600937],
[0.9422132860498034, 2.057786713950199, 0, 0, 0.3140710953499342, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.999999999999998, 0, -5.399638707740988, 1, 0.3333333333333333, 0.18519757600937],
[0.9410275938599646, 2.000000000000004, 1, 0, 0.3199655779580455, 1.062668094458462, 0, -5.738023776319278, 1, 0.3199655779580455, 0.18519757600937],
[0.5663685875853666, 2.433631412414637, 1, 0, 0.188789529195122, 1.765634644857972, 0, -9.533789172103637, 1, 0.1887895291951219, 0.18519757600937],
[0.7635228211577513, 2.001368389640917, 0, 1, 0.2761493176207825, 0, 0.499658136491013, 2.697973414434609, 0.7238506823792175, 1, 0.18519757600937],
[1.939479108276576, 1.060165596020117, 2, 0, 0.6465696105603657, 1.031204714433456, 0, -5.56813289165989, 1, 0.4180522613001829, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5663685875853665, 2.000000000000004, 1, 0, 0.2206887156915554, 1.765634644857973, 0, -9.533789172103639, 1, 0.2206887156915555, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.9386554397464646, 2.000000000000004, 1, 0, 0.3194166376400517, 1.065353651250458, 0, -5.752524812725175, 1, 0.3194166376400518, 0.18519757600937],
[1.292399390010684, 1.273795685605373, 1, 0, 0.5036247642632634, 0.773754620846527, 0, -4.177995401016368, 1, 0.5036247642632634, 0.18519757600937],
[0.9986312048345609, 2.001368795165445, 0, 1, 0.3328770682781863, 0, 0.499658035248488, 2.697972867761552, 0.6671229317218137, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5078224578585316, 1.549964256091669, 1, 0, 0.2467809002827594, 1.969192154708877, 0, -10.63292618154595, 1, 0.2467809002827595, 0.18519757600937],
[0.507128092813544, 2.025138432547364, 0, 0, 0.200266475797316, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.764148974733374, 2.000000000000004, 0, 0, 0.2764499966240356, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.000000000000004, 0, 0, 0.2203288411508547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0, 3.000000000000003, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5661871782470843, 2.433071559361743, 1, 1, 0.1887757035254917, 1.76620036344871, 0.4110031191447266, -7.317575496967724, 0.9643637337584557, 0.341915140809439, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 1.942213286049806, 0, 0, 0.3398801863690154, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5116422263134381, 1.549108267472726, 0, 1, 0.2482795602166331, 0, 0.6455326725687406, 3.485643205913667, 0.7517204397833669, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 1.532266525360906, 0, 0, 0.3949031391383567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.932265863303664, 1.060665331588901, 1, 1, 0.645609851172347, 0.5175271265674923, 0.9428044551074152, 2.296343924708853, 0.5831879200692198, 0.874407622413914, 0.18519757600937],
[0.999454621258079, 2.000545378741927, 1, 1, 0.333151540419359, 1.000545676342198, 0.499863692484129, -2.703501820308583, 0.8890100511162081, 0.5553131319549263, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.999999999999998, 0, -5.399638707740988, 1, 0.3333333333333333, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.499999999999999, 2.699819353870494, 0.6666666666666667, 1, 0.18519757600937],
[0.507128092813544, 2.257020881919831, 0, 0, 0.1834662666336428, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5656960244798253, 2.433561889233412, 0, 1, 0.1886119969520941, 0, 0.4109203075640729, 2.218821198519804, 0.8113880030479059, 1, 0.18519757600937],
[0.9422132860498034, 2.057786713950199, 0, 0, 0.3140710953499342, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.2720909165466105, 2.727909083453393, 0, 0, 0.09069697218220341, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.9410273007483362, 2.058972699251667, 1, 0, 0.3136757669161118, 1.062668425458822, 0, -5.738025563601637, 1, 0.3136757669161118, 0.18519757600937],
[0.7275571059769419, 2.036591868756435, 1, 1, 0.2632119732429111, 1.374462556663824, 0.4910163962358401, -4.770290084052103, 0.9307194571415731, 0.4571434036273953, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.9422132860498034, 2.057786713950199, 0, 0, 0.3140710953499342, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.6792359271637471, 2.320764072836256, 0, 1, 0.2264119757212488, 0, 0.4308925718493558, 2.326664209835851, 0.7735880242787512, 1, 0.18519757600937],
[0.7279090834533908, 2.036239891279986, 0, 0, 0.2633393098950476, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.072312115975508, 1.81464763073148, 0, 0, 0.371432998745009, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.075045203508433, 1.812269697229407, 1, 0, 0.3723338951472561, 0.9301934437142541, 0, -5.022708524366384, 1, 0.3723338951472561, 0.18519757600937],
[0.9986331076408419, 2.001366892359164, 0, 1, 0.3328777025469466, 0, 0.4996585103000397, 2.697975432868299, 0.6671222974530534, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.7279090834533908, 2.036239891279986, 0, 0, 0.2633393098950476, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.321775723545022, 0, 0, 0.1957713555953254, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.9665577550156792, 2.033442244984326, 1, 0, 0.3221859183385592, 1.034599324055683, 0, -5.586462557173737, 1, 0.3221859183385591, 0.18519757600937],
[0.7268840724605783, 2.038750536342508, 0, 1, 0.2628272260358934, 0, 0.4904964987987138, 2.648503880924971, 0.7371727739641066, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.999999999999998, 0, -5.399638707740988, 1, 0.3333333333333333, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 1, 3, 0.3333333333333333, 0.999999999999998, 1.499999999999997, 2.699819353870494, 0.5925925925925928, 0.802469135802469, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.999999999999998, 0, -5.399638707740988, 1, 0.3333333333333333, 0.18519757600937],
[0.5080049756927574, 1.552745581189339, 1, 1, 0.2465145400525166, 1.968484656348725, 0.6440205092929913, -7.151627875457308, 0.939230581542696, 0.4322596616477294, 0.18519757600937]
],
"RESOLVED": [
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.999999999999998, 0, -5.399638707740988, 1, 0.3333333333333333, 0.18519757600937],
[0.7279090834533908, 2.035511292749209, 0, 1, 0.2634087414719215, 0, 0.4912770582812029, 2.652718620120313, 0.7365912585280785, 1, 0.18519757600937],
[0.764148974733374, 2.000000000000004, 0, 0, 0.2764499966240356, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.999999999999998, 0, -5.399638707740988, 1, 0.3333333333333333, 0.18519757600937],
[0.9702487341385679, 2.029751265861437, 1, 0, 0.3234162447128555, 1.030663545145304, 0, -5.565210773024146, 1, 0.3234162447128555, 0.18519757600937],
[0.5072419457030567, 2.257647989330493, 0, 1, 0.183458277769347, 0, 0.4429388481844552, 2.391709749818998, 0.816541722230653, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 1.998528048156412, 1, 0, 0.3334969638235775, 0.999999999999998, 0, -5.399638707740988, 1, 0.3334969638235774, 0.18519757600937],
[0.9977108511185642, 2.002289148881442, 0, 1, 0.3325702837061874, 0, 0.4994283670560966, 2.696732742499978, 0.6674297162938126, 1, 0.18519757600937],
[0.9422132860498034, 2.057604984673054, 0, 1, 0.3140901218068657, 0, 0.486001933047852, 2.624234849722131, 0.6859098781931343, 1, 0.18519757600937],
[0.9410275938599646, 2.058972406140038, 1, 0, 0.3136758646199879, 1.062668094458462, 0, -5.738023776319278, 1, 0.313675864619988, 0.18519757600937],
[0, 1.985743814372916, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.072312115975508, 1.81464763073148, 0, 0, 0.371432998745009, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.292172255898936, 1.274196331686434, 0, 1, 0.5035022101461692, 0, 0.784808412276994, 4.237681881091613, 0.4964977898538308, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.999999999999998, 0, -5.399638707740988, 1, 0.3333333333333333, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.6782242764549814, 2.321775723545022, 0, 0, 0.2260747588183269, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.072312115975508, 1.81464763073148, 0, 0, 0.371432998745009, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.999999999999998, 0, -5.399638707740988, 1, 0.3333333333333333, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 1.942213286049806, 0, 0, 0.3398801863690154, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.293093106615355, 1.272090916546612, 0, 0, 0.5040937004673167, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.9986324424686055, 2.001367557531401, 0, 1, 0.3328774808228678, 0, 0.4996583442341077, 2.697974536172264, 0.6671225191771322, 1, 0.18519757600937],
[1.293093106615355, 1.272090916546612, 0, 0, 0.5040937004673167, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.507128092813544, 1.550658621136657, 0, 0, 0.2464434673309961, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.7279090834533908, 1.32987763049681, 0, 0, 0.3537339795804545, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0, 1.985743814372916, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.9986323377076163, 2.00136766229239, 0, 1, 0.3328774459025381, 0, 0.4996583180796417, 2.697974394947598, 0.6671225540974619, 1, 0.18519757600937],
[1.071900378330145, 1.815417118925014, 0, 1, 0.3712443745272737, 0, 0.5508375951594766, 2.974324000502075, 0.6287556254727262, 1, 0.18519757600937],
[3.117617635238448, 6.808853413505585, 0, 0, 0.3140710953499341, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04352165083273263],
[0.9362697086439548, 2.063730291356047, 1, 0, 0.312089902881318, 1.068068304215832, 0, -5.767182957955095, 1, 0.312089902881318, 0.18519757600937],
[0.5665501440114288, 2.433449855988575, 0, 1, 0.1888500480038093, 0, 0.4109392258644901, 2.218923350507022, 0.8111499519961907, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.9797661517571429, 1.927822346116933, 0, 15, 0.3369686434216922, 0, 7.780799942595007, 42.01350854722494, 0.002103831813458096, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.000000000000004, 0, 0, 0.2203288411508547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.7279090834533908, 1.804357441907519, 0, 0, 0.2874535820630674, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.433447587197128, 0, 1, 0.1884806460418397, 0, 0.4109396089980353, 2.218925419289743, 0.8115193539581603, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.999999999999998, 0, -5.399638707740988, 1, 0.3333333333333333, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.292399491020882, 1.273795437378565, 1, 0, 0.503624832516897, 0.7737545603721091, 0, -4.177995074476359, 1, 0.503624832516897, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.999999999999998, 0.499999999999999, -2.699819353870494, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.499999999999999, 2.699819353870494, 0.6666666666666667, 1, 0.18519757600937],
[0.002133110940110098, 2.997866889059893, 0, 1, 0.0007110369800366988, 0, 0.3335705143044533, 1.801160260799399, 0.9992889630199633, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.6778685020145305, 2.322131497985473, 0, 1, 0.2259561673381766, 0, 0.430638833704092, 2.325294115525054, 0.7740438326618234, 1, 0.18519757600937],
[0.6792352432735955, 2.320764756726408, 0, 1, 0.2264117477578649, 0, 0.4308924448725971, 2.32666352420723, 0.7735882522421351, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.499999999999999, 2.699819353870494, 0.6666666666666667, 1, 0.18519757600937],
[0, 3.000000000000003, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 1.999818178751056, 1, 0, 0.333353536918808, 0.999999999999998, 0, -5.399638707740988, 1, 0.333353536918808, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.499999999999999, 2.699819353870494, 0.6666666666666667, 1, 0.18519757600937],
[0, 3.000000000000003, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.18519757600937],
[0, 3.000000000000003, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.7279090834533908, 2.036239891279986, 0, 0, 0.2633393098950476, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.507822241234981, 2.256326733498395, 1, 0, 0.1837173921799799, 1.969192994714221, 0, -10.63293071727132, 1, 0.18371739217998, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.321775723545022, 0, 0, 0.1957713555953254, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.072312115975508, 1.81464763073148, 0, 0, 0.371432998745009, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5687388087678164, 2.431261191232188, 1, 0, 0.1895796029226052, 1.758276355655278, 0, -9.494057068902016, 1, 0.1895796029226052, 0.18519757600937],
[1.072312115975508, 1.81464763073148, 0, 0, 0.371432998745009, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.293093106615355, 1.272090916546612, 0, 0, 0.5040937004673167, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 2, 0, 0.3333333333333333, 1.999999999999996, 0, -10.79927741548198, 1, 0.1111111111111109, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.999999999999998, 0, -5.399638707740988, 1, 0.3333333333333333, 0.18519757600937],
[0.9986325785327134, 2.001367421467293, 1, 1, 0.3328775261775704, 1.001369293869118, 0.4996583782036658, -2.709057680323357, 0.8891925525659007, 0.5549476049210419, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.000000000000004, 0, 0, 0.2203288411508547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.002132990068697013, 2.997867009931305, 0, 1, 0.0007109966895656704, 0, 0.3335705008551779, 1.80116018817817, 0.9992890033104344, 1, 0.18519757600937],
[0.9999093094673777, 2.000090690532628, 1, 1, 0.3333031031557919, 1.000090698758141, 0.499977328394893, -2.700431512872204, 0.8889090414267194, 0.5555152477383034, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.000000000000004, 0, 0, 0.2203288411508547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0, 3.000000000000003, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.499999999999999, 2.699819353870494, 0.6666666666666667, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.499999999999999, 2.699819353870494, 0.6666666666666667, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0, 1.985743814372916, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.499999999999999, 2.699819353870494, 0.6666666666666667, 1, 0.18519757600937],
[0.00314377266189268, 2.99685622733811, 0, 1, 0.001047924220630892, 0, 0.3336830078392607, 1.801767685244315, 0.9989520757793691, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.6782242764549814, 2.321775723545022, 0, 0, 0.2260747588183269, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0, 3.000000000000003, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.999999999999998, 0, -5.399638707740988, 1, 0.3333333333333333, 0.18519757600937],
[0, 1.985743814372916, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.072312115975508, 1.81464763073148, 0, 0, 0.371432998745009, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5665504205539368, 2.433449579446067, 0, 1, 0.1888501401846454, 0, 0.4109392725645184, 2.218923602670302, 0.8111498598153546, 1, 0.18519757600937],
[0.006384723280748933, 2.993615276719254, 0, 2, 0.002128241093582976, 0, 0.6680885201093137, 3.607436633379651, 0.9957480472229864, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.830457623265638, 7.885621821222252, 0, 0, 0.1883946743873209, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04386951600323353],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.072312115975508, 1.81464763073148, 0, 0, 0.371432998745009, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.998632578533018, 2.001367421466988, 0, 1, 0.332877526177672, 0, 0.4996583782037419, 2.697974719596016, 0.667122473822328, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5073106765504377, 2.257580040865984, 0, 1, 0.1834830842878595, 0, 0.4429521797226779, 2.391781735308819, 0.8165169157121405, 1, 0.18519757600937],
[1.942213286049806, 1.0577867139502, 0, 0, 0.6474044286832675, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.7279090834533908, 2.036239891279986, 0, 0, 0.2633393098950476, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.9422132860498034, 2.057786713950199, 0, 0, 0.3140710953499342, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.3221313158578, 0, 1, 0.1957472450355361, 0, 0.430638867479636, 2.325294297900789, 0.8042527549644639, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.999999999999998, 0, -5.399638707740988, 1, 0.3333333333333333, 0.18519757600937],
[0, 3.000000000000003, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.566368587585843, 2.000000000000004, 1, 0, 0.2206887156917001, 1.765634644856487, 0, -9.533789172095618, 1, 0.2206887156917001, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.499999999999999, 2.699819353870494, 0.6666666666666667, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 1.942213286049806, 0, 0, 0.3398801863690154, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.293093106615355, 1.272090916546612, 0, 0, 0.5040937004673167, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.942213286049806, 1.0577867139502, 0, 0, 0.6474044286832675, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.9711694873366479, 2.028830512663357, 0, 0, 0.3237231624455488, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0, 3.000000000000003, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.999999999999998, 0.499999999999999, -2.699819353870494, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.18519757600937],
[0.764148974733374, 2.000000000000004, 0, 0, 0.2764499966240356, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.9989880706885386, 2.001011929311467, 0, 1, 0.3329960235628455, 0, 0.4997471456075188, 2.698454031505435, 0.6670039764371545, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.000000000000004, 0, 0, 0.2203288411508547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.9986331076410019, 2.001366892359004, 0, 2, 0.3328777025469999, 0, 0.9993170206001593, 5.395950865737029, 0.445052159758969, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5433679840935272, 2.456632015906477, 0, 0, 0.1811226613645088, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.764148974733374, 2.000000000000004, 0, 0, 0.2764499966240356, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0, 1.985743814372916, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.499999999999999, 2.699819353870494, 0.6666666666666667, 1, 0.18519757600937],
[0.003141645449017372, 2.996858354550985, 0, 1, 0.001047215149672456, 0, 0.3336827709862946, 1.801766406323871, 0.9989527848503276, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.9999093094673777, 2.000090690532628, 0, 1, 0.3333031031557919, 0, 0.499977328394893, 2.699696935393996, 0.6666968968442081, 1, 0.18519757600937],
[1.074168786292699, 1.810018017090039, 1, 1, 0.3724338468759558, 0.9309523910588771, 0.5524806883456869, -2.043610455754786, 0.8612930297011769, 0.6061607234530888, 0.18519757600937],
[0.9977110208094144, 2.002288979190592, 0, 1, 0.3325703402698041, 0, 0.4994284093818673, 2.696732971043848, 0.6674296597301959, 1, 0.18519757600937],
[0.9998183711502927, 2.000181628849713, 0, 1, 0.3332727903834303, 0, 0.4999545969108271, 2.69957419359275, 0.6667272096165697, 1, 0.18519757600937],
[0.9986324424687737, 2.001367557531232, 0, 1, 0.3328774808229239, 0, 0.4996583442341497, 2.697974536172491, 0.6671225191770761, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.000000000000004, 0, 0, 0.2203288411508547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.7279090834533908, 2.036239891279986, 0, 0, 0.2633393098950476, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.001011052454045, 0, 1, 0.2202420340263075, 0, 0.4997473646003091, 2.698455213987383, 0.7797579659736925, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.000000000000004, 0, 0, 0.2203288411508547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 2, 0.188394674387321, 0, 0.8214173140909353, 4.43535672437406, 0.6587032045628626, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.293093106615355, 1.272090916546612, 0, 0, 0.5040937004673167, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 1, 0.188394674387321, 0, 0.4107086570454677, 2.21767836218703, 0.811605325612679, 1, 0.18519757600937],
[0.7288548667610719, 1.328931847189129, 0, 1, 0.3541935915029484, 0, 0.7524840360437864, 4.063141927979202, 0.6458064084970516, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.999999999999998, 0, -5.399638707740988, 1, 0.3333333333333333, 0.18519757600937],
[0.6782242764549814, 2.321775723545022, 0, 0, 0.2260747588183269, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 1.999817844421825, 1, 0, 0.3333535740710077, 0.999999999999998, 0, -5.399638707740988, 1, 0.3333535740710076, 0.18519757600937],
[0.002988807352987419, 2.997011192647015, 0, 2, 0.0009962691176624721, 0, 0.6673315084397677, 3.603349043866559, 0.9980084543168298, 1, 0.18519757600937],
[0, 1.985743814372916, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.9958944380073664, 2.00410556199264, 0, 2, 0.3319648126691215, 0, 0.9979514242809857, 5.38857713899287, 0.446271011512202, 1, 0.18519757600937],
[0.274377748804994, 2.725622251195009, 0, 1, 0.0914592496016646, 0, 0.3668886983739456, 1.981066417172668, 0.9085407503983354, 1, 0.18519757600937],
[0.9711694873366479, 2.028830512663357, 0, 0, 0.3237231624455488, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.9422132860498034, 2.057786713950199, 0, 0, 0.3140710953499342, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.9422132860498034, 2.000000000000004, 0, 0, 0.320239627261969, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 1.942213286049806, 0, 0, 0.3398801863690154, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.999999999999998, 0, -5.399638707740988, 1, 0.3333333333333333, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.9989886299024003, 2.001011370097606, 1, 1, 0.3329962099674662, 1.001012394002621, 0.4997472852696593, -2.7066504839545, 0.8891135241473032, 0.5551059440822355, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.006398934537171723, 2.993601065462831, 0, 1, 0.002132978179057239, 0, 0.3340458458333002, 1.80372687932157, 0.9978670218209428, 1, 0.18519757600937],
[0.5665510426278102, 2.433448957372194, 0, 1, 0.1888503475426032, 0, 0.4109393776148356, 2.218924169904061, 0.8111496524573969, 1, 0.18519757600937],
[1.070717126647487, 1.816598147588333, 0, 1, 0.3708348500081521, 0, 0.5504794779888843, 2.972390297165838, 0.6291651499918478, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.499999999999999, 2.699819353870494, 0.6666666666666667, 1, 0.18519757600937],
[0.764148974733374, 2.000000000000004, 0, 0, 0.2764499966240356, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.9986331076408419, 2.001366892359164, 0, 2, 0.3328777025469467, 0, 0.9993170206000797, 5.395950865736599, 0.4450521597590401, 1, 0.18519757600937],
[0.6802466096067721, 2.319753390393231, 0, 2, 0.2267488698689238, 0, 0.8621606108143123, 4.655355806442583, 0.5979173102489866, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0, 3.000000000000003, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.321775723545022, 0, 0, 0.1957713555953254, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.9986324424686055, 2.0013675575314, 0, 1, 0.3328774808228678, 0, 0.4996583442341078, 2.697974536172265, 0.6671225191771322, 1, 0.18519757600937],
[0.5083697824521524, 2.02830930872851, 1, 1, 0.2004076054474587, 1.967072069422458, 0.4930214517562272, -7.959340772320105, 0.9598367916788159, 0.360652002573733, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.000000000000004, 0, 0, 0.2203288411508547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.9410275938599646, 2.029751774970512, 1, 0, 0.3167611852072422, 1.062668094458462, 0, -5.738023776319278, 1, 0.3167611852072422, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.6782242764549814, 2.321775723545022, 0, 0, 0.2260747588183269, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.9410275938596272, 2.058972406140375, 1, 0, 0.3136758646198755, 1.062668094458843, 0, -5.738023776321336, 1, 0.3136758646198754, 0.18519757600937],
[0.942133257732778, 2.056496113099207, 1, 1, 0.3141879643069655, 1.061420973935765, 0.4862639873862769, -3.105639927600284, 0.9012859230846448, 0.529661851698576, 0.18519757600937],
[0.2720909165466105, 2.727909083453393, 0, 0, 0.09069697218220341, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.998632578533018, 2.001367421466988, 0, 1, 0.332877526177672, 0, 0.4996583782037419, 2.697974719596016, 0.667122473822328, 1, 0.18519757600937],
[0.5089500754526143, 1.554759964243415, 0, 2, 0.2466189850622519, 0, 1.286372202781315, 6.945945138700042, 0.5675829536686314, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.321775723545022, 0, 0, 0.1957713555953254, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.2720909165466105, 2.727909083453393, 0, 0, 0.09069697218220341, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0, 3.000000000000003, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.942213286049806, 1.0577867139502, 0, 0, 0.6474044286832675, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.000000000000004, 0, 0, 0.2203288411508547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.321775723545022, 0, 0, 0.1957713555953254, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.9410275938599646, 2.058972406140038, 1, 0, 0.3136758646199879, 1.062668094458462, 0, -5.738023776319278, 1, 0.313675864619988, 0.18519757600937],
[1.293093106615355, 1.272090916546612, 0, 0, 0.5040937004673167, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.000000000000004, 0, 0, 0.2203288411508547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5663685875853666, 2.321210929805644, 1, 1, 0.1961395640100303, 1.765634644857972, 0.4308096205990768, -7.207572869049648, 0.9615292714299553, 0.3538083994500159, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.999999999999998, 0.499999999999999, -2.699819353870494, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.321775723545022, 0, 0, 0.1957713555953254, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.9422132860498034, 2.000000000000004, 0, 0, 0.320239627261969, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.999818270722805, 2.000181729277201, 1, 1, 0.3332727569076011, 1.000181762308728, 0.499954571808516, -2.701046100489474, 0.8889292695032071, 0.5554747833184092, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.321775723545022, 0, 0, 0.1957713555953254, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.293093106615355, 1.272090916546612, 0, 0, 0.5040937004673167, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.9998182707228568, 2.000181729277149, 0, 1, 0.3332727569076183, 0, 0.4999545718085289, 2.699574058049409, 0.6667272430923817, 1, 0.18519757600937],
[0.9422132860498034, 2.057786713950199, 0, 0, 0.3140710953499342, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.999999999999998, 0, -5.399638707740988, 1, 0.3333333333333333, 0.18519757600937],
[0.9410275938599646, 2.000000000000004, 1, 0, 0.3199655779580455, 1.062668094458462, 0, -5.738023776319278, 1, 0.3199655779580455, 0.18519757600937],
[0.5663685875853666, 2.433631412414637, 1, 0, 0.188789529195122, 1.765634644857972, 0, -9.533789172103637, 1, 0.1887895291951219, 0.18519757600937],
[0.7635228211577513, 2.001368389640917, 0, 1, 0.2761493176207825, 0, 0.499658136491013, 2.697973414434609, 0.7238506823792175, 1, 0.18519757600937],
[1.939479108276576, 1.060165596020117, 2, 0, 0.6465696105603657, 1.031204714433456, 0, -5.56813289165989, 1, 0.4180522613001829, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5663685875853665, 2.000000000000004, 1, 0, 0.2206887156915554, 1.765634644857973, 0, -9.533789172103639, 1, 0.2206887156915555, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.9386554397464646, 2.000000000000004, 1, 0, 0.3194166376400517, 1.065353651250458, 0, -5.752524812725175, 1, 0.3194166376400518, 0.18519757600937],
[1.292399390010684, 1.273795685605373, 1, 0, 0.5036247642632634, 0.773754620846527, 0, -4.177995401016368, 1, 0.5036247642632634, 0.18519757600937],
[0.9986312048345609, 2.001368795165445, 0, 1, 0.3328770682781863, 0, 0.499658035248488, 2.697972867761552, 0.6671229317218137, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5078224578585316, 1.549964256091669, 1, 0, 0.2467809002827594, 1.969192154708877, 0, -10.63292618154595, 1, 0.2467809002827595, 0.18519757600937],
[0.507128092813544, 2.025138432547364, 0, 0, 0.200266475797316, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.764148974733374, 2.000000000000004, 0, 0, 0.2764499966240356, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.000000000000004, 0, 0, 0.2203288411508547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0, 3.000000000000003, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5661871782470843, 2.433071559361743, 1, 1, 0.1887757035254917, 1.76620036344871, 0.4110031191447266, -7.317575496967724, 0.9643637337584557, 0.341915140809439, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 1.942213286049806, 0, 0, 0.3398801863690154, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5116422263134381, 1.549108267472726, 0, 1, 0.2482795602166331, 0, 0.6455326725687406, 3.485643205913667, 0.7517204397833669, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 1.532266525360906, 0, 0, 0.3949031391383567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.932265863303664, 1.060665331588901, 1, 1, 0.645609851172347, 0.5175271265674923, 0.9428044551074152, 2.296343924708853, 0.5831879200692198, 0.874407622413914, 0.18519757600937],
[0.999454621258079, 2.000545378741927, 1, 1, 0.333151540419359, 1.000545676342198, 0.499863692484129, -2.703501820308583, 0.8890100511162081, 0.5553131319549263, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.999999999999998, 0, -5.399638707740988, 1, 0.3333333333333333, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.499999999999999, 2.699819353870494, 0.6666666666666667, 1, 0.18519757600937],
[0.507128092813544, 2.257020881919831, 0, 0, 0.1834662666336428, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5656960244798253, 2.433561889233412, 0, 1, 0.1886119969520941, 0, 0.4109203075640729, 2.218821198519804, 0.8113880030479059, 1, 0.18519757600937],
[0.9422132860498034, 2.057786713950199, 0, 0, 0.3140710953499342, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.2720909165466105, 2.727909083453393, 0, 0, 0.09069697218220341, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.43481597683804, 0, 0, 0.188394674387321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.9410273007483362, 2.058972699251667, 1, 0, 0.3136757669161118, 1.062668425458822, 0, -5.738025563601637, 1, 0.3136757669161118, 0.18519757600937],
[0.7275571059769419, 2.036591868756435, 1, 1, 0.2632119732429111, 1.374462556663824, 0.4910163962358401, -4.770290084052103, 0.9307194571415731, 0.4571434036273953, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.9422132860498034, 2.057786713950199, 0, 0, 0.3140710953499342, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.6792359271637471, 2.320764072836256, 0, 1, 0.2264119757212488, 0, 0.4308925718493558, 2.326664209835851, 0.7735880242787512, 1, 0.18519757600937],
[0.7279090834533908, 2.036239891279986, 0, 0, 0.2633393098950476, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.072312115975508, 1.81464763073148, 0, 0, 0.371432998745009, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.075045203508433, 1.812269697229407, 1, 0, 0.3723338951472561, 0.9301934437142541, 0, -5.022708524366384, 1, 0.3723338951472561, 0.18519757600937],
[0.9986331076408419, 2.001366892359164, 0, 1, 0.3328777025469466, 0, 0.4996585103000397, 2.697975432868299, 0.6671222974530534, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.7279090834533908, 2.036239891279986, 0, 0, 0.2633393098950476, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.5651840231619637, 2.321775723545022, 0, 0, 0.1957713555953254, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[0.9665577550156792, 2.033442244984326, 1, 0, 0.3221859183385592, 1.034599324055683, 0, -5.586462557173737, 1, 0.3221859183385591, 0.18519757600937],
[0.7268840724605783, 2.038750536342508, 0, 1, 0.2628272260358934, 0, 0.4904964987987138, 2.648503880924971, 0.7371727739641066, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.999999999999998, 0, -5.399638707740988, 1, 0.3333333333333333, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 1, 3, 0.3333333333333333, 0.999999999999998, 1.499999999999997, 2.699819353870494, 0.5925925925925928, 0.802469135802469, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.18519757600937],
[1.000000000000002, 2.000000000000004, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.999999999999998, 0, -5.399638707740988, 1, 0.3333333333333333, 0.18519757600937],
[0.5080049756927574, 1.552745581189339, 1, 1, 0.2465145400525166, 1.968484656348725, 0.6440205092929913, -7.151627875457308, 0.939230581542696, 0.4322596616477294, 0.18519757600937]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node102":{
"Global MG94xREV":0.001164914373237138,
"Nucleotide GTR":0.001150559790487007,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTA", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node105":{
"Global MG94xREV":0.001164718497787312,
"Nucleotide GTR":0.001150366328699864,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "V", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GTA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node108":{
"Global MG94xREV":0.001164413563767595,
"Nucleotide GTR":0.001150065152210075,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTT", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node111":{
"Global MG94xREV":0.001164431079616309,
"Nucleotide GTR":0.001150082452220865,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAT", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node114":{
"Global MG94xREV":0.001163546292689852,
"Nucleotide GTR":0.001149208568024638,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "R", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AGA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node118":{
"Global MG94xREV":0.00116431707969749,
"Nucleotide GTR":0.001149969857058746,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "D", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAT", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node123":{
"Global MG94xREV":0.001165059898274166,
"Nucleotide GTR":0.001150703522301087,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATT", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node151":{
"Global MG94xREV":0.001163952196114406,
"Nucleotide GTR":0.001149609469730242,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCG", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node173":{
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "N", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "AAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node252":{
"Global MG94xREV":0.0007518408867466438,
"Nucleotide GTR":0.0007425763755759681,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "V", "V", "D", "N", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "GTG", "GTT", "GAT", "AAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node38":{
"Global MG94xREV":0.001164984968786785,
"Nucleotide GTR":0.001150629516127516,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node75":{
"Global MG94xREV":0.001164871852457486,
"Nucleotide GTR":0.001150517793666939,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGT", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node79":{
"Global MG94xREV":0.001164550003702594,
"Nucleotide GTR":0.001150199910872714,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node80":{
"Global MG94xREV":0.001164993814548998,
"Nucleotide GTR":0.001150638252888391,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node84":{
"Global MG94xREV":0.00116457462185361,
"Nucleotide GTR":0.001150224225668142,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "V", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GTT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node87":{
"Global MG94xREV":0.001164898475829738,
"Nucleotide GTR":0.001150544088974392,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "TTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node90":{
"Global MG94xREV":0.001164405658599737,
"Nucleotide GTR":0.001150057344453142,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "F", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "TTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node93":{
"Global MG94xREV":0.001165126289371205,
"Nucleotide GTR":0.001150769095298085,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "I", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATT", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node96":{
"Global MG94xREV":0.00116416948725796,
"Nucleotide GTR":0.001149824083317598,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTC", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node99":{
"Global MG94xREV":0.001164315173642105,
"Nucleotide GTR":0.001149967974490605,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "S", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "TCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00116381970431506,
"Nucleotide GTR":0.001149478610552608,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTG", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406798_Hubei_20191226_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001165418563210203,
"Nucleotide GTR":0.001151057767611424,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "K", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAA", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406798_Hubei_20191226_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_412981_Hubei_20200118_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001165999228162923,
"Nucleotide GTR":0.001151631277357458,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "D", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GAT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_412981_Hubei_20200118_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413612_USA_20200217_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTA", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413612_USA_20200217_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413898_Guangdong_20200228_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001164185342888241,
"Nucleotide GTR":0.001149839743567889,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "I", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ATT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413898_Guangdong_20200228_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413902_Guangdong_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164544145474664,
"Nucleotide GTR":0.001150194124832424,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "N", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "AAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413902_Guangdong_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001165034197644527,
"Nucleotide GTR":0.001150678138365812,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "F", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TTT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416350_Shanghai_20200129_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001163819704257828,
"Nucleotide GTR":0.001149478610496079,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "C", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TGT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416350_Shanghai_20200129_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416382_Shanghai_20200208_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164705960784122,
"Nucleotide GTR":0.001150353946183094,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACC", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416382_Shanghai_20200208_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416589_unknown_20200216_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001165157233031903,
"Nucleotide GTR":0.001150799657657508,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "F", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TTT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416589_unknown_20200216_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417088_Washington_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164742705425847,
"Nucleotide GTR":0.001150390238041325,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCT", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417088_Washington_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417176_Hong_Kong_20200121_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00116562926630808,
"Nucleotide GTR":0.001151265874333872,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGA", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417176_Hong_Kong_20200121_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417177_Hong_Kong_20200123_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163890581832312,
"Nucleotide GTR":0.001149548614686193,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "S", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TCG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417177_Hong_Kong_20200123_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417296_England_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163819703897904,
"Nucleotide GTR":0.001149478610140592,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "E", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "GAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417296_England_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417351_Washington_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164544145474664,
"Nucleotide GTR":0.001150194124832424,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAA", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417351_Washington_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417386_New_South_Wales_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001165157233031903,
"Nucleotide GTR":0.001150799657657508,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "F", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TTT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417386_New_South_Wales_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417393_New_South_Wales_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00117222904951114,
"Nucleotide GTR":0.001157784332131137,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "F", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTC", "---", "TTT", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417393_New_South_Wales_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002331902624486625,
"Nucleotide GTR":0.002303167903757391,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "L", "T", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CTT", "ACT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417427_Sint_Pieters_Woluwe_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164742705563006,
"Nucleotide GTR":0.001150390238176795,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "I", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ATA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417427_Sint_Pieters_Woluwe_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417445_Lombardy_20200224_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002333132351118612,
"Nucleotide GTR":0.00230438247716172,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "N", "V", "S", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAT", "GTA", "TCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417445_Lombardy_20200224_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417487_Oslo_20200301_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00116489386293108,
"Nucleotide GTR":0.00115053953291788,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCT", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417487_Oslo_20200301_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417572_Reykjavik_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164185342888241,
"Nucleotide GTR":0.001149839743567889,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "V", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GTA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417572_Reykjavik_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417797_Reykjavik_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164944957679513,
"Nucleotide GTR":0.001150589998054551,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "F", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "TTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417797_Reykjavik_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163721129552795,
"Nucleotide GTR":0.001149381250471535,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCC", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417979_Madrid_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001165096798305297,
"Nucleotide GTR":0.001150739967633949,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "S", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "TCT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417979_Madrid_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418017_Portugal_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164944957679513,
"Nucleotide GTR":0.001150589998054551,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "F", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTT", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418017_Portugal_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418062_Washington_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164944957679513,
"Nucleotide GTR":0.001150589998054551,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "F", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "TTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418062_Washington_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418082_Washington_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163721129552711,
"Nucleotide GTR":0.001149381250471454,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "T", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ACT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418082_Washington_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418251_Madrid_20200225_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164251918830229,
"Nucleotide GTR":0.001149905499132096,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "A", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GCG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418251_Madrid_20200225_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418764_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164108230300042,
"Nucleotide GTR":0.00114976358119462,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "R", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AGA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418764_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418805_Deinze_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001165403711751609,
"Nucleotide GTR":0.001151043099158978,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTT", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418805_Deinze_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418949_Washington_20200316_null_11":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAT", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418949_Washington_20200316_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419187_ARA_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163650243196344,
"Nucleotide GTR":0.001149311237607671,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACG", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419187_ARA_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419235_Madrid_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164907565861288,
"Nucleotide GTR":0.00115055306699461,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAA", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419235_Madrid_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419246_Hong_Kong_20200223_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001167561511263963,
"Nucleotide GTR":0.001153174309325049,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCA", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419246_Hong_Kong_20200223_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419249_Hong_Kong_20200225_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163721129552795,
"Nucleotide GTR":0.001149381250471535,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "L", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "CTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419249_Hong_Kong_20200225_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419599_Luxembourg_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTT", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419599_Luxembourg_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419604_Luxembourg_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163650243196344,
"Nucleotide GTR":0.001149311237607671,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "S", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AGT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419604_Luxembourg_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419662_Austria_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001165121602054438,
"Nucleotide GTR":0.00115076446574048,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "H"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
],
"original name":"epi_isl_419662_Austria_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419688_Comunitat_Valenciana_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164829052429292,
"Nucleotide GTR":0.001150475521039351,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "I", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ATT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419688_Comunitat_Valenciana_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419735_Victoria_20200224_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001165576176407623,
"Nucleotide GTR":0.001151213438630314,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTA", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419735_Victoria_20200224_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419832_Northern_Territory_20200221_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164758717736781,
"Nucleotide GTR":0.001150406053041584,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGT", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAC", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419832_Northern_Territory_20200221_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419863_Victoria_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164944957536274,
"Nucleotide GTR":0.001150589997913077,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "I", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419863_Victoria_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419869_Victoria_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001165157232886941,
"Nucleotide GTR":0.001150799657514329,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "V", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GTT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419869_Victoria_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419941_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001165629266314735,
"Nucleotide GTR":0.001151265874340446,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACA", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419941_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420051_Ile_de_France_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001165096798305297,
"Nucleotide GTR":0.001150739967633949,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCT", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420051_Ile_de_France_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420061_Ile_de_France_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00116418534296718,
"Nucleotide GTR":0.001149839743645856,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "F", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "TTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420061_Ile_de_France_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420241_South_Yorkshire_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164251918830229,
"Nucleotide GTR":0.001149905499132096,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTC", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420241_South_Yorkshire_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420310_Norway_20200316_null_3":{
"Global MG94xREV":0.00116473319567649,
"Nucleotide GTR":0.001150380845475246,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420310_Norway_20200316_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
]
},
"epi_isl_420387_Sint_Agatha_Berchem_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001171296013838719,
"Nucleotide GTR":0.001156862793731026,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "V", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "GTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420387_Sint_Agatha_Berchem_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420432_Leuven_20200323_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001164829052429292,
"Nucleotide GTR":0.001150475521039351,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "V", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GTA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420432_Leuven_20200323_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420495_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001165131331737631,
"Nucleotide GTR":0.001150774075530274,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTA", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420495_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420815_Utah_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001165418563210203,
"Nucleotide GTR":0.001151057767611424,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCA", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420815_Utah_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420890_Japan_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164185342888241,
"Nucleotide GTR":0.001149839743567889,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTT", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420890_Japan_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420946_Wales_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "I", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATT", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420946_Wales_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421256_Jiangxi_20200127_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001167561511288431,
"Nucleotide GTR":0.001153174309349215,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "L", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTA", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421256_Jiangxi_20200127_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421258_Jiangxi_20200208_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "F", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "TTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421258_Jiangxi_20200208_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421313_Wisconsin_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163650243677685,
"Nucleotide GTR":0.001149311238083082,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "R", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AGG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421313_Wisconsin_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421375_New_York_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163959373679157,
"Nucleotide GTR":0.001149616558849912,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCA", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421375_New_York_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421410_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163650243677772,
"Nucleotide GTR":0.001149311238083169,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTG", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421410_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421435_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164829052097778,
"Nucleotide GTR":0.001150475520711922,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "Y", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "TAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421435_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421460_Portugal_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163721129552711,
"Nucleotide GTR":0.001149381250471454,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAC", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421460_Portugal_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421495_Portugal_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001164829052097804,
"Nucleotide GTR":0.001150475520711949,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "F", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "TTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421495_Portugal_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421507_Ile_de_France_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164326530898234,
"Nucleotide GTR":0.001149979191797672,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "F", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "TTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421507_Ile_de_France_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421641_Taipei_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164393795284309,
"Nucleotide GTR":0.001150045627322658,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "I", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATT", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421641_Taipei_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421761_Luxembourg_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164403480097685,
"Nucleotide GTR":0.001150055192795542,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "I", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATA", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421761_Luxembourg_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421815_England_20200325_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001164907565861288,
"Nucleotide GTR":0.00115055306699461,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "T", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "ACC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421815_England_20200325_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421841_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164992506421468,
"Nucleotide GTR":0.001150636960880178,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "TTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421841_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421929_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001165653784739988,
"Nucleotide GTR":0.001151290090638973,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "S", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGT", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421929_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421980_England_20200331_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001164878946509701,
"Nucleotide GTR":0.00115052480030315,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "N", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAT", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421980_England_20200331_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422000_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164508353628869,
"Nucleotide GTR":0.001150158774029356,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "T", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ACT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422000_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422017_Wales_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0011643504915699,
"Nucleotide GTR":0.001150002857215496,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "T", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "ACC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422017_Wales_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422072_Wales_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001164033508292403,
"Nucleotide GTR":0.001149689779944133,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTC", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422072_Wales_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422171_Wales_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164181009274786,
"Nucleotide GTR":0.001149835463355108,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCG", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422171_Wales_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422184_Wales_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001163650243677772,
"Nucleotide GTR":0.001149311238083169,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "V", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "GTG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422184_Wales_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422231_Wales_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001164829052097778,
"Nucleotide GTR":0.001150475520711922,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTT", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422231_Wales_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422328_Wales_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164829052429292,
"Nucleotide GTR":0.001150475521039351,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "V", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GTT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422328_Wales_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422356_Wales_20200327_null_25":{
"Global MG94xREV":0.001164378335051217,
"Nucleotide GTR":0.001150030357597298,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "S", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "AGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422356_Wales_20200327_null_25",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422414_Taipei_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001165125123307371,
"Nucleotide GTR":0.001150767943602999,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "I", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATT", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422414_Taipei_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422421_Taipei_20200319_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001164486610052446,
"Nucleotide GTR":0.001150137298386759,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "V", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "GTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422421_Taipei_20200319_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422564_Pichincha_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00116412466621867,
"Nucleotide GTR":0.001149779814582693,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "K", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAG", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422564_Pichincha_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422667_Netherlands_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001165166963927454,
"Nucleotide GTR":0.00115080926864472,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "S", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "TCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422667_Netherlands_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422712_Netherlands_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001164878946651059,
"Nucleotide GTR":0.001150524800442767,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "H", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAT", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422712_Netherlands_20200322_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422878_Noord_Brabant_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163721129552711,
"Nucleotide GTR":0.001149381250471454,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTC", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422878_Noord_Brabant_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422915_Zuid_Holland_20200319_null_19":{
"Global MG94xREV":0.001163650243196344,
"Nucleotide GTR":0.001149311237607671,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "D", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422915_Zuid_Holland_20200319_null_19",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423094_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163956700483351,
"Nucleotide GTR":0.001149613918594388,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "G", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GGT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423094_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423110_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001165999228162923,
"Nucleotide GTR":0.001151631277357458,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "Q", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CAA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423110_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423168_England_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001164181009669053,
"Nucleotide GTR":0.001149835463744517,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACG", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423168_England_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423187_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164742705563006,
"Nucleotide GTR":0.001150390238176795,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "L", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CTC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423187_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423231_England_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001165653784739988,
"Nucleotide GTR":0.001151290090638973,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "Y", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "TAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423231_England_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423274_England_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGT", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423274_England_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423293_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001165131331872779,
"Nucleotide GTR":0.001150774075663757,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "I", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "ATC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423293_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423316_England_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001165475776600092,
"Nucleotide GTR":0.00115111427599298,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "V", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GTA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423316_England_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423589_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164181009669125,
"Nucleotide GTR":0.001149835463744589,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTG", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423589_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423772_England_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001164878946650231,
"Nucleotide GTR":0.001150524800441948,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "I", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATT", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423772_England_20200322_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423831_England_20200323_null_24":{
"Global MG94xREV":0.001165131331872779,
"Nucleotide GTR":0.001150774075663757,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "I", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "ATC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423831_England_20200323_null_24",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423889_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001165406133229597,
"Nucleotide GTR":0.001151045490798456,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAT", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423889_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424010_England_20200320_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001164185342888241,
"Nucleotide GTR":0.001149839743567889,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "TTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424010_England_20200320_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424174_Connecticut_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164745535447593,
"Nucleotide GTR":0.001150393033190309,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "I", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATT", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424174_Connecticut_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424225_Washington_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164829052429292,
"Nucleotide GTR":0.001150475521039351,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCT", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424225_Washington_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424351_USA_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001164284972124978,
"Nucleotide GTR":0.001149938145129737,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAA", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424351_USA_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424413_Reykjavik_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "-", "-", "-", "D", "N", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "---", "---", "---", "GAT", "AAT", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424413_Reykjavik_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424421_Reykjavik_20200319_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "D", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAT", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424421_Reykjavik_20200319_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424532_Reykjavik_20200320_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCG", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424532_Reykjavik_20200320_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424570_Reykjavik_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001164829052097804,
"Nucleotide GTR":0.001150475520711949,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAT", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424570_Reykjavik_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424860_Georgia_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATT", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424860_Georgia_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424904_South_Carolina_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163721129552711,
"Nucleotide GTR":0.001149381250471454,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGC", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424904_South_Carolina_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424931_New_York_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001164878946650231,
"Nucleotide GTR":0.001150524800441948,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTT", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424931_New_York_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425139_Duesseldorf_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTC", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425139_Duesseldorf_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425146_Wisconsin_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164829052097804,
"Nucleotide GTR":0.001150475520711949,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTT", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425146_Wisconsin_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425162_Wisconsin_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001164829052097804,
"Nucleotide GTR":0.001150475520711949,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "F", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "TTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425162_Wisconsin_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425281_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164829052097804,
"Nucleotide GTR":0.001150475520711949,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGT", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425281_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425284_England_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTT", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425284_England_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425451_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001165203652537842,
"Nucleotide GTR":0.001150845505162056,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTT", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425451_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425459_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "S", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "TCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425459_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425460_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0004116547620542882,
"Nucleotide GTR":0.000406582172615828,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "V", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "GTG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425460_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425569_England_20200323_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001163650243196344,
"Nucleotide GTR":0.001149311237607671,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "V", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "GTA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425569_England_20200323_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425637_England_20200330_null_16":{
"Global MG94xREV":0.001163721129552711,
"Nucleotide GTR":0.001149381250471454,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "CTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425637_England_20200330_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425689_Scotland_20200314_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001165652587746514,
"Nucleotide GTR":0.001151288908395376,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "F", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "TTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425689_Scotland_20200314_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425930_Scotland_20200325_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001164829052429292,
"Nucleotide GTR":0.001150475521039351,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "I", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ATA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425930_Scotland_20200325_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425950_Scotland_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164982809037904,
"Nucleotide GTR":0.001150627382992002,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "D", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAT", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425950_Scotland_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425994_Scotland_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "TTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425994_Scotland_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426042_New_York_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164829052429292,
"Nucleotide GTR":0.001150475521039351,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "F", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "TTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426042_New_York_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426068_Idaho_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001164829052097804,
"Nucleotide GTR":0.001150475520711949,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "F", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TTT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426068_Idaho_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426171_South_Korea_20200205_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001164829052429292,
"Nucleotide GTR":0.001150475521039351,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTT", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426171_South_Korea_20200205_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426295_New_York_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "V", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GTA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426295_New_York_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426482_Montevideo_20200317_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001163650243196344,
"Nucleotide GTR":0.001149311237607671,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAG", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426482_Montevideo_20200317_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426483_Arizona_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001165754004580854,
"Nucleotide GTR":0.001151389075527268,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "F", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "TTT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426483_Arizona_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426513_Arizona_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163721129552795,
"Nucleotide GTR":0.001149381250471535,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCC", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426513_Arizona_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426627_Louisiana_20200406_null_9":{
"Global MG94xREV":0.001164829052097804,
"Nucleotide GTR":0.001150475520711949,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAT", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426627_Louisiana_20200406_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426628_Louisiana_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163721129552795,
"Nucleotide GTR":0.001149381250471535,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "T", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ACT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426628_Louisiana_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426772_Victoria_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164378335051217,
"Nucleotide GTR":0.001150030357597298,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "S", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "AGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426772_Victoria_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426810_Victoria_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00116489386293108,
"Nucleotide GTR":0.00115053953291788,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "V", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GTC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426810_Victoria_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426853_Victoria_20200325_null_22":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "V", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GTT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426853_Victoria_20200325_null_22",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163721129552711,
"Nucleotide GTR":0.001149381250471454,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "S", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TCA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426882_Victoria_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001165381942122219,
"Nucleotide GTR":0.001151021597784451,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "V", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GTT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426882_Victoria_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426898_Northern_territory_20200326_null_15":{
"Global MG94xREV":0.00116482905235735,
"Nucleotide GTR":0.001150475520968297,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "F", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "TTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426898_Northern_territory_20200326_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426979_Victoria_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164378334914994,
"Nucleotide GTR":0.001150030357462754,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "S", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "AGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426979_Victoria_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427105_Victoria_20200404_null_25":{
"Global MG94xREV":0.001164829052429292,
"Nucleotide GTR":0.001150475521039351,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "V", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GTT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427105_Victoria_20200404_null_25",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427149_Victoria_20200408_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002332969657348906,
"Nucleotide GTR":0.002304221788175573,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "F", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "TTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATT", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427149_Victoria_20200408_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427152_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163721129552795,
"Nucleotide GTR":0.001149381250471535,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTC", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427152_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427166_Idaho_20200325_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001164829052097778,
"Nucleotide GTR":0.001150475520711922,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTT", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427166_Idaho_20200325_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427178_Washington_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001165096798299227,
"Nucleotide GTR":0.001150739967627954,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "L", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CTG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427178_Washington_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427179_Washington_20200326_null_28":{
"Global MG94xREV":0.001163721130020807,
"Nucleotide GTR":0.001149381250933781,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAC", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427179_Washington_20200326_null_28",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427188_Washington_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163650243677772,
"Nucleotide GTR":0.001149311238083169,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTG", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427188_Washington_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427210_Washington_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163650243677685,
"Nucleotide GTR":0.001149311238083082,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "R", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CGG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427210_Washington_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427333_Saint_Petersburg_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163650243677685,
"Nucleotide GTR":0.001149311238083082,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "R", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CGA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427333_Saint_Petersburg_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427376_Liege_20200407_null_14":{
"Global MG94xREV":0.001163650243628045,
"Nucleotide GTR":0.001149311238034054,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427376_Liege_20200407_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
]
},
"epi_isl_427459_Wisconsin_20200406_null_32":{
"Global MG94xREV":0.001164944957536274,
"Nucleotide GTR":0.001150589997913077,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "F", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "TTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427459_Wisconsin_20200406_null_32",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427519_New_York_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "R", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AGA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427519_New_York_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427646_New_South_Wales_20200304_null_45":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "F", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427646_New_South_Wales_20200304_null_45",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427671_New_South_Wales_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164185342877442,
"Nucleotide GTR":0.001149839743557221,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATT", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427671_New_South_Wales_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427743_New_South_Wales_20200321_null_15":{
"Global MG94xREV":0.001163721129552711,
"Nucleotide GTR":0.001149381250471454,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACC", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427743_New_South_Wales_20200321_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427758_New_South_Wales_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001164181009669053,
"Nucleotide GTR":0.001149835463744517,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "V", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "GTT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427758_New_South_Wales_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427759_New_South_Wales_20200320_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001165117006208639,
"Nucleotide GTR":0.001150759926526695,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTT", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427759_New_South_Wales_20200320_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427779_New_South_Wales_20200324_null_8065":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "L", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTG", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427779_New_South_Wales_20200324_null_8065",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427800_New_South_Wales_20200324_null_1498":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "M", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "ATG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427800_New_South_Wales_20200324_null_1498",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427805_New_South_Wales_20200320_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001164438153014098,
"Nucleotide GTR":0.001150089438457164,
"amino-acid": [
["S", "A", "V", "K", "R", "T", "I", "K", "G", "T", "H", "H", "W", "L", "L", "L", "T", "I", "L", "T", "S", "L", "L", "V", "L", "V", "Q", "S", "T", "Q", "W", "S", "L", "-", "F", "F", "F", "F", "Y", "E", "N", "A", "F", "L", "P", "F", "A", "M", "G", "I", "I", "A", "M", "S", "A", "F", "A", "M", "M", "F", "V", "K", "H", "K", "H", "A", "F", "L", "C", "L", "F", "L", "L", "P", "S", "L", "A", "T", "V", "A", "Y", "F", "N", "M", "V", "Y", "M", "P", "A", "S", "W", "V", "V", "R", "I", "M", "T", "W", "L", "D", "M", "V", "D", "-", "T", "S", "L", "S", "G", "F", "K", "L", "K", "D", "C", "V", "M", "Y", "A", "S", "A", "V", "V", "L", "L", "I", "L", "M", "T", "A", "R", "T", "V", "Y", "D", "D", "G", "A", "R", "R", "V", "W", "T", "L", "M", "N", "V", "L", "T", "L", "V", "Y", "K", "V", "Y", "Y", "G", "N", "A", "L", "D", "Q", "A", "I", "S", "M", "W", "A", "L", "I", "I", "S", "V", "T", "S", "N", "Y", "S", "G", "V", "V", "T", "T", "V", "M", "F", "L", "A", "R", "G", "I", "V", "F", "M", "C", "V", "E", "Y", "C", "P", "I", "F", "F", "I", "T", "G", "N", "T", "L", "Q", "C", "I", "M", "L", "V", "Y", "C", "F", "L", "G", "Y", "F", "C", "T", "C", "Y", "F", "G", "L", "F", "C", "L", "L", "N", "R", "Y", "F", "R", "L", "T", "L", "G", "V", "Y", "D", "Y", "L", "V", "S", "T", "Q", "E", "F", "R", "Y", "M", "N", "S", "Q", "G", "L", "L", "P", "P", "K", "N", "S", "I", "D", "A", "F", "K", "L", "N", "I", "K", "L", "L", "G", "V", "G", "G", "K", "P", "C", "I", "K", "V", "A", "T", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "GCA", "GTG", "AAA", "AGA", "ACA", "ATC", "AAG", "GGT", "ACA", "CAC", "CAC", "TGG", "TTG", "TTA", "CTC", "ACA", "ATT", "TTG", "ACT", "TCA", "CTT", "TTA", "GTT", "TTA", "GTC", "CAG", "AGT", "ACT", "CAA", "TGG", "TCT", "TTG", "---", "TTC", "TTT", "TTT", "TTT", "TAT", "GAA", "AAT", "GCC", "TTT", "TTA", "CCT", "TTT", "GCT", "ATG", "GGT", "ATT", "ATT", "GCT", "ATG", "TCT", "GCT", "TTT", "GCA", "ATG", "ATG", "TTT", "GTC", "AAA", "CAT", "AAG", "CAT", "GCA", "TTT", "CTC", "TGT", "TTG", "TTT", "TTG", "TTA", "CCT", "TCT", "CTT", "GCC", "ACT", "GTA", "GCT", "TAT", "TTT", "AAT", "ATG", "GTC", "TAT", "ATG", "CCT", "GCT", "AGT", "TGG", "GTG", "GTG", "CGT", "ATT", "ATG", "ACA", "TGG", "TTG", "GAT", "ATG", "GTT", "GAT", "---", "ACT", "AGT", "TTG", "TCT", "GGT", "TTT", "AAG", "CTA", "AAA", "GAC", "TGT", "GTT", "ATG", "TAT", "GCA", "TCA", "GCT", "GTA", "GTG", "TTA", "CTA", "ATC", "CTT", "ATG", "ACA", "GCA", "AGA", "ACT", "GTG", "TAT", "GAT", "GAT", "GGT", "GCT", "AGG", "AGA", "GTG", "TGG", "ACA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTC", "TTG", "ACA", "CTC", "GTT", "TAT", "AAA", "GTT", "TAT", "TAT", "GGT", "AAT", "GCT", "TTA", "GAT", "CAA", "GCC", "ATT", "TCC", "ATG", "TGG", "GCT", "CTT", "ATA", "ATC", "TCT", "GTT", "ACT", "TCT", "AAC", "TAC", "TCA", "GGT", "GTA", "GTT", "ACA", "ACT", "GTC", "ATG", "TTT", "TTG", "GCC", "AGA", "GGT", "ATT", "GTT", "TTT", "ATG", "TGT", "GTT", "GAG", "TAT", "TGC", "CCT", "ATT", "TTC", "TTC", "ATA", "ACT", "GGT", "AAT", "ACA", "CTT", "CAG", "TGT", "ATA", "ATG", "CTA", "GTT", "TAT", "TGT", "TTC", "TTA", "GGC", "TAT", "TTT", "TGT", "ACT", "TGT", "TAC", "TTT", "GGC", "CTC", "TTT", "TGT", "TTA", "CTC", "AAC", "CGC", "TAC", "TTT", "AGA", "CTG", "ACT", "CTT", "GGT", "GTT", "TAT", "GAT", "TAC", "TTA", "GTT", "TCT", "ACA", "CAG", "GAG", "TTT", "AGA", "TAT", "ATG", "AAT", "TCA", "CAG", "GGA", "CTA", "CTC", "CCA", "CCC", "AAG", "AAT", "AGC", "ATA", "GAT", "GCC", "TTC", "AAA", "CTC", "AAC", "ATT", "AAA", "TTG", "TTG", "GGT", "GTT", "GGT", "GGC", "AAA", "CCT", "TGT", "ATC", "AAA", "GTA", "GCC", "ACT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427805_New_South_Wales_20200320_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":5273.380894907255,
"Equilibrium frequencies": [
[0.01643306396741099],
[0.01047967109214852],
[0.01335173422103325],
[0.03065202710323398],
[0.01386970384580799],
[0.008844968579068637],
[0.0112690244400507],
[0.02587067993154746],
[0.01129934148229095],
[0.007205800605846178],
[0.009180625393014483],
[0.02107627171967036],
[0.02870072098315319],
[0.01830298455646781],
[0.02331910830987089],
[0.05353446437028438],
[0.007265682861725882],
[0.004633461343651288],
[0.005903309735571121],
[0.01355242749877835],
[0.006132323815543289],
[0.003910697161825007],
[0.004982464493829035],
[0.011438411982854],
[0.004995868811773636],
[0.003185958630157943],
[0.004059103811086781],
[0.00931862168408591],
[0.01268968081545941],
[0.008092445905041597],
[0.01031026508104392],
[0.02366962369636118],
[0.01381972098351945],
[0.008813093576447892],
[0.01122841376061767],
[0.02577744862346006],
[0.01166401090224146],
[0.007438357089897157],
[0.009476916406265171],
[0.02175647700373734],
[0.009502412142522064],
[0.00605986528337957],
[0.007720634547354139],
[0.01772452143533979],
[0.02413645786322029],
[0.01539226891818041],
[0.01961068070239233],
[0.04502090188821026],
[0.01227836266266671],
[0.03591302644997765],
[0.01625024796533949],
[0.01036308592118526],
[0.01320319766839455],
[0.03031102672366307],
[0.008442577284675429],
[0.01075635361590424],
[0.02469372420904517],
[0.03362680544193635],
[0.02144444040441978],
[0.02732151288728078],
[0.06272291970903826]
],
"Log Likelihood":-2443.883882797423,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.6364600856525877, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":192
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":5605.716162266889,
"Equilibrium frequencies": [
[0.2413482034381662],
[0.1652662287115243],
[0.1973344391336927],
[0.3960511287166169]
],
"Log Likelihood":-2481.109547610857,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.05944680470562676,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.1614404130054564,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.07239031707272044,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":1.178769711183666,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":0.5620482477209694
},
"display order":0,
"estimated parameters":321
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-04-19/sequences.nsp6.compressed.fas",
"number of sequences":158,
"number of sites":292,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_427166_Idaho_20200325_null_8,epi_isl_427178_Washington_20200327_null_1,epi_isl_427671_New_South_Wales_20200321_null_1,epi_isl_427188_Washington_20200326_null_1,epi_isl_421435_New_York_20200318_null_1,epi_isl_421761_Luxembourg_20200317_null_1,epi_isl_422414_Taipei_20200316_null_1,epi_isl_427210_Washington_20200327_null_1,epi_isl_421495_Portugal_20200323_null_2,epi_isl_419662_Austria_20200314_null_1,epi_isl_420310_Norway_20200316_null_3,epi_isl_427333_Saint_Petersburg_20200407_null_1,epi_isl_419688_Comunitat_Valenciana_20200309_null_1,epi_isl_417797_Reykjavik_20200313_null_1,epi_isl_424010_England_20200320_null_6,epi_isl_427376_Liege_20200407_null_14,epi_isl_419604_Luxembourg_20200315_null_1,epi_isl_419235_Madrid_20200307_null_1,epi_isl_419246_Hong_Kong_20200223_null_1,epi_isl_424225_Washington_20200321_null_1,epi_isl_425281_England_20200330_null_1,epi_isl_426772_Victoria_20200324_null_1,epi_isl_417572_Reykjavik_20200317_null_1,epi_isl_422564_Pichincha_20200330_null_2,epi_isl_422184_Wales_20200327_null_2,epi_isl_417177_Hong_Kong_20200123_null_1,epi_isl_419941_Victoria_20200321_null_1,epi_isl_422915_Zuid_Holland_20200319_null_19,epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_419249_Hong_Kong_20200225_null_1,epi_isl_417176_Hong_Kong_20200121_null_1,epi_isl_423187_England_20200329_null_1,(epi_isl_421375_New_York_20200316_null_1,epi_isl_424532_Reykjavik_20200320_null_3)Node151,epi_isl_422171_Wales_20200330_null_1,epi_isl_426171_South_Korea_20200205_null_8,epi_isl_413902_Guangdong_20200228_null_1,epi_isl_420051_Ile_de_France_20200319_null_1,epi_isl_424904_South_Carolina_20200307_null_1,epi_isl_421410_New_York_20200318_null_1,epi_isl_417296_England_20200306_null_1,epi_isl_421980_England_20200331_null_6,epi_isl_422328_Wales_20200325_null_1,epi_isl_422356_Wales_20200327_null_25,epi_isl_419187_ARA_20200322_null_1,epi_isl_418062_Washington_20200314_null_1,epi_isl_420061_Ile_de_France_20200323_null_1,epi_isl_427743_New_South_Wales_20200321_null_15,epi_isl_427152_Victoria_20200327_null_1,epi_isl_417088_Washington_20200302_null_1,epi_isl_423772_England_20200322_null_2,epi_isl_425162_Wisconsin_20200330_null_2,epi_isl_418082_Washington_20200315_null_1,epi_isl_417427_Sint_Pieters_Woluwe_20200302_null_1,epi_isl_422421_Taipei_20200319_null_2,epi_isl_421256_Jiangxi_20200127_null_1,epi_isl_423168_England_20200325_null_2,epi_isl_425569_England_20200323_null_3,epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1,epi_isl_418017_Portugal_20200316_null_1,epi_isl_420890_Japan_20200309_null_1,epi_isl_426627_Louisiana_20200406_null_9,epi_isl_421815_England_20200325_null_5,epi_isl_417445_Lombardy_20200224_null_1,epi_isl_422017_Wales_20200329_null_1,epi_isl_425930_Scotland_20200325_null_6,epi_isl_426513_Arizona_20200311_null_1,epi_isl_413898_Guangdong_20200228_null_2,epi_isl_420387_Sint_Agatha_Berchem_20200324_null_1,epi_isl_426042_New_York_20200306_null_1,epi_isl_426628_Louisiana_20200406_null_1,epi_isl_422712_Netherlands_20200322_null_2,epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1,epi_isl_427779_New_South_Wales_20200324_null_8065,epi_isl_427105_Victoria_20200404_null_25,epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1,epi_isl_426483_Arizona_20200322_null_1,epi_isl_425146_Wisconsin_20200331_null_1,epi_isl_421313_Wisconsin_20200323_null_1,epi_isl_417351_Washington_20200312_null_1,epi_isl_424931_New_York_20200401_null_2,(epi_isl_424860_Georgia_20200301_null_1,epi_isl_427149_Victoria_20200408_null_3)Node123,epi_isl_421507_Ile_de_France_20200323_null_1,epi_isl_422878_Noord_Brabant_20200311_null_1,epi_isl_427179_Washington_20200326_null_28,epi_isl_420241_South_Yorkshire_20200326_null_1,epi_isl_420815_Utah_20200324_null_2,epi_isl_426898_Northern_territory_20200326_null_15,epi_isl_421460_Portugal_20200320_null_1,(epi_isl_424421_Reykjavik_20200319_null_2,epi_isl_425950_Scotland_20200326_null_1)Node118,epi_isl_424351_USA_20200327_null_2,epi_isl_421641_Taipei_20200319_null_1,(epi_isl_424413_Reykjavik_20200319_null_1,epi_isl_425460_England_20200331_null_1)Node252,epi_isl_423094_England_20200324_null_1,(epi_isl_418764_England_20200318_null_1,epi_isl_427519_New_York_20200318_null_2)Node114,epi_isl_425637_England_20200330_null_16,epi_isl_426068_Idaho_20200327_null_2,epi_isl_427459_Wisconsin_20200406_null_32,epi_isl_427758_New_South_Wales_20200320_null_1,epi_isl_422231_Wales_20200327_null_2,epi_isl_406798_Hubei_20191226_null_1,epi_isl_418251_Madrid_20200225_null_1,(epi_isl_423889_England_20200319_null_1,epi_isl_418949_Washington_20200316_null_11)Node111,epi_isl_424570_Reykjavik_20200328_null_2,epi_isl_426482_Montevideo_20200317_null_4,epi_isl_416350_Shanghai_20200129_null_5,epi_isl_419863_Victoria_20200318_null_1,epi_isl_420432_Leuven_20200323_null_3,(epi_isl_418805_Deinze_20200306_null_1,epi_isl_419599_Luxembourg_20200316_null_1)Node108,epi_isl_426979_Victoria_20200329_null_1,epi_isl_417979_Madrid_20200303_null_1,epi_isl_423589_England_20200330_null_1,(epi_isl_423316_England_20200326_null_2,epi_isl_426295_New_York_20200322_null_1)Node105,(epi_isl_413612_USA_20200217_null_2,epi_isl_419735_Victoria_20200224_null_6)Node102,(epi_isl_422667_Netherlands_20200316_null_1,epi_isl_425459_England_20200331_null_1)Node99,(epi_isl_422072_Wales_20200328_null_2,epi_isl_425139_Duesseldorf_20200319_null_1)Node96,(epi_isl_420946_Wales_20200321_null_1,epi_isl_424174_Connecticut_20200313_null_1)Node93,(epi_isl_421258_Jiangxi_20200208_null_2,epi_isl_425689_Scotland_20200314_null_2)Node90,(epi_isl_421841_England_20200323_null_1,epi_isl_425994_Scotland_20200330_null_2)Node87,(epi_isl_426853_Victoria_20200325_null_22,epi_isl_426882_Victoria_20200324_null_3)Node84,(epi_isl_425451_England_20200401_null_1,(epi_isl_419832_Northern_Territory_20200221_null_1,epi_isl_423274_England_20200320_null_2)Node75,epi_isl_427800_New_South_Wales_20200324_null_1498,epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1,epi_isl_427759_New_South_Wales_20200320_null_5,epi_isl_416382_Shanghai_20200208_null_1,epi_isl_412981_Hubei_20200118_null_1,epi_isl_423293_England_20200326_null_1,epi_isl_419869_Victoria_20200318_null_2,epi_isl_426810_Victoria_20200325_null_2,epi_isl_416589_unknown_20200216_null_1,epi_isl_417487_Oslo_20200301_null_2,epi_isl_421929_England_20200329_null_1,epi_isl_422000_England_20200402_null_1,epi_isl_417386_New_South_Wales_20200304_null_1,epi_isl_423831_England_20200323_null_24,epi_isl_423110_England_20200324_null_1,epi_isl_427805_New_South_Wales_20200320_null_3,epi_isl_420495_England_20200319_null_1,epi_isl_423231_England_20200324_null_3)Node38,((epi_isl_417393_New_South_Wales_20200308_null_1,epi_isl_427646_New_South_Wales_20200304_null_45)Node80,epi_isl_425284_England_20200318_null_2)Node79)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node102":"test",
"Node105":"test",
"Node108":"test",
"Node111":"test",
"Node114":"test",
"Node118":"test",
"Node123":"test",
"Node151":"test",
"Node252":"test",
"Node38":"test",
"Node75":"test",
"Node79":"test",
"Node80":"test",
"Node84":"test",
"Node87":"test",
"Node90":"test",
"Node93":"test",
"Node96":"test",
"Node99":"test",
"epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1":"test",
"epi_isl_406798_Hubei_20191226_null_1":"test",
"epi_isl_412981_Hubei_20200118_null_1":"test",
"epi_isl_413612_USA_20200217_null_2":"test",
"epi_isl_413898_Guangdong_20200228_null_2":"test",
"epi_isl_413902_Guangdong_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_416350_Shanghai_20200129_null_5":"test",
"epi_isl_416382_Shanghai_20200208_null_1":"test",
"epi_isl_416589_unknown_20200216_null_1":"test",
"epi_isl_417088_Washington_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_417176_Hong_Kong_20200121_null_1":"test",
"epi_isl_417177_Hong_Kong_20200123_null_1":"test",
"epi_isl_417296_England_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_417351_Washington_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_417386_New_South_Wales_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_417393_New_South_Wales_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417427_Sint_Pieters_Woluwe_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_417445_Lombardy_20200224_null_1":"test",
"epi_isl_417487_Oslo_20200301_null_2":"test",
"epi_isl_417572_Reykjavik_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417797_Reykjavik_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_417979_Madrid_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_418017_Portugal_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418062_Washington_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_418082_Washington_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_418251_Madrid_20200225_null_1":"test",
"epi_isl_418764_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418805_Deinze_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_418949_Washington_20200316_null_11":"test",
"epi_isl_419187_ARA_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_419235_Madrid_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_419246_Hong_Kong_20200223_null_1":"test",
"epi_isl_419249_Hong_Kong_20200225_null_1":"test",
"epi_isl_419599_Luxembourg_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_419604_Luxembourg_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_419662_Austria_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_419688_Comunitat_Valenciana_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_419735_Victoria_20200224_null_6":"test",
"epi_isl_419832_Northern_Territory_20200221_null_1":"test",
"epi_isl_419863_Victoria_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419869_Victoria_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_419941_Victoria_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_420051_Ile_de_France_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_420061_Ile_de_France_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420241_South_Yorkshire_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_420310_Norway_20200316_null_3":"test",
"epi_isl_420387_Sint_Agatha_Berchem_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420432_Leuven_20200323_null_3":"test",
"epi_isl_420495_England_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_420815_Utah_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_420890_Japan_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_420946_Wales_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_421256_Jiangxi_20200127_null_1":"test",
"epi_isl_421258_Jiangxi_20200208_null_2":"test",
"epi_isl_421313_Wisconsin_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_421375_New_York_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_421410_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_421435_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_421460_Portugal_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_421495_Portugal_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_421507_Ile_de_France_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_421641_Taipei_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_421761_Luxembourg_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_421815_England_20200325_null_5":"test",
"epi_isl_421841_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_421929_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_421980_England_20200331_null_6":"test",
"epi_isl_422000_England_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_422017_Wales_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_422072_Wales_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_422171_Wales_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_422184_Wales_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_422231_Wales_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_422328_Wales_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_422356_Wales_20200327_null_25":"test",
"epi_isl_422414_Taipei_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_422421_Taipei_20200319_null_2":"test",
"epi_isl_422564_Pichincha_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_422667_Netherlands_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_422712_Netherlands_20200322_null_2":"test",
"epi_isl_422878_Noord_Brabant_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_422915_Zuid_Holland_20200319_null_19":"test",
"epi_isl_423094_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423110_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423168_England_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_423187_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_423231_England_20200324_null_3":"test",
"epi_isl_423274_England_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_423293_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_423316_England_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_423589_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_423772_England_20200322_null_2":"test",
"epi_isl_423831_England_20200323_null_24":"test",
"epi_isl_423889_England_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_424010_England_20200320_null_6":"test",
"epi_isl_424174_Connecticut_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_424225_Washington_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_424351_USA_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_424413_Reykjavik_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_424421_Reykjavik_20200319_null_2":"test",
"epi_isl_424532_Reykjavik_20200320_null_3":"test",
"epi_isl_424570_Reykjavik_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_424860_Georgia_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_424904_South_Carolina_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_424931_New_York_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_425139_Duesseldorf_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_425146_Wisconsin_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_425162_Wisconsin_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_425281_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_425284_England_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_425451_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_425459_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_425460_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_425569_England_20200323_null_3":"test",
"epi_isl_425637_England_20200330_null_16":"test",
"epi_isl_425689_Scotland_20200314_null_2":"test",
"epi_isl_425930_Scotland_20200325_null_6":"test",
"epi_isl_425950_Scotland_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_425994_Scotland_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_426042_New_York_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_426068_Idaho_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_426171_South_Korea_20200205_null_8":"test",
"epi_isl_426295_New_York_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_426482_Montevideo_20200317_null_4":"test",
"epi_isl_426483_Arizona_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_426513_Arizona_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_426627_Louisiana_20200406_null_9":"test",
"epi_isl_426628_Louisiana_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_426772_Victoria_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_426810_Victoria_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_426853_Victoria_20200325_null_22":"test",
"epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_426882_Victoria_20200324_null_3":"test",
"epi_isl_426898_Northern_territory_20200326_null_15":"test",
"epi_isl_426979_Victoria_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_427105_Victoria_20200404_null_25":"test",
"epi_isl_427149_Victoria_20200408_null_3":"test",
"epi_isl_427152_Victoria_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_427166_Idaho_20200325_null_8":"test",
"epi_isl_427178_Washington_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_427179_Washington_20200326_null_28":"test",
"epi_isl_427188_Washington_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_427210_Washington_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_427333_Saint_Petersburg_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_427376_Liege_20200407_null_14":"test",
"epi_isl_427459_Wisconsin_20200406_null_32":"test",
"epi_isl_427519_New_York_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_427646_New_South_Wales_20200304_null_45":"test",
"epi_isl_427671_New_South_Wales_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_427743_New_South_Wales_20200321_null_15":"test",
"epi_isl_427758_New_South_Wales_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_427759_New_South_Wales_20200320_null_5":"test",
"epi_isl_427779_New_South_Wales_20200324_null_8065":"test",
"epi_isl_427800_New_South_Wales_20200324_null_1498":"test",
"epi_isl_427805_New_South_Wales_20200320_null_3":"test"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":3
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":4
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":7
}
}
}